CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 83377 351121 19.19 434498 2 82653 343007 19.42 425660 3 82323 341285 19.43 423608 4 82334 342742 19.37 425076 5 81803 345599 19.14 427402 6 81657 346341 19.08 427998 7 83049 349238 19.21 432287 8 84092 357605 19.04 441697 9 84799 359506 19.09 444305 10 83028 354462 18.98 437490 11 83578 353420 19.13 436998 12 84369 351042 19.38 435411 13 84555 349693 19.47 434248 14 84484 349429 19.47 433913 15 83704 345967 19.48 429671 16 83058 345126 19.40 428184 17 83265 348749 19.27 432014 18 84123 352090 19.28 436213 19 84029 354565 19.16 438594 20 84683 353485 19.33 438168 21 83271 351994 19.13 435265 22 83543 347500 19.38 431043 23 83278 348303 19.30 431581 24 83711 345921 19.48 429632 25 83773 347557 19.42 431330 26 83511 349035 19.31 432546 27 83037 349156 19.21 432193 28 83823 350059 19.32 433882 29 83445 347874 19.35 431319 30 84227 349415 19.42 433642 31 83579 349428 19.30 433007 32 83160 352824 19.07 435984 33 83640 348709 19.35 432349 34 83273 349713 19.23 432986 35 83568 345253 19.49 428821 36 83605 347087 19.41 430692 37 83458 347959 19.35 431417 38 83250 351753 19.14 435003 39 83228 349635 19.23 432863 40 83642 349495 19.31 433137 41 83240 347725 19.31 430965 42 83800 346246 19.49 430046 43 83329 347746 19.33 431075 44 83579 348819 19.33 432398 45 83408 345976 19.43 429384 46 83054 345896 19.36 428950 47 82850 345742 19.33 428592 48 82280 345419 19.24 427699 49 82966 344185 19.42 427151 50 83159 348181 19.28 431340 51 82815 343619 19.42 426434 52 82792 346951 19.27 429743 53 83464 347005 19.39 430469 54 83575 346314 19.44 429889 55 83128 345060 19.41 428188 56 83141 345325 19.40 428466 57 82866 344259 19.40 427125 58 82895 344489 19.40 427384 59 82410 344435 19.31 426845 60 83111 345403 19.40 428514 61 82690 344734 19.35 427424 62 83103 344728 19.42 427831 63 82747 342777 19.45 425524 64 82471 342077 19.43 424548 65 82811 340684 19.55 423495 66 82689 344589 19.35 427278 67 83914 342800 19.67 426714 68 83287 344416 19.47 427703 69 83577 345708 19.47 429285 70 83732 346588 19.46 430320 71 83512 344872 19.49 428384 72 83845 341861 19.70 425706 73 83603 341864 19.65 425467 74 83267 343119 19.53 426386 75 83639 340613 19.71 424252 76 83416 342509 19.58 425925 77 83175 341188 19.60 424363 78 82882 340777 19.56 423659 79 83454 341415 19.64 424869 80 83183 341983 19.56 425166 81 83072 344713 19.42 427785 82 83670 342529 19.63 426199 83 82812 341763 19.50 424575 84 83479 340379 19.70 423858 85 82796 341338 19.52 424134 86 83405 342010 19.61 425415 87 83201 339454 19.69 422655 88 82905 341393 19.54 424298 89 83264 343038 19.53 426302 90 83626 343177 19.59 426803 91 83225 340895 19.62 424120 92 83471 341641 19.64 425112 93 83334 341472 19.62 424806 94 83220 339044 19.71 422264 95 83821 340913 19.73 424734 96 83479 338591 19.78 422070 97 83075 338053 19.73 421128 98 83785 338567 19.84 422352 99 83250 338147 19.76 421397 100 83687 339052 19.80 422739 101 83637 339480 19.77 423117 102 84469 