pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
31082002	A	C	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/9	0.25/4	0.00/3	0.00/6	0.00/5	0.00/11	0.00/2	0.00/6	0.00/4
31082013	A	G	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/8	0.25/4	0.00/3	0.00/6	0.00/5	0.00/14	0.00/2	0.00/6	0.00/5
31082051	A	G	True	1	0.0	0.0	0.057	False	False	0.00/11	0.00/4	0.00/3	0.00/7	0.00/6	0.00/14	0.00/6	0.25/8	0.00/7
31082053	C	A	True	2	0.0	0.091	0.182	False	False	0.00/6	0.00/4		0.00/4	0.33/3	0.00/8	0.25/4	0.20/5	0.40/5
31082059	C	T	True	1	0.0	0.0	0.053	False	True	0.00/6	0.00/4		0.00/4	0.00/4	0.00/7	0.25/4	0.00/4	0.00/4
31082174	C	T	True	0		0.25	0.0	False	True	0.00/2	0.00/1	1.00/1		0.00/2	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/4
31082176	C	A	True	1		0.0	0.118	False	False	0.00/2	0.00/1	0.00/1		0.00/2	0.00/4	0.25/4	0.20/5	0.00/4
31082184	G	A	True	0			0.25	False	True			0.00/1			0.00/1	1.00/1	0.00/1	0.00/1
31082194	C	T	True	0		0.25	0.0	False	True	0.00/1	0.00/1	1.00/1		0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/4	0.00/1
31082221	T	A	True	1		0.143	0.059	False	False	0.00/3	0.00/2	0.50/2		0.00/3	0.00/5	0.25/4	0.00/5	0.00/3
31082281	C	T	True	0		0.25	0.0	False	True	0.00/1	0.00/2	1.00/1		0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/2
31082393	C	T	True	0		0.0	0.333	False	True	0.00/1	0.00/2			0.00/2	0.00/2	1.00/1	0.50/2	0.00/1
31082396	C	A	True	0		0.25	0.167	False	False	0.00/1	0.50/2			0.00/2	0.00/2	1.00/1	0.00/2	0.00/1
31082401	A	G	True	1		0.0	0.062	False	False	0.00/2	0.00/3		0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.25/4	0.00/7	0.00/2
31082431	A	G	True	1		0.0	0.059	False	False	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.25/4	0.00/4	0.00/7	0.00/2
31082441	A	T	True	1		0.0	0.059	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/5	0.25/4	0.00/6	0.00/2
31082447	C	A	True	0		0.25		False	False	0.00/1	0.00/2	1.00/1		0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1	
31082501	C	T	True	0			0.333	False	True	0.00/2		0.00/2		0.00/1	1.00/1	0.00/1	0.50/2	0.00/2
31082502	T	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/1	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/8	0.00/4
31082504	A	G	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/8	0.25/4
31082507	A	G	True	1	0.0	0.0	0.043	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.00/7	0.25/4	0.00/8	0.00/4
31082508	T	G	True	1	0.0	0.0	0.043	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.00/7	0.25/4	0.00/8	0.00/4
31082510	T	A	True	1	0.0	0.0	0.043	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.00/7	0.25/4	0.00/8	0.00/4
31082512	A	G	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.14/7	0.25/4	0.00/8	0.00/3
31082536	A	T	True	1	0.0	0.0	0.042	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.00/10	0.25/4	0.00/7	0.00/3
31082546	C	T	True	0		0.25	0.0	False	True	0.00/2		0.50/2		0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/2
31082588	G	A	True	1		0.188	0.143	False	True	0.00/3	0.40/5	0.00/4	0.33/3	0.00/4	0.12/8	0.00/1	0.22/9	0.00/3
31082602	A	T	True	1	0.25	0.0	0.029	False	False	0.25/4	0.00/8	0.00/6	0.00/4	0.00/5	0.08/13	0.00/3	0.00/12	0.00/7
31082611	G	T	True	1		0.053	0.095	False	False	0.00/3	0.20/5	0.00/4	0.00/4	0.00/6	0.00/7	0.00/2	0.12/8	0.25/4
31082612	G	C	True	1		0.0	0.048	False	False	0.00/3	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/6	0.00/7	0.00/2	0.00/8	0.25/4
31082622	A	G	True	1	0.0	0.08	0.062	False	False	0.00/5	0.00/8	0.00/5	0.25/4	0.12/8	0.00/12	0.00/4	0.20/10	0.00/6
31082684	G	T	True	1		0.0	0.083	False	False	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/5	0.00/1	0.25/4	0.00/2
31082685	G	C	True	1		0.0	0.083	False	False	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/5	0.00/1	0.25/4	0.00/2
31082691	G	T	True	0		0.25		False	False		0.50/2	0.00/1		0.00/1				
31082694	T	C	True	1	0.167	0.071	0.0	False	False	0.17/6	0.00/6	0.00/2	0.00/2	0.25/4	0.00/10	0.00/2	0.00/5	0.00/2
31082706	A	G	True	1	0.0	0.0	0.042	False	False	0.00/5	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/3	0.00/11	0.25/4	0.00/4	0.00/5
31082773	G	A	True	1	0.0	0.071	0.0	False	True	0.00/4	0.25/4	0.00/5	0.00/3	0.00/2	0.00/7	0.00/4	0.00/4	0.00/4
31082953	C	A	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/1	0.50/2	0.00/2			0.00/2	0.00/3	0.00/1	
31082987	A	G	True	1	0.0	0.043	0.0	False	False	0.00/6	0.00/7	0.00/5	0.25/4	0.00/7	0.00/9	0.00/6	0.00/6	0.00/6
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31082990	T	G	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/6	0.00/6	0.00/5	0.25/4	0.00/7	0.00/8	0.00/6	0.00/6	0.00/6