CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 102415 402839 20.27 505254 2 102075 391064 20.70 493139 3 101847 389851 20.71 491698 4 101083 391695 20.51 492778 5 100601 391553 20.44 492154 6 100646 392747 20.40 493393 7 101892 395847 20.47 497739 8 102673 404779 20.23 507452 9 104052 407023 20.36 511075 10 103279 403089 20.40 506368 11 103223 403249 20.38 506472 12 103667 400745 20.55 504412 13 104332 398899 20.73 503231 14 104230 400725 20.64 504955 15 103012 396231 20.63 499243 16 103037 392581 20.79 495618 17 102857 396424 20.60 499281 18 103907 399431 20.64 503338 19 102858 401501 20.39 504359 20 103706 401261 20.54 504967 21 103239 399795 20.52 503034 22 102119 398318 20.41 500437 23 103333 398979 20.57 502312 24 102416 394593 20.61 497009 25 103535 396104 20.72 499639 26 103260 396960 20.64 500220 27 102201 396596 20.49 498797 28 103099 398206 20.57 501305 29 103005 395981 20.64 498986 30 103565 396277 20.72 499842 31 102878 397658 20.55 500536 32 103726 401044 20.55 504770 33 102809 398084 20.53 500893 34 103246 399171 20.55 502417 35 103103 395626 20.67 498729 36 103025 394504 20.71 497529 37 102741 395748 20.61 498489 38 102753 399995 20.44 502748 39 101970 398218 20.39 500188 40 103204 396377 20.66 499581 41 102665 395494 20.61 498159 42 102793 394171 20.68 496964 43 102481 395644 20.57 498125 44 103090 396244 20.65 499334 45 102141 395316 20.53 497457 46 102489 393093 20.68 495582 47 102276 395089 20.56 497365 48 101518 393247 20.52 494765 49 102311 392475 20.68 494786 50 102278 396582 20.50 498860 51 102239 392719 20.66 494958 52 102528 394085 20.65 496613 53 102415 394526 20.61 496941 54 102966 395718 20.65 498684 55 102573 392763 20.71 495336 56 102021 393677 20.58 495698 57 102719 391314 20.79 494033 58 102023 392515 20.63 494538 59 102350 392447 20.69 494797 60 102624 392364 20.73 494988 61 102533 392268 20.72 494801 62 102554 393258 20.68 495812 63 101987 390851 20.69 492838 64 101439 390078 20.64 491517 65 101517 388735 20.71 490252 66 101833 392151 20.61 493984 67 102320 390817 20.75 493137 68 103421 393270 20.82 496691 69 102505 392730 20.70 495235 70 102261 392866 20.65 495127 71 102845 390523 20.85 493368 72 102912 389010 20.92 491922 73 102206 389159 20.80 491365 74 102403 390530 20.77 492933 75 102719 389383 20.87 492102 76 102970 390188 20.88 493158 77 102224 388465 20.83 490689 78 101759 387124 20.81 488883 79 102012 388120 20.81 490132 80 101886 388713 20.77 490599 81 102032 390274 20.73 492306 82 101981 389678 20.74 491659 83 102549 388631 20.88 491180 84 102298 388492 20.84 490790 85 102465 387011 20.93 489476 86 102675 388477 20.90 491152 87 101976 387435 20.84 489411 88 102096 388641 20.80 490737 89 102025 389672 20.75 491697 90 102606 388631 20.89 491237 91 102349 386304 20.95 488653 92 102186 386411 20.91 488597 93 102206 387941 20.85 490147 94 102582 387023 20.95 489605 95 102317 388055 20.87 490372 96 102437 384922 21.02 487359 97 101896 385323 20.91 487219 98 102859 385352 21.07 488211 99 102940 384709 21.11 487649 100 103431 