pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
55846051	A	G	True	1	0.0	0.04	0.0	False	False	0.00/7	0.00/8	0.00/8	0.25/4	0.00/5	0.00/12	0.00/6	0.00/4	0.00/9
55846061	C	T	True	1	0.0	0.077	0.0	False	True	0.00/5	0.00/6	0.25/4	0.00/3		0.00/11	0.00/4	0.00/2	0.00/3
55846063	T	C	True	4	0.714	0.154	0.241	False	False	0.71/7	0.11/9	0.43/7	0.00/6	0.00/4	0.31/13	0.17/6	0.50/4	0.00/6
55846081	G	A	True	2		0.615	0.444	False	True	1.00/3	0.33/3	1.00/3	0.00/3	1.00/4	0.50/2	0.50/2	1.00/1	0.25/4
55846140	T	A	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/5	0.00/7	0.00/3	0.00/8	0.00/4		0.00/3
55846174	T	C	True	1	0.333	0.045	0.0	False	False	0.33/6	0.00/6	0.00/5	0.12/8	0.00/3	0.00/8	0.00/4		0.00/6
55846184	A	C	True	1	0.333	0.077	0.0	False	False	0.33/6	0.00/9	0.00/5	0.22/9	0.00/3	0.00/8	0.00/5		0.00/7
55846189	T	C	True	4	0.333	0.192	0.364	False	False	0.33/6	0.11/9	0.20/5	0.33/9	0.00/3	0.22/9	0.40/5	1.00/1	0.43/7
55846199	C	T	True	4		0.227	0.5	False	True	0.67/3	0.14/7	0.33/6	0.12/8	1.00/1	0.43/7	0.40/5	1.00/1	0.60/5
55846209	C	T	True	1		0.192	0.0	False	True	0.33/3	0.00/7	0.33/9	0.12/8	0.50/2	0.00/8	0.00/5	0.00/1	0.00/5
55846210	C	T	True	2		0.308	0.0	False	True	0.33/3	0.00/7	0.56/9	0.25/8	0.50/2	0.00/8	0.00/5	0.00/1	0.00/5
55846217	G	A	True	2	0.333	0.4	0.0	False	True	0.33/6	0.50/2	0.00/2	1.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/1		0.00/3
55846222	T	C	True	2	0.0	0.231	0.0	False	False	0.00/6	0.00/9	0.50/10	0.14/14	0.33/6	0.00/11	0.00/6	0.00/2	0.00/10
55846244	G	A	True	3	0.8	0.556	0.0	False	True	0.80/5	0.50/2	0.00/2	0.80/10	0.25/4	0.00/2	0.00/1		0.00/3
55846249	G	C	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.00/10	0.25/4	0.00/1	0.00/1		0.00/3
55846252	C	A	True	4	0.571	0.436	0.043	False	False	0.57/7	0.00/7	0.67/12	0.40/15	0.60/5	0.00/7	0.00/6	0.00/3	0.14/7
55846264	T	A	True	5	0.6	0.534	0.129	False	False	0.60/15	0.11/9	0.71/14	0.58/26	0.56/9	0.00/10	0.14/7	0.00/3	0.27/11
55846331	G	T	True	3	0.625	0.667	0.333	False	False	0.62/8	0.33/3	0.50/2	0.75/12	0.69/13	0.00/2	0.50/2		0.50/2
55846343	A	G	True	2	0.2	0.247	0.105	False	False	0.20/25	0.08/12	0.09/22	0.30/33	0.41/22	0.12/8	0.18/11	0.00/3	0.06/16
55846347	T	A	True	3	0.192	0.122	0.317	False	False	0.19/26	0.23/13	0.14/21	0.09/34	0.09/22	0.33/9	0.36/11	0.75/4	0.18/17
55846416	A	T	True	4	0.345	0.33	0.0	False	False	0.34/29	0.00/13	0.58/19	0.32/34	0.32/25	0.00/11	0.00/12	0.00/5	0.00/18
55846419	G	A	True	7	0.545	0.718	0.267	False	True	0.55/11	0.33/6	0.75/4	0.77/13	0.81/16	0.00/2	0.43/7	0.00/2	0.25/4
55846436	G	T	True	7	0.5	0.675	0.214	False	False	0.50/12	0.33/6	0.75/4	0.77/13	0.71/17	0.00/2	0.33/6	0.00/2	0.25/4
