CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 104690 417621 20.04 522311 2 104415 406111 20.45 510526 3 103687 405623 20.36 509310 4 103672 407748 20.27 511420 5 103161 408798 20.15 511959 6 103257 410959 20.08 514216 7 104615 411612 20.27 516227 8 105706 420905 20.07 526611 9 106045 422424 20.07 528469 10 105144 419038 20.06 524182 11 105547 417650 20.17 523197 12 106328 416362 20.34 522690 13 106519 415041 20.42 521560 14 107754 418083 20.49 525837 15 105786 410009 20.51 515795 16 105317 408354 20.50 513671 17 106348 412721 20.49 519069 18 105896 415520 20.31 521416 19 106847 416876 20.40 523723 20 106477 417672 20.31 524149 21 105715 417301 20.21 523016 22 105420 411658 20.39 517078 23 105036 413790 20.24 518826 24 105948 412152 20.45 518100 25 105828 412055 20.43 517883 26 105710 411758 20.43 517468 27 105298 411378 20.38 516676 28 105244 413011 20.31 518255 29 105791 410722 20.48 516513 30 105855 411804 20.45 517659 31 104799 413646 20.21 518445 32 106207 416330 20.33 522537 33 106111 412790 20.45 518901 34 106071 414569 20.37 520640 35 105090 411361 20.35 516451 36 106274 410360 20.57 516634 37 104776 412280 20.26 517056 38 106287 415223 20.38 521510 39 105692 412972 20.38 518664 40 105534 410884 20.44 516418 41 105346 411142 20.40 516488 42 105354 408914 20.49 514268 43 105840 409617 20.53 515457 44 105229 411255 20.37 516484 45 105460 409419 20.48 514879 46 104814 408475 20.42 513289 47 104896 409450 20.39 514346 48 104675 407623 20.43 512298 49 104769 406365 20.50 511134 50 104726 411764 20.28 516490 51 104311 408394 20.35 512705 52 105478 408600 20.52 514078 53 105522 409244 20.50 514766 54 105635 408998 20.53 514633 55 104916 407580 20.47 512496 56 104907 408181 20.45 513088 57 105392 407823 20.54 513215 58 104160 407209 20.37 511369 59 104650 407009 20.45 511659 60 104757 406517 20.49 511274 61 104782 407831 20.44 512613 62 105144 407958 20.49 513102 63 104818 403797 20.61 508615 64 105068 405044 20.60 510112 65 104286 404506 20.50 508792 66 104574 405706 20.49 510280 67 104765 405701 20.52 510466 68 106464 406207 20.77 512671 69 105548 408149 20.55 513697 70 105496 407093 20.58 512589 71 104753 404622 20.57 509375 72 105158 404857 20.62 510015 73 105227 403696 20.68 508923 74 104633 406014 20.49 510647 75 104722 404350 20.57 509072 76 105088 405370 20.59 510458 77 104914 402476 20.68 507390 78 104715 403236 20.62 507951 79 104785 400923 20.72 505708 80 105311 403266 20.71 508577 81 104343 403769 20.54 508112 82 105125 404244 20.64 509369 83 104721 404360 20.57 509081 84 104479 401895 20.63 506374 85 104159 402849 20.54 507008 86 104554 404320 20.55 508874 87 104218 403177 20.54 507395 88 104952 403454 20.64 508406 89 104705 404297 20.57 509002 90 104396 402757 20.58 507153 91 104067 402220 20.55 506287 92 104629 402666 20.62 507295 93 104137 402364 20.56 506501 94 104483 400454 20.69 504937 95 104301 403865 20.52 508166 96 105121 400755 20.78 505876 97 104083 400199 20.64 504282 98 104977 399863 20.79 504840 99 104978 400775 20.76 505753 100 104946 