pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
28945014	C	A	True	0		0.25		False		0.00/2	0.00/1	1.00/1		0.00/2			
28945015	C	G	True	0		0.25		False		0.00/2	0.00/1	1.00/1		0.00/2			
28945016	C	A	True	0		0.25		False		0.00/2	0.00/1	1.00/1		0.00/2			
28945045	A	G	True	1		0.067	0.0	False	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.00/5			0.00/2
28945047	A	G	True	1		0.067	0.0	False	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.00/5			0.00/2
28945048	C	G	True	1		0.125	0.0	False	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/3			0.00/1
28945049	C	A	True	1		0.125	0.0	False	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/3			0.00/1
28945050	C	A	True	1		0.125	0.0	False	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/3			0.00/1
28945051	T	A	True	1		0.067	0.0	False	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/5	0.00/5			0.00/2
28945052	T	G	True	1		0.067	0.0	False	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/5	0.00/5			0.00/2
28945053	A	G	True	1		0.067	0.0	False	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/5	0.00/5			0.00/2
28945080	C	G	True	1		0.0	0.2	False	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/2	0.00/1	0.25/4			0.00/1
28945081	C	A	True	1		0.0	0.2	False	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/2	0.00/1	0.25/4			0.00/1
28945103	A	C	True	1		0.056	0.0	False	0.00/3	0.00/5	0.00/5	0.00/4	0.25/4	0.00/4	0.00/1		0.00/2
28945104	G	T	True	0		0.286		False	0.00/1		0.50/2	0.00/2	0.33/3	0.00/1	0.00/1		0.00/1
28945105	T	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/1		0.00/2
28945106	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/1		0.00/2
28945125	A	C	True	1	0.0	0.0	0.125	False	0.00/4	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/2	0.25/4	0.00/1		0.00/3
28945134	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/5	0.00/2	0.00/4	0.00/1		0.00/3
28945189	C	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/2
28945209	T	G	True	1	0.0	0.062	0.071	False	0.00/6	0.00/8	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/3	0.20/5	0.00/2	0.00/4
28945214	T	G	True	1	0.0	0.0	0.077	False	0.00/6	0.00/8	0.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/4
28945215	T	A	True	1	0.0	0.0	0.077	False	0.00/6	0.00/8	0.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/4
28945219	C	G	True	1	0.0	0.083	0.0	False	0.00/6	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/3
28945221	C	A	True	1	0.0	0.0	0.083	False	0.00/6	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.00/5	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/3
28945270	C	G	True	1	0.0	0.0	0.067	False	0.00/8	0.00/6	0.00/1	0.00/2	0.00/6	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.25/4
28945274	C	A	True	1	0.0	0.0	0.067	False	0.00/8	0.00/6	0.00/1	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.25/4
28945277	T	G	True	1	0.0	0.0	0.062	False	0.00/7	0.00/9	0.00/1	0.00/3	0.00/6	0.00/6	0.00/5	0.00/1	0.25/4
28945388	G	T	True	0		0.25		False		0.50/2		0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1		
28945391	G	C	True	0		0.25		False		0.50/2		0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1		
28945444	A	G	True	1	0.0	0.071	0.0	False	0.00/5	0.00/8	0.25/8	0.00/4	0.00/8	0.00/7	0.00/4	0.00/5	0.00/4
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28945494	A	G	True	1	0.0	0.0	0.045	False	0.00/4	0.00/8	0.00/8	0.00/4	0.00/11	0.00/8	0.00/6	0.00/4	0.25/4
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28945632	G	A	True	1		0.0	0.125	False	0.00/1	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.25/4	0.00/2		0.00/2
28945708	C	G	True	1	0.0	0.045	0.0	False	0.00/4	0.00/7	0.00/5	0.00/6	0.25/4	0.00/9	0.00/3	0.00/7	0.00/7
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