pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
5221052	G	A	True	1		0.0	0.111	False	True	0.00/3	0.00/7	0.00/13	0.00/5	0.00/8	0.00/8	0.00/5	0.00/6	0.38/8
5221097	C	A	True	1		0.1	0.0	False	False	0.00/2	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.25/8		0.00/3	0.00/2	0.00/5
5221120	T	G	True	1	0.0	0.0	0.036	False	False	0.00/6	0.00/10	0.00/17	0.00/6	0.00/15	0.25/4	0.00/7	0.00/7	0.00/10
5221158	G	C	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/6	0.00/1	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/3	0.00/5
5221194	A	G	True	1		0.05	0.0	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/16	0.25/8	0.00/9	0.00/6	0.00/2	0.00/4	0.00/5
5221235	G	C	True	1			0.111	False	False	0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.25/4
5221239	G	T	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1		0.50/2	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/2
5221240	T	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/11	0.00/9	0.00/7	0.00/8	0.00/2	0.00/6	0.00/4
5221241	C	A	True	1		0.0	0.167	False	False	0.67/3	0.00/3	0.00/10	0.00/8	0.00/6	0.00/6	0.00/1	0.50/4	0.00/1
5221242	A	C	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/4	0.00/4	0.00/11	0.00/10	0.00/7	0.00/8	0.00/2	0.00/5	0.25/4
5221243	T	C	True	1	0.0	0.0	0.05	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/11	0.00/9	0.00/7	0.00/8	0.00/2	0.00/6	0.25/4
5221260	G	T	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1	1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/1
5221273	T	G	True	2	0.5	0.077	0.167	False	False	0.50/4	0.00/3	0.11/9	0.11/9	0.00/5	0.00/8	0.00/2	0.50/6	0.00/2
5221316	T	A	True	1		0.0	0.05	False	False	0.00/3	0.00/2	0.00/8	0.00/9	0.00/7	0.00/9	0.00/3	0.00/4	0.25/4
5221333	T	C	True	2		0.12	0.238	False	False	0.67/3	0.00/2	0.11/9	0.22/9	0.00/5	0.10/10	0.00/3	0.75/4	0.25/4
5221375	A	G	True	3		0.25	0.312	False	False	1.00/2	0.00/2	0.25/8	0.40/5	0.20/5	0.12/8	0.00/1	0.67/3	0.50/4
5221377	A	G	True	2		0.2	0.312	False	False	1.00/2	0.00/2	0.12/8	0.40/5	0.20/5	0.12/8	0.00/1	1.00/3	0.25/4
5221379	C	T	True	2		0.267	0.417	False	True	1.00/2	0.00/1	0.17/6	0.50/4	0.25/4	0.14/7		1.00/3	0.50/2
5221387	G	T	True	0		0.2	0.286	False	False		0.00/1	0.50/2	0.00/1	0.00/1	0.50/2	0.00/1	0.00/2	0.50/2
5221426	A	G	True	1		0.067	0.125	False	False	0.00/2	0.00/1	0.20/5	0.00/4	0.00/5	0.00/7	0.00/2	0.25/4	0.33/3
5221428	A	C	True	2		0.267	0.25	False	False	1.00/2	0.00/1	0.20/5	0.50/4	0.20/5	0.14/7	0.00/2	0.50/4	0.33/3
5221457	A	T	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/2	0.25/4	0.00/2
5221483	G	C	True	0		0.25	0.0	False	False		0.50/2	0.00/1		0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/1
5221492	A	T	True	1			0.125	False	False		0.00/1			0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.25/4	0.00/1
5221493	A	C	True	1			0.125	False	False		0.00/1			0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.25/4	0.00/1
5221566	C	A	True	0			0.25	False	False					0.00/2	1.00/1	0.00/2	0.00/1	
5221567	C	G	True	0			0.25	False	False					0.00/2	1.00/1	0.00/2	0.00/1	
5221625	T	G	True	1		0.0	0.045	False	False	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/2	0.00/11	0.00/5	0.25/4	0.00/2
5221650	G	T	True	0		0.25	0.143	False	False		0.00/1	0.00/1	0.50/2		0.33/3	0.00/3	0.00/1	
5221675	A	G	True	1		0.059	0.0	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/7	0.25/4	0.00/10	0.00/7	0.00/5	0.00/2
5221676	T	G	True	1		0.056	0.0	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/8	0.25/4	0.00/10	0.00/7	0.00/6	0.00/2
5221678	A	G	True	1		0.105	0.0	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/8	0.40/5	0.00/10	0.00/8	0.00/6	0.00/2
5221681	C	A	True	1		0.154	0.056	False	False	0.00/2	1.00/1	0.00/2	0.00/5	0.20/5	0.00/8	0.25/4	0.00/4	0.00/2
5221686	T	A	True	1		0.05	0.0	False	False	0.33/3	0.00/3	0.25/4	0.00/8	0.00/5	0.00/10	0.00/9	0.00/7	0.00/2
5221712	A	G	True	1		0.103	0.088	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/6	0.08/13	0.29/7	0.15/13	0.10/10	0.00/5	0.00/6
5221713	A	T	True	3		0.3	0.265	False	False	0.33/3	0.33/3	0.17/6	0.21/14	0.57/7	0.15/13	0.20/10	0.40/5	0.50/6
5221782	C	G	True	1		0.043	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/9	0.00/6	0.00/8	0.00/4	0.00/2	0.00/5
5221812	G	A	True	3	0.6	0.091	0.31	False	True	0.60/5	0.00/4	0.00/5	0.22/9	0.00/4	0.00/5	0.15/13	0.50/6	0.80/5
5221816	T	A	True	6	0.2	0.325	0.289	False	False	0.20/5	0.38/8	0.25/8	0.20/15	0.56/9	0.42/12	0.33/15	0.43/7	0.00/11
5221840	C	T	True	1		0.235	0.2	False	True		0.25/4	0.33/3	0.14/7	0.33/3	0.20/5	0.67/3	0.00/2	0.00/5
5221933	G	A	True	5	0.4	0.152	0.308	False	True	0.40/5	0.08/12	0.17/12	0.23/13	0.11/9	0.25/8	0.33/21	0.30/10	0.31/13
5221964	C	T	True	2	0.4	0.167	0.1	False	True	0.40/5	0.33/3	0.00/1	0.20/5	0.00/3	0.00/2	0.00/4		0.25/4
5221975	T	C	True	1	0.2	0.1	0.059	False	False	0.20/15	0.00/17	0.00/13	0.07/15	0.33/15	0.08/13	0.12/24	0.00/15	0.00/16