399841 20.79 504787 101 104666 400442 20.72 505108 102 104541 399402 20.74 503943 103 105101 398813 20.86 503914 104 104770 398916 20.80 503686 105 104979 398236 20.86 503215 106 104601 399150 20.76 503751 107 105277 400802 20.80 506079 108 105092 397337 20.92 502429 109 105023 397869 20.88 502892 110 105266 399148 20.87 504414 111 105123 397176 20.93 502299 112 105597 399260 20.92 504857 113 104635 397360 20.84 501995 114 104713 397313 20.86 502026 115 104937 394887 20.99 499824 116 105070 397627 20.90 502697 117 105154 393657 21.08 498811 118 105519 395074 21.08 500593 119 105159 393101 21.11 498260 120 105416 393726 21.12 499142 121 105509 390447 21.27 495956 122 104932 392636 21.09 497568 123 105326 391932 21.18 497258 124 105225 390645 21.22 495870 125 105402 391066 21.23 496468 126 104853 389870 21.19 494723 127 105296 390172 21.25 495468 128 105860 388829 21.40 494689 129 105653 388830 21.37 494483 130 104696 385954 21.34 490650 131 104789 386432 21.33 491221 132 105124 384974 21.45 490098 133 104718 383429 21.45 488147 134 104563 384501 21.38 489064 135 104702 384737 21.39 489439 136 104494 381944 21.48 486438 137 104597 383108 21.45 487705 138 104148 382427 21.40 486575 139 104415 380659 21.53 485074 140 104571 381305 21.52 485876 141 109227 381741 22.25 490968 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2628 713861 0.37 716489 2 2026 715409 0.28 717435 3 2026 705965 0.29 707991 4 2004 705071 0.28 707075 5 2017 709274 0.28 711291 6 1922 707553 0.27 709475 7 1986 719916 0.28 721902 8 2023 720866 0.28 722889 9 2093 719554 0.29 721647 10 2022 721300 0.28 723322 11 2042 720211 0.28 722253 12 2130 724750 0.29 726880 13 2067 723086 0.29 725153 14 1986 712305 0.28 714291 15 2035 710020 0.29 712055 16 2047 711758 0.29 713805 17 2110 717267 0.29 719377 18 2042 717005 0.28 719047 19 2098 721828 0.29 723926 20 2059 721592 0.28 723651 21 2052 717098 0.29 719150 22 2047 711345 0.29 713392 23 2125 717485 0.30 719610 24 2115 718454 0.29 720569 25 2093 715996 0.29 718089 26 2096 716433 0.29 718529 27 2174 714625 0.30 716799 28 2121 716361 0.30 718482 29 2125 714442 0.30 716567 30 2091 717197 0.29 719288 31 2125 719520 0.29 721645 32 2170 718715 0.30 720885 33 2105 710815 0.30 712920 34 2013 715385 0.28 717398 35 2089 713572 0.29 715661 36 2125 711582 0.30 713707 37 2057 714237 0.29 716294 38 2125 710591 0.30 712716 39 2107 708844 0.30 710951 40 2071 711178 0.29 713249 41 2046 713412 0.29 715458 42 2150 712707 0.30 714857 43 2079 711831 0.29 713910 44 2178 710869 0.31 713047 45 2208 707207 0.31 709415 46 2175 717047 0.30 719222 47 2191 710437 0.31 712628 48 2337 716679 0.33 719016 49 2393 710672 0.34 713065 50 2576 712322 0.36 714898 51 2365 707195 0.33 709560 52 2527 712347 0.35 714874 53 2427 716052 0.34 718479 54 2576 712949 0.36 715525 55 2557 706067 0.36 708624 56 2643 704359 0.37 707002 57 2508 707735 0.35 710243 58 2714 708407 0.38 711121 59 2643 707604 0.37 710247 60 2748 706491 0.39 709239 61 2634 706117 0.37 708751 62 2714 709662 0.38 712376 63 2720 710105 0.38 712825 