385415 21.16 488846 101 102651 385718 21.02 488369 102 102768 383692 21.13 486460 103 102347 383229 21.08 485576 104 102467 381570 21.17 484037 105 102547 382335 21.15 484882 106 101951 381670 21.08 483621 107 102735 382463 21.17 485198 108 103273 381971 21.28 485244 109 102879 381917 21.22 484796 110 103014 382278 21.23 485292 111 102448 380700 21.20 483148 112 102477 381354 21.18 483831 113 102643 380026 21.27 482669 114 102622 380125 21.26 482747 115 102954 377114 21.45 480068 116 103338 380008 21.38 483346 117 102551 377625 21.36 480176 118 103436 376623 21.55 480059 119 103045 375728 21.52 478773 120 103482 374735 21.64 478217 121 103563 373956 21.69 477519 122 103239 373375 21.66 476614 123 102833 373699 21.58 476532 124 102922 372368 21.65 475290 125 103033 371186 21.73 474219 126 102639 370893 21.68 473532 127 102898 369987 21.76 472885 128 102835 369575 21.77 472410 129 103478 366650 22.01 470128 130 102183 366591 21.80 468774 131 102438 366686 21.84 469124 132 102089 364618 21.87 466707 133 101857 363803 21.87 465660 134 102451 363700 21.98 466151 135 102430 362419 22.04 464849 136 101918 360787 22.03 462705 137 101948 361966 21.98 463914 138 101934 360329 22.05 462263 139 101654 359237 22.06 460891 140 101758 358574 22.11 460332 141 107836 361465 22.98 469301 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2724 695852 0.39 698576 2 2207 695230 0.32 697437 3 1939 684483 0.28 686422 4 2108 684443 0.31 686551 5 2135 686606 0.31 688741 6 1967 688779 0.28 690746 7 2008 698087 0.29 700095 8 1836 699857 0.26 701693 9 1984 699118 0.28 701102 10 2072 700354 0.29 702426 11 1824 701139 0.26 702963 12 1988 703619 0.28 705607 13 2050 703344 0.29 705394 14 1992 695891 0.29 697883 15 1911 690238 0.28 692149 16 1904 691328 0.27 693232 17 2384 696977 0.34 699361 18 1932 694393 0.28 696325 19 2036 699678 0.29 701714 20 2033 702746 0.29 704779 21 1957 698380 0.28 700337 22 2037 692812 0.29 694849 23 1939 695953 0.28 697892 24 1909 696739 0.27 698648 25 1955 696030 0.28 697985 26 1919 696428 0.27 698347 27 1911 695490 0.27 697401 28 2019 694652 0.29 696671 29 1949 694800 0.28 696749 30 1967 697075 0.28 699042 31 1996 698844 0.28 700840 32 2072 700389 0.29 702461 33 1909 691605 0.28 693514 34 1972 695013 0.28 696985 35 1978 694583 0.28 696561 36 1981 690988 0.29 692969 37 1976 695025 0.28 697001 38 2018 690324 0.29 692342 39 1863 688681 0.27 690544 40 1945 691204 0.28 693149 41 2007 694146 0.29 696153 42 2044 695028 0.29 697072 43 1925 692992 0.28 694917 44 2084 691468 0.30 693552 45 2074 689225 0.30 691299 46 2063 696214 0.30 698277 47 2122 690009 0.31 692131 48 2164 694182 0.31 696346 49 2263 689946 0.33 692209 50 2322 690502 0.34 692824 51 2287 689223 0.33 691510 52 2297 693738 0.33 696035 53 2351 696533 0.34 698884 54 2330 692514 0.34 694844 55 2358 687460 0.34 689818 56 2440 687434 0.35 689874 57 2594 686294 0.38 688888 58 2442 688046 0.35 690488 59 2423 687726 0.35 690149 60 2533 688805 0.37 691338 61 2577 687481 0.37 690058 62 2577 690666 0.37 693243 63 2676 