CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 86238 362002 19.24 448240 2 86305 352036 19.69 438341 3 85536 352814 19.51 438350 4 85315 356154 19.33 441469 5 84829 355708 19.26 440537 6 86656 359184 19.44 445840 7 86720 359735 19.42 446455 8 87369 368584 19.16 455953 9 88653 368751 19.38 457404 10 87051 365231 19.25 452282 11 88083 366536 19.38 454619 12 87954 365367 19.40 453321 13 88398 362515 19.60 450913 14 88745 365810 19.52 454555 15 88173 362795 19.55 450968 16 87475 360276 19.54 447751 17 87881 363503 19.47 451384 18 87683 364028 19.41 451711 19 88506 365517 19.49 454023 20 88557 366138 19.48 454695 21 87724 366063 19.33 453787 22 87618 362767 19.45 450385 23 87120 364772 19.28 451892 24 88202 360458 19.66 448660 25 87699 362594 19.48 450293 26 87803 362361 19.50 450164 27 88149 362862 19.54 451011 28 88597 364515 19.55 453112 29 87919 362249 19.53 450168 30 87931 362508 19.52 450439 31 87934 363843 19.46 451777 32 88779 367428 19.46 456207 33 87875 364332 19.43 452207 34 89027 365637 19.58 454664 35 87590 363751 19.41 451341 36 88571 362671 19.63 451242 37 87631 362664 19.46 450295 38 88686 366119 19.50 454805 39 87025 364318 19.28 451343 40 88422 363233 19.58 451655 41 87933 362030 19.54 449963 42 87960 360499 19.61 448459 43 88181 363102 19.54 451283 44 88652 364145 19.58 452797 45 88127 362282 19.57 450409 46 87828 362225 19.52 450053 47 87962 361309 19.58 449271 48 87657 360042 19.58 447699 49 87832 359556 19.63 447388 50 87904 364445 19.43 452349 51 87736 359128 19.63 446864 52 88126 360822 19.63 448948 53 88368 362400 19.60 450768 54 88308 361999 19.61 450307 55 88032 359650 19.66 447682 56 88329 360875 19.66 449204 57 88101 361089 19.61 449190 58 87758 361687 19.53 449445 59 88036 361562 19.58 449598 60 87683 359385 19.61 447068 61 88051 359879 19.66 447930 62 87440 360719 19.51 448159 63 87475 357749 19.65 445224 64 87870 358111 19.70 445981 65 87382 356038 19.71 443420 66 87485 360611 19.52 448096 67 87732 359790 19.60 447522 68 88537 361178 19.69 449715 69 88754 360724 19.75 449478 70 88278 360755 19.66 449033 71 87767 358410 19.67 446177 72 87708 358241 19.67 445949 73 87626 357080 19.70 444706 74 88317 360404 19.68 448721 75 87774 356549 19.75 444323 76 88430 358598 19.78 447028 77 87904 357220 19.75 445124 78 87669 357565 19.69 445234 79 88290 354933 19.92 443223 80 87851 356310 19.78 444161 81 88287 357437 19.81 445724 82 88070 357480 19.77 445550 83 88198 357813 19.77 446011 84 88151 357387 19.79 445538 85 87752 357695 19.70 445447 86 88820 357846 19.89 446666 87 88279 355412 19.90 443691 88 87854 357748 19.72 445602 89 87372 357026 19.66 444398 90 87855 355847 19.80 443702 91 87871 354640 19.86 442511 92 87882 356052 19.80 443934 93 87518 357094 19.68 444612 94 87341 354089 19.79 441430 95 87941 357717 19.73 445658 96 88605 354190 20.01 442795 97 88197 354037 19.94 442234 98 88210 354004 19.95 442214 99 87853 354225 19.87 442078 100 88400 353418 20.01 441818 101 88503 354379 19.98 442882 102 87918 353831 19.90 441749 