64 2892 707547 0.41 710439 65 2868 708200 0.40 711068 66 2883 707100 0.41 709983 67 2931 706858 0.41 709789 68 3035 708689 0.43 711724 69 2849 707654 0.40 710503 70 3026 705604 0.43 708630 71 2896 705377 0.41 708273 72 2927 703504 0.41 706431 73 3095 703872 0.44 706967 74 3114 708356 0.44 711470 75 3110 708572 0.44 711682 76 3163 706375 0.45 709538 77 3305 707063 0.47 710368 78 3145 702495 0.45 705640 79 3264 702708 0.46 705972 80 3216 703544 0.46 706760 81 3236 707874 0.46 711110 82 3312 704097 0.47 707409 83 3467 702552 0.49 706019 84 3591 704349 0.51 707940 85 3578 703443 0.51 707021 86 3582 703960 0.51 707542 87 3739 700003 0.53 703742 88 3702 702763 0.52 706465 89 3836 699674 0.55 703510 90 3896 698419 0.55 702315 91 4004 699042 0.57 703046 92 4025 701489 0.57 705514 93 4142 699178 0.59 703320 94 4250 702386 0.60 706636 95 4347 699383 0.62 703730 96 4350 699795 0.62 704145 97 4542 696754 0.65 701296 98 4693 700190 0.67 704883 99 4598 695907 0.66 700505 100 4878 696598 0.70 701476 101 4926 695344 0.70 700270 102 5009 698006 0.71 703015 103 5307 694596 0.76 699903 104 5476 695695 0.78 701171 105 5249 693390 0.75 698639 106 5644 700649 0.80 706293 107 5762 693722 0.82 699484 108 6009 691403 0.86 697412 109 6204 690613 0.89 696817 110 6247 694438 0.89 700685 111 6530 691828 0.94 698358 112 6715 690772 0.96 697487 113 6969 688696 1.00 695665 114 7248 689033 1.04 696281 115 7247 689857 1.04 697104 116 7555 688592 1.09 696147 117 7886 685700 1.14 693586 118 8093 686328 1.17 694421 119 8066 684206 1.17 692272 120 8574 682572 1.24 691146 121 8503 682153 1.23 690656 122 8793 681953 1.27 690746 123 9039 679059 1.31 688098 124 9314 677143 1.36 686457 125 9445 678226 1.37 687671 126 9911 676752 1.44 686663 127 10167 674370 1.49 684537 128 10377 672491 1.52 682868 129 10861 670477 1.59 681338 130 10857 672004 1.59 682861 131 11036 668120 1.62 679156 132 11351 667459 1.67 678810 133 11720 667290 1.73 679010 134 11950 669355 1.75 681305 135 12340 665885 1.82 678225 136 12551 662731 1.86 675282 137 13451 660435 2.00 673886 138 13843 660146 2.05 673989 139 14201 661231 2.10 675432 140 20897 663938 3.05 684835 141 20716 658508 3.05 679224 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9937 3003555 0.33 3013492 2 8646 3000666 0.29 3009312 3 8421 2985928 0.28 2994349 4 8407 2983046 0.28 2991453 5 8508 2962761 0.29 2971269 6 8161 2958933 0.28 2967094 7 8424 2970466 0.28 2978890 8 8385 2993448 0.28 3001833 9 8607 2989159 0.29 2997766 10 8446 2984062 0.28 2992508 11 8400 2983763 0.28 2992163 12 8450 2960458 0.28 2968908 13 8266 2950042 0.28 2958308 14 8334 2943525 0.28 2951859 15 8615 2945532 0.29 2954147 16 8550 2953286 0.29 2961836 17 8584 2962982 0.29 2971566 18 8737 2964899 0.29 2973636 19 8659 2968827 0.29 2977486 20 8588 2978725 0.29 2987313 21 8563 2965144 0.29 2973707 22 8435 2963928 0.28 2972363 23 8789 2971229 0.29 2980018 24 8659 2958257 0.29 2966916 25 8783 2951368 0.30 2960151 26 8689 2957896 0.29 2966585 27 8549 2955093 0.29 2963642 28 8827 2954826 0.30 2963653 29 8679 