pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
55561038	A	G	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/2		1.00/1	0.00/12	0.00/13	0.00/4	0.00/9
55561039	C	G	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/2		1.00/1	0.00/10	0.00/12	0.00/4	0.00/7
55561040	C	A	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/2		1.00/1	0.00/10	0.00/12	0.00/4	0.00/7
55561117	A	T	True	0		1.0	0.024	False	False	1.00/3	1.00/1		1.00/3	1.00/2	0.08/12	0.00/10	0.00/6	0.00/14
55561168	A	G	True	1	0.0	0.077	0.0	False	False	0.00/7	0.00/2	0.00/1	0.00/6	0.25/4	0.00/14	0.00/6	0.00/7	0.00/15
55561189	T	G	True	1	0.0	0.077	0.0	False	False	0.00/8	0.00/2	0.00/1	0.00/6	0.25/4	0.00/10	0.00/6	0.00/7	0.00/15
55561195	C	T	True	3	0.875	0.833	0.059	True	True	0.88/8	1.00/2	1.00/1	0.83/6	0.67/3	0.00/9	0.00/6	0.33/6	0.00/13
55561202	T	A	True	4	0.778	0.769	0.079	True	False	0.78/9	1.00/2	0.50/2	1.00/5	0.50/4	0.00/10	0.17/6	0.33/6	0.00/16
55561217	T	G	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/9	0.25/4	0.00/2	0.00/8	0.00/4	0.00/10	0.00/7	0.00/8	0.00/16
55561219	T	A	True	5	0.889	0.833	0.048	True	False	0.89/9	0.75/4	1.00/2	0.88/8	0.75/4	0.00/10	0.00/8	0.25/8	0.00/16
55561220	T	A	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/9	0.25/4	0.00/2	0.00/8	0.00/4	0.00/10	0.00/8	0.00/7	0.00/16
55561221	A	C	True	5	0.778	0.684	0.048	True	False	0.78/9	0.50/4	0.67/3	0.88/8	0.50/4	0.00/10	0.00/8	0.29/7	0.00/17
55561239	C	T	True	5	0.75	0.722	0.079	True	True	0.75/8	0.75/4	0.67/3	0.83/6	0.60/5	0.00/8	0.09/11	0.40/5	0.00/14
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55561382	C	T	True	5	1.0	1.0	0.111	True	True	1.00/6	1.00/5	1.00/3	1.00/7	1.00/5	0.00/8	0.12/8	0.50/6	0.00/14
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55561497	A	G	True	2	0.429	0.208	0.0	False	False	0.43/7	0.60/5	0.00/3	0.00/7	0.22/9	0.00/11	0.00/5	0.00/7	0.00/7
55561519	T	A	True	5	1.0	0.87	0.143	True	False	1.00/7	1.00/6	0.33/3	0.83/6	1.00/8	0.00/10	0.00/5	0.57/7	0.00/6
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55561526	T	A	True	5	0.625	0.739	0.161	True	False	0.62/8	0.33/6	1.00/2	1.00/6	0.78/9	0.00/10	0.00/7	0.62/8	0.00/6
55561538	T	G	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/8	0.00/6	0.25/4	0.00/6	0.00/8	0.00/10	0.00/6	0.00/9	0.00/6
55561539	T	G	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/8	0.00/6	0.25/4	0.00/6	0.00/8	0.00/10	0.00/6	0.00/9	0.00/6
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55561577	G	A	True	1	1.0	1.0	0.0	False	True	1.00/6	1.00/3	1.00/1		1.00/3	0.00/5	0.00/5	0.00/2	0.00/1
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55561727	G	A	True	3	1.0	1.0	0.0	False	True	1.00/9	1.00/2	1.00/4	1.00/2	1.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/2
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