339334 19.93 423803 103 83847 337182 19.91 421029 104 83349 336153 19.87 419502 105 84117 336030 20.02 420147 106 83623 335765 19.94 419388 107 84581 337410 20.04 421991 108 84087 335267 20.05 419354 109 83784 336258 19.95 420042 110 84298 337419 19.99 421717 111 83983 335476 20.02 419459 112 83922 335842 19.99 419764 113 84454 334202 20.17 418656 114 84548 335033 20.15 419581 115 84894 332010 20.36 416904 116 84963 333554 20.30 418517 117 84413 331665 20.29 416078 118 84511 331348 20.32 415859 119 85290 330011 20.54 415301 120 84240 330189 20.33 414429 121 84974 329139 20.52 414113 122 84969 329050 20.52 414019 123 85151 328945 20.56 414096 124 85255 327401 20.66 412656 125 84709 327290 20.56 411999 126 85267 325174 20.77 410441 127 84597 324034 20.70 408631 128 84542 324824 20.65 409366 129 84556 323314 20.73 407870 130 84874 321754 20.87 406628 131 84523 321077 20.84 405600 132 84251 320304 20.83 404555 133 84019 320168 20.79 404187 134 84227 318270 20.93 402497 135 84644 318137 21.01 402781 136 84291 316695 21.02 400986 137 83898 316965 20.93 400863 138 84523 315995 21.10 400518 139 84362 314077 21.17 398439 140 84865 313450 21.31 398315 141 89506 314585 22.15 404091 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2239 595610 0.37 597849 2 1834 596555 0.31 598389 3 1647 589574 0.28 591221 4 1674 588256 0.28 589930 5 1616 591015 0.27 592631 6 1581 590870 0.27 592451 7 1618 601498 0.27 603116 8 1698 600969 0.28 602667 9 1646 601044 0.27 602690 10 1698 600187 0.28 601885 11 1616 599653 0.27 601269 12 1677 603456 0.28 605133 13 1700 603047 0.28 604747 14 1616 596023 0.27 597639 15 1631 591068 0.28 592699 16 1685 595593 0.28 597278 17 1637 599743 0.27 601380 18 1646 597247 0.27 598893 19 1667 601470 0.28 603137 20 1732 602989 0.29 604721 21 1661 597993 0.28 599654 22 1683 591141 0.28 592824 23 1696 596668 0.28 598364 24 1631 597933 0.27 599564 25 1749 596797 0.29 598546 26 1590 598959 0.26 600549 27 1691 597555 0.28 599246 28 1657 597113 0.28 598770 29 1658 597595 0.28 599253 30 1643 598142 0.27 599785 31 1665 599070 0.28 600735 32 1726 601697 0.29 603423 33 1649 593832 0.28 595481 34 1648 597877 0.27 599525 35 1667 595874 0.28 597541 36 1648 595287 0.28 596935 37 1682 596685 0.28 598367 38 1631 593784 0.27 595415 39 1702 591653 0.29 593355 40 1681 593317 0.28 594998 41 1700 596218 0.28 597918 42 1635 597032 0.27 598667 43 1753 596736 0.29 598489 44 1824 594068 0.31 595892 45 1764 591743 0.30 593507 46 1815 599398 0.30 601213 47 1847 592786 0.31 594633 48 1884 596417 0.31 598301 49 1978 594008 0.33 595986 50 2122 593406 0.36 595528 51 2050 592229 0.34 594279 52 2114 596158 0.35 598272 53 2200 598537 0.37 600737 54 2165 595865 0.36 598030 55 2182 591644 0.37 593826 56 2235 589693 0.38 591928 57 2181 591510 0.37 593691 58 2213 590550 0.37 592763 59 2250 590589 0.38 592839 60 2385 589873 0.40 592258 61 2352 590841 0.40 593193 62 2388 592687 0.40 595075 63 2465 593014 0.41 595479 64 2468 592120 0.42 594588 65 2516 594018 0.42 596534 66 