103 87714 352754 19.91 440468 104 87847 351332 20.00 439179 105 87948 350933 20.04 438881 106 87516 352322 19.90 439838 107 88516 352798 20.06 441314 108 87801 351234 20.00 439035 109 88096 352564 19.99 440660 110 88703 354092 20.03 442795 111 88462 349536 20.20 437998 112 88316 351058 20.10 439374 113 88218 349832 20.14 438050 114 88768 349556 20.25 438324 115 88105 348086 20.20 436191 116 88215 350876 20.09 439091 117 87812 348163 20.14 435975 118 88478 348372 20.25 436850 119 88613 347767 20.31 436380 120 88279 346579 20.30 434858 121 88562 344499 20.45 433061 122 88927 345567 20.47 434494 123 87637 344551 20.28 432188 124 89039 345334 20.50 434373 125 87556 345372 20.22 432928 126 88646 342920 20.54 431566 127 87825 343658 20.35 431483 128 88498 343229 20.50 431727 129 88113 341727 20.50 429840 130 87868 340937 20.49 428805 131 87333 339411 20.46 426744 132 87935 339286 20.58 427221 133 87065 336559 20.55 423624 134 87874 338330 20.62 426204 135 87050 339419 20.41 426469 136 86829 335806 20.54 422635 137 87732 336245 20.69 423977 138 87423 337383 20.58 424806 139 86825 336428 20.51 423253 140 87501 335237 20.70 422738 141 90848 335927 21.29 426775 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2004 626407 0.32 628411 2 1577 629364 0.25 630941 3 1467 618905 0.24 620372 4 1562 618729 0.25 620291 5 1558 624267 0.25 625825 6 1451 624536 0.23 625987 7 1470 634389 0.23 635859 8 1535 634341 0.24 635876 9 1537 634693 0.24 636230 10 1470 637505 0.23 638975 11 1541 637143 0.24 638684 12 1485 639327 0.23 640812 13 1530 640868 0.24 642398 14 1468 633558 0.23 635026 15 1522 628865 0.24 630387 16 1585 628827 0.25 630412 17 1524 636202 0.24 637726 18 1571 634141 0.25 635712 19 1522 641075 0.24 642597 20 1543 639490 0.24 641033 21 1578 635256 0.25 636834 22 1485 626865 0.24 628350 23 1608 633761 0.25 635369 24 1535 635018 0.24 636553 25 1504 632978 0.24 634482 26 1549 637934 0.24 639483 27 1548 635444 0.24 636992 28 1558 634306 0.25 635864 29 1587 634819 0.25 636406 30 1558 635183 0.24 636741 31 1566 637060 0.25 638626 32 1652 641128 0.26 642780 33 1570 630158 0.25 631728 34 1600 635372 0.25 636972 35 1617 634360 0.25 635977 36 1566 632362 0.25 633928 37 1546 634595 0.24 636141 38 1519 631526 0.24 633045 39 1513 630666 0.24 632179 40 1572 632983 0.25 634555 41 1579 634360 0.25 635939 42 1607 637429 0.25 639036 43 1540 632625 0.24 634165 44 1606 628450 0.25 630056 45 1577 627460 0.25 629037 46 1654 637078 0.26 638732 47 1639 629941 0.26 631580 48 1694 637708 0.26 639402 49 1870 630814 0.30 632684 50 1841 629676 0.29 631517 51 1874 627942 0.30 629816 52 1858 632493 0.29 634351 53 1923 636586 0.30 638509 54 1947 634104 0.31 636051 55 1937 626903 0.31 628840 56 1998 629236 0.32 631234 57 2020 629030 0.32 631050 58 1902 629088 0.30 630990 59 1986 629661 0.31 631647 60 2030 628399 0.32 630429 61 1981 627782 0.31 629763 62 2171 630445 0.34 632616 63 2092 631056 0.33 633148 64 2227 628919 0.35 631146 65 2226 630688 0.35 632914 66 2246 630361 0.36 632607 67 