pos ref alt in_target n_oysters_with_alt alt_freq_Pum alt_freq_Qui alt_freq_Rio pop_differentiated cpg_destroying Pum1 Qui1 Qui2 Qui3 Qui4 Rio1 Rio2 Rio3 Rio4 18370014 A G True 1 0.091 0.0 False False 0.00/1 0.00/2 0.00/2 0.00/3 0.25/4 0.00/3 0.00/3 0.00/3 0.00/7 18370030 A C True 1 0.091 0.0 False False 0.00/2 0.00/1 0.25/4 0.00/4 0.00/4 0.00/3 0.00/3 0.00/8 18370031 T C True 1 0.091 0.0 False False 0.00/2 0.00/1 0.25/4 0.00/4 0.00/4 0.00/3 0.00/3 0.00/8 18370033 A C True 1 0.1 0.0 False False 0.00/2 0.25/4 0.00/4 0.00/4 0.00/4 0.00/3 0.00/8 18370160 G A True 2 0.167 0.095 False True 0.00/2 0.50/4 0.00/5 0.00/1 0.25/8 0.00/3 0.00/3 0.00/7 18370244 C A True 1 0.6 0.13 False False 1.00/1 1.00/2 0.67/3 0.25/4 0.22/9 0.00/3 0.00/3 0.12/8 18370289 C A True 3 0.538 0.172 False False 1.00/1 1.00/1 1.00/2 0.50/4 0.33/6 0.17/12 0.40/5 0.00/4 0.12/8 18370313 C A True 1 0.062 0.0 False False 0.00/1 0.00/1 0.25/4 0.00/5 0.00/6 0.00/15 0.00/6 0.00/3 0.00/12 18370315 G T True 1 0.111 0.105 False False 0.00/2 0.00/2 0.00/9 0.40/5 0.22/9 0.00/2 0.00/4 0.00/4 18370350 C T True 1 0.111 0.0 False True 0.00/1 0.00/2 0.50/4 0.00/6 0.00/6 0.00/14 0.00/5 0.00/4 0.00/11 18370406 A T True 1 0.25 0.0 0.016 False False 0.25/4 0.00/6 0.00/5 0.00/9 0.00/13 0.00/24 0.00/7 0.10/10 0.00/20 18370413 G A True 1 0.6 0.045 0.0 False True 0.60/5 0.00/5 0.00/2 0.12/8 0.00/7 0.00/10 0.00/1 0.00/8 0.00/9 18370417 A T True 1 0.5 0.056 0.015 False False 0.50/6 0.00/7 0.00/5 0.18/11 0.00/13 0.00/27 0.00/8 0.10/10 0.00/22 18370421 A G True 1 0.5 0.079 0.014 False False 0.50/8 0.12/8 0.00/5 0.18/11 0.00/14 0.03/29 0.00/11 0.00/10 0.00/21 18370422 C T True 1 0.0 0.122 False True 0.33/3 0.00/2 0.00/3 0.00/3 0.00/4 0.06/18 0.44/9 0.00/2 0.00/12 18370425 A T True 2 0.0 0.175 0.014 False False 0.00/9 0.12/8 0.33/6 0.33/12 0.00/14 0.00/28 0.00/11 0.00/9 0.05/22 18370429 T C True 1 0.111 0.15 0.029 False False 0.11/9 0.25/8 0.17/6 0.08/12 0.14/14 0.04/27 0.00/10 0.00/10 0.05/22 18370432 A T True 2 0.0 0.15 0.014 False False 0.00/8 0.25/8 0.00/6 0.25/12 0.07/14 0.03/29 0.00/11 0.00/11 0.00/19 18370437 A G True 2 0.0 0.152 0.03 False False 0.00/8 0.29/7 0.00/5 0.27/11 0.00/10 0.07/29 0.00/10 0.00/10 0.00/18 18370442 T C True 1 0.125 0.031 0.0 