2552 594204 0.43 596756 67 2502 591488 0.42 593990 68 2578 592159 0.43 594737 69 2508 592848 0.42 595356 70 2552 590371 0.43 592923 71 2550 590364 0.43 592914 72 2529 588384 0.43 590913 73 2644 588800 0.45 591444 74 2770 592164 0.47 594934 75 2728 593465 0.46 596193 76 2872 590004 0.48 592876 77 3066 590799 0.52 593865 78 2859 586596 0.49 589455 79 2887 586762 0.49 589649 80 3012 587166 0.51 590178 81 3064 590144 0.52 593208 82 3142 587389 0.53 590531 83 3061 587103 0.52 590164 84 3247 588236 0.55 591483 85 3368 588724 0.57 592092 86 3418 587472 0.58 590890 87 3296 585555 0.56 588851 88 3387 587989 0.57 591376 89 3613 585431 0.61 589044 90 3731 584513 0.63 588244 91 3868 585778 0.66 589646 92 3863 588441 0.65 592304 93 4003 583341 0.68 587344 94 4000 586082 0.68 590082 95 4217 585003 0.72 589220 96 4381 583219 0.75 587600 97 4512 583618 0.77 588130 98 4729 581991 0.81 586720 99 4801 580466 0.82 585267 100 4923 578925 0.84 583848 101 4988 581117 0.85 586105 102 5151 581341 0.88 586492 103 5368 578395 0.92 583763 104 5614 580561 0.96 586175 105 5772 578764 0.99 584536 106 5932 580809 1.01 586741 107 6086 578414 1.04 584500 108 6299 575595 1.08 581894 109 6474 574510 1.11 580984 110 6796 575672 1.17 582468 111 7127 573580 1.23 580707 112 7316 573122 1.26 580438 113 7728 571294 1.33 579022 114 8034 570412 1.39 578446 115 8270 569831 1.43 578101 116 8318 568756 1.44 577074 117 8546 567792 1.48 576338 118 9010 566827 1.56 575837 119 9213 564509 1.61 573722 120 9502 562734 1.66 572236 121 9592 562420 1.68 572012 122 9936 561534 1.74 571470 123 10526 560252 1.84 570778 124 10748 558531 1.89 569279 125 10889 556208 1.92 567097 126 11500 555511 2.03 567011 127 11450 552351 2.03 563801 128 11798 552334 2.09 564132 129 12272 549571 2.18 561843 130 12564 546455 2.25 559019 131 12617 544055 2.27 556672 132 13223 544295 2.37 557518 133 13437 544406 2.41 557843 134 13752 540415 2.48 554167 135 14301 539265 2.58 553566 136 14533 537334 2.63 551867 137 15292 535628 2.78 550920 138 16078 534141 2.92 550219 139 16425 532211 2.99 548636 140 23533 537307 4.20 560840 141 23424 532405 4.21 555829 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7968 2484061 0.32 2492029 2 6828 2480464 0.27 2487292 3 6830 2465229 0.28 2472059 4 6739 2457690 0.27 2464429 5 6930 2443196 0.28 2450126 6 6630 2438440 0.27 2445070 7 6828 2450372 0.28 2457200 8 6913 2473428 0.28 2480341 9 6919 2470504 0.28 2477423 10 6798 2467225 0.27 2474023 11 6845 2468752 0.28 2475597 12 6862 2449713 0.28 2456575 13 6742 2437948 0.28 2444690 14 6711 2430242 0.28 2436953 15 6782 2429153 0.28 2435935 16 6836 2438042 0.28 2444878 17 6853 2447691 0.28 2454544 18 6953 2454232 0.28 2461185 19 6965 2463790 0.28 2470755 20 6908 2469817 0.28 2476725 21 6896 2456853 0.28 2463749 22 6939 2455419 0.28 2462358 23 7028 2461841 0.28 2468869 24 7034 2444925 0.29 2451959 25 6932 2437082 0.28 2444014 26 6924 2446026 0.28 2452950 27 6857 2443107 0.28 2449964 28 7147 2451480 0.29 2458627 29 6969 2452941 0.28 2459910 