CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 87222 349590 19.97 436812 2 86559 341778 20.21 428337 3 86495 342333 20.17 428828 4 86010 344576 19.98 430586 5 85537 344408 19.89 429945 6 86115 346701 19.90 432816 7 86996 346999 20.05 433995 8 87966 355542 19.83 443508 9 88039 354936 19.87 442975 10 87639 354537 19.82 442176 11 87689 353797 19.86 441486 12 87968 351954 20.00 439922 13 88395 349663 20.18 438058 14 88720 352299 20.12 441019 15 87982 348008 20.18 435990 16 87435 346326 20.16 433761 17 88476 349339 20.21 437815 18 88390 350375 20.15 438765 19 88354 352715 20.03 441069 20 88975 352611 20.15 441586 21 87784 353011 19.91 440795 22 87874 349706 20.08 437580 23 88232 350731 20.10 438963 24 87969 347294 20.21 435263 25 87919 349030 20.12 436949 26 88558 349807 20.20 438365 27 88192 350868 20.09 439060 28 87869 351030 20.02 438899 29 88078 349874 20.11 437952 30 87736 349800 20.05 437536 31 87702 350297 20.02 437999 32 88019 355187 19.86 443206 33 88537 352019 20.10 440556 34 88454 352315 20.07 440769 35 87942 350749 20.05 438691 36 88624 348693 20.27 437317 37 88095 350430 20.09 438525 38 87704 353419 19.88 441123 39 87834 351198 20.01 439032 40 88102 350402 20.09 438504 41 88133 348345 20.19 436478 42 88881 348024 20.34 436905 43 87995 349207 20.13 437202 44 88497 350872 20.14 439369 45 87887 348699 20.13 436586 46 87826 348702 20.12 436528 47 87635 348949 20.07 436584 48 87769 348933 20.10 436702 49 87220 347699 20.05 434919 50 87991 349882 20.10 437873 51 87127 346668 20.08 433795 52 87936 348196 20.16 436132 53 88259 349956 20.14 438215 54 88116 348124 20.20 436240 55 88259 347460 20.26 435719 56 88110 347782 20.21 435892 57 87917 348408 20.15 436325 58 88526 348129 20.27 436655 59 87632 348752 20.08 436384 60 88225 345297 20.35 433522 61 88286 346748 20.29 435034 62 87685 348416 20.11 436101 63 87377 344114 20.25 431491 64 87868 345614 20.27 433482 65 87729 344373 20.30 432102 66 88095 347280 20.23 435375 67 87619 346166 20.20 433785 68 88314 347754 20.25 436068 69 88875 348130 20.34 437005 70 88690 347296 20.34 435986 71 87743 345654 20.25 433397 72 88335 344646 20.40 432981 73 87513 343937 20.28 431450 74 87860 345613 20.27 433473 75 88170 343475 20.43 431645 76 88278 343640 20.44 431918 77 87975 343073 20.41 431048 78 87939 343820 20.37 431759 79 87978 342449 20.44 430427 80 87702 343357 20.35 431059 81 87694 344043 20.31 431737 82 87520 344370 20.26 431890 83 87878 345130 20.29 433008 84 87754 342592 20.39 430346 85 88155 343416 20.43 431571 86 87935 343856 20.37 431791 87 87315 342522 20.31 429837 88 87976 343241 20.40 431217 89 87750 344354 20.31 432104 90 87800 343100 20.38 430900 91 87563 342152 20.38 429715 92 88132 342044 20.49 430176 93 87597 343187 20.33 430784 94 87324 341003 20.39 428327 95 88182 344314 20.39 432496 96 87705 340392 20.49 428097 97 88026 341068 20.51 429094 98 87786 341286 20.46 429072 99 88098 340507 20.55 428605 100 87936 340087 20.54 428023 101 87451 340665 20.43 428116 102 87815 338634 20.59 