2282 628590 0.36 630872 68 2303 632616 0.36 634919 69 2240 627662 0.36 629902 70 2184 628720 0.35 630904 71 2262 628158 0.36 630420 72 2204 624644 0.35 626848 73 2422 624485 0.39 626907 74 2494 631154 0.39 633648 75 2406 630246 0.38 632652 76 2525 629872 0.40 632397 77 2512 629636 0.40 632148 78 2560 626504 0.41 629064 79 2565 623559 0.41 626124 80 2555 626134 0.41 628689 81 2716 627565 0.43 630281 82 2702 627467 0.43 630169 83 2766 624722 0.44 627488 84 2811 625436 0.45 628247 85 2958 625299 0.47 628257 86 2979 626762 0.47 629741 87 3009 622620 0.48 625629 88 3115 624219 0.50 627334 89 3204 623359 0.51 626563 90 3244 623201 0.52 626445 91 3281 620555 0.53 623836 92 3350 623620 0.53 626970 93 3503 621455 0.56 624958 94 3553 624743 0.57 628296 95 3633 623031 0.58 626664 96 3719 621788 0.59 625507 97 3787 619351 0.61 623138 98 3879 622302 0.62 626181 99 4089 617235 0.66 621324 100 4134 617371 0.67 621505 101 4265 617171 0.69 621436 102 4405 620293 0.71 624698 103 4443 614977 0.72 619420 104 4627 618115 0.74 622742 105 4740 617013 0.76 621753 106 4997 620893 0.80 625890 107 4989 617285 0.80 622274 108 5253 615298 0.85 620551 109 5306 611625 0.86 616931 110 5611 616139 0.90 621750 111 5560 611222 0.90 616782 112 5766 614111 0.93 619877 113 6020 609862 0.98 615882 114 6277 611519 1.02 617796 115 6347 609968 1.03 616315 116 6568 609994 1.07 616562 117 6664 608166 1.08 614830 118 7057 609262 1.15 616319 119 7176 606585 1.17 613761 120 7203 604038 1.18 611241 121 7457 602745 1.22 610202 122 7656 604611 1.25 612267 123 7928 602636 1.30 610564 124 7946 599886 1.31 607832 125 8218 599012 1.35 607230 126 8524 599086 1.40 607610 127 8698 595715 1.44 604413 128 8748 594577 1.45 603325 129 9042 592985 1.50 602027 130 9287 592214 1.54 601501 131 9534 590567 1.59 600101 132 9586 588099 1.60 597685 133 9999 590044 1.67 600043 134 9894 590392 1.65 600286 135 10290 587970 1.72 598260 136 10508 585598 1.76 596106 137 11256 584296 1.89 595552 138 11295 584729 1.90 596024 139 11975 582350 2.01 594325 140 17279 587601 2.86 604880 141 17251 583467 2.87 600718 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7333 2655256 0.28 2662589 2 6268 2657314 0.24 2663582 3 6093 2636127 0.23 2642220 4 6080 2639087 0.23 2645167 5 6089 2628645 0.23 2634734 6 5857 2627826 0.22 2633683 7 6237 2629167 0.24 2635404 8 6195 2650418 0.23 2656613 9 6163 2643941 0.23 2650104 10 6199 2639840 0.23 2646039 11 6103 2644802 0.23 2650905 12 6187 2622636 0.24 2628823 13 6036 2611873 0.23 2617909 14 6206 2610137 0.24 2616343 15 6112 2615015 0.23 2621127 16 6234 2617004 0.24 2623238 17 6242 2627971 0.24 2634213 18 6300 2630199 0.24 2636499 19 6358 2631582 0.24 2637940 20 6336 2640123 0.24 2646459 21 6211 2628766 0.24 2634977 22 6314 2625900 0.24 2632214 23 6425 2640704 0.24 2647129 24 6311 2625242 0.24 2631553 25 6236 2621405 0.24 2627641 26 6484 2627742 0.25 2634226 27 6386 2624263 0.24 2630649 28 6282 2627320 0.24 2633602 29 6175 2628094 0.23 2634269 30 6344 2636752 0.24 2643096 31 6241 2628613 0.24 