2960835 0.29 2969514 30 8763 2966101 0.29 2974864 31 8713 2963399 0.29 2972112 32 8938 2964632 0.30 2973570 33 8796 2953455 0.30 2962251 34 8558 2954157 0.29 2962715 35 8681 2945950 0.29 2954631 36 8583 2952637 0.29 2961220 37 8646 2958755 0.29 2967401 38 8700 2965068 0.29 2973768 39 8604 2955011 0.29 2963615 40 8718 2948565 0.29 2957283 41 8927 2948940 0.30 2957867 42 9039 2943391 0.31 2952430 43 8823 2941600 0.30 2950423 44 9100 2954829 0.31 2963929 45 9275 2948053 0.31 2957328 46 9589 2949815 0.32 2959404 47 9811 2945453 0.33 2955264 48 10281 2950198 0.35 2960479 49 10589 2948796 0.36 2959385 50 10781 2955672 0.36 2966453 51 10805 2945988 0.37 2956793 52 11095 2951710 0.37 2962805 53 11066 2947530 0.37 2958596 54 11201 2943057 0.38 2954258 55 11306 2936909 0.38 2948215 56 11593 2945662 0.39 2957255 57 11406 2941812 0.39 2953218 58 11625 2944324 0.39 2955949 59 11596 2943685 0.39 2955281 60 12093 2949723 0.41 2961816 61 11803 2937581 0.40 2949384 62 11978 2945498 0.41 2957476 63 12077 2929312 0.41 2941389 64 12442 2933912 0.42 2946354 65 12587 2935138 0.43 2947725 66 13041 2938606 0.44 2951647 67 13061 2942930 0.44 2955991 68 13106 2939073 0.44 2952179 69 12770 2926852 0.43 2939622 70 12879 2925805 0.44 2938684 71 13094 2926174 0.45 2939268 72 12985 2931661 0.44 2944646 73 13511 2926253 0.46 2939764 74 13751 2944054 0.46 2957805 75 13881 2926289 0.47 2940170 76 14107 2927396 0.48 2941503 77 14613 2923178 0.50 2937791 78 14103 2924681 0.48 2938784 79 14463 2922208 0.49 2936671 80 14555 2928345 0.49 2942900 81 14704 2918721 0.50 2933425 82 14948 2915415 0.51 2930363 83 15105 2914923 0.52 2930028 84 15414 2911848 0.53 2927262 85 15997 2914898 0.55 2930895 86 16097 2917997 0.55 2934094 87 16355 2909113 0.56 2925468 88 16625 2911973 0.57 2928598 89 16839 2914864 0.57 2931703 90 17205 2915375 0.59 2932580 91 17545 2908409 0.60 2925954 92 18170 2915215 0.62 2933385 93 18497 2909569 0.63 2928066 94 18958 2907044 0.65 2926002 95 19359 2909309 0.66 2928668 96 20008 2899871 0.69 2919879 97 20456 2898554 0.70 2919010 98 20745 2901905 0.71 2922650 99 21266 2899259 0.73 2920525 100 22195 2903208 0.76 2925403 101 22704 2901773 0.78 2924477 102 22882 2897960 0.78 2920842 103 23913 2896010 0.82 2919923 104 24246 2901223 0.83 2925469 105 24846 2891110 0.85 2915956 106 25639 2886158 0.88 2911797 107 26065 2883811 0.90 2909876 108 27328 2876257 0.94 2903585 109 28333 2874400 0.98 2902733 110 28712 2879790 0.99 2908502 111 29631 2870223 1.02 2899854 112 30779 2868641 1.06 2899420 113 31382 2869078 1.08 2900460 114 33383 2863065 1.15 2896448 115 33705 2857822 1.17 2891527 116 34352 2861091 1.19 2895443 117 35363 2852128 1.22 2887491 118 36987 2848899 1.28 2885886 119 37261 2842234 1.29 2879495 120 38367 2838476 1.33 2876843 121 39357 2829894 1.37 2869251 122 40634 2831110 1.41 2871744 123 41550 2830844 1.45 2872394 124 42537 2827413 1.48 2869950 125 43795 2822157 1.53 2865952 126 45326 2811473 1.59 2856799 127 46585 2803172 1.63 2849757 128 47373 2804686 1.66 2852059 129 49322 2794287 1.73 