426449 103 87947 340322 20.54 428269 104 87185 338719 20.47 425904 105 88077 338744 20.64 426821 106 88139 338185 20.67 426324 107 88047 339612 20.59 427659 108 87915 337727 20.65 425642 109 88586 337841 20.77 426427 110 88242 339837 20.61 428079 111 88107 337590 20.70 425697 112 88422 338826 20.70 427248 113 88131 336345 20.76 424476 114 88290 336099 20.80 424389 115 88724 335416 20.92 424140 116 88203 337346 20.73 425549 117 87463 335197 20.69 422660 118 87985 334919 20.80 422904 119 88667 333266 21.01 421933 120 88399 333285 20.96 421684 121 88677 331226 21.12 419903 122 88581 331427 21.09 420008 123 88103 331193 21.01 419296 124 88847 330364 21.19 419211 125 88013 329806 21.06 417819 126 88529 329814 21.16 418343 127 87963 328476 21.12 416439 128 88502 328331 21.23 416833 129 88613 328035 21.27 416648 130 88174 326002 21.29 414176 131 87610 325309 21.22 412919 132 87836 324343 21.31 412179 133 88227 323622 21.42 411849 134 87964 323419 21.38 411383 135 87493 323464 21.29 410957 136 87657 321840 21.41 409497 137 87750 322646 21.38 410396 138 87244 320928 21.37 408172 139 87592 320531 21.46 408123 140 87704 320393 21.49 408097 141 92365 321571 22.31 413936 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2268 605849 0.37 608117 2 1788 607203 0.29 608991 3 1726 599132 0.29 600858 4 1749 600262 0.29 602011 5 1710 603449 0.28 605159 6 1626 604928 0.27 606554 7 1616 614437 0.26 616053 8 1679 611341 0.27 613020 9 1703 613347 0.28 615050 10 1714 614121 0.28 615835 11 1695 613922 0.28 615617 12 1699 615936 0.28 617635 13 1725 617470 0.28 619195 14 1701 609835 0.28 611536 15 1625 606097 0.27 607722 16 1784 609154 0.29 610938 17 1738 615430 0.28 617168 18 1727 613432 0.28 615159 19 1802 619515 0.29 621317 20 1724 620254 0.28 621978 21 1711 614074 0.28 615785 22 1725 607393 0.28 609118 23 1775 613601 0.29 615376 24 1810 615106 0.29 616916 25 1812 612510 0.29 614322 26 1694 613522 0.28 615216 27 1770 613144 0.29 614914 28 1789 614984 0.29 616773 29 1740 611110 0.28 612850 30 1835 613554 0.30 615389 31 1831 615502 0.30 617333 32 1822 617794 0.29 619616 33 1706 610316 0.28 612022 34 1750 613928 0.28 615678 35 1739 611420 0.28 613159 36 1741 612150 0.28 613891 37 1729 614297 0.28 616026 38 1792 611275 0.29 613067 39 1741 608301 0.29 610042 40 1760 610290 0.29 612050 41 1814 613094 0.30 614908 42 1828 613833 0.30 615661 43 1806 610623 0.29 612429 44 1855 608429 0.30 610284 45 1832 608809 0.30 610641 46 1984 616538 0.32 618522 47 1889 609523 0.31 611412 48 1995 615138 0.32 617133 49 2031 609737 0.33 611768 50 2208 608673 0.36 610881 51 2198 607875 0.36 610073 52 2219 612669 0.36 614888 53 2345 614335 0.38 616680 54 2250 611727 0.37 613977 55 2264 605811 0.37 608075 56 2326 608395 0.38 610721 57 2302 608532 0.38 610834 58 2443 608297 0.40 610740 59 2290 606895 0.38 609185 60 2395 607688 0.39 610083 61 2358 606818 0.39 609176 62 2388 607815 0.39 610203 63 2456 609283 0.40 611739 64 2532 608540 0.41 611072 65 2488 610140 0.41 612628 66 2611 607124 0.43 609735 67 