30 6913 2462840 0.28 2469753 31 7061 2460718 0.29 2467779 32 7103 2460990 0.29 2468093 33 6876 2448362 0.28 2455238 34 7022 2446626 0.29 2453648 35 7000 2436892 0.29 2443892 36 6884 2442906 0.28 2449790 37 7012 2448786 0.29 2455798 38 7157 2451269 0.29 2458426 39 7030 2447460 0.29 2454490 40 6969 2448122 0.28 2455091 41 7272 2446415 0.30 2453687 42 7034 2442158 0.29 2449192 43 7179 2442505 0.29 2449684 44 7421 2450714 0.30 2458135 45 7535 2442748 0.31 2450283 46 7675 2443436 0.31 2451111 47 8211 2439984 0.34 2448195 48 8516 2447782 0.35 2456298 49 8742 2446700 0.36 2455442 50 9176 2451632 0.37 2460808 51 9175 2446263 0.37 2455438 52 9201 2449271 0.37 2458472 53 9456 2448242 0.38 2457698 54 9717 2444125 0.40 2453842 55 9380 2436678 0.38 2446058 56 9828 2438234 0.40 2448062 57 9775 2434259 0.40 2444034 58 9732 2437952 0.40 2447684 59 9995 2439602 0.41 2449597 60 10262 2444229 0.42 2454491 61 10059 2437004 0.41 2447063 62 10107 2446165 0.41 2456272 63 10318 2428100 0.42 2438418 64 10531 2434400 0.43 2444931 65 10812 2432309 0.44 2443121 66 11059 2434207 0.45 2445266 67 11022 2436713 0.45 2447735 68 11498 2433244 0.47 2444742 69 11037 2431338 0.45 2442375 70 11475 2429881 0.47 2441356 71 11555 2434820 0.47 2446375 72 11452 2430099 0.47 2441551 73 11878 2428036 0.49 2439914 74 12160 2436606 0.50 2448766 75 12060 2422650 0.50 2434710 76 12209 2423036 0.50 2435245 77 12870 2416546 0.53 2429416 78 12884 2416350 0.53 2429234 79 12803 2420726 0.53 2433529 80 13070 2428293 0.54 2441363 81 13537 2424963 0.56 2438500 82 13560 2422111 0.56 2435671 83 14028 2419372 0.58 2433400 84 14122 2413284 0.58 2427406 85 14670 2411986 0.60 2426656 86 15001 2416030 0.62 2431031 87 15117 2406187 0.62 2421304 88 15767 2409673 0.65 2425440 89 16143 2412800 0.66 2428943 90 16601 2415002 0.68 2431603 91 16954 2409680 0.70 2426634 92 17584 2414524 0.72 2432108 93 17850 2406418 0.74 2424268 94 18379 2404698 0.76 2423077 95 18963 2403352 0.78 2422315 96 19701 2398202 0.81 2417903 97 20586 2395308 0.85 2415894 98 20859 2394063 0.86 2414922 99 21722 2394524 0.90 2416246 100 22500 2396853 0.93 2419353 101 23105 2396520 0.95 2419625 102 23849 2395417 0.99 2419266 103 24704 2392519 1.02 2417223 104 25390 2388617 1.05 2414007 105 26315 2384547 1.09 2410862 106 27150 2376624 1.13 2403774 107 28205 2372986 1.17 2401191 108 29338 2365213 1.23 2394551 109 30244 2363329 1.26 2393573 110 31198 2366845 1.30 2398043 111 32298 2359506 1.35 2391804 112 33436 2360310 1.40 2393746 113 34770 2358812 1.45 2393582 114 36520 2349580 1.53 2386100 115 36882 2343679 1.55 2380561 116 38056 2342912 1.60 2380968 117 39263 2328816 1.66 2368079 118 41346 2323072 1.75 2364418 119 42185 2318761 1.79 2360946 120 43396 2315496 1.84 2358892 121 44687 2306824 1.90 2351511 122 46109 2306942 1.96 2353051 123 47267 2305255 2.01 2352522 124 48803 2298648 2.08 2347451 125 50635 2294753 2.16 2345388 126 51433 2285989 2.20 2337422 127 52766 2273252 2.27 2326018 128 54260 2269190 2.34 2323450 129 55608 2259586 