689957 0.39 692633 64 2809 687900 0.41 690709 65 2777 690641 0.40 693418 66 2692 690122 0.39 692814 67 2919 688489 0.42 691408 68 2995 691316 0.43 694311 69 2883 687208 0.42 690091 70 2753 687220 0.40 689973 71 2866 688393 0.41 691259 72 2951 685561 0.43 688512 73 2922 683761 0.43 686683 74 3135 688711 0.45 691846 75 3158 688161 0.46 691319 76 3107 687843 0.45 690950 77 3373 686638 0.49 690011 78 3259 683334 0.47 686593 79 3238 683779 0.47 687017 80 3463 685442 0.50 688905 81 3379 685526 0.49 688905 82 3478 685184 0.51 688662 83 3640 684666 0.53 688306 84 3588 684929 0.52 688517 85 3674 684734 0.53 688408 86 3862 685766 0.56 689628 87 3922 679701 0.57 683623 88 3912 684116 0.57 688028 89 4123 684373 0.60 688496 90 4223 681053 0.62 685276 91 4234 679421 0.62 683655 92 4391 682997 0.64 687388 93 4499 680859 0.66 685358 94 4715 681731 0.69 686446 95 4917 681199 0.72 686116 96 4952 678153 0.72 683105 97 4984 677206 0.73 682190 98 5182 679794 0.76 684976 99 5410 674862 0.80 680272 100 5565 675493 0.82 681058 101 5719 673578 0.84 679297 102 5765 675347 0.85 681112 103 5907 671548 0.87 677455 104 6307 674509 0.93 680816 105 6388 674014 0.94 680402 106 6541 677038 0.96 683579 107 6886 672307 1.01 679193 108 7164 672281 1.05 679445 109 7160 666859 1.06 674019 110 7594 670609 1.12 678203 111 7678 668115 1.14 675793 112 7965 669389 1.18 677354 113 8128 665587 1.21 673715 114 8535 664513 1.27 673048 115 8650 666794 1.28 675444 116 8913 664162 1.32 673075 117 9265 662161 1.38 671426 118 9801 660181 1.46 669982 119 9929 659333 1.48 669262 120 10173 657996 1.52 668169 121 10415 655474 1.56 665889 122 10963 657474 1.64 668437 123 11105 652836 1.67 663941 124 11471 651535 1.73 663006 125 11617 651333 1.75 662950 126 12000 648175 1.82 660175 127 12316 646492 1.87 658808 128 12616 645973 1.92 658589 129 13148 642636 2.00 655784 130 13292 640117 2.03 653409 131 13428 637386 2.06 650814 132 13856 636295 2.13 650151 133 14412 636285 2.21 650697 134 14241 634951 2.19 649192 135 14951 631957 2.31 646908 136 15263 631747 2.36 647010 137 16038 627055 2.49 643093 138 16541 629610 2.56 646151 139 17405 625712 2.71 643117 140 25493 631482 3.88 656975 141 25384 627283 3.89 652667 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 10886 2944648 0.37 2955534 2 9735 2942641 0.33 2952376 3 8519 2920580 0.29 2929099 4 8588 2916779 0.29 2925367 5 9176 2900611 0.32 2909787 6 8381 2896728 0.29 2905109 7 8983 2911449 0.31 2920432 8 8174 2937081 0.28 2945255 9 8629 2933224 0.29 2941853 10 8877 2925885 0.30 2934762 11 8079 2932968 0.27 2941047 12 8768 2906339 0.30 2915107 13 8088 2890420 0.28 2898508 14 8905 2883822 0.31 2892727 15 7951 2885779 0.27 2893730 16 8226 2890488 0.28 2898714 17 8397 2904428 0.29 2912825 18 8571 2908992 0.29 2917563 19 8319 2914594 0.28 2922913 20 8539 2922827 0.29 2931366 21 8226 2910701 0.28 2918927 22 9091 2905388 0.31 2914479 23 8192 2916145 0.28 2924337 24 8088 2899312 0.28 2907400 25 8179 2893310 0.28 2901489 26 8270 2896313 0.28 2904583 27 8209 2894284 0.28 2902493 28 8239 