2623 607089 0.43 609712 68 2693 609897 0.44 612590 69 2462 608564 0.40 611026 70 2626 606556 0.43 609182 71 2586 606971 0.42 609557 72 2513 603838 0.41 606351 73 2660 601989 0.44 604649 74 2780 607219 0.46 609999 75 2672 609721 0.44 612393 76 2872 605939 0.47 608811 77 2842 607119 0.47 609961 78 2787 605379 0.46 608166 79 2934 603746 0.48 606680 80 2941 604616 0.48 607557 81 2930 605243 0.48 608173 82 2968 605332 0.49 608300 83 2980 604518 0.49 607498 84 3078 603203 0.51 606281 85 3235 603528 0.53 606763 86 3137 604923 0.52 608060 87 3241 599792 0.54 603033 88 3299 604606 0.54 607905 89 3398 602533 0.56 605931 90 3428 601548 0.57 604976 91 3539 599287 0.59 602826 92 3644 605289 0.60 608933 93 3592 601003 0.59 604595 94 3766 603210 0.62 606976 95 3899 601471 0.64 605370 96 4007 600700 0.66 604707 97 4148 598813 0.69 602961 98 4161 599167 0.69 603328 99 4310 596763 0.72 601073 100 4414 595979 0.74 600393 101 4484 595642 0.75 600126 102 4568 597226 0.76 601794 103 4583 593127 0.77 597710 104 4892 595365 0.81 600257 105 5087 594915 0.85 600002 106 5114 599141 0.85 604255 107 5247 594770 0.87 600017 108 5631 591493 0.94 597124 109 5466 591785 0.92 597251 110 5771 594364 0.96 600135 111 6071 592122 1.01 598193 112 6199 591895 1.04 598094 113 6405 587449 1.08 593854 114 6742 590072 1.13 596814 115 6776 589613 1.14 596389 116 7014 587746 1.18 594760 117 7370 587310 1.24 594680 118 7491 586171 1.26 593662 119 7602 584564 1.28 592166 120 7889 582118 1.34 590007 121 8097 580012 1.38 588109 122 8341 581856 1.41 590197 123 8690 578751 1.48 587441 124 8900 578369 1.52 587269 125 8929 579564 1.52 588493 126 9375 576640 1.60 586015 127 9478 573536 1.63 583014 128 9704 572607 1.67 582311 129 10044 570059 1.73 580103 130 10388 568336 1.79 578724 131 10479 566315 1.82 576794 132 10948 566596 1.90 577544 133 11023 566394 1.91 577417 134 11193 567644 1.93 578837 135 11707 564400 2.03 576107 136 11724 562957 2.04 574681 137 12576 559475 2.20 572051 138 12779 559153 2.23 571932 139 13193 557744 2.31 570937 140 19351 564301 3.32 583652 141 19445 558778 3.36 578223 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8188 2547113 0.32 2555301 2 7172 2542953 0.28 2550125 3 7048 2533712 0.28 2540760 4 6963 2534171 0.27 2541134 5 7258 2519179 0.29 2526437 6 6967 2513750 0.28 2520717 7 7130 2521720 0.28 2528850 8 7129 2541574 0.28 2548703 9 7278 2533163 0.29 2540441 10 7106 2532910 0.28 2540016 11 7123 2538159 0.28 2545282 12 7008 2515192 0.28 2522200 13 7011 2505169 0.28 2512180 14 7133 2504493 0.28 2511626 15 6956 2511567 0.28 2518523 16 7245 2516669 0.29 2523914 17 7250 2521393 0.29 2528643 18 7417 2524262 0.29 2531679 19 7155 2527118 0.28 2534273 20 7119 2535521 0.28 2542640 21 7267 2524155 0.29 2531422 22 7443 2524123 0.29 2531566 23 7305 2532807 0.29 2540112 24 7299 2521013 0.29 2528312 25 7243 2514768 0.29 2522011 26 7287 2521379 0.29 2528666 27 7201 2518387 0.29 2525588 28 7283 2518868 0.29 2526151 29 7253 2523176 0.29 2530429 30 7270 2529904 0.29 2537174 31 7256 