2.40 2315194 130 57113 2255044 2.47 2312157 131 58486 2246529 2.54 2305015 132 60556 2238854 2.63 2299410 133 61809 2231880 2.69 2293689 134 63121 2225770 2.76 2288891 135 64538 2218790 2.83 2283328 136 67139 2214050 2.94 2281189 137 69376 2208536 3.05 2277912 138 74703 2202747 3.28 2277450 139 76196 2191279 3.36 2267475 140 75223 2181162 3.33 2256385 141 79072 2166727 3.52 2245799 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 76491 304674 20.07 381165 2 75634 301228 20.07 376862 3 75402 299637 20.11 375039 4 74612 297569 20.05 372181 5 74293 295389 20.10 369682 6 73776 294186 20.05 367962 7 73195 292217 20.03 365412 8 73560 290926 20.18 364486 9 72241 286796 20.12 359037 10 71557 284792 20.08 356349 11 71224 284082 20.05 355306 12 70184 283096 19.87 353280 13 70206 281548 19.96 351754 14 69798 280037 19.95 349835 15 69177 278825 19.88 348002 16 68684 276939 19.87 345623 17 67574 274414 19.76 341988 18 67027 271786 19.78 338813 19 66158 268071 19.79 334229 20 65672 265496 19.83 331168 21 65488 263824 19.89 329312 22 64605 261232 19.83 325837 23 63566 259344 19.69 322910 24 63096 258135 19.64 321231 25 62229 256868 19.50 319097 26 62102 254473 19.62 316575 27 61321 252120 19.56 313441 28 60846 249386 19.61 310232 29 60154 246502 19.62 306656 30 59321 245210 19.48 304531 31 58785 242760 19.49 301545 32 58399 239810 19.58 298209 33 57296 236718 19.49 294014 34 56991 235293 19.50 292284 35 56691 233777 19.52 290468 36 56058 231373 19.50 287431 37 54845 230309 19.23 285154 38 54799 227757 19.39 282556 39 54219 224814 19.43 279033 40 53781 222184 19.49 275965 41 52862 219407 19.42 272269 42 52321 217898 19.36 270219 43 52060 214764 19.51 266824 44 50948 212376 19.35 263324 45 50506 211112 19.31 261618 46 49795 209334 19.22 259129 47 49332 206555 19.28 255887 48 49021 204693 19.32 253714 49 48806 202944 19.39 251750 50 48107 200406 19.36 248513 51 47817 198065 19.45 245882 52 47469 197022 19.42 244491 53 46591 193624 19.40 240215 54 46052 192514 19.30 238566 55 45310 189845 19.27 235155 56 45151 188689 19.31 233840 57 44452 186453 19.25 230905 58 43654 184418 19.14 228072 59 43357 182214 19.22 225571 60 43125 180875 19.25 224000 61 42255 178235 19.16 220490 62 42206 176183 19.33 218389 63 41233 174047 19.15 215280 64 40975 172635 19.18 213610 65 40417 170340 19.18 210757 66 40057 169137 19.15 209194 67 39762 166981 19.23 206743 68 39506 166066 19.22 205572 69 38628 163234 19.14 201862 70 38275 161470 19.16 199745 71 37903 159965 19.16 197868 72 37498 157312 19.25 194810 73 37285 156881 19.20 194166 74 36650 154487 19.17 191137 75 35781 152773 18.98 188554 76 36131 151942 19.21 188073 77 35000 150334 18.88 185334 78 34977 148058 19.11 183035 79 34545 146479 19.08 181024 80 34075 144472 19.08 178547 81 33608 142609 19.07 176217 82 33552 139908 19.34 173460 83 32911 138988 19.15 171899 84 32554 137769 19.11 170323 85 32170 136871 19.03 169041 86 31560 134676 18.99 166236 87 31517 132544 19.21 164061 88 31132 131865 19.10 162997 89 