2634854 32 6407 2639725 0.24 2646132 33 6319 2621985 0.24 2628304 34 6216 2622887 0.24 2629103 35 6272 2617149 0.24 2623421 36 6255 2622368 0.24 2628623 37 6270 2629996 0.24 2636266 38 6297 2636517 0.24 2642814 39 6422 2625501 0.24 2631923 40 6448 2620103 0.25 2626551 41 6633 2622148 0.25 2628781 42 6560 2611537 0.25 2618097 43 6418 2613099 0.25 2619517 44 6825 2623192 0.26 2630017 45 6941 2617368 0.26 2624309 46 7112 2624149 0.27 2631261 47 7251 2619596 0.28 2626847 48 7579 2624250 0.29 2631829 49 7691 2616927 0.29 2624618 50 7974 2626485 0.30 2634459 51 8132 2617090 0.31 2625222 52 8277 2623194 0.31 2631471 53 8367 2619890 0.32 2628257 54 8315 2618926 0.32 2627241 55 8402 2608791 0.32 2617193 56 8646 2618937 0.33 2627583 57 8689 2613352 0.33 2622041 58 8727 2615564 0.33 2624291 59 8692 2616155 0.33 2624847 60 9086 2618070 0.35 2627156 61 8851 2607650 0.34 2616501 62 9086 2616712 0.35 2625798 63 9194 2599406 0.35 2608600 64 9406 2607481 0.36 2616887 65 9401 2608177 0.36 2617578 66 10004 2618538 0.38 2628542 67 9811 2615279 0.37 2625090 68 9838 2618399 0.37 2628237 69 9653 2604152 0.37 2613805 70 9909 2602672 0.38 2612581 71 10016 2604708 0.38 2614724 72 9918 2604985 0.38 2614903 73 10468 2597606 0.40 2608074 74 10674 2617709 0.41 2628383 75 10607 2602939 0.41 2613546 76 10706 2602262 0.41 2612968 77 11174 2597607 0.43 2608781 78 11130 2601363 0.43 2612493 79 11292 2595823 0.43 2607115 80 11545 2604563 0.44 2616108 81 11808 2597470 0.45 2609278 82 11905 2593300 0.46 2605205 83 12033 2589547 0.46 2601580 84 12541 2589241 0.48 2601782 85 12560 2591023 0.48 2603583 86 12916 2601626 0.49 2614542 87 13063 2586592 0.50 2599655 88 13651 2590815 0.52 2604466 89 13974 2592309 0.54 2606283 90 14190 2593217 0.54 2607407 91 14515 2581774 0.56 2596289 92 15085 2589611 0.58 2604696 93 15482 2581466 0.60 2596948 94 16026 2581999 0.62 2598025 95 16227 2586385 0.62 2602612 96 16583 2577384 0.64 2593967 97 17198 2578405 0.66 2595603 98 17939 2578088 0.69 2596027 99 18184 2573950 0.70 2592134 100 18832 2579492 0.72 2598324 101 19474 2575384 0.75 2594858 102 19947 2575580 0.77 2595527 103 20277 2571264 0.78 2591541 104 20921 2572844 0.81 2593765 105 21752 2569940 0.84 2591692 106 22119 2559810 0.86 2581929 107 22946 2561675 0.89 2584621 108 23748 2554976 0.92 2578724 109 24769 2555685 0.96 2580454 110 25304 2559470 0.98 2584774 111 26266 2548857 1.02 2575123 112 26671 2548551 1.04 2575222 113 27361 2544908 1.06 2572269 114 28690 2540416 1.12 2569106 115 28689 2532722 1.12 2561411 116 29951 2539714 1.17 2569665 117 30565 2524691 1.20 2555256 118 31952 2524547 1.25 2556499 119 32497 2521825 1.27 2554322 120 33485 2512694 1.32 2546179 121 34163 2506458 1.34 2540621 122 35180 2510565 1.38 2545745 123 35981 2509135 1.41 2545116 124 37137 2500658 1.46 2537795 125 37570 2499139 1.48 2536709 126 38774 2490301 1.53 2529075 127 39400 2485317 1.56 2524717 128 40468 2486386 1.60 2526854 129 41876 2476183 1.66 2518059 130 42564 2478623 1.69 2521187 131 43285 2466958 1.72 2510243 