pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
106644021	C	G	True	1		0.067	0.0	False	False	0.00/1	0.00/5	0.00/1	0.00/5	0.25/4	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/2
106644125	G	T	True	1	0.0	0.0	0.105	False	False	0.00/9	0.00/9	0.00/3	0.00/10	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.50/4	0.00/5
106644127	T	C	True	1	0.0	0.0	0.065	False	False	0.00/13	0.00/14	0.00/5	0.00/14	0.00/7	0.00/10	0.00/10	0.40/5	0.00/6
106644131	T	C	True	1	0.0	0.0	0.033	False	False	0.00/13	0.00/14	0.00/5	0.00/14	0.00/7	0.00/9	0.00/11	0.25/4	0.00/6
106644135	A	C	True	1	0.0	0.0	0.033	False	False	0.00/13	0.00/14	0.00/5	0.00/14	0.00/7	0.00/9	0.00/11	0.25/4	0.00/6
106644175	C	T	True	1	0.0	0.1	0.0	False	True	0.00/6	0.00/6	0.00/3	0.00/5	0.33/6	0.00/7	0.00/6	0.00/1	0.00/2
106644183	A	G	True	1	0.0	0.029	0.036	False	False	0.00/12	0.00/11	0.20/5	0.00/11	0.00/8	0.00/9	0.00/10	0.25/4	0.00/5
106644186	T	G	True	1	0.0	0.029	0.034	False	False	0.00/11	0.00/9	0.17/6	0.00/11	0.00/8	0.00/9	0.00/11	0.25/4	0.00/5
106644188	T	G	True	1	0.0	0.029	0.036	False	False	0.00/11	0.00/9	0.17/6	0.00/11	0.00/8	0.00/9	0.00/10	0.25/4	0.00/5
106644189	T	A	True	1	0.091	0.0	0.036	False	False	0.09/11	0.00/9	0.00/6	0.00/11	0.00/8	0.00/9	0.00/10	0.25/4	0.00/5
106644194	G	T	True	1	0.0	0.0	0.077	False	False	0.00/7	0.00/2	0.00/2	0.00/7	0.00/1	0.00/4	0.25/4	0.00/2	0.00/3
106644196	T	A	True	1	0.0	0.032	0.037	False	False	0.00/9	0.00/7	0.17/6	0.00/12	0.00/6	0.00/9	0.00/9	0.25/4	0.00/5
106644254	T	A	True	3	0.0	0.2	0.217	False	False	0.00/5	0.00/4	0.33/6	0.17/12	0.33/3	0.29/7	0.43/7	0.00/3	0.00/6
106644255	C	A	True	4		0.312	0.417	False	False	0.00/2	0.00/4	0.40/5	0.33/6	1.00/1	0.50/4	0.75/4	0.00/1	0.00/3
106644267	G	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	True	0.25/4		0.00/1	0.00/6	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/3
106644291	G	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	True	0.25/4		0.00/1	0.00/6	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/3
106644306	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/8	0.00/5	0.00/6	0.00/9	0.00/2	0.00/5	0.00/7	0.00/2	0.00/5
106644318	T	C	True	1	0.0	0.0	0.056	False	False	0.00/7	0.00/5	0.00/5	0.00/8		0.25/4	0.00/7	0.00/1	0.00/6
106644331	G	C	True	1	0.0	0.2	0.2	False	False	0.00/4	0.00/1		0.25/4		1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/2
106644398	A	G	True	1	0.167	0.0	0.043	False	False	0.17/6	0.00/5	0.00/5	0.00/7		0.25/4	0.00/8	0.00/3	0.00/8
106644413	T	C	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/4	0.00/4	0.25/4	0.00/7		0.00/4	0.00/6	0.00/3	0.00/9
106644448	A	G	True	1	0.0	0.12	0.0	False	False	0.00/4	0.00/7	0.14/7	0.25/8	0.00/3	0.00/7	0.00/10	0.00/7	0.00/10
106644450	A	G	True	1	0.0	0.08	0.0	False	False	0.00/4	0.00/7	0.00/7	0.25/8	0.00/3	0.00/7	0.00/10	0.00/7	0.00/10
106644473	A	G	True	1	0.143	0.162	0.104	False	False	0.14/7	0.11/9	0.11/9	0.21/14	0.20/5	0.25/12	0.00/13	0.20/10	0.00/13
106644491	C	T	True	1	0.375	0.208	0.036	False	True	0.38/8	0.00/3	0.22/9	0.22/9	0.33/3	0.00/6	0.00/9	0.00/6	0.14/7
106644499	G	T	True	1		0.103	0.088	False	False	0.00/3	0.00/5	0.25/4	0.17/12	0.00/8	0.08/12	0.14/7	0.00/7	0.12/8
106644500	C	T	True	2	0.429	0.154	0.062	False	True	0.43/7	0.00/3	0.20/10	0.11/9	0.25/4	0.10/10	0.00/9	0.00/6	0.14/7