2898475 0.28 2906714 29 8040 2905470 0.28 2913510 30 8224 2912791 0.28 2921015 31 8197 2908099 0.28 2916296 32 8627 2910768 0.30 2919395 33 8296 2897617 0.29 2905913 34 8287 2895800 0.29 2904087 35 8228 2886376 0.28 2894604 36 8189 2898241 0.28 2906430 37 8148 2901067 0.28 2909215 38 8425 2906201 0.29 2914626 39 8428 2898500 0.29 2906928 40 8278 2898344 0.28 2906622 41 8491 2895217 0.29 2903708 42 8456 2888396 0.29 2896852 43 8493 2887418 0.29 2895911 44 8706 2901472 0.30 2910178 45 8866 2891088 0.31 2899954 46 9236 2896199 0.32 2905435 47 9372 2889895 0.32 2899267 48 9766 2895522 0.34 2905288 49 10013 2891756 0.35 2901769 50 10240 2899385 0.35 2909625 51 10412 2888713 0.36 2899125 52 10344 2894545 0.36 2904889 53 10657 2894321 0.37 2904978 54 10664 2888996 0.37 2899660 55 10646 2882513 0.37 2893159 56 10921 2887581 0.38 2898502 57 10896 2884739 0.38 2895635 58 11251 2885572 0.39 2896823 59 11063 2890394 0.38 2901457 60 11489 2887179 0.40 2898668 61 11168 2886582 0.39 2897750 62 11591 2889903 0.40 2901494 63 11776 2874568 0.41 2886344 64 12099 2879908 0.42 2892007 65 12183 2880156 0.42 2892339 66 12614 2882360 0.44 2894974 67 12844 2883231 0.44 2896075 68 12954 2885483 0.45 2898437 69 12623 2877258 0.44 2889881 70 12811 2875719 0.44 2888530 71 13073 2875784 0.45 2888857 72 13099 2876438 0.45 2889537 73 13570 2874575 0.47 2888145 74 13757 2884819 0.47 2898576 75 13877 2869330 0.48 2883207 76 14128 2868779 0.49 2882907 77 14556 2867279 0.51 2881835 78 14589 2865609 0.51 2880198 79 14927 2866415 0.52 2881342 80 15160 2871551 0.53 2886711 81 15268 2864478 0.53 2879746 82 15724 2864262 0.55 2879986 83 15977 2862702 0.56 2878679 84 16498 2858039 0.57 2874537 85 16984 2856882 0.59 2873866 86 17305 2863793 0.60 2881098 87 17696 2851072 0.62 2868768 88 18021 2856806 0.63 2874827 89 18825 2853509 0.66 2872334 90 18817 2854231 0.65 2873048 91 19630 2851577 0.68 2871207 92 20232 2855217 0.70 2875449 93 20837 2846393 0.73 2867230 94 21499 2845284 0.75 2866783 95 22106 2849078 0.77 2871184 96 22598 2841172 0.79 2863770 97 23522 2837951 0.82 2861473 98 24141 2836607 0.84 2860748 99 24739 2833287 0.87 2858026 100 25461 2840000 0.89 2865461 101 26646 2838962 0.93 2865608 102 27233 2835708 0.95 2862941 103 28054 2828529 0.98 2856583 104 29143 2830522 1.02 2859665 105 29974 2826344 1.05 2856318 106 30774 2816935 1.08 2847709 107 31399 2812761 1.10 2844160 108 33006 2805132 1.16 2838138 109 33919 2803875 1.20 2837794 110 34989 2808680 1.23 2843669 111 35927 2796677 1.27 2832604 112 37093 2795074 1.31 2832167 113 38462 2791573 1.36 2830035 114 40508 2785931 1.43 2826439 115 40893 2782669 1.45 2823562 116 42007 2782140 1.49 2824147 117 43291 2767846 1.54 2811137 118 44960 2766724 1.60 2811684 119 45725 2758617 1.63 2804342 120 47349 2750886 1.69 2798235 121 48627 2743219 1.74 2791846 122 49950 2746084 1.79 2796034 123 51558 2736882 1.85 2788440 124 52754 2734438 1.89 2787192 125 53775 2729409 1.93 2783184 126 55641 2718199 2.01 2773840 127 57294 2710677 2.07 2767971 128 58136 2707796 2.10 