132 44415 2460080 1.77 2504495 133 45399 2453426 1.82 2498825 134 46056 2455774 1.84 2501830 135 47422 2447822 1.90 2495244 136 49130 2443889 1.97 2493019 137 51116 2446326 2.05 2497442 138 55390 2439084 2.22 2494474 139 56332 2429881 2.27 2486213 140 55022 2427196 2.22 2482218 141 58909 2416008 2.38 2474917 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 82170 316007 20.64 398177 2 81530 313838 20.62 395368 3 81106 314031 20.53 395137 4 80692 311319 20.58 392011 5 80336 312267 20.46 392603 6 80374 310956 20.54 391330 7 79842 310831 20.44 390673 8 80185 310124 20.54 390309 9 79982 309921 20.51 389903 10 78814 309842 20.28 388656 11 78749 308582 20.33 387331 12 78941 309375 20.33 388316 13 77876 308362 20.16 386238 14 78379 307783 20.30 386162 15 78029 307789 20.22 385818 16 76863 307187 20.01 384050 17 76948 306181 20.08 383129 18 76377 306113 19.97 382490 19 76155 303078 20.08 379233 20 75573 301880 20.02 377453 21 75192 301366 19.97 376558 22 75230 299463 20.08 374693 23 74290 298784 19.91 373074 24 74339 298029 19.96 372368 25 74189 296359 20.02 370548 26 73550 295179 19.95 368729 27 72889 293268 19.91 366157 28 72224 292460 19.80 364684 29 72383 289969 19.98 362352 30 71584 289080 19.85 360664 31 71616 288319 19.90 359935 32 70286 285348 19.76 355634 33 70586 284552 19.88 355138 34 69691 282876 19.77 352567 35 69129 281722 19.70 350851 36 69065 279722 19.80 348787 37 69088 279324 19.83 348412 38 67854 277353 19.66 345207 39 67469 276088 19.64 343557 40 66697 273773 19.59 340470 41 66896 271273 19.78 338169 42 66414 270211 19.73 336625 43 65765 269471 19.62 335236 44 65559 267321 19.69 332880 45 64619 264925 19.61 329544 46 64148 263580 19.57 327728 47 63837 260872 19.66 324709 48 63903 261093 19.66 324996 49 63060 257616 19.66 320676 50 62460 257726 19.51 320186 51 62386 255264 19.64 317650 52 62454 252377 19.84 314831 53 61057 251716 19.52 312773 54 60558 249350 19.54 309908 55 60649 247391 19.69 308040 56 60086 246069 19.63 306155 57 59827 244790 19.64 304617 58 59310 242809 19.63 302119 59 58756 240904 19.61 299660 60 57983 238155 19.58 296138 61 57796 236861 19.61 294657 62 57752 235924 19.67 293676 63 56908 234073 19.56 290981 64 56394 231444 19.59 287838 65 55709 229394 19.54 285103 66 56094 228261 19.73 284355 67 54874 226437 19.51 281311 68 54769 225231 19.56 280000 69 54121 223144 19.52 277265 70 53930 222424 19.51 276354 71 53884 219004 19.75 272888 72 53044 218031 19.57 271075 73 53252 217336 19.68 270588 74 51887 215430 19.41 267317 75 51983 213520 19.58 265503 76 51560 211596 19.59 263156 77 50799 208967 19.56 259766 78 50820 208308 19.61 259128 79 50271 206045 19.61 256316 80 49417 204523 19.46 253940 81 49051 203710 19.41 252761 82 48704 200948 19.51 249652 83 48493 198358 19.64 246851 84 47643 196972 19.48 244615 85 47325 195176 19.52 242501 86 46966 194809 19.43 241775 87 46766 192058 19.58 238824 88 45765 190720 19.35 236485 89 45646 189232 19.43 234878 90 45633 187406 19.58 233039 91 45286 186654 19.52 231940 92 44560 