2527307 0.29 2534563 32 7429 2535223 0.29 2542652 33 7299 2519378 0.29 2526677 34 7315 2518159 0.29 2525474 35 7230 2512356 0.29 2519586 36 7395 2520410 0.29 2527805 37 7362 2524591 0.29 2531953 38 7469 2530092 0.29 2537561 39 7294 2522396 0.29 2529690 40 7381 2517199 0.29 2524580 41 7433 2518744 0.29 2526177 42 7496 2510532 0.30 2518028 43 7416 2515781 0.29 2523197 44 7916 2527110 0.31 2535026 45 8069 2516405 0.32 2524474 46 8354 2522738 0.33 2531092 47 8516 2516730 0.34 2525246 48 8877 2520949 0.35 2529826 49 9139 2514803 0.36 2523942 50 9562 2523439 0.38 2533001 51 9863 2514214 0.39 2524077 52 9685 2520676 0.38 2530361 53 9883 2517661 0.39 2527544 54 9706 2515147 0.38 2524853 55 9820 2507044 0.39 2516864 56 10111 2514714 0.40 2524825 57 9931 2511010 0.39 2520941 58 10288 2512053 0.41 2522341 59 10125 2512463 0.40 2522588 60 10400 2514994 0.41 2525394 61 10458 2507352 0.42 2517810 62 10467 2514542 0.41 2525009 63 10701 2501091 0.43 2511792 64 10833 2505002 0.43 2515835 65 10883 2501081 0.43 2511964 66 11397 2508833 0.45 2520230 67 11427 2509032 0.45 2520459 68 11360 2511458 0.45 2522818 69 11285 2501317 0.45 2512602 70 11399 2498576 0.45 2509975 71 11463 2500748 0.46 2512211 72 11538 2501675 0.46 2513213 73 11712 2495481 0.47 2507193 74 12279 2513781 0.49 2526060 75 11964 2499788 0.48 2511752 76 12116 2496533 0.48 2508649 77 12606 2492627 0.50 2505233 78 12531 2495209 0.50 2507740 79 12648 2492750 0.50 2505398 80 12825 2498804 0.51 2511629 81 12912 2488608 0.52 2501520 82 13295 2490525 0.53 2503820 83 13277 2488591 0.53 2501868 84 13640 2484773 0.55 2498413 85 13892 2486847 0.56 2500739 86 14309 2496946 0.57 2511255 87 14555 2484094 0.58 2498649 88 14806 2486452 0.59 2501258 89 15243 2486373 0.61 2501616 90 15318 2482797 0.61 2498115 91 15898 2475499 0.64 2491397 92 16373 2485347 0.65 2501720 93 16278 2476429 0.65 2492707 94 17304 2477739 0.69 2495043 95 17485 2482946 0.70 2500431 96 18170 2472199 0.73 2490369 97 18391 2469534 0.74 2487925 98 19049 2475610 0.76 2494659 99 19523 2469451 0.78 2488974 100 20033 2473960 0.80 2493993 101 20962 2471172 0.84 2492134 102 21094 2470611 0.85 2491705 103 21800 2465985 0.88 2487785 104 22421 2466660 0.90 2489081 105 22763 2463685 0.92 2486448 106 23667 2459900 0.95 2483567 107 24279 2457412 0.98 2481691 108 25253 2449363 1.02 2474616 109 26321 2447561 1.06 2473882 110 26835 2456407 1.08 2483242 111 27714 2444434 1.12 2472148 112 28583 2438180 1.16 2466763 113 29421 2439995 1.19 2469416 114 30929 2431932 1.26 2462861 115 31280 2427384 1.27 2458664 116 32167 2431673 1.31 2463840 117 33012 2417749 1.35 2450761 118 34504 2420382 1.41 2454886 119 35421 2410896 1.45 2446317 120 35996 2411117 1.47 2447113 121 37172 2400967 1.52 2438139 122 38125 2403432 1.56 2441557 123 39471 2398251 1.62 2437722 124 40576 2393450 1.67 2434026 125 41489 2392601 1.70 2434090 126 43010 2383705 1.77 2426715 127 43891 2377503 1.81 2421394 128 44976 2374561 1.86 2419537 129 46047 2363837 1.91 2409884 130 47092 2362487 1.95 2409579 131 