30800 130023 19.15 160823 90 30501 128442 19.19 158943 91 29793 127085 18.99 156878 92 29460 125148 19.05 154608 93 29271 123726 19.13 152997 94 28862 122283 19.10 151145 95 28598 120732 19.15 149330 96 28287 120331 19.03 148618 97 27847 119238 18.93 147085 98 27369 116603 19.01 143972 99 27266 115395 19.11 142661 100 27026 114289 19.12 141315 101 26763 112575 19.21 139338 102 26343 111085 19.17 137428 103 25906 109285 19.16 135191 104 25591 107929 19.17 133520 105 25331 106605 19.20 131936 106 24955 105600 19.11 130555 107 24794 103814 19.28 128608 108 24205 103610 18.94 127815 109 24104 101970 19.12 126074 110 23754 101562 18.96 125316 111 23513 99596 19.10 123109 112 23195 98468 19.06 121663 113 22759 96706 19.05 119465 114 22735 95568 19.22 118303 115 22426 95224 19.06 117650 116 22006 94112 18.95 116118 117 21786 93016 18.98 114802 118 21519 91160 19.10 112679 119 21040 90638 18.84 111678 120 20927 89433 18.96 110360 121 20630 88905 18.83 109535 122 20500 87083 19.06 107583 123 19994 85843 18.89 105837 124 19941 85394 18.93 105335 125 19501 83724 18.89 103225 126 19269 82565 18.92 101834 127 19136 81376 19.04 100512 128 18795 80646 18.90 99441 129 18687 79592 19.01 98279 130 18349 78496 18.95 96845 131 18188 77673 18.97 95861 132 17905 76954 18.88 94859 133 17548 75469 18.87 93017 134 17384 75143 18.79 92527 135 17211 74116 18.85 91327 136 16877 72975 18.78 89852 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5608 510810 1.09 516418 2 4408 505959 0.86 510367 3 3282 499262 0.65 502544 4 2821 495332 0.57 498153 5 2504 492577 0.51 495081 6 2223 488834 0.45 491057 7 2376 485951 0.49 488327 8 2181 482760 0.45 484941 9 1844 480723 0.38 482567 10 1814 478923 0.38 480737 11 1756 474726 0.37 476482 12 1658 472310 0.35 473968 13 1619 470020 0.34 471639 14 1550 466759 0.33 468309 15 1559 462955 0.34 464514 16 1429 460402 0.31 461831 17 1435 458318 0.31 459753 18 1411 455411 0.31 456822 19 1396 449581 0.31 450977 20 1320 446436 0.29 447756 21 1282 443835 0.29 445117 22 1289 440553 0.29 441842 23 1278 437004 0.29 438282 24 1178 434273 0.27 435451 25 1173 430699 0.27 431872 26 1146 428421 0.27 429567 27 1214 423065 0.29 424279 28 1132 419073 0.27 420205 29 1143 416364 0.27 417507 30 1155 413258 0.28 414413 31 1116 407924 0.27 409040 32 1086 406277 0.27 407363 33 1045 401804 0.26 402849 34 1079 397616 0.27 398695 35 1059 394749 0.27 395808 36 1092 391318 0.28 392410 37 1073 386864 0.28 387937 38 1073 383985 0.28 385058 39 1040 380853 0.27 381893 40 1043 376076 0.28 377119 41 995 372370 0.27 373365 42 1035 368342 0.28 369377 43 1061 364117 0.29 365178 44 907 361214 0.25 362121 45 957 356911 0.27 357868 46 942 354623 0.26 355565 47 894 350497 0.25 351391 48 928 347484 0.27 348412 49 896 344245 0.26 345141 50 841 340827 0.25 341668 51 858 336854 0.25 337712 52 887 334253 0.26 335140 53 907 330351 0.27 331258 54 862 326377 0.26 327239 55 832 322373 0.26 323205 56 926 319208 0.29 320134 57 855 315834 0.27 316689 58 821 312873 0.26 313694 59 853 