pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
46177009	G	T	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/5	0.00/3	0.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/5	0.00/5
46177010	G	T	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/5
46177104	T	C	True	1	0.0	0.0	0.032	False	False	0.00/9	0.00/13	0.00/10	0.00/8	0.00/9	0.00/6	0.00/8	0.00/13	0.25/4
46177141	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/8	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/1	0.00/4	0.00/3	0.00/2
46177146	C	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/8	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/1	0.00/4	0.00/3	0.00/2
46177147	C	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/8	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/1	0.00/4	0.00/3	0.00/2
46177148	G	A	True	1	0.0	0.235	0.143	False	True	0.00/6	0.00/5	0.33/3	0.50/4	0.20/5	0.00/2	0.33/3	0.14/7	0.00/2
46177151	T	G	True	2	0.0	0.103	0.167	False	False	0.00/11	0.00/13	0.11/9	0.20/10	0.14/7	0.00/3	0.29/7	0.10/10	0.25/4
46177152	T	C	True	1	0.0	0.0	0.083	False	False	0.00/11	0.00/13	0.00/9	0.00/10	0.00/7	0.00/3	0.14/7	0.00/10	0.25/4
46177173	C	T	True	1	0.0	0.15	0.25	False	True	0.00/6	0.00/7	0.00/6	0.75/4	0.00/3		0.33/3	0.00/3	0.50/2
46177187	T	C	True	1	0.1	0.0	0.08	False	False	0.10/10	0.00/10	0.00/7	0.00/8	0.00/7	0.00/4	0.14/7	0.00/10	0.25/4
46177193	A	G	True	3	0.0	0.097	0.259	False	False	0.00/9	0.00/10	0.00/7	0.25/8	0.17/6	0.20/5	0.38/8	0.30/10	0.00/4
46177202	C	A	True	1	0.0	0.05	0.333	False	False	0.00/5	0.12/8	0.00/6	0.00/4	0.00/2	0.50/2	0.40/5	0.00/3	0.50/2
46177210	T	A	True	5	0.0	0.167	0.444	False	False	0.00/9	0.18/11	0.00/7	0.33/9	0.11/9	0.29/7	0.58/12	0.45/11	0.33/6
46177232	A	T	True	4	0.0	0.159	0.395	False	False	0.00/9	0.08/13	0.10/10	0.33/12	0.11/9	0.40/10	0.45/11	0.50/10	0.14/7
46177252	T	C	True	5	0.0	0.195	0.459	False	False	0.00/10	0.17/12	0.25/8	0.25/12	0.11/9	0.33/9	0.58/12	0.67/9	0.14/7
46177265	C	G	True	1	0.0	0.0	0.067	False	False	0.00/4	0.00/9	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/2	0.00/5	0.25/4	0.00/4
46177266	G	T	True	1	0.0	0.042	0.042	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/4	0.00/9	0.00/7	0.14/7	0.00/8	0.00/4	0.00/5
46177271	G	A	True	6	0.0	0.333	0.609	False	True	0.00/5	0.00/4	0.50/4	0.56/9	0.14/7	0.43/7	0.62/8	1.00/4	0.50/4
46177273	T	C	True	6	0.0	0.214	0.513	False	False	0.00/9	0.17/12	0.38/8	0.25/12	0.10/10	0.38/8	0.50/14	0.75/8	0.44/9
46177277	G	T	True	1	0.0	0.042	0.04	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/4	0.00/8	0.00/8	0.14/7	0.00/9	0.00/4	0.00/5
46177290	C	T	True	4		0.176	0.5	False	True	0.00/3	0.25/8	0.33/3	0.00/3	0.00/3	0.50/2	0.40/5	0.50/4	0.60/5
46177295	G	A	True	6	0.0	0.32	0.556	False	True	0.00/5	0.00/4	0.50/4	0.62/8	0.11/9	0.33/6	0.50/10	1.00/5	0.50/6
46177298	C	T	True	2		0.167	0.333	False	True	0.00/3	0.22/9	0.33/3	0.00/3	0.00/3	0.33/3	0.20/5	0.50/4	0.33/6
46177299	A	G	True	6	0.0	0.214	0.37	False	False	0.00/8	0.08/13	0.29/7	0.45/11	0.09/11	0.40/10	0.33/15	0.56/9	0.25/12
46177355	A	G	True	1	0.0	0.026	0.041	False	False	0.00/8	0.08/13	0.00/7	0.00/10	0.00/9	0.25/8	0.00/17	0.00/11	0.00/13
46177371	A	G	True	5	0.0	0.189	0.306	False	False	0.00/7	0.00/9	0.29/7	0.40/10	0.09/11	0.29/7	0.24/17	0.36/11	0.36/14
46177375	C	A	True	1		0.0	0.042	False	False	0.00/2	0.00/6	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.25/4	0.00/10	0.00/4	0.00/6
46177384	C	A	True	3		0.143	0.227	False	False	0.00/2	0.17/6	0.33/3	0.00/2	0.00/3	0.25/4	0.11/9	0.25/4	0.40/5
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46177435	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/7	0.00/5	0.00/8	0.00/10	0.00/10	0.00/14	0.00/8	0.00/13
46177436	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/7	0.00/5	0.00/8	0.00/10	0.00/10	0.00/14	0.00/7	0.00/13
46177443	T	A	True	3	0.0	0.143	0.261	False	False	0.00/4	0.14/7	0.00/5	0.29/7	0.11/9	0.36/11	0.20/15	0.12/8	0.33/12
46177451	A	G	True	3	0.0	0.1	0.222	False	False	0.00/5	0.00/7	0.00/5	0.29/7	0.09/11	0.18/11	0.14/14	0.25/8	0.33/12
46177460	A	T	True	1	0.0	0.1	0.182	False	False	0.00/5	0.14/7	0.00/4	0.12/8	0.09/11	0.11/9	0.20/15	0.12/8	0.25/12
46177477	A	G	True	1	0.0	0.065	0.156	False	False	0.00/5	0.00/7	0.00/6	0.14/7	0.09/11	0.10/10	0.13/15	0.12/8	0.25/12
46177492	C	T	True	1		0.0	0.188	False	True	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.33/3	0.12/8	0.00/1	0.25/4
46177493	A	T	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/7	0.00/7	0.00/6	0.00/9	0.00/10	0.00/14	0.00/7	0.00/11
46177615	C	G	True	1		0.0	0.143	False	False	0.00/1	0.00/4		0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.25/4
46177661	G	A	True	2		0.25	0.077	False	True	0.00/3	0.00/3	0.67/3	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/3	0.25/4
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46177737	A	T	True	1	0.25	0.048	0.0	False	False	0.25/4	0.20/5	0.00/7	0.00/7	0.00/2	0.00/4	0.00/1	0.00/4	0.00/7
46177738	T	C	True	1	0.25	0.05	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/7	0.14/7	0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.00/4	0.00/7
46177762	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/6	0.00/7	0.00/2	0.00/7	0.00/1	0.00/5	0.00/7
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