48254 2352652 2.01 2400906 132 49491 2349656 2.06 2399147 133 50851 2342469 2.12 2393320 134 51450 2340823 2.15 2392273 135 53309 2331003 2.24 2384312 136 55177 2329347 2.31 2384524 137 56404 2329640 2.36 2386044 138 61634 2324408 2.58 2386042 139 62665 2314771 2.64 2377436 140 61426 2309300 2.59 2370726 141 65750 2297690 2.78 2363440 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 81657 306376 21.04 388033 2 80590 303698 20.97 384288 3 79626 301846 20.87 381472 4 78773 299121 20.85 377894 5 79016 299117 20.90 378133 6 79017 297689 20.98 376706 7 78613 297046 20.93 375659 8 77814 295708 20.83 373522 9 78141 294287 20.98 372428 10 77401 293673 20.86 371074 11 77196 292159 20.90 369355 12 76962 292950 20.81 369912 13 76448 292635 20.71 369083 14 75423 291052 20.58 366475 15 75661 290391 20.67 366052 16 75402 289618 20.66 365020 17 74773 287557 20.64 362330 18 74367 286372 20.62 360739 19 73978 285124 20.60 359102 20 73060 282724 20.53 355784 21 73387 283158 20.58 356545 22 72656 280349 20.58 353005 23 72052 278891 20.53 350943 24 71491 278665 20.42 350156 25 71495 276781 20.53 348276 26 70982 276095 20.45 347077 27 70059 274065 20.36 344124 28 69828 271163 20.48 340991 29 68993 269472 20.38 338465 30 68477 268318 20.33 336795 31 68043 266511 20.34 334554 32 67805 264336 20.41 332141 33 67563 264002 20.38 331565 34 66889 261554 20.37 328443 35 66273 261166 20.24 327439 36 65937 258445 20.33 324382 37 66184 256894 20.49 323078 38 65010 255363 20.29 320373 39 64100 253374 20.19 317474 40 64093 251366 20.32 315459 41 63131 249848 20.17 312979 42 62371 247372 20.14 309743 43 62520 246076 20.26 308596 44 62114 244079 20.29 306193 45 61144 242206 20.16 303350 46 60960 240638 20.21 301598 47 60422 238002 20.25 298424 48 60044 236658 20.24 296702 49 59441 235257 20.17 294698 50 59458 233084 20.32 292542 51 58365 231559 20.13 289924 52 57940 228924 20.20 286864 53 57284 227041 20.15 284325 54 57035 227008 20.08 284043 55 56713 223568 20.23 280281 56 55774 222540 20.04 278314 57 55772 220907 20.16 276679 58 55450 218776 20.22 274226 59 55024 216199 20.29 271223 60 54573 214953 20.25 269526 61 53458 212276 20.12 265734 62 53229 210578 20.18 263807 63 52989 208357 20.28 261346 64 52102 207081 20.10 259183 65 52003 205891 20.16 257894 66 51572 203869 20.19 255441 67 51213 201411 20.27 252624 68 50908 200405 20.26 251313 69 49893 198203 20.11 248096 70 49782 196847 20.18 246629 71 49121 194076 20.20 243197 72 48570 192793 20.12 241363 73 48716 192095 20.23 240811 74 47987 190172 20.15 238159 75 47926 188788 20.25 236714 76 47065 186686 20.13 233751 77 46617 185440 20.09 232057 78 46370 182913 20.22 229283 79 45656 181658 20.08 227314 80 45280 179581 20.14 224861 81 45101 177456 20.26 222557 82 44354 176033 20.13 220387 83 44032 173172 20.27 217204 84 43762 172264 20.26 216026 85 43080 171353 20.09 214433 86 42316 168932 20.03 211248 87 42204 167725 20.10 209929 88 41865 166385 20.10 208250 89 41173 164613 20.01 205786 90 41290 162224 20.29 203514 91 40743 160509 