2843609 130 50613 2794658 1.78 2845271 131 51578 2782522 1.82 2834100 132 53149 2778686 1.88 2831835 133 54357 2769899 1.92 2824256 134 55031 2769759 1.95 2824790 135 57120 2761204 2.03 2818324 136 59342 2756810 2.11 2816152 137 61157 2760755 2.17 2821912 138 66257 2753549 2.35 2819806 139 68010 2740499 2.42 2808509 140 66441 2738068 2.37 2804509 141 71032 2723234 2.54 2794266 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 101494 378138 21.16 479632 2 100031 374481 21.08 474512 3 99206 372014 21.05 471220 4 98557 368917 21.08 467474 5 98781 368389 21.14 467170 6 97941 364841 21.16 462782 7 98073 363746 21.24 461819 8 97135 362443 21.14 459578 9 96753 361386 21.12 458139 10 96494 359655 21.15 456149 11 95455 357664 21.07 453119 12 95305 357159 21.06 452464 13 94765 355801 21.03 450566 14 94114 355016 20.95 449130 15 93976 354316 20.96 448292 16 93413 352461 20.95 445874 17 92402 351326 20.82 443728 18 91938 349727 20.82 441665 19 91549 346860 20.88 438409 20 90858 343778 20.90 434636 21 90066 342523 20.82 432589 22 89289 341576 20.72 430865 23 88513 339703 20.67 428216 24 88963 337428 20.86 426391 25 88334 336718 20.78 425052 26 87572 333805 20.78 421377 27 86761 332698 20.68 419459 28 85861 329962 20.65 415823 29 86009 327474 20.80 413483 30 84849 325350 20.68 410199 31 84142 323739 20.63 407881 32 83057 320108 20.60 403165 33 83028 319651 20.62 402679 34 82601 317267 20.66 399868 35 81604 314390 20.61 395994 36 81552 312938 20.67 394490 37 81099 312049 20.63 393148 38 80307 309526 20.60 389833 39 79303 307360 20.51 386663 40 78544 305028 20.48 383572 41 78727 302195 20.67 380922 42 77996 300361 20.61 378357 43 76785 297904 20.49 374689 44 76722 295118 20.63 371840 45 75769 293701 20.51 369470 46 75346 291388 20.55 366734 47 74571 288610 20.53 363181 48 73642 286789 20.43 360431 49 73084 284582 20.43 357666 50 72897 281799 20.55 354696 51 72032 279485 20.49 351517 52 71999 277416 20.61 349415 53 71165 277272 20.42 348437 54 70454 274073 20.45 344527 55 69889 270780 20.52 340669 56 69064 268731 20.45 337795 57 68532 268043 20.36 336575 58 67534 265081 20.30 332615 59 66840 262940 20.27 329780 60 66718 260219 20.41 326937 61 66204 258010 20.42 324214 62 65412 254750 20.43 320162 63 65243 253515 20.47 318758 64 64454 250935 20.44 315389 65 63448 249225 20.29 312673 66 63391 247212 20.41 310603 67 63026 244883 20.47 307909 68 62216 242810 20.40 305026 69 61323 240764 20.30 302087 70 61066 238752 20.37 299818 71 60173 236296 20.30 296469 72 60118 234804 20.38 294922 73 59407 232441 20.36 291848 74 58957 230953 20.34 289910 75 58222 228974 20.27 287196 76 57989 226302 20.40 284291 77 57546 224479 20.40 282025 78 56664 222070 20.33 278734 79 56033 220454 20.27 276487 80 55951 216556 20.53 272507 81 54770 216202 20.21 270972 82 54458 212789 20.38 267247 83 54312 210489 20.51 264801 84 53745 209064 20.45 262809 85 52813 208030 20.25 260843 86 52418 205194 20.35 257612 87 51989 203732 20.33 255721 88 51304 201178 20.32 252482 89 50602 199077 20.27 249679 90 49969 197349 20.20 