55846457	G	A	True	7	0.545	0.651	0.231	False	True	0.55/11	0.43/7	0.75/4	0.67/15	0.71/17	0.00/2	0.40/5	0.00/2	0.25/4
55846460	A	G	True	3	0.194	0.341	0.073	False	False	0.19/31	0.25/16	0.15/20	0.37/27	0.55/22	0.00/8	0.22/9	0.00/6	0.06/18
55846516	G	A	True	1	0.143	0.184	0.0	False	True	0.14/7	0.00/7	0.17/6	0.25/12	0.23/13	0.00/1	0.00/4	0.00/2	0.00/1
55846520	A	T	True	6	0.52	0.526	0.174	False	False	0.52/25	0.50/18	0.57/23	0.44/18	0.59/17	0.00/10	0.17/12	0.00/7	0.35/17
55846539	T	C	True	3	0.429	0.243	0.15	False	False	0.43/21	0.24/21	0.43/21	0.13/15	0.08/13	0.00/8	0.09/11	0.00/8	0.38/13
55846540	T	C	True	3	0.45	0.243	0.146	False	False	0.45/20	0.24/21	0.43/21	0.13/15	0.08/13	0.00/10	0.09/11	0.00/7	0.38/13
55846545	G	A	True	5	0.4	0.5	0.1	False	True	0.40/5	0.57/7	0.50/6	0.38/8	0.56/9	0.00/3	0.33/3	0.00/3	0.00/1
55846573	T	C	True	1	0.0	0.056	0.024	False	False	0.00/22	0.00/17	0.00/17	0.00/9	0.27/11	0.00/11	0.00/12	0.14/7	0.00/12
55846601	G	A	True	1		0.143	0.0	False	True	0.00/1	0.25/4	0.00/3	0.00/5	0.50/2	0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/1
55846630	A	C	True	3	0.353	0.196	0.121	False	False	0.35/17	0.07/14	0.38/16	0.12/8	0.12/8	0.00/9	0.10/10	0.00/5	0.33/9
55846636	T	C	True	3	0.333	0.2	0.118	False	False	0.33/18	0.07/14	0.38/16	0.14/7	0.12/8	0.00/10	0.10/10	0.00/5	0.33/9
55846691	C	A	True	2	0.333	0.111	0.0	False	False	0.33/9	0.00/7	0.33/6	0.00/2	0.00/3	0.00/10	0.00/4	0.00/2	0.00/5
55846796	C	G	True	1		0.0	0.1	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/1	0.25/4		0.00/2	0.00/4
55846804	C	A	True	1		0.0	0.1	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/1	0.25/4		0.00/2	0.00/4
55846840	T	A	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/4	0.00/1	0.25/4	0.00/4
55846843	T	G	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/4	0.00/1	0.25/4	0.00/4
55846878	T	C	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/3			0.50/2	0.00/2	0.00/4	0.00/1	0.00/2	0.00/3
55846888	C	A	True	1			0.25	False	False	0.00/2			0.00/1	0.00/1	0.25/4			
55846916	T	C	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/2			1.00/1	0.00/3	0.00/5		0.00/2	0.00/2
55846917	A	C	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/2			1.00/1	0.00/3	0.00/5		0.00/2	0.00/2
55846937	G	T	True	0			0.4	False	False	0.00/1	0.00/1			0.00/2	1.00/1		0.33/3	0.00/1
55846939	A	C	True	0			0.286	False	False	0.00/2	0.00/1			0.00/2	0.33/3		0.33/3	0.00/1
55846941	T	C	True	0			0.286	False	False	0.00/2	0.00/1			0.00/2	0.33/3		0.33/3	0.00/1
55846946	T	C	True	0			0.333	False	False	0.00/2	0.00/1			0.00/2	0.67/3		0.00/2	0.00/1
55846948	G	C	True	0			0.25	False	False	0.00/1	0.00/1			0.00/2	1.00/1		0.00/2	0.00/1