184651 19.44 229211 93 44197 182230 19.52 226427 94 43978 181182 19.53 225160 95 43645 179862 19.53 223507 96 42994 177617 19.49 220611 97 42585 176226 19.46 218811 98 41872 174221 19.38 216093 99 41633 173125 19.39 214758 100 41324 171727 19.40 213051 101 40920 170120 19.39 211040 102 40596 168172 19.45 208768 103 40032 166102 19.42 206134 104 39730 165377 19.37 205107 105 38976 162803 19.32 201779 106 38918 161320 19.44 200238 107 38397 159868 19.37 198265 108 38213 158463 19.43 196676 109 37982 156761 19.50 194743 110 37127 155524 19.27 192651 111 37272 154514 19.43 191786 112 36634 152684 19.35 189318 113 36698 151140 19.54 187838 114 36072 148753 19.52 184825 115 35652 147751 19.44 183403 116 35397 145901 19.52 181298 117 35063 145054 19.47 180117 118 34391 143260 19.36 177651 119 33981 141534 19.36 175515 120 33936 140388 19.47 174324 121 33306 139343 19.29 172649 122 33012 137943 19.31 170955 123 32562 136654 19.24 169216 124 32845 135186 19.55 168031 125 32523 133366 19.61 165889 126 31603 132189 19.29 163792 127 31586 130621 19.47 162207 128 30867 129811 19.21 160678 129 30689 128199 19.31 158888 130 30342 126719 19.32 157061 131 30001 125446 19.30 155447 132 29594 124607 19.19 154201 133 29456 122591 19.37 152047 134 28706 122185 19.02 150891 135 28665 119903 19.29 148568 136 28093 118270 19.19 146363 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9909 543223 1.79 553132 2 7361 541914 1.34 549275 3 5394 540023 0.99 545417 4 4495 538175 0.83 542670 5 3664 537325 0.68 540989 6 3283 536283 0.61 539566 7 3098 535211 0.58 538309 8 2592 536046 0.48 538638 9 2322 534515 0.43 536837 10 2252 534896 0.42 537148 11 2083 535952 0.39 538035 12 1936 532319 0.36 534255 13 1952 532187 0.37 534139 14 1805 531751 0.34 533556 15 1615 530645 0.30 532260 16 1651 529429 0.31 531080 17 1497 529661 0.28 531158 18 1524 528028 0.29 529552 19 1433 527287 0.27 528720 20 1316 524169 0.25 525485 21 1348 523341 0.26 524689 22 1329 519582 0.26 520911 23 1264 519966 0.24 521230 24 1271 516065 0.25 517336 25 1330 514209 0.26 515539 26 1204 512159 0.23 513363 27 1202 511006 0.23 512208 28 1207 506600 0.24 507807 29 1207 505914 0.24 507121 30 1172 502510 0.23 503682 31 1198 501229 0.24 502427 32 1118 497345 0.22 498463 33 1060 495042 0.21 496102 34 1096 491752 0.22 492848 35 1108 490712 0.23 491820 36 1142 487034 0.23 488176 37 1166 484038 0.24 485204 38 1067 482708 0.22 483775 39 1067 477998 0.22 479065 40 1123 476414 0.24 477537 41 1072 471895 0.23 472967 42 1054 469137 0.22 470191 43 1034 466495 0.22 467529 44 1076 463314 0.23 464390 45 1062 462360 0.23 463422 46 1069 458730 0.23 459799 47 1031 456071 0.23 457102 48 1058 451890 0.23 452948 49 1030 449476 0.23 450506 50 991 446901 0.22 447892 51 1002 444737 0.22 445739 52 1035 440472 0.23 441507 53 1013 437160 0.23 438173 54 924 434107 0.21 435031 55 1019 430783 0.24 431802 56 1001 428260 0.23 429261 57 992 425700 0.23 426692 58 947 422144 0.22 423091 59 925 418789 0.22 419714 60 959 415575 0.23 416534 61 965 412111 