247318 91 49261 195572 20.12 244833 92 49054 193307 20.24 242361 93 48638 191175 20.28 239813 94 47884 189501 20.17 237385 95 47590 188760 20.14 236350 96 47608 186322 20.35 233930 97 46727 184611 20.20 231338 98 45948 182602 20.10 228550 99 45619 180196 20.20 225815 100 44999 178018 20.18 223017 101 44578 176647 20.15 221225 102 44350 174614 20.25 218964 103 43702 172562 20.21 216264 104 43369 170527 20.28 213896 105 42994 168848 20.30 211842 106 42494 167593 20.23 210087 107 41921 164966 20.26 206887 108 40932 163692 20.00 204624 109 40856 162108 20.13 202964 110 40409 160683 20.09 201092 111 40034 158429 20.17 198463 112 39601 157164 20.13 196765 113 39135 154843 20.17 193978 114 38558 152701 20.16 191259 115 37631 151129 19.94 188760 116 37860 149590 20.20 187450 117 37349 147901 20.16 185250 118 37074 146339 20.21 183413 119 36527 144758 20.15 181285 120 35803 143504 19.97 179307 121 35333 142340 19.89 177673 122 35449 140277 20.17 175726 123 34854 138203 20.14 173057 124 34323 136606 20.08 170929 125 33877 134670 20.10 168547 126 33728 134150 20.09 167878 127 33045 132170 20.00 165215 128 32876 130137 20.17 163013 129 32089 128766 19.95 160855 130 32226 127261 20.21 159487 131 31157 126267 19.79 157424 132 31213 124350 20.06 155563 133 30596 123308 19.88 153904 134 30482 121668 20.03 152150 135 29995 120567 19.92 150562 136 29352 117763 19.95 147115 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 10893 645197 1.66 656090 2 8236 640939 1.27 649175 3 5878 634469 0.92 640347 4 4901 633444 0.77 638345 5 4135 627661 0.65 631796 6 3698 625534 0.59 629232 7 3523 623116 0.56 626639 8 3207 621746 0.51 624953 9 2797 620540 0.45 623337 10 2696 619246 0.43 621942 11 2483 616563 0.40 619046 12 2435 614374 0.39 616809 13 2402 611613 0.39 614015 14 2203 609343 0.36 611546 15 2150 607465 0.35 609615 16 2029 606135 0.33 608164 17 1933 602489 0.32 604422 18 1979 599854 0.33 601833 19 1844 595936 0.31 597780 20 1835 593633 0.31 595468 21 1763 590227 0.30 591990 22 1679 588372 0.28 590051 23 1662 585211 0.28 586873 24 1713 582240 0.29 583953 25 1687 578258 0.29 579945 26 1741 577536 0.30 579277 27 1684 574322 0.29 576006 28 1593 569308 0.28 570901 29 1577 565428 0.28 567005 30 1451 562657 0.26 564108 31 1492 558720 0.27 560212 32 1536 556610 0.28 558146 33 1541 551556 0.28 553097 34 1582 548760 0.29 550342 35 1525 545198 0.28 546723 36 1511 542045 0.28 543556 37 1446 539251 0.27 540697 38 1467 536114 0.27 537581 39 1420 531397 0.27 532817 40 1398 527902 0.26 529300 41 1397 523341 0.27 524738 42 1469 519278 0.28 520747 43 1393 516003 0.27 517396 44 1416 511319 0.28 512735 45 1395 507781 0.27 509176 46 1376 503624 0.27 505000 47 1406 500116 0.28 501522 48 1338 496870 0.27 498208 49 1344 493331 0.27 494675 50 1297 489639 0.26 490936 51 1357 486097 0.28 487454 52 1292 480575 0.27 481867 53 1334 479677 0.28 481011 54 1351 474566 0.28 475917 55 1237 470725 0.26 471962 56 1304 466494 0.28 467798 57 1332 462796 0.29 464128 58 1274 458409 0.28 459683 59 1293 453596 0.28 454889 60 1228 451759 