False False 0.12/8 0.00/6 0.25/4 0.00/11 0.00/11 0.00/25 0.00/9 0.00/11 0.00/18 18370446 A G True 1 0.0 0.121 0.0 False False 0.00/8 0.14/7 0.00/3 0.25/12 0.00/11 0.00/23 0.00/9 0.00/10 0.00/16 18370450 G T True 1 0.0 0.182 0.0 False False 0.00/5 0.17/6 0.00/1 0.33/9 0.00/6 0.00/9 0.00/2 0.00/6 0.00/9 18370468 T A True 4 0.778 0.208 0.077 False False 0.78/9 0.25/4 0.33/3 0.33/6 0.09/11 0.00/18 0.44/9 0.00/10 0.00/15 18370478 T C True 1 0.0 0.174 0.087 False False 0.00/9 0.00/4 0.50/4 0.00/6 0.22/9 0.13/15 0.12/8 0.11/9 0.00/14 18370483 G T True 5 0.143 0.333 0.409 False False 0.14/7 0.50/4 0.50/2 0.00/5 0.50/4 0.33/6 0.00/2 0.50/6 0.50/8 18370515 A G True 1 0.0 0.071 0.023 False False 0.00/13 0.00/5 0.33/6 0.00/7 0.00/10 0.00/14 0.11/9 0.00/9 0.00/12 18370563 T A True 0 0.5 0.037 False False 0.50/2 0.50/2 1.00/1 0.00/1 0.12/8 0.00/2 0.00/7 0.00/10 18370564 C A True 2 0.0 0.071 0.036 False False 0.00/7 0.25/4 0.00/5 0.00/1 0.00/4 0.00/6 0.00/12 0.25/4 0.00/6 18370607 C G True 1 0.0 0.0 0.061 False False 0.00/12 0.00/7 0.00/5 0.00/3 0.00/3 0.00/6 0.00/12 0.33/6 0.00/9 18370617 C A True 5 1.0 0.722 0.364 False False 1.00/12 0.71/7 0.60/5 1.00/3 0.67/3 0.00/6 0.67/12 0.17/6 0.33/9 18370620 C A True 1 0.0 0.053 0.0 False False 0.00/12 0.00/7 0.00/5 0.25/4 0.00/3 0.00/6 0.00/12 0.00/6 0.00/9 18370722 A C True 8 0.579 0.448 0.319 False False 0.58/19 0.62/13 0.47/15 0.25/16 0.50/14 0.25/16 0.53/15 0.35/23 0.17/18 18370811 G A True 6 0.545 0.382 False True 1.00/3 0.33/3 0.50/2 0.67/12 0.40/5 0.30/10 0.71/7 0.25/8 0.33/9 18370825 G A True 5 0.526 0.4 False True 1.00/3 0.00/2 0.50/2 0.70/10 0.40/5 0.38/8 0.71/7 0.17/6 0.33/9 18370847 T A True 9 0.857 0.647 0.36 False False 0.86/14 0.82/11 0.86/21 0.40/20 0.56/16 0.32/22 0.62/13 0.29/21 0.32/19 18370868 T A True 5 0.067 0.288 0.158 False False 0.07/15 0.36/11 0.30/23 0.36/22 0.12/17 0.13/23 0.25/12 0.26/23 0.00/18 18370879 C T True 5 0.077 0.333 0.167 False True 0.08/13 0.30/10 0.41/17 0.50/12 0.00/9 0.13/15 0.29/7 0.27/15 0.00/11 18370926 T C True 8 0.824 0.564 0.453 False False 0.82/17 0.60/15 0.63/27 0.43/21 0.60/15 0.41/27 0.67/15 0.19/16 0.59/17 18370927 G C True 1 0.062 0.0 False False 0.00/2 0.25/4 0.00/4 0.00/5 0.00/3 0.00/5 0.00/2 0.00/5 0.00/2