20.24 201252 92 40001 159172 20.08 199173 93 40370 157758 20.38 198128 94 39334 156363 20.10 195697 95 38938 154192 20.16 193130 96 38157 153434 19.92 191591 97 38121 151863 20.07 189984 98 37666 150348 20.03 188014 99 37523 148883 20.13 186406 100 36826 146396 20.10 183222 101 36675 145503 20.13 182178 102 36177 144303 20.04 180480 103 35430 142424 19.92 177854 104 35686 141205 20.17 176891 105 34756 140261 19.86 175017 106 34396 138344 19.91 172740 107 34155 136337 20.03 170492 108 33942 135302 20.06 169244 109 33320 133373 19.99 166693 110 32816 132365 19.87 165181 111 32562 130415 19.98 162977 112 32011 129288 19.85 161299 113 32070 127812 20.06 159882 114 31818 126932 20.04 158750 115 31403 124821 20.10 156224 116 31092 123691 20.09 154783 117 30811 122910 20.04 153721 118 30031 121388 19.83 151419 119 29761 119173 19.98 148934 120 29614 118700 19.97 148314 121 28771 117353 19.69 146124 122 28822 115890 19.92 144712 123 28655 114499 20.02 143154 124 28424 112500 20.17 140924 125 27839 112216 19.88 140055 126 27673 110379 20.05 138052 127 27065 109118 19.87 136183 128 27063 107974 20.04 135037 129 26576 106724 19.94 133300 130 26195 105211 19.93 131406 131 26031 104536 19.94 130567 132 25603 103671 19.81 129274 133 25487 101920 20.00 127407 134 24924 100736 19.83 125660 135 24787 99664 19.92 124451 136 24454 98093 19.95 122547 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 8550 525454 1.60 534004 2 6316 523394 1.19 529710 3 4498 521293 0.86 525791 4 3829 518327 0.73 522156 5 3143 514082 0.61 517225 6 2791 514555 0.54 517346 7 2734 512828 0.53 515562 8 2272 510217 0.44 512489 9 2180 508981 0.43 511161 10 1988 509024 0.39 511012 11 1891 508246 0.37 510137 12 1810 505891 0.36 507701 13 1829 504719 0.36 506548 14 1768 503037 0.35 504805 15 1667 501036 0.33 502703 16 1737 500048 0.35 501785 17 1601 498200 0.32 499801 18 1445 497783 0.29 499228 19 1580 494499 0.32 496079 20 1469 492339 0.30 493808 21 1493 490580 0.30 492073 22 1389 488533 0.28 489922 23 1423 484759 0.29 486182 24 1351 482907 0.28 484258 25 1372 480712 0.28 482084 26 1382 479949 0.29 481331 27 1249 478407 0.26 479656 28 1328 473251 0.28 474579 29 1281 469163 0.27 470444 30 1306 467780 0.28 469086 31 1226 465319 0.26 466545 32 1254 461612 0.27 462866 33 1256 459577 0.27 460833 34 1239 457110 0.27 458349 35 1247 453911 0.27 455158 36 1245 450667 0.28 451912 37 1194 448031 0.27 449225 38 1199 446460 0.27 447659 39 1192 441373 0.27 442565 40 1115 437929 0.25 439044 41 1191 434603 0.27 435794 42 1222 431423 0.28 432645 43 1192 427505 0.28 428697 44 1214 426106 0.28 427320 45 1124 422207 0.27 423331 46 1109 419512 0.26 420621 47 1149 417304 0.27 418453 48 1091 414353 0.26 415444 49 1127 410659 0.27 411786 50 1089 406731 0.27 407820 51 1100 404912 0.27 406012 52 1077 401480 0.27 402557 53 1141 397829 0.29 398970 54 1061 393938 0.27 394999 55 1056 390394 0.27 391450 56 1093 386495 0.28 387588 57 1005 384548 0.26 385553 58 1087 380633 0.28 381720 59 1013 377681 0.27 378694 60 1063 