2765932 129 60051 2695362 2.18 2755413 130 61643 2692640 2.24 2754283 131 63292 2682711 2.30 2746003 132 64900 2674077 2.37 2738977 133 66574 2660817 2.44 2727391 134 67229 2665045 2.46 2732274 135 69757 2654894 2.56 2724651 136 71598 2648925 2.63 2720523 137 74167 2646658 2.73 2720825 138 80407 2637780 2.96 2718187 139 81947 2625656 3.03 2707603 140 80992 2619650 3.00 2700642 141 85892 2606949 3.19 2692841 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 95276 346127 21.58 441403 2 93554 341933 21.48 435487 3 93246 339758 21.53 433004 4 92758 337170 21.58 429928 5 92399 335234 21.61 427633 6 91777 334615 21.52 426392 7 91372 332372 21.56 423744 8 90438 331665 21.43 422103 9 90121 330211 21.44 420332 10 89657 328177 21.46 417834 11 89986 327317 21.56 417303 12 88645 326061 21.38 414706 13 87740 325079 21.25 412819 14 87402 324456 21.22 411858 15 87139 323112 21.24 410251 16 86102 322228 21.09 408330 17 85435 320160 21.06 405595 18 84976 317278 21.12 402254 19 84140 315104 21.07 399244 20 83331 312177 21.07 395508 21 83620 309874 21.25 393494 22 81976 307883 21.03 389859 23 81355 306890 20.95 388245 24 81327 304034 21.10 385361 25 80215 304401 20.86 384616 26 79429 302310 20.81 381739 27 79087 298633 20.94 377720 28 79024 296024 21.07 375048 29 77406 293744 20.86 371150 30 76827 290869 20.89 367696 31 76106 289250 20.83 365356 32 75829 286950 20.90 362779 33 75143 284902 20.87 360045 34 74800 283401 20.88 358201 35 73937 280086 20.88 354023 36 73003 278952 20.74 351955 37 72602 276472 20.80 349074 38 71954 274940 20.74 346894 39 71112 271834 20.74 342946 40 70351 269199 20.72 339550 41 69868 267353 20.72 337221 42 69349 264113 20.80 333462 43 68768 262406 20.76 331174 44 68106 259468 20.79 327574 45 67326 258256 20.68 325582 46 66427 255776 20.62 322203 47 65968 253788 20.63 319756 48 65260 251474 20.60 316734 49 65024 248432 20.74 313456 50 64421 247255 20.67 311676 51 63093 244015 20.54 307108 52 62552 242402 20.51 304954 53 63029 239366 20.84 302395 54 61943 238742 20.60 300685 55 60686 235735 20.47 296421 56 60317 232757 20.58 293074 57 59712 230865 20.55 290577 58 59079 228840 20.52 287919 59 59181 227118 20.67 286299 60 58379 225111 20.59 283490 61 57473 221847 20.58 279320 62 56972 220219 20.55 277191 63 56256 217161 20.58 273417 64 55479 215160 20.50 270639 65 55322 213848 20.55 269170 66 54477 210872 20.53 265349 67 54131 209353 20.54 263484 68 53441 207764 20.46 261205 69 52667 205480 20.40 258147 70 52833 202759 20.67 255592 71 51472 201485 20.35 252957 72 51325 199538 20.46 250863 73 50633 197159 20.43 247792 74 50222 195999 20.40 246221 75 49547 193417 20.39 242964 76 49270 191669 20.45 240939 77 48625 189618 20.41 238243 78 48461 187582 20.53 236043 79 47764 184955 20.52 232719 80 47327 183329 20.52 230656 81 46551 181314 20.43 227865 82 46029 178542 20.50 224571 83 45343 177044 20.39 222387 84 45042 175562 20.42 220604 85 44654 173117 20.51 217771 86 44317 171728 20.51 216045 87 43414 170361 20.31 213775 88 42957 168236 20.34 211193 89 42440 166381 