106644546	G	T	True	8	0.3	0.375	0.348	False	False	0.30/10	0.38/8	0.33/12	0.44/16	0.33/12	0.38/16	0.43/7	0.40/10	0.23/13
106644562	A	T	True	1	0.158	0.2	0.177	False	False	0.16/19	0.23/13	0.12/26	0.19/27	0.32/19	0.22/36	0.10/21	0.24/17	0.14/22
106644566	A	T	True	1	0.105	0.108	0.052	False	False	0.11/19	0.25/12	0.00/25	0.15/27	0.11/19	0.00/38	0.14/21	0.12/17	0.00/21
106644576	A	G	True	1	0.111	0.165	0.149	False	False	0.11/18	0.27/11	0.08/25	0.17/30	0.21/19	0.16/38	0.14/21	0.19/16	0.11/19
106644617	A	G	True	2	0.15	0.188	0.18	False	False	0.15/20	0.33/9	0.07/28	0.18/28	0.30/20	0.19/42	0.14/21	0.22/18	0.16/19
106644622	G	T	True	3	0.273	0.167	0.111	False	False	0.27/11	0.38/8	0.06/17	0.19/21	0.14/14	0.00/22	0.38/8	0.23/13	0.00/11
106644628	C	T	True	1	0.167	0.182	0.114	False	True	0.17/6	1.00/1	0.12/8	0.25/8	0.00/5	0.11/18	0.08/12	0.17/6	0.12/8
106644657	C	T	True	2	0.333	0.115	0.051	False	True	0.33/6	0.33/3	0.00/10	0.11/9	0.25/4	0.06/17	0.12/8	0.00/7	0.00/7
106644673	A	T	True	1	0.111	0.11	0.038	False	False	0.11/18	0.27/11	0.04/28	0.12/33	0.11/19	0.00/43	0.10/20	0.09/23	0.00/18
106644721	G	T	True	1		0.133	0.128	False	False	0.00/2	0.50/4	0.00/12	0.22/9	0.00/5	0.17/18	0.20/5	0.11/9	0.00/7
106644723	G	A	True	1		0.148	0.128	False	True	0.00/2	0.50/4	0.00/9	0.22/9	0.00/5	0.17/18	0.20/5	0.11/9	0.00/7
106644735	C	T	True	2	0.0	0.08	0.105	False	True	0.00/7	0.00/6	0.40/5	0.00/8	0.00/6	0.13/15	0.00/10	0.25/8	0.00/5
106644743	C	T	True	2	0.0	0.08	0.105	False	True	0.00/7	0.00/6	0.40/5	0.00/8	0.00/6	0.13/15	0.00/10	0.29/7	0.00/6
106644785	C	A	True	4	0.0	0.261	0.243	False	False	0.00/8	0.00/7	0.20/5	0.33/6	0.60/5	0.46/13	0.25/12	0.00/7	0.00/5
106644805	C	T	True	3	0.444	0.15	0.057	False	True	0.44/9	0.14/7	0.00/6	0.00/2	0.40/5	0.00/12	0.08/13	0.00/6	0.25/4
106644850	A	G	True	6	0.412	0.275	0.235	False	False	0.41/17	0.17/12	0.25/12	0.36/11	0.40/5	0.29/24	0.24/17	0.00/9	0.28/18
106644858	A	T	True	8	0.562	0.525	0.409	False	False	0.56/16	0.33/12	0.67/12	0.55/11	0.60/5	0.60/20	0.53/17	0.30/10	0.16/19
106644860	A	T	True	1	0.059	0.1	0.079	False	False	0.06/17	0.17/12	0.00/12	0.00/11	0.40/5	0.06/18	0.06/17	0.00/9	0.16/19
106644866	C	A	True	4	0.375	0.222	0.207	False	False	0.38/8	0.14/7	0.50/4	0.00/5	0.50/2	0.14/7	0.17/12	0.33/6	0.25/4
106644867	C	A	True	3	0.375	0.176	0.069	False	False	0.38/8	0.29/7	0.00/4	0.00/4	0.50/2	0.00/7	0.08/12	0.00/6	0.25/4
106644871	A	G	True	1	0.0	0.103	0.098	False	False	0.00/17	0.00/12	0.18/11	0.08/12	0.25/4	0.16/19	0.19/16	0.00/8	0.00/18
106644919	C	T	True	2	0.2	0.308	0.167	False	True	0.20/5	0.25/4	0.67/3	0.00/4	0.50/2	0.00/5	0.20/5	0.33/6	0.00/2
106644920	C	T	True	1	0.4	0.0	0.0	False	True	0.40/5	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/6	0.00/2
106644924	C	A	True	3	0.4	0.417	0.235	False	False	0.40/5	0.33/3	1.00/3	0.00/4	0.50/2	0.25/4	0.20/5	0.33/6	0.00/2
106644951	C	T	True	1	0.0	0.0	0.091	False	True	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.00/4	0.00/1	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/2
106644977	C	A	True	2	0.25	0.0	0.091	False	False	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/2
106644981	A	G	True	1	0.0	0.05	0.034	False	False	0.00/9	0.00/5	0.00/7	0.00/4	0.25/4	0.00/9	0.00/5	0.20/5	0.00/10
106644983	A	T	True	1	0.0	0.05	0.0	False	False	0.00/7	0.00/5	0.00/7	0.25/4	0.00/4	0.00/9	0.00/5	0.00/5	0.00/9