374634 0.28 375697 61 1005 371422 0.27 372427 62 983 369092 0.27 370075 63 976 364570 0.27 365546 64 1003 362094 0.28 363097 65 994 360098 0.28 361092 66 944 357068 0.26 358012 67 951 353491 0.27 354442 68 941 349855 0.27 350796 69 981 348121 0.28 349102 70 878 344872 0.25 345750 71 920 341720 0.27 342640 72 910 338617 0.27 339527 73 914 335234 0.27 336148 74 883 332846 0.26 333729 75 933 330248 0.28 331181 76 902 327118 0.27 328020 77 876 323525 0.27 324401 78 872 318847 0.27 319719 79 878 315817 0.28 316695 80 890 314103 0.28 314993 81 861 309821 0.28 310682 82 892 307491 0.29 308383 83 814 305426 0.27 306240 84 799 300710 0.27 301509 85 811 298266 0.27 299077 86 803 296292 0.27 297095 87 812 292002 0.28 292814 88 802 290768 0.28 291570 89 753 286692 0.26 287445 90 755 284473 0.26 285228 91 772 281412 0.27 282184 92 741 278101 0.27 278842 93 756 275845 0.27 276601 94 731 273030 0.27 273761 95 742 270620 0.27 271362 96 749 267629 0.28 268378 97 756 264307 0.29 265063 98 754 262159 0.29 262913 99 727 260148 0.28 260875 100 705 256019 0.27 256724 101 723 254427 0.28 255150 102 719 251144 0.29 251863 103 696 249352 0.28 250048 104 681 245911 0.28 246592 105 681 243671 0.28 244352 106 696 241117 0.29 241813 107 656 238214 0.27 238870 108 679 235021 0.29 235700 109 658 233616 0.28 234274 110 716 230724 0.31 231440 111 659 227678 0.29 228337 112 647 226375 0.28 227022 113 641 222727 0.29 223368 114 584 220344 0.26 220928 115 621 217512 0.28 218133 116 643 214540 0.30 215183 117 607 213413 0.28 214020 118 536 211457 0.25 211993 119 560 208968 0.27 209528 120 579 206156 0.28 206735 121 531 204411 0.26 204942 122 545 202364 0.27 202909 123 579 199320 0.29 199899 124 536 196669 0.27 197205 125 512 194295 0.26 194807 126 530 192881 0.27 193411 127 532 190301 0.28 190833 128 579 188063 0.31 188642 129 574 186487 0.31 187061 130 537 182693 0.29 183230 131 534 181426 0.29 181960 132 532 179232 0.30 179764 133 483 178018 0.27 178501 134 458 175268 0.26 175726 135 542 173972 0.31 174514 136 544 169013 0.32 169557 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 50577 2174558 2.27 2225135 2 34134 2176223 1.54 2210357 3 25004 2173174 1.14 2198178 4 19111 2171917 0.87 2191028 5 15997 2169328 0.73 2185325 6 13481 2161568 0.62 2175049 7 12384 2150142 0.57 2162526 8 11637 2144116 0.54 2155753 9 10796 2133738 0.50 2144534 10 10101 2119183 0.47 2129284 11 9644 2113875 0.45 2123519 12 9046 2105448 0.43 2114494 13 8594 2097549 0.41 2106143 14 8163 2085419 0.39 2093582 15 7754 2077900 0.37 2085654 16 7567 2064207 0.37 2071774 17 7260 2050841 0.35 2058101 18 7153 2045901 0.35 2053054 19 6841 2031382 0.34 2038223 20 6648 2018774 0.33 2025422 21 6529 2010421 0.32 2016950 22 6130 2000789 0.31 2006919 23 6268 1988589 0.31 1994857 24 5970 1978631 0.30 1984601 25 5860 1968163 0.30 1974023 26 5722 1954913 0.29 1960635 27 5522 1945219 0.28 1950741 28 5656 1932400 0.29 1938056 29 5335 1921669 0.28 1927004 30 5489 1909807 0.29 1915296 31 5469 1897639 0.29 1903108 32 5424 1885602 