309622 0.27 310475 60 834 305224 0.27 306058 61 827 302853 0.27 303680 62 814 300238 0.27 301052 63 805 296538 0.27 297343 64 801 293532 0.27 294333 65 749 290893 0.26 291642 66 778 287082 0.27 287860 67 747 284129 0.26 284876 68 751 281631 0.27 282382 69 733 279536 0.26 280269 70 735 276944 0.26 277679 71 764 272498 0.28 273262 72 696 270140 0.26 270836 73 700 267798 0.26 268498 74 720 264894 0.27 265614 75 719 261249 0.27 261968 76 697 257565 0.27 258262 77 685 255155 0.27 255840 78 639 251958 0.25 252597 79 658 249428 0.26 250086 80 677 246550 0.27 247227 81 652 242626 0.27 243278 82 629 239090 0.26 239719 83 654 237655 0.27 238309 84 628 234189 0.27 234817 85 595 231257 0.26 231852 86 605 229318 0.26 229923 87 636 226757 0.28 227393 88 567 223175 0.25 223742 89 598 221664 0.27 222262 90 557 218647 0.25 219204 91 603 216581 0.28 217184 92 583 213511 0.27 214094 93 556 210575 0.26 211131 94 547 207973 0.26 208520 95 525 205782 0.25 206307 96 535 202994 0.26 203529 97 572 201691 0.28 202263 98 529 198643 0.27 199172 99 475 196470 0.24 196945 100 552 194654 0.28 195206 101 492 191890 0.26 192382 102 525 189689 0.28 190214 103 515 187446 0.27 187961 104 520 184538 0.28 185058 105 522 182386 0.29 182908 106 511 181152 0.28 181663 107 477 178313 0.27 178790 108 492 175828 0.28 176320 109 467 173926 0.27 174393 110 491 171933 0.28 172424 111 466 170311 0.27 170777 112 485 167544 0.29 168029 113 439 166154 0.26 166593 114 427 163233 0.26 163660 115 488 161623 0.30 162111 116 421 158473 0.26 158894 117 460 157869 0.29 158329 118 442 155645 0.28 156087 119 446 152793 0.29 153239 120 460 151111 0.30 151571 121 429 149328 0.29 149757 122 414 147713 0.28 148127 123 402 145106 0.28 145508 124 411 142918 0.29 143329 125 344 141689 0.24 142033 126 410 140797 0.29 141207 127 371 138341 0.27 138712 128 390 136379 0.29 136769 129 387 135133 0.29 135520 130 399 132973 0.30 133372 131 365 131547 0.28 131912 132 339 129495 0.26 129834 133 372 127240 0.29 127612 134 344 126192 0.27 126536 135 389 124665 0.31 125054 136 361 122285 0.29 122646 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 32684 2031946 1.58 2064630 2 22225 2035376 1.08 2057601 3 16673 2034119 0.81 2050792 4 13457 2034934 0.66 2048391 5 11743 2026436 0.58 2038179 6 10746 2014773 0.53 2025519 7 10460 2002768 0.52 2013228 8 10089 1983739 0.51 1993828 9 9612 1968982 0.49 1978594 10 9198 1950664 0.47 1959862 11 8708 1939000 0.45 1947708 12 8344 1928927 0.43 1937271 13 7990 1917369 0.41 1925359 14 7419 1905371 0.39 1912790 15 7049 1891764 0.37 1898813 16 6833 1872807 0.36 1879640 17 6508 1857563 0.35 1864071 18 6179 1841481 0.33 1847660 19 6073 1825023 0.33 1831096 20 5923 1809966 0.33 1815889 21 5690 1796923 0.32 1802613 22 5529 1782101 0.31 1787630 23 5383 1769730 0.30 1775113 24 5379 1754566 0.31 1759945 25 5218 1740629 0.30 1745847 26 5083 1723075 0.29 1728158 27 4993 1709645 0.29 1714638 28 4953 1692070 0.29 1697023 29 4747 1677820 0.28 1682567 30 4804 1660301 0.29 1665105 31 4649 