20.32 208821 90 41577 164552 20.17 206129 91 41658 162993 20.36 204651 92 41056 159663 20.45 200719 93 40603 158076 20.44 198679 94 40050 156877 20.34 196927 95 39788 154586 20.47 194374 96 39110 154099 20.24 193209 97 38579 152267 20.21 190846 98 38454 150434 20.36 188888 99 37840 149113 20.24 186953 100 36975 146895 20.11 183870 101 37001 144928 20.34 181929 102 36760 143299 20.42 180059 103 35522 141666 20.05 177188 104 35337 140082 20.14 175419 105 35238 138413 20.29 173651 106 34667 136577 20.24 171244 107 33951 135908 19.99 169859 108 33726 133338 20.19 167064 109 33400 132499 20.13 165899 110 32919 130820 20.10 163739 111 32771 129084 20.25 161855 112 32236 127218 20.22 159454 113 31622 125161 20.17 156783 114 31396 124757 20.11 156153 115 31407 123121 20.32 154528 116 30648 121630 20.13 152278 117 30204 119710 20.15 149914 118 29752 119152 19.98 148904 119 29692 117082 20.23 146774 120 29352 116273 20.16 145625 121 28846 115021 20.05 143867 122 28479 113227 20.10 141706 123 28367 112237 20.18 140604 124 27969 110501 20.20 138470 125 27448 109404 20.06 136852 126 27048 107760 20.06 134808 127 26597 106170 20.03 132767 128 26487 105293 20.10 131780 129 26011 103439 20.09 129450 130 25712 102730 20.02 128442 131 25340 100370 20.16 125710 132 25176 99704 20.16 124880 133 24504 98996 19.84 123500 134 24241 97388 19.93 121629 135 23955 96071 19.96 120026 136 23356 94888 19.75 118244 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 11641 596098 1.92 607739 2 8920 590759 1.49 599679 3 6717 586625 1.13 593342 4 5573 584587 0.94 590160 5 4589 579602 0.79 584191 6 4072 578851 0.70 582923 7 3921 576024 0.68 579945 8 3359 572805 0.58 576164 9 3031 570980 0.53 574011 10 2770 569839 0.48 572609 11 2688 567111 0.47 569799 12 2487 565595 0.44 568082 13 2393 562061 0.42 564454 14 2166 558594 0.39 560760 15 2103 556822 0.38 558925 16 2023 555929 0.36 557952 17 1917 553349 0.35 555266 18 1813 550091 0.33 551904 19 1773 547071 0.32 548844 20 1704 542746 0.31 544450 21 1655 539882 0.31 541537 22 1621 537133 0.30 538754 23 1544 531201 0.29 532745 24 1569 529647 0.30 531216 25 1498 526201 0.28 527699 26 1523 522857 0.29 524380 27 1427 518694 0.27 520121 28 1427 515913 0.28 517340 29 1480 512490 0.29 513970 30 1324 507110 0.26 508434 31 1352 504102 0.27 505454 32 1397 501634 0.28 503031 33 1384 497326 0.28 498710 34 1355 492764 0.27 494119 35 1344 490513 0.27 491857 36 1242 486492 0.25 487734 37 1280 482928 0.26 484208 38 1201 478018 0.25 479219 39 1271 475144 0.27 476415 40 1293 469349 0.27 470642 41 1220 465512 0.26 466732 42 1207 461132 0.26 462339 43 1213 457509 0.26 458722 44 1307 454106 0.29 455413 45 1231 448827 0.27 450058 46 1164 445963 0.26 447127 47 1204 443346 0.27 444550 48 1175 437895 0.27 439070 49 1176 434246 0.27 435422 50 1110 431125 0.26 432235 51 1173 427789 0.27 428962 52 1201 423823 0.28 425024 53 1086 419324 0.26 420410 54 1124 415503 0.27 416627 55 1033 411440 0.25 412473 56 1089 406777 0.27 407866 57 1059 403137 0.26 404196 58 1088 398239 0.27 399327 59 