0.23 413076 62 990 411031 0.24 412021 63 969 407181 0.24 408150 64 870 403941 0.21 404811 65 885 400593 0.22 401478 66 914 399105 0.23 400019 67 913 394537 0.23 395450 68 905 393843 0.23 394748 69 911 388911 0.23 389822 70 848 387765 0.22 388613 71 865 383185 0.23 384050 72 880 381413 0.23 382293 73 910 377961 0.24 378871 74 839 376332 0.22 377171 75 827 370432 0.22 371259 76 815 368625 0.22 369440 77 833 365011 0.23 365844 78 818 360697 0.23 361515 79 854 358370 0.24 359224 80 898 355022 0.25 355920 81 859 353374 0.24 354233 82 787 349100 0.22 349887 83 783 346614 0.23 347397 84 772 344124 0.22 344896 85 784 340898 0.23 341682 86 718 337180 0.21 337898 87 784 335144 0.23 335928 88 774 332067 0.23 332841 89 792 328659 0.24 329451 90 748 327116 0.23 327864 91 753 322942 0.23 323695 92 762 320712 0.24 321474 93 819 316272 0.26 317091 94 725 315049 0.23 315774 95 734 312377 0.23 313111 96 711 308813 0.23 309524 97 692 305986 0.23 306678 98 727 302812 0.24 303539 99 662 300621 0.22 301283 100 680 297969 0.23 298649 101 689 294913 0.23 295602 102 650 292348 0.22 292998 103 677 288521 0.23 289198 104 690 287033 0.24 287723 105 687 282694 0.24 283381 106 697 281097 0.25 281794 107 630 278925 0.23 279555 108 655 274947 0.24 275602 109 598 271898 0.22 272496 110 667 270045 0.25 270712 111 647 267253 0.24 267900 112 645 264877 0.24 265522 113 624 262945 0.24 263569 114 598 259068 0.23 259666 115 599 256876 0.23 257475 116 618 254223 0.24 254841 117 583 250899 0.23 251482 118 590 249786 0.24 250376 119 572 246620 0.23 247192 120 562 243422 0.23 243984 121 552 241504 0.23 242056 122 538 239042 0.22 239580 123 583 236735 0.25 237318 124 618 232987 0.26 233605 125 562 231173 0.24 231735 126 566 229186 0.25 229752 127 567 226590 0.25 227157 128 597 224479 0.27 225076 129 582 222062 0.26 222644 130 525 218729 0.24 219254 131 542 215845 0.25 216387 132 499 214589 0.23 215088 133 517 211904 0.24 212421 134 505 210118 0.24 210623 135 529 208247 0.25 208776 136 569 203657 0.28 204226 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 59841 2290699 2.55 2350540 2 41654 2289442 1.79 2331096 3 30421 2289018 1.31 2319439 4 23411 2292196 1.01 2315607 5 19462 2289001 0.84 2308463 6 16653 2283247 0.72 2299900 7 14688 2277728 0.64 2292416 8 13748 2267865 0.60 2281613 9 12257 2260264 0.54 2272521 10 11308 2251973 0.50 2263281 11 10497 2245709 0.47 2256206 12 9855 2240108 0.44 2249963 13 9071 2232687 0.40 2241758 14 8830 2224936 0.40 2233766 15 8246 2215280 0.37 2223526 16 7576 2206623 0.34 2214199 17 7297 2198996 0.33 2206293 18 6974 2187743 0.32 2194717 19 6669 2178622 0.31 2185291 20 6328 2172382 0.29 2178710 21 6212 2160326 0.29 2166538 22 5854 2152435 0.27 2158289 23 5822 2143492 0.27 2149314 24 5672 2133442 0.27 2139114 25 5358 2122749 0.25 2128107 26 5303 2111607 0.25 2116910 27 5231 2102440 0.25 2107671 28 5105 2091797 0.24 2096902 29 5022 2080027 0.24 2085049 30 4931 2071049 0.24 2075980 31 5008 2060671 0.24 2065679 32 4921 2049837 0.24 2054758 33 4910 2038231 0.24 