1645967 0.28 1650616 32 4603 1634098 0.28 1638701 33 4634 1621041 0.29 1625675 34 4704 1607930 0.29 1612634 35 4439 1597443 0.28 1601882 36 4659 1580603 0.29 1585262 37 4384 1566393 0.28 1570777 38 4317 1552268 0.28 1556585 39 4338 1534576 0.28 1538914 40 4233 1519850 0.28 1524083 41 4267 1504638 0.28 1508905 42 4210 1488307 0.28 1492517 43 4250 1476431 0.29 1480681 44 4179 1462967 0.28 1467146 45 4082 1446588 0.28 1450670 46 4030 1436318 0.28 1440348 47 3983 1423423 0.28 1427406 48 4078 1408551 0.29 1412629 49 4058 1395029 0.29 1399087 50 3800 1379817 0.27 1383617 51 3940 1364695 0.29 1368635 52 3816 1351809 0.28 1355625 53 3951 1337406 0.29 1341357 54 3844 1324310 0.29 1328154 55 3637 1310814 0.28 1314451 56 3693 1297793 0.28 1301486 57 3616 1285804 0.28 1289420 58 3569 1270958 0.28 1274527 59 3724 1256670 0.30 1260394 60 3503 1242337 0.28 1245840 61 3477 1230155 0.28 1233632 62 3533 1216886 0.29 1220419 63 3497 1204013 0.29 1207510 64 3438 1192289 0.29 1195727 65 3511 1181031 0.30 1184542 66 3506 1171016 0.30 1174522 67 3195 1158079 0.28 1161274 68 3231 1145145 0.28 1148376 69 3431 1131774 0.30 1135205 70 3178 1118820 0.28 1121998 71 3213 1104603 0.29 1107816 72 3227 1093873 0.29 1097100 73 3295 1084414 0.30 1087709 74 3191 1075171 0.30 1078362 75 3100 1063987 0.29 1067087 76 3221 1053270 0.30 1056491 77 3132 1041781 0.30 1044913 78 3109 1027800 0.30 1030909 79 3019 1014321 0.30 1017340 80 2894 1003527 0.29 1006421 81 2914 991239 0.29 994153 82 2839 980356 0.29 983195 83 2854 967950 0.29 970804 84 3012 956136 0.31 959148 85 2828 948586 0.30 951414 86 2975 937980 0.32 940955 87 2852 926194 0.31 929046 88 2628 915963 0.29 918591 89 2665 902569 0.29 905234 90 2750 893294 0.31 896044 91 2778 880639 0.31 883417 92 2608 870467 0.30 873075 93 2716 860728 0.31 863444 94 2527 851400 0.30 853927 95 2520 841192 0.30 843712 96 2514 832487 0.30 835001 97 2456 820779 0.30 823235 98 2460 812192 0.30 814652 99 2545 802222 0.32 804767 100 2550 791621 0.32 794171 101 2341 783283 0.30 785624 102 2315 773490 0.30 775805 103 2299 763601 0.30 765900 104 2485 755167 0.33 757652 105 2359 744050 0.32 746409 106 2452 737633 0.33 740085 107 2314 729131 0.32 731445 108 2327 720516 0.32 722843 109 2233 711372 0.31 713605 110 2365 701893 0.34 704258 111 2221 691906 0.32 694127 112 2134 682260 0.31 684394 113 2199 674494 0.32 676693 114 2175 666021 0.33 668196 115 2357 657759 0.36 660116 116 2260 649847 0.35 652107 117 2084 641740 0.32 643824 118 2122 635513 0.33 637635 119 2032 627534 0.32 629566 120 2211 618606 0.36 620817 121 1921 609642 0.31 611563 122 2083 600880 0.35 602963 123 1953 592348 0.33 594301 124 2018 585791 0.34 587809 125 2070 578684 0.36 580754 126 1953 571987 0.34 573940 127 2012 564171 0.36 566183 128 1928 556813 0.35 558741 129 2084 550073 0.38 552157 130 1966 543497 0.36 545463 131 1955 535507 0.36 537462 132 1903 528134 0.36 530037 133 1817 521970 0.35 523787 134 1854 514101 0.36 515955 135 2025 507614 0.40 509639 136 2212 496710 0.44 498922