1070 396051 0.27 397121 60 1021 391809 0.26 392830 61 1036 389499 0.27 390535 62 986 385191 0.26 386177 63 1016 380968 0.27 381984 64 1026 377848 0.27 378874 65 987 373054 0.26 374041 66 1000 369828 0.27 370828 67 958 366981 0.26 367939 68 978 364104 0.27 365082 69 944 360153 0.26 361097 70 912 355544 0.26 356456 71 944 351803 0.27 352747 72 908 349328 0.26 350236 73 920 345185 0.27 346105 74 896 341872 0.26 342768 75 887 339376 0.26 340263 76 889 335313 0.26 336202 77 976 330636 0.29 331612 78 850 326176 0.26 327026 79 864 324060 0.27 324924 80 853 320194 0.27 321047 81 869 316509 0.27 317378 82 893 313030 0.28 313923 83 781 309137 0.25 309918 84 786 306045 0.26 306831 85 780 302088 0.26 302868 86 774 299219 0.26 299993 87 811 296044 0.27 296855 88 785 293156 0.27 293941 89 782 290436 0.27 291218 90 771 287574 0.27 288345 91 732 282895 0.26 283627 92 748 280552 0.27 281300 93 782 276474 0.28 277256 94 726 272694 0.27 273420 95 668 270786 0.25 271454 96 676 267582 0.25 268258 97 693 265069 0.26 265762 98 738 262293 0.28 263031 99 693 258303 0.27 258996 100 723 255140 0.28 255863 101 653 253124 0.26 253777 102 635 249815 0.25 250450 103 655 246881 0.26 247536 104 715 244023 0.29 244738 105 628 240808 0.26 241436 106 667 238612 0.28 239279 107 644 235304 0.27 235948 108 670 232914 0.29 233584 109 608 229645 0.26 230253 110 624 227311 0.27 227935 111 601 224594 0.27 225195 112 591 221990 0.27 222581 113 595 219401 0.27 219996 114 566 216329 0.26 216895 115 623 214136 0.29 214759 116 562 211363 0.27 211925 117 537 208473 0.26 209010 118 558 205550 0.27 206108 119 559 203692 0.27 204251 120 542 201090 0.27 201632 121 521 199040 0.26 199561 122 501 195937 0.26 196438 123 534 193805 0.27 194339 124 570 191062 0.30 191632 125 505 189117 0.27 189622 126 544 186618 0.29 187162 127 508 184251 0.27 184759 128 519 182151 0.28 182670 129 477 180068 0.26 180545 130 472 176970 0.27 177442 131 473 175909 0.27 176382 132 536 172589 0.31 173125 133 482 170819 0.28 171301 134 485 168252 0.29 168737 135 499 166291 0.30 166790 136 517 161880 0.32 162397 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 70771 2429356 2.83 2500127 2 49912 2435699 2.01 2485611 3 37663 2438067 1.52 2475730 4 29220 2443153 1.18 2472373 5 24295 2440518 0.99 2464813 6 20822 2432298 0.85 2453120 7 18828 2424140 0.77 2442968 8 17286 2412937 0.71 2430223 9 15773 2396113 0.65 2411886 10 14417 2380935 0.60 2395352 11 13643 2371195 0.57 2384838 12 12708 2357944 0.54 2370652 13 11760 2348373 0.50 2360133 14 11015 2337099 0.47 2348114 15 10504 2324363 0.45 2334867 16 9942 2304611 0.43 2314553 17 9357 2292361 0.41 2301718 18 8840 2275682 0.39 2284522 19 8380 2262558 0.37 2270938 20 8098 2247929 0.36 2256027 21 7710 2232351 0.34 2240061 22 7464 2217598 0.34 2225062 23 7167 2203415 0.32 2210582 24 6774 2191682 0.31 2198456 25 6541 2174577 0.30 2181118 26 6406 2160904 0.30 2167310 27 6561 2144929 0.30 2151490 28 6327 2128622 0.30 2134949 29 5912 2113579 0.28 2119491 30 6090 2095050 0.29 2101140 31 5851 2080234 0.28 2086085 