pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
54887003	A	T	True	1	0.5		0.0	False	False	0.50/6					0.00/5	0.00/14	0.00/8	0.00/6
54887007	G	A	True	1	0.25		0.0	False	True	0.25/4					0.00/5	0.00/13	0.00/6	0.00/5
54887013	A	C	True	1	0.4		0.033	False	False	0.40/5					0.00/5	0.00/14	0.00/6	0.20/5
54887014	A	G	True	1	0.8		0.0	False	False	0.80/5					0.00/5	0.00/14	0.00/5	0.00/5
54887018	A	G	True	1	0.25		0.0	False	False	0.25/4					0.00/5	0.00/15	0.00/6	0.00/5
54887035	T	C	True	1	0.25		0.0	False	False	0.25/4					0.00/5	0.00/17	0.00/8	0.00/4
54887045	A	T	True	1	0.25		0.0	False	False	0.25/4				0.00/1	0.00/5	0.00/17	0.00/9	0.00/5
54887056	G	T	True	0		1.0	0.0	False	False	0.00/3	1.00/1	1.00/3	1.00/1	1.00/1	0.00/4	0.00/15	0.00/8	0.00/5
54887065	T	A	True	4	0.75	1.0	0.1	True	False	0.75/4	1.00/1	1.00/4	1.00/3	1.00/3	0.33/6	0.00/16	0.00/10	0.25/8
54887085	A	T	True	5		0.895	0.098	True	False	0.00/3	1.00/1	0.83/6	1.00/5	0.86/7	0.29/7	0.00/16	0.00/11	0.29/7
54887090	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/1	0.00/6	0.00/7	0.00/7	0.00/8	0.00/17	0.00/11	0.00/7
54887105	A	T	True	5		1.0	0.116	True	False	0.33/3	1.00/1	1.00/8	1.00/7	1.00/8	0.43/7	0.00/19	0.00/9	0.25/8
54887116	A	G	True	5	0.75	0.88	0.14	True	False	0.75/4	1.00/1	0.78/9	1.00/7	0.88/8	0.43/7	0.00/16	0.09/11	0.22/9
54887132	A	T	True	4	0.0	1.0	0.143	True	False	0.00/4	1.00/1	1.00/11	1.00/7	1.00/7	0.50/6	0.00/16	0.09/11	0.22/9
54887151	A	G	True	5	0.143	0.867	0.128	True	False	0.14/7	1.00/2	0.82/11	1.00/7	0.80/10	0.38/8	0.00/18	0.08/13	0.25/8
54887167	G	A	True	2	0.111	0.324	0.091	False	True	0.11/9	0.67/3	0.33/12	0.22/9	0.30/10	0.22/9	0.00/15	0.15/13	0.00/7
54887187	A	G	True	3	0.0	0.375	0.119	False	False	0.00/13	0.33/3	0.36/14	0.33/9	0.43/14	0.12/8	0.00/13	0.21/14	0.14/7
54887190	T	A	True	3	0.0	0.45	0.095	False	False	0.00/14	0.67/3	0.36/14	0.44/9	0.50/14	0.22/9	0.00/13	0.15/13	0.00/7
54887198	A	G	True	3	0.071	0.525	0.133	False	False	0.07/14	1.00/3	0.50/14	0.44/9	0.50/14	0.20/10	0.00/13	0.20/15	0.14/7
54887210	A	T	True	5	0.0	0.556	0.179	False	False	0.00/15	1.00/3	0.67/12	0.43/7	0.43/14	0.25/8	0.00/11	0.29/14	0.17/6
54887218	G	A	True	5	0.0	0.971	0.222	True	True	0.00/12	1.00/3	1.00/11	0.88/8	1.00/12	0.38/8	0.00/10	0.33/12	0.17/6
54887230	A	G	True	2	0.0	0.229	0.0	False	False	0.00/15	0.00/3	0.31/13	0.25/8	0.18/11	0.00/10	0.00/9	0.00/13	0.00/7
54887249	A	G	True	6	0.0	0.829	0.216	True	False	0.00/15	0.83/6	0.85/13	0.83/6	0.80/10	0.27/11	0.00/7	0.33/12	0.14/7
54887266	G	A	True	6	0.0	1.0	0.265	True	True	0.00/14	1.00/6	1.00/12	1.00/5	1.00/8	0.36/11	0.00/6	0.33/12	0.20/5