0.29 1891026 33 5232 1875888 0.28 1881120 34 5236 1862568 0.28 1867804 35 5174 1850085 0.28 1855259 36 5236 1837810 0.28 1843046 37 5236 1826974 0.29 1832210 38 5196 1811857 0.29 1817053 39 5118 1800224 0.28 1805342 40 5117 1786632 0.29 1791749 41 4968 1774892 0.28 1779860 42 4940 1762097 0.28 1767037 43 4995 1749009 0.28 1754004 44 5010 1735516 0.29 1740526 45 4843 1722672 0.28 1727515 46 4848 1710036 0.28 1714884 47 4807 1696578 0.28 1701385 48 4821 1685772 0.29 1690593 49 4692 1673563 0.28 1678255 50 4716 1660134 0.28 1664850 51 4666 1645832 0.28 1650498 52 4601 1634245 0.28 1638846 53 4755 1620915 0.29 1625670 54 4640 1609076 0.29 1613716 55 4570 1597699 0.29 1602269 56 4499 1583718 0.28 1588217 57 4499 1571177 0.29 1575676 58 4453 1558674 0.28 1563127 59 4538 1543074 0.29 1547612 60 4400 1531759 0.29 1536159 61 4283 1518573 0.28 1522856 62 4418 1505537 0.29 1509955 63 4445 1493596 0.30 1498041 64 4231 1482231 0.28 1486462 65 4261 1470601 0.29 1474862 66 4341 1457468 0.30 1461809 67 4227 1445399 0.29 1449626 68 4190 1432986 0.29 1437176 69 4196 1420975 0.29 1425171 70 4098 1408747 0.29 1412845 71 4105 1394721 0.29 1398826 72 4162 1381852 0.30 1386014 73 4071 1369556 0.30 1373627 74 4005 1356132 0.29 1360137 75 3981 1345505 0.30 1349486 76 3981 1333928 0.30 1337909 77 3813 1321066 0.29 1324879 78 3832 1307513 0.29 1311345 79 3797 1294329 0.29 1298126 80 3798 1285021 0.29 1288819 81 3727 1272837 0.29 1276564 82 3710 1258654 0.29 1262364 83 3601 1245278 0.29 1248879 84 3549 1237102 0.29 1240651 85 3666 1223170 0.30 1226836 86 3585 1213608 0.29 1217193 87 3565 1199981 0.30 1203546 88 3429 1188205 0.29 1191634 89 3457 1177689 0.29 1181146 90 3456 1162067 0.30 1165523 91 3593 1153760 0.31 1157353 92 3365 1139940 0.29 1143305 93 3545 1128482 0.31 1132027 94 3318 1118185 0.30 1121503 95 3379 1107248 0.30 1110627 96 3293 1097877 0.30 1101170 97 3211 1082834 0.30 1086045 98 3315 1072374 0.31 1075689 99 3330 1062534 0.31 1065864 100 3388 1051145 0.32 1054533 101 3167 1040856 0.30 1044023 102 3199 1028925 0.31 1032124 103 3155 1018706 0.31 1021861 104 3280 1006900 0.32 1010180 105 3078 995724 0.31 998802 106 3239 985589 0.33 988828 107 3080 975688 0.31 978768 108 3046 964759 0.31 967805 109 3120 954773 0.33 957893 110 3076 945021 0.32 948097 111 2884 934698 0.31 937582 112 2934 923308 0.32 926242 113 2868 915087 0.31 917955 114 2911 904531 0.32 907442 115 3142 893694 0.35 896836 116 2927 883323 0.33 886250 117 2789 872753 0.32 875542 118 2878 864755 0.33 867633 119 2852 853959 0.33 856811 120 2992 844942 0.35 847934 121 2681 835739 0.32 838420 122 2672 825265 0.32 827937 123 2710 816467 0.33 819177 124 2709 806158 0.33 808867 125 2729 797349 0.34 800078 126 2802 787815 0.35 790617 127 2585 779031 0.33 781616 128 2629 770884 0.34 773513 129 2680 762094 0.35 764774 130 2672 753125 0.35 755797 131 2759 742505 0.37 745264 132 2597 734649 0.35 737246 133 2510 725364 0.34 727874 134 2696 716626 0.37 719322 135 2679 708826 0.38 711505 136 2858 694174 0.41 697032