32 5914 2064555 0.29 2070469 33 5972 2051636 0.29 2057608 34 5869 2036799 0.29 2042668 35 5622 2020793 0.28 2026415 36 5774 2006961 0.29 2012735 37 5632 1989470 0.28 1995102 38 5576 1975977 0.28 1981553 39 5585 1960378 0.28 1965963 40 5307 1941206 0.27 1946513 41 5318 1924020 0.28 1929338 42 5278 1907943 0.28 1913221 43 5348 1891585 0.28 1896933 44 5313 1875507 0.28 1880820 45 5282 1863413 0.28 1868695 46 5293 1846601 0.29 1851894 47 5245 1831704 0.29 1836949 48 5155 1812018 0.28 1817173 49 5055 1797979 0.28 1803034 50 4842 1782219 0.27 1787061 51 5027 1767214 0.28 1772241 52 5004 1747219 0.29 1752223 53 4892 1735062 0.28 1739954 54 4917 1718549 0.29 1723466 55 4969 1702902 0.29 1707871 56 4794 1688367 0.28 1693161 57 4719 1673639 0.28 1678358 58 4741 1659889 0.28 1664630 59 4729 1642956 0.29 1647685 60 4657 1625023 0.29 1629680 61 4588 1610862 0.28 1615450 62 4493 1596680 0.28 1601173 63 4419 1580051 0.28 1584470 64 4568 1567713 0.29 1572281 65 4489 1552674 0.29 1557163 66 4630 1536868 0.30 1541498 67 4277 1522466 0.28 1526743 68 4330 1507508 0.29 1511838 69 4499 1490303 0.30 1494802 70 4122 1476004 0.28 1480126 71 4169 1462978 0.28 1467147 72 4181 1446713 0.29 1450894 73 4207 1431647 0.29 1435854 74 4230 1418045 0.30 1422275 75 3977 1402565 0.28 1406542 76 4148 1391699 0.30 1395847 77 3942 1374608 0.29 1378550 78 3986 1362913 0.29 1366899 79 3986 1346269 0.30 1350255 80 3926 1331747 0.29 1335673 81 3836 1318033 0.29 1321869 82 3786 1304884 0.29 1308670 83 3804 1288149 0.29 1291953 84 3937 1275916 0.31 1279853 85 3855 1261891 0.30 1265746 86 3727 1249937 0.30 1253664 87 3761 1234581 0.30 1238342 88 3642 1220305 0.30 1223947 89 3601 1206736 0.30 1210337 90 3586 1192607 0.30 1196193 91 3702 1181690 0.31 1185392 92 3435 1169041 0.29 1172476 93 3601 1153350 0.31 1156951 94 3435 1141157 0.30 1144592 95 3319 1127942 0.29 1131261 96 3391 1116179 0.30 1119570 97 3271 1102317 0.30 1105588 98 3283 1091005 0.30 1094288 99 3224 1077678 0.30 1080902 100 3296 1065713 0.31 1069009 101 3170 1054016 0.30 1057186 102 3206 1041259 0.31 1044465 103 3057 1027854 0.30 1030911 104 3321 1018086 0.33 1021407 105 3219 1004107 0.32 1007326 106 3246 993674 0.33 996920 107 3148 981404 0.32 984552 108 3013 968071 0.31 971084 109 3047 958273 0.32 961320 110 3170 946308 0.33 949478 111 2871 935092 0.31 937963 112 2887 923442 0.31 926329 113 2816 912958 0.31 915774 114 2865 903370 0.32 906235 115 3210 891268 0.36 894478 116 2897 880788 0.33 883685 117 2864 870330 0.33 873194 118 2686 857963 0.31 860649 119 2870 848013 0.34 850883 120 2885 836263 0.34 839148 121 2653 826487 0.32 829140 122 2673 816229 0.33 818902 123 2612 806558 0.32 809170 124 2633 795163 0.33 797796 125 2694 786176 0.34 788870 126 2619 776557 0.34 779176 127 2592 766175 0.34 768767 128 2676 755615 0.35 758291 129 2676 746469 0.36 749145 130 2562 738136 0.35 740698 131 2655 728029 0.36 730684 132 2523 719167 0.35 721690 133 2528 710053 0.35 712581 134 2424 700381 0.34 702805 135 2746 691365 0.40 694111 136 2873 677958 0.42 680831