pos ref alt in_target n_oysters_with_alt alt_freq_Pum alt_freq_Qui alt_freq_Rio pop_differentiated cpg_destroying Pum1 Qui1 Qui2 Qui3 Qui4 Rio1 Rio2 Rio3 Rio4 13028046 A G True 4 0.4 0.455 0.458 False False 0.40/5 0.83/6 0.00/4 0.00/1 0.64/11 0.00/2 0.00/4 0.57/7 13028107 G A True 1 0.167 0.105 0.136 False True 0.17/6 0.00/16 1.00/2 0.00/1 0.00/18 0.67/3 0.29/7 0.12/16 13028113 A T True 1 0.167 0.125 0.02 False False 0.17/6 0.06/18 0.40/5 0.00/1 0.00/22 0.33/3 0.00/7 0.00/18 13028190 A G True 1 0.0 0.045 0.0 False False 0.00/17 0.00/37 0.25/4 0.33/3 0.00/31 0.00/1 0.00/8 0.00/25 13028193 G T True 1 0.333 0.0 0.0 False False 0.33/15 0.00/33 0.00/3 0.00/2 0.00/28 0.00/1 0.00/8 0.00/24 13028194 A G True 2 0.056 0.083 0.03 False False 0.06/18 1.00/1 0.00/38 0.40/5 0.25/4 0.00/31 0.00/1 0.11/9 0.04/25 13028195 A G True 2 0.0 0.061 0.015 False False 0.00/18 0.00/2 0.00/38 0.40/5 0.25/4 0.00/31 0.00/1 0.11/9 0.00/25 13028196 A G True 1 0.0 0.042 0.0 False False 0.00/18 0.50/2 0.00/38 0.00/4 0.25/4 0.00/31 0.00/1 0.00/9 0.00/25 13028205 A C True 1 0.0 0.021 0.045 False False 0.00/18 0.00/2 0.00/38 0.25/4 0.00/4 0.03/32 0.00/1 0.22/9 0.00/24 13028206 T C True 1 0.056 0.02 0.031 False False 0.06/18 0.00/2 0.00/40 0.25/4 0.00/4 0.00/32 0.00/1 0.11/9 0.04/23 13028218 A G True 1 0.0 0.022 0.0 False False 0.00/17 0.00/2 0.00/36 0.00/4 0.25/4 0.00/28 0.00/7 0.00/21 13028266 G A True 5 0.833 0.857 0.821 False True 0.83/12 0.50/2 0.88/25 1.00/1 0.88/17 0.38/8 1.00/14 13028455 T A True 1 0.0 0.0 0.077 False False 0.00/4 0.00/6 0.00/2 0.00/1 0.00/3 0.00/2 0.00/4 0.25/4 13028462 A G True 1 0.0 0.308 False False 0.00/2 0.00/4 0.00/2 0.00/1 0.00/2 1.00/2 0.50/4 0.00/5 13028464 G A True 0 0.0 0.0 0.25 False True 0.00/4 0.00/4 0.00/2 0.00/1 0.00/2 0.50/2 0.67/3 0.00/5 13028465 A T True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/4 0.00/2 0.00/1 0.00/2 0.00/2 0.00/4 0.00/5 13028466 A C True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/4 0.00/2 0.00/1 0.00/2 0.00/2 0.00/4 0.00/5 13028467 A C True 1 0.25 0.143 0.0 False False 0.25/4 0.00/4 0.00/2 1.00/1 0.00/2 0.00/2 0.00/4 0.00/5 13028470 T G True 1 0.0 0.231 False False 0.00/3 0.00/4 0.00/2 0.00/1 0.00/2 0.50/2 0.50/4 0.00/5 13028477 A C True 1 0.0 0.091 False False 0.00/1 0.00/4 0.00/2 0.00/1 0.00/1 0.25/4 0.00/5 13028560 C G True 0 0.25 False False 0.00/1 0.00/2 1.00/1 0.00/1 0.00/1 13028588 A T True 1 0.0 0.167 False False 0.00/2 0.00/2 0.00/2 0.00/3 0.00/3 0.00/1 0.00/1 0.25/4 13028725 G T True 2 0.0 0.06 0.2 False False 0.00/7 0.10/39 0.38/8 0.02/111 0.07/74 0.23/26 0.33/3 0.40/5 0.00/11 13028756 G T True 3 0.2 0.84 0.016 True False 0.20/10 0.68/62 0.00/13 0.97/159 0.85/97 0.00/33 0.00/3 0.08/12 0.00/15 13028810 A G True 4 0.0 0.097 0.403 False False 0.00/11 0.23/57 0.46/13 0.02/151 0.09/98 0.38/32 1.00/3 0.42/12 0.33/15 13028830 G T True 4 0.0 0.097 0.421 False False 0.00/9 0.24/55 0.38/13 0.02/141 0.09/89 0.39/28 1.00/3 0.42/12 0.36/14 13028938 A C True 1 0.0 0.007 0.071 False False 0.00/7 0.00/24 0.00/4 0.01/76 0.00/44 0.06/16 0.00/3 0.00/5 0.25/4 13028950 A C True 1 0.0 0.009 0.0 False False 0.00/4 0.00/17 0.25/4 0.00/53 0.00/35 0.00/12 0.00/2 0.00/5 0.00/4 13028951 A T True 1 0.0 0.009 0.0 False False 0.00/4 0.00/16 0.25/4 0.00/54 0.00/35 0.00/12 0.00/2 0.00/5 0.00/4