pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
29878012	A	G	True	3		0.333	0.222	False	False	0.00/2	1.00/2	0.14/7	0.60/5	0.20/10	0.12/17	0.00/13	0.31/13	0.55/11
29878047	T	C	True	6		0.931	0.467	False	False	1.00/3	0.67/3	1.00/10	0.83/6	1.00/10	0.62/13	0.00/15	0.60/10	1.00/7
29878049	T	A	True	1		0.033	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/10	0.00/6	0.00/10	0.00/12	0.00/14	0.00/9	0.00/7
29878117	T	A	True	1		0.0	0.103	False	False			0.00/1		0.00/3	0.14/7	0.00/13	0.20/5	0.25/4
29878118	T	A	True	1		0.5	0.08	False	False			0.00/1		0.67/3	0.33/6	0.00/13	0.00/4	0.00/2
29878119	T	C	True	0		0.5	0.04	False	False			0.00/1		0.67/3	0.20/5	0.00/13	0.00/5	0.00/2
29878121	T	G	True	0		0.25	0.038	False	False			0.00/1		0.33/3	0.00/6	0.00/12	0.00/5	0.33/3
29878122	T	A	True	0		0.25	0.0	False	False			1.00/1		0.00/3	0.00/6	0.00/11	0.00/5	0.00/3
29878125	T	G	True	0		0.4	0.125	False	False			0.00/2	1.00/1	0.50/2	0.17/6	0.00/10	0.00/5	0.67/3
29878128	T	A	True	0		0.286	0.0	False	False	1.00/1		0.67/3	0.00/2	0.00/2	0.00/6	0.00/9	0.00/5	0.00/3
29878205	G	A	True	5		1.0	0.435	True	True	1.00/3	1.00/6	1.00/4	1.00/8	1.00/7	0.50/10	0.00/7	0.67/3	1.00/3
29878211	G	A	True	5		1.0	0.417	True	True	1.00/3	1.00/6	1.00/4	1.00/8	1.00/7	0.50/10	0.00/8	0.67/3	1.00/3
29878212	G	A	True	5		1.0	0.417	True	True	1.00/3	1.00/6	1.00/4	1.00/8	1.00/7	0.50/10	0.00/8	0.67/3	1.00/3
29878224	G	C	True	1		0.038	0.0	False	False	0.00/3	0.00/7	0.25/4	0.00/7	0.00/8	0.00/9	0.00/6	0.00/3	0.00/3
29878334	A	G	True	1	0.286	0.0	0.0	False	False	0.29/7	0.00/5	0.00/1	0.00/6	0.00/6	0.00/7	0.00/12	0.00/3	0.00/9
29878340	A	G	True	6	1.0	1.0	0.448	True	False	1.00/6	1.00/4	1.00/2	1.00/5	1.00/5	0.43/7	0.00/11	0.67/3	1.00/8
29878363	T	A	True	2	0.333	0.286	0.138	False	False	0.33/6	0.67/3	0.00/1	0.20/5	0.20/5	0.20/5	0.00/13	0.00/3	0.38/8
29878375	G	T	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/6	0.00/11	0.00/3	0.00/6
29878406	T	A	True	1		0.25	0.095	False	False	0.00/2	0.00/1	0.50/2	0.00/1		0.20/5	0.00/12		0.25/4
29878445	A	T	True	1		0.0	0.059	False	False	0.00/2	0.00/1	0.00/4	0.00/1		0.25/4	0.00/13		
29878458	C	T	True	0			0.25	False	True	0.00/1		0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.33/3		
29878463	G	A	True	0		1.0	0.25	False	True	1.00/2	1.00/1	1.00/3		1.00/3	0.33/3	0.00/7		1.00/2
29878464	T	C	True	2		0.222	0.056	False	False	0.00/3	0.00/1	0.25/4	1.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/12		0.00/2
29878492	T	A	True	2		1.0	0.263	False	False	0.67/3	1.00/1	1.00/3		1.00/3	0.25/4	0.00/11		1.00/4
29878506	G	A	True	1		1.0	0.294	False	True	1.00/2	1.00/1	1.00/3		1.00/3	0.20/5	0.00/8		1.00/4
29878546	A	G	True	1		0.0	0.062	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/3	0.00/5	0.00/6	0.00/1	0.25/4
29878578	T	A	True	0		0.375	0.0	False	False	0.00/1	0.50/2	0.50/2	1.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/1	0.00/4
29878587	T	C	True	1		0.111	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/5	0.00/1	0.00/5
29878588	G	C	True	1		0.2	0.0	False	False	0.00/1			0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/1	0.00/5
29878589	A	T	True	1		0.111	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/5	0.00/1	0.00/5
29878590	G	T	True	1		0.2	0.0	False	False	0.00/1			0.00/1	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/5
29878592	A	T	True	1		0.111	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/5	0.00/1	0.00/5
29878593	T	C	True	1		0.111	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/5	0.00/1	0.00/4
29878603	T	C	True	1		0.0	0.071	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.25/4	0.00/5	0.00/2	0.00/3
29878611	A	G	True	1		0.625	0.071	True	False	1.00/1	1.00/1	0.67/3	0.33/3	1.00/1	0.00/3	0.00/5	0.00/2	0.25/4
29878697	A	G	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/4	0.00/4	0.00/4	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/6	0.25/4	0.00/7
29878702	A	G	True	1	0.0	0.0	0.05	False	False	0.00/4	0.00/4	0.00/4	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/6	0.25/4	0.00/7
29878714	A	G	True	1	0.0	0.111	0.0	False	False	0.00/5	0.00/4	0.29/7	0.00/4	0.00/3	0.00/2	0.00/7	0.00/5	0.00/7
29878753	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/3	0.00/2		0.00/1	0.00/5	0.00/3	0.00/3
29878771	G	A	True	0		1.0	0.556	False	True	1.00/1	1.00/1	1.00/3		1.00/2	0.00/1	0.00/2	0.67/3	1.00/3
29878784	G	T	True	1		0.0	0.1	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/3		0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.25/4	0.00/3
29878785	G	T	True	1		0.0	0.1	False	False	0.00/1	0.00/1	0.00/3		0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.25/4	0.00/3
29878810	T	A	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/5	0.00/5	0.00/6	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/7	0.00/7	0.00/7
29878857	C	G	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/3	0.25/4		0.00/2	0.00/5	0.00/4
29878885	C	A	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/3	0.00/4	0.25/4	0.00/3	0.00/3		0.00/4	0.00/4	0.00/3
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29878924	T	A	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/8	0.00/5	0.00/9	0.00/5	0.00/8	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.25/4
29878934	A	G	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/12	0.00/6	0.00/8	0.00/5	0.00/8	0.25/4	0.00/4	0.00/5	0.00/3
29878959	T	G	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/12	0.00/8	0.00/9	0.00/5	0.00/6	0.00/5	0.25/8	0.00/7	0.00/2