54887323	A	G	True	1	0.0	0.053	0.023	False	False	0.00/16	0.00/9	0.00/11	0.29/7	0.00/11	0.00/12	0.00/9	0.08/12	0.00/10
54887489	T	C	True	1	0.0	0.028	0.1	False	False	0.00/11	0.00/8	0.08/13	0.00/10	0.00/5	0.00/15	0.00/12	0.62/8	0.00/15
54887504	C	A	True	1	0.0	0.056	0.069	False	False	0.00/7	0.00/3	0.00/7	0.00/4	0.25/4	0.12/8	0.12/8	0.00/8	0.00/5
54887516	T	A	True	7	0.083	1.0	0.333	True	False	0.08/12	1.00/9	1.00/13	1.00/12	1.00/6	0.28/18	0.00/13	0.62/8	0.53/15
54887548	C	G	True	1	0.0	0.048	0.034	False	False	0.00/8	0.25/4	0.00/6	0.00/6	0.00/5	0.11/9	0.00/9	0.00/6	0.00/5
54887576	T	C	True	4	0.0	0.6	0.106	False	False	0.00/7	0.50/8	0.57/7	0.60/10	0.80/5	0.20/15	0.00/11	0.00/5	0.12/16
54887586	G	T	True	1		0.083	0.0	False	False	0.00/1	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/8	0.00/3	0.00/1	0.00/10
54887605	C	T	True	1	1.0	0.0	0.0	False	True	1.00/5	0.00/4	0.00/3	0.00/5	0.00/5	0.00/5	0.00/7	0.00/4	0.00/6
54887627	A	T	True	1	0.0	0.083	0.051	False	False	0.00/7	0.14/7	0.25/4	0.00/7	0.00/6	0.17/12	0.00/10	0.00/6	0.00/11
54887666	A	C	True	1	0.0	0.071	0.0	False	False	0.00/15	0.00/4	0.00/1	0.25/4	0.00/5	0.00/10	0.00/8	0.00/6	0.00/10
54887671	G	T	True	1	0.0		0.071	False	False	0.00/6	0.00/1		0.00/1	0.00/1	0.00/5	0.00/4	0.00/1	0.25/4
54887689	T	C	True	1	0.0	0.125	0.0	False	False	0.00/16	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/8	0.00/6	0.00/7	0.00/8
54887691	T	C	True	1	0.0	0.125	0.0	False	False	0.00/16	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/9	0.00/6	0.00/7	0.00/8
54887692	A	C	True	1	0.0	0.125	0.0	False	False	0.00/16	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/9	0.00/6	0.00/7	0.00/8
54887693	T	C	True	1	0.0	0.125	0.0	False	False	0.00/16	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/9	0.00/6	0.00/7	0.00/8
54887716	T	G	True	0	0.0	0.25	0.0	False	False	0.00/14	0.00/1		0.00/2	1.00/1	0.00/8	0.00/7	0.00/4	0.00/8
54887775	A	G	True	1	0.0	0.556	0.125	False	False	0.00/17	0.00/3	1.00/4	0.50/2		0.18/11	0.00/5	0.00/7	0.22/9
54887801	A	G	True	1	0.0	0.0	0.036	False	False	0.00/13	0.00/3	0.00/4	0.00/6		0.00/11	0.00/7	0.25/4	0.00/6
54887832	G	C	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/7		0.00/4	0.00/4	0.00/6	0.00/8	0.00/2	0.00/5	0.25/4
54887846	A	G	True	5	0.0	0.958	0.263	True	False	0.00/13	0.67/3	1.00/5	1.00/10	1.00/6	0.43/14	0.00/9	0.12/8	0.43/7
54887925	T	A	True	6	0.062	1.0	0.378	True	False	0.06/16	1.00/2	1.00/13	1.00/18	1.00/9	0.58/12	0.00/13	0.40/10	0.60/10
54888000	C	T	True	3	0.0	1.0	0.154	True	True	0.00/4	1.00/4	1.00/6	1.00/7	1.00/3	0.00/1	0.00/8	0.50/2	0.50/2
