pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
41517058	A	T	True	1	0.0	0.077	0.0	False	False	0.00/18	0.00/7	0.00/14	0.00/8	0.30/10	0.00/23	0.00/10	0.00/7	0.00/7
41517211	G	T	True	1	0.0	0.04	0.029	False	False	0.00/10	0.14/7	0.00/5	0.00/6	0.00/7	0.00/11	0.00/7	0.25/4	0.00/12
41517258	C	A	True	1		0.0	0.053	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/5	0.00/2	0.25/4	0.00/4	0.00/5	0.00/6
41517284	A	T	True	5	0.273	0.216	0.241	False	False	0.27/11	0.20/15	0.27/11	0.25/16	0.11/9	0.29/14	0.25/12	0.20/15	0.24/17
41517294	T	C	True	2	0.182	0.113	0.186	False	False	0.18/11	0.07/15	0.27/11	0.06/17	0.10/10	0.27/15	0.18/11	0.12/16	0.18/17
41517309	A	T	True	3	0.182	0.233	0.197	False	False	0.18/11	0.06/16	0.23/13	0.37/19	0.25/12	0.28/18	0.00/10	0.24/17	0.19/16
41517314	A	T	True	8	0.364	0.356	0.3	False	False	0.36/11	0.20/15	0.31/13	0.47/19	0.42/12	0.33/18	0.30/10	0.29/17	0.27/15
41517323	G	A	True	2	0.2	0.229	0.133	False	True	0.20/5	0.20/10	0.00/8	0.40/10	0.29/7	0.11/9	0.20/5	0.11/9	0.14/7
41517324	T	A	True	5	0.3	0.3	0.262	False	False	0.30/10	0.14/14	0.21/14	0.47/19	0.31/13	0.33/18	0.27/11	0.24/17	0.20/15
41517364	C	T	True	9	0.6	0.714	0.515	False	True	0.60/5	0.67/9	0.62/8	0.83/12	0.67/6	0.58/12	0.50/6	0.50/8	0.43/7
41517366	C	A	True	9	0.5	0.735	0.5	False	False	0.50/6	0.75/8	0.62/8	0.83/12	0.67/6	0.55/11	0.50/6	0.50/8	0.43/7
41517371	T	A	True	9	0.417	0.584	0.452	False	False	0.42/12	0.58/19	0.44/16	0.74/27	0.47/15	0.44/25	0.50/14	0.47/19	0.40/15
41517423	A	T	True	9	0.545	0.722	0.692	False	False	0.55/11	0.71/21	0.65/20	0.81/32	0.67/24	0.66/29	0.64/14	0.75/20	0.73/15
41517444	T	A	True	9	0.364	0.475	0.452	False	False	0.36/11	0.50/22	0.48/21	0.50/34	0.42/24	0.56/27	0.40/15	0.41/17	0.36/14
41517457	C	T	True	6	0.333	0.309	0.205	False	True	0.33/6	0.31/13	0.38/13	0.12/17	0.50/12	0.26/19	0.22/9	0.00/8	0.25/8
41517464	G	T	True	2	0.25	0.116	0.071	False	False	0.25/4	0.00/8	0.14/7	0.18/17	0.09/11	0.00/8	0.00/4	0.00/9	0.29/7
41517520	G	T	True	7		0.536	0.737	False	False	0.67/3	0.71/7	0.38/8	0.57/7	0.50/6	0.50/6	1.00/1	0.88/8	0.75/4
41517536	G	C	True	1		0.043	0.077	False	False	0.00/2	0.00/8	0.00/7	0.00/6	0.50/2	0.00/4	0.00/2	0.25/4	0.00/3
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41517544	G	A	True	4		0.318	0.364	False	True	0.00/2	0.38/8	0.29/7	0.40/5	0.00/2	0.25/4	0.50/2	0.50/2	0.33/3
41517547	T	A	True	1	0.0	0.209	0.125	False	False	0.00/6	0.21/14	0.07/14	0.44/9	0.17/6	0.18/11	0.00/9	0.20/5	0.14/7
41517548	C	T	True	5	0.0	0.381	0.227	False	True	0.00/4	0.33/6	0.00/7	1.00/4	0.50/4	0.38/8	0.00/7	0.33/3	0.25/4
41517553	C	T	True	2		0.25	0.105	False	True	0.00/3	0.40/5	0.00/6	1.00/2	0.00/3	0.20/5	0.00/7	0.00/3	0.25/4
41517555	C	A	True	1		0.071	0.059	False	False	0.00/3	0.00/5	0.00/5	0.50/2	0.00/2	0.00/6	0.00/6	0.00/1	0.25/4
41517573	G	T	True	0		0.0	0.25	False	False	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.33/3	0.00/1		
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41517627	G	T	True	1	0.0	0.0	0.143	False	False	0.00/4	0.00/4	0.00/4	0.00/2	0.00/1	0.25/4	0.00/1	0.00/1	0.00/1
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41517635	C	G	True	1		0.0	0.111	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/5	0.00/2	0.00/2	0.00/4	0.25/4		0.00/1
41517667	A	G	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/8	0.00/7	0.00/6	0.00/5	0.25/4	0.00/8	0.00/6	0.00/1	0.00/3
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41517700	A	G	True	1	0.0	0.0	0.05	False	False	0.00/5	0.00/7	0.00/6	0.00/6	0.00/5	0.00/8	0.25/4	0.00/3	0.00/5
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