2043141 34 4757 2025936 0.23 2030693 35 4833 2017973 0.24 2022806 36 4804 2004179 0.24 2008983 37 4641 1996169 0.23 2000810 38 4683 1985507 0.24 1990190 39 4510 1972925 0.23 1977435 40 4584 1956584 0.23 1961168 41 4614 1946866 0.24 1951480 42 4454 1934624 0.23 1939078 43 4657 1921956 0.24 1926613 44 4562 1910577 0.24 1915139 45 4535 1898235 0.24 1902770 46 4471 1885557 0.24 1890028 47 4343 1875306 0.23 1879649 48 4473 1863676 0.24 1868149 49 4468 1850205 0.24 1854673 50 4165 1841529 0.23 1845694 51 4390 1827113 0.24 1831503 52 4189 1816096 0.23 1820285 53 4300 1805806 0.24 1810106 54 4343 1792449 0.24 1796792 55 4351 1780227 0.24 1784578 56 4174 1765099 0.24 1769273 57 4143 1752212 0.24 1756355 58 4075 1742222 0.23 1746297 59 4245 1727704 0.25 1731949 60 4071 1717923 0.24 1721994 61 4061 1705523 0.24 1709584 62 4020 1692951 0.24 1696971 63 3946 1683009 0.23 1686955 64 4083 1667747 0.24 1671830 65 3986 1655618 0.24 1659604 66 4024 1644202 0.24 1648226 67 3998 1629700 0.24 1633698 68 3640 1618030 0.22 1621670 69 4159 1606502 0.26 1610661 70 3888 1592934 0.24 1596822 71 3945 1583411 0.25 1587356 72 3709 1569877 0.24 1573586 73 3848 1556394 0.25 1560242 74 3932 1544329 0.25 1548261 75 3626 1532083 0.24 1535709 76 3851 1518375 0.25 1522226 77 3682 1507890 0.24 1511572 78 3844 1496232 0.26 1500076 79 3717 1484600 0.25 1488317 80 3761 1469930 0.26 1473691 81 3525 1457390 0.24 1460915 82 3617 1445899 0.25 1449516 83 3609 1432340 0.25 1435949 84 3581 1422535 0.25 1426116 85 3492 1407308 0.25 1410800 86 3476 1396839 0.25 1400315 87 3488 1383115 0.25 1386603 88 3459 1371798 0.25 1375257 89 3509 1360032 0.26 1363541 90 3461 1346083 0.26 1349544 91 3471 1337288 0.26 1340759 92 3291 1319573 0.25 1322864 93 3513 1311134 0.27 1314647 94 3252 1298404 0.25 1301656 95 3206 1288610 0.25 1291816 96 3223 1276764 0.25 1279987 97 3129 1264749 0.25 1267878 98 3200 1251407 0.26 1254607 99 3288 1239608 0.26 1242896 100 3291 1227364 0.27 1230655 101 3054 1217609 0.25 1220663 102 3068 1206640 0.25 1209708 103 3121 1194368 0.26 1197489 104 3312 1182199 0.28 1185511 105 3119 1173404 0.27 1176523 106 3172 1161034 0.27 1164206 107 2997 1150687 0.26 1153684 108 3100 1138453 0.27 1141553 109 3178 1127109 0.28 1130287 110 3299 1116066 0.29 1119365 111 2952 1104744 0.27 1107696 112 2997 1093461 0.27 1096458 113 3009 1081847 0.28 1084856 114 2983 1072941 0.28 1075924 115 3164 1062706 0.30 1065870 116 3082 1050596 0.29 1053678 117 2917 1039541 0.28 1042458 118 2905 1029943 0.28 1032848 119 2882 1018184 0.28 1021066 120 3181 1008644 0.31 1011825 121 2785 998467 0.28 1001252 122 2859 985671 0.29 988530 123 2887 975045 0.30 977932 124 2835 964627 0.29 967462 125 2784 954679 0.29 957463 126 2796 945962 0.29 948758 127 2749 934649 0.29 937398 128 2853 923469 0.31 926322 129 2800 914627 0.31 917427 130 2726 904981 0.30 907707 131 2762 896750 0.31 899512 132 2776 885109 0.31 887885 133 2584 875071 0.29 877655 134 2767 865769 0.32 868536 135 2861 856516 0.33 859377 136 3129 840482 0.37 843611