pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
54491017	G	T	True	1	0.0	0.08	0.032	False	False	0.00/10	0.25/4	0.11/9	0.00/9	0.00/3	0.00/7	0.14/7	0.00/6	0.00/11
54491061	C	G	True	1		0.0	0.05	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/5	0.00/9	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/11
54491062	G	A	True	1	0.1	0.125	0.033	False	True	0.10/10	0.20/5	0.00/6	0.00/9	0.50/4	0.00/8	0.12/8	0.00/5	0.00/9
54491084	C	T	True	2		0.15	0.045	False	True	0.00/3	0.00/3	0.50/4	0.00/7	0.17/6	0.00/5	0.00/2	0.25/4	0.00/11
54491134	T	A	True	1	0.0	0.03	0.024	False	False	0.00/11	0.00/9	0.25/4	0.00/14	0.00/6	0.00/14	0.00/8	0.00/6	0.08/13
54491138	A	G	True	1	0.182	0.242	0.086	False	False	0.18/11	0.22/9	0.50/4	0.21/14	0.17/6	0.08/13	0.20/5	0.17/6	0.00/11
54491144	T	C	True	1	0.0	0.03	0.031	False	False	0.00/11	0.00/10	0.25/4	0.00/13	0.00/6	0.00/12	0.00/4	0.00/6	0.10/10
54491154	T	G	True	1	0.1	0.069	0.03	False	False	0.10/10	0.00/9	0.00/3	0.00/12	0.40/5	0.08/12	0.00/4	0.00/6	0.00/11
54491156	C	A	True	1		0.071	0.077	False	False	0.00/3	0.00/4	1.00/1	0.00/6	0.00/3	0.00/3		0.25/4	0.00/6
54491179	A	T	True	1	0.125	0.083	0.038	False	False	0.12/8	0.00/7	0.00/3	0.00/10	0.50/4	0.11/9	0.00/2	0.00/6	0.00/9
54491208	G	T	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/3
54491211	C	A	True	1		0.167	0.0	False	False	0.50/2	0.25/4		0.00/2		0.00/1	0.00/1	0.00/2	0.00/5
54491215	G	T	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/1	0.00/3	0.00/1		0.00/3
54491217	G	C	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/1	0.00/3	0.00/2		0.00/3
54491231	T	A	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/4	0.00/6	0.00/1	0.00/5		0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/8
54491320	A	T	True	1		0.0	0.125	False	False		0.00/3	0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.25/4
54491322	T	C	True	1		0.0	0.125	False	False		0.00/3	0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.25/4
54491323	A	C	True	1		0.0	0.125	False	False		0.00/3	0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.25/4
54491324	T	C	True	1		0.0	0.125	False	False		0.00/3	0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.25/4
54491336	A	G	True	1		0.0	0.125	False	False		0.00/3	0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.25/4
54491338	A	G	True	1		0.0	0.125	False	False	1.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.25/4
54491339	A	G	True	1		0.0	0.125	False	False	1.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.25/4
54491376	C	A	True	0			0.25	False	False	0.00/2					0.00/1		1.00/1	0.00/2
54491464	C	G	True	0			0.25	False	False	0.00/2					0.00/1		0.50/2	0.00/1
54491467	C	G	True	0			0.25	False	False	0.00/2					0.00/1		0.50/2	0.00/1
54491569	A	G	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/3	1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/5	0.00/2	0.00/3	0.00/1
54491854	G	A	True	0		0.0	0.4	False	True	0.00/1	0.00/1	0.00/3		0.00/3	0.00/1	0.00/2	1.00/2	
54491876	A	G	True	1		0.0	0.125	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1
54491877	A	G	True	0		0.125	0.25	False	False	0.00/1	0.00/1	0.33/3	0.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/1	1.00/2	0.00/1
54491886	G	A	True	0		0.0	0.333	False	True	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/3	0.00/3	0.00/1	1.00/2	
54491973	G	T	True	0		0.0	0.25	False	False		0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/4	0.00/2	1.00/1	0.00/1	
54491977	G	T	True	1		0.143		False	False		0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.25/4	0.00/2		0.00/1	
54491981	G	C	True	1		0.143		False	False		0.00/2		0.00/1	0.25/4	0.00/2		0.00/1	
54491982	G	C	True	1		0.125		False	False		0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.25/4	0.00/2		0.00/1	