0.27 452987 61 1232 445933 0.28 447165 62 1220 443603 0.27 444823 63 1244 440174 0.28 441418 64 1204 436047 0.28 437251 65 1271 431857 0.29 433128 66 1177 430029 0.27 431206 67 1198 425409 0.28 426607 68 1184 422073 0.28 423257 69 1205 417965 0.29 419170 70 1155 415055 0.28 416210 71 1187 411261 0.29 412448 72 1141 406404 0.28 407545 73 1101 404495 0.27 405596 74 1120 401505 0.28 402625 75 1057 396702 0.27 397759 76 1080 392727 0.27 393807 77 1095 389294 0.28 390389 78 1114 385442 0.29 386556 79 1048 381093 0.27 382141 80 1039 378114 0.27 379153 81 1068 373606 0.29 374674 82 1036 369885 0.28 370921 83 975 366036 0.27 367011 84 1017 362978 0.28 363995 85 977 359690 0.27 360667 86 973 356072 0.27 357045 87 949 352200 0.27 353149 88 1018 349978 0.29 350996 89 904 344826 0.26 345730 90 969 341941 0.28 342910 91 960 337509 0.28 338469 92 902 334402 0.27 335304 93 944 331565 0.28 332509 94 931 327370 0.28 328301 95 910 323632 0.28 324542 96 875 321152 0.27 322027 97 877 317125 0.28 318002 98 832 313974 0.26 314806 99 856 311258 0.27 312114 100 830 308602 0.27 309432 101 866 305444 0.28 306310 102 808 300572 0.27 301380 103 802 299146 0.27 299948 104 849 294461 0.29 295310 105 817 291296 0.28 292113 106 804 288767 0.28 289571 107 822 285055 0.29 285877 108 812 282099 0.29 282911 109 809 279445 0.29 280254 110 732 277113 0.26 277845 111 785 272863 0.29 273648 112 766 269951 0.28 270717 113 809 266234 0.30 267043 114 748 263858 0.28 264606 115 779 260471 0.30 261250 116 701 258411 0.27 259112 117 757 254552 0.30 255309 118 690 252461 0.27 253151 119 721 248582 0.29 249303 120 673 246243 0.27 246916 121 723 243498 0.30 244221 122 709 239090 0.30 239799 123 696 238084 0.29 238780 124 630 235221 0.27 235851 125 640 232273 0.27 232913 126 620 228776 0.27 229396 127 672 227482 0.29 228154 128 648 223773 0.29 224421 129 630 220668 0.28 221298 130 631 218206 0.29 218837 131 667 216059 0.31 216726 132 636 213136 0.30 213772 133 593 211124 0.28 211717 134 682 207940 0.33 208622 135 654 206109 0.32 206763 136 640 200350 0.32 200990 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 64818 2601889 2.43 2666707 2 44337 2606753 1.67 2651090 3 32920 2608623 1.25 2641543 4 25345 2611479 0.96 2636824 5 21302 2611541 0.81 2632843 6 18365 2606642 0.70 2625007 7 16677 2594520 0.64 2611197 8 15295 2585005 0.59 2600300 9 14241 2568432 0.55 2582673 10 13320 2558214 0.52 2571534 11 12627 2548800 0.49 2561427 12 11909 2537071 0.47 2548980 13 11115 2526927 0.44 2538042 14 10889 2515753 0.43 2526642 15 10028 2499705 0.40 2509733 16 9671 2486048 0.39 2495719 17 9332 2474385 0.38 2483717 18 8793 2465128 0.36 2473921 19 8706 2449285 0.35 2457991 20 8365 2432990 0.34 2441355 21 8026 2421020 0.33 2429046 22 7834 2409350 0.32 2417184 23 7579 2396213 0.32 2403792 24 7502 2384471 0.31 2391973 25 7280 2371419 0.31 2378699 26 7201 2353790 0.30 2360991 27 7173 2342717 0.31 2349890 28 7047 2327568 0.30 2334615 29 6831 2313262 0.29 2320093 30 6844 2298199 0.30 2305043 31 6680 2284313 0.29 2290993 32 6741 2268996 0.30 2275737 33 6753 2257141 0.30 2263894 34 6527 2242328 0.29 2248855 35 6371 2230066 0.28 2236437 36 6647 2216744 0.30 2223391 37 6359 2198222 0.29 2204581 38 6217 2187864 0.28 2194081 39 6164 2173446 0.28 2179610 40 6072 2156207 0.28 2162279 41 6048 2142359 0.28 2148407 42 6241 2126027 0.29 2132268 43 6297 2109536 0.30 2115833 44 6080 2097310 0.29 2103390 45 6054 2082225 0.29 2088279 46 5958 2065864 0.29 2071822 47 5872 2051754 0.29 2057626 48 5882 2033579 0.29 2039461 49 5748 2020554 0.28 2026302 50 5758 2008678 0.29 2014436 51 5912 1988359 0.30 1994271 52 5782 1974930 0.29 1980712 53 5810 1958870 0.30 1964680 54 5760 1944823 0.30 1950583 55 5670 1927241 0.29 1932911 56 5545 1915944 0.29 1921489 57 5484 1901909 0.29 1907393 58 5488 1884578 0.29 1890066 59 5494 1870774 0.29 1876268 60 5362 1852499 0.29 1857861 61 5407 1839049 0.29 1844456 62 5259 1823471 0.29 1828730 63 5365 1807852 0.30 1813217 64 5419 1791938 0.30 1797357 65 5225 1778259 0.29 1783484 66 5417 1761706 0.31 1767123 67 5145 1748300 0.29 1753445 68 5191 1735781 0.30 1740972 69 5334 1720144 0.31 1725478 70 5105 1704030 0.30 1709135 71 5079 1690001 0.30 1695080 72 4968 1675525 0.30 1680493 73 5054 1659036 0.30 1664090 74 5151 1643585 0.31 1648736 75 4870 1629095 0.30 1633965 76 4911 1617035 0.30 1621946 77 4762 1601430 0.30 1606192 78 5028 1585791 0.32 1590819 79 4676 1572260 0.30 1576936 80 4685 1554178 0.30 1558863 81 4665 1541648 0.30 1546313 82 4636 1527192 0.30 1531828 83 4698 1513070 0.31 1517768 84 4525 1496092 0.30 1500617 85 4537 1481676 0.31 1486213 86 4624 1468453 0.31 1473077 87 4454 1452747 0.31 1457201 88 4273 1439813 0.30 1444086 89 4542 1427619 0.32 1432161 90 4188 1411571 0.30 1415759 91 4447 1395499 0.32 1399946 92 4229 1381077 0.31 1385306 93 4536 1364814 0.33 1369350 94 4256 1351491 0.31 1355747 95 4173 1340666 0.31 1344839 96 4042 1325072 0.30 1329114 97 3921 1314049 0.30 1317970 98 4008 1299169 0.31 1303177 99 3918 1285466 0.30 1289384 100 4153 1270623 0.33 1274776 101 3877 1256316 0.31 1260193 102 3955 1242550 0.32 1246505 103 3907 1229718 0.32 1233625 104 4113 1216596 0.34 1220709 105 3771 1202967 0.31 1206738 106 3963 1191262 0.33 1195225 107 3726 1178536 0.32 1182262 108 3887 1166969 0.33 1170856 109 3775 1151464 0.33 1155239 110 3886 1140315 0.34 1144201 111 3735 1125975 0.33 1129710 112 3624 1113806 0.32 1117430 113 3598 1100934 0.33 1104532 114 3609 1088036 0.33 1091645 115 3777 1075081 0.35 1078858 116 3694 1064604 0.35 1068298 117 3536 1052241 0.33 1055777 118 3465 1039606 0.33 1043071 119 3472 1028307 0.34 1031779 120 3735 1014968 0.37 1018703 121 3379 1003474 0.34 1006853 122 3383 989904 0.34 993287 123 3363 979668 0.34 983031 124 3279 967453 0.34 970732 125 3385 955362 0.35 958747 126 3468 944052 0.37 947520 127 3308 933282 0.35 936590 128 3350 922776 0.36 926126 129 3419 911980 0.37 915399 130 3265 901263 0.36 904528 131 3237 890388 0.36 893625 132 3298 879910 0.37 883208 133 3176 869327 0.36 872503 134 3205 856632 0.37 859837 135 3506 847690 0.41 851196 136 3644 828314 0.44 831958