pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
39076028	C	A	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/6	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/2	0.00/9	0.00/1	0.29/7	0.00/5
39076034	C	A	True	0	0.0	0.286	0.0	False	False	0.00/6	0.33/3	0.00/1	1.00/1	0.00/2	0.00/9	0.00/1	0.00/7	0.00/5
39076072	T	C	True	1	0.111	0.111	0.103	False	False	0.11/9	0.00/5	0.00/2	1.00/1	0.00/1	0.08/12	0.00/3	0.29/7	0.00/7
39076104	T	C	True	1	0.125	0.25	0.125	False	False	0.12/8	0.00/4	0.33/3		1.00/1	0.00/9	0.00/3	0.43/7	0.00/5
39076115	T	C	True	1	0.143	0.25	0.12	False	False	0.14/7	0.00/4	0.33/3		1.00/1	0.00/9	0.00/3	0.43/7	0.00/6
39076117	T	A	True	1	0.125	0.25	0.16	False	False	0.12/8	0.00/4	0.33/3		1.00/1	0.00/9	0.50/2	0.43/7	0.00/7
39076135	C	T	True	1	0.0	0.0	0.095	False	True	0.00/5	0.00/4	0.00/2		0.00/1	0.00/7		0.29/7	0.00/7
39076151	T	C	True	2	0.0	0.444	0.227	False	False	0.00/5	0.00/5	1.00/2		1.00/2	0.33/6	0.00/2	0.33/6	0.12/8
39076185	T	G	True	1	0.0	0.111	0.0	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/3		0.00/2	0.00/7	0.00/2	0.00/5	0.00/8
39076208	C	T	True	0	0.0	0.556	0.062	False	True	0.00/4	0.00/4	1.00/3		1.00/2	0.00/3		0.20/5	0.00/8
39076231	T	G	True	1	0.0	0.091	0.0	False	False	0.00/7	0.00/5	0.25/4		0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.00/5	0.00/9
39076232	C	G	True	1	0.0	0.091	0.0	False	False	0.00/5	0.00/5	0.25/4		0.00/2	0.00/3		0.00/5	0.00/8
39076233	A	G	True	1	0.0	0.083	0.0	False	False	0.00/7	0.00/6	0.25/4		0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.00/5	0.00/9
39076234	C	G	True	1	0.0	0.091	0.0	False	False	0.00/5	0.00/5	0.25/4		0.00/2	0.00/3		0.00/4	0.00/8
39076251	G	A	True	0			0.25	False	True	0.50/2	0.00/1		0.00/1		0.00/1	0.00/1	1.00/1	0.00/1
39076293	G	T	True	0	0.0		0.25	False	False	0.00/4	0.00/1		0.00/1		1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1
39076303	C	T	True	1	0.25	0.125	0.0	False	True	0.25/4	0.00/4	0.00/2	1.00/1	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/5
39076338	C	T	True	1	0.0	0.167	0.0	False	True	0.00/4	0.25/4	0.00/1	0.00/1		0.00/2	0.00/2	0.00/5	0.00/2
39076340	T	A	True	0	0.167	0.25	0.0	False	False	0.17/6	0.20/5	0.00/1	0.50/2		0.00/1	0.00/3	0.00/5	0.00/3
39076346	T	C	True	1	0.333	0.444	0.125	False	False	0.33/6	0.20/5	1.00/1	0.50/2	1.00/1	0.50/2	0.00/5	0.17/6	0.00/3
39076370	A	T	True	1	0.0	0.125	0.0	False	False	0.00/6	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/5	0.00/8	0.00/5
39076381	G	A	True	0			0.25	False	True	0.00/2	0.00/1		0.00/1			0.00/1	0.50/2	0.00/1
39076386	G	T	True	0			0.25	False	False	0.00/2	0.00/1		0.00/1			0.00/1	0.50/2	0.00/1
39076420	T	C	True	2	0.333	0.143	0.0	False	False	0.33/6	0.25/4		0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/5	0.00/7	0.00/5
39076424	A	G	True	2	0.0	0.3	0.0	False	False	0.00/6	0.40/5		0.25/4	0.00/1	0.00/3	0.00/6	0.00/7	0.00/4
39076442	T	C	True	2	0.375	0.182	0.0	False	False	0.38/8	0.20/5	0.00/1	0.25/4	0.00/1	0.00/3	0.00/6	0.00/5	0.00/5
39076558	G	A	True	0		0.25		False	True	0.00/1	0.00/2	0.00/1	1.00/1				0.00/1	
39076589	C	T	True	1	0.0	0.0	0.043	False	True	0.00/20	0.00/8	0.00/5	0.00/10	0.00/1	0.00/3	0.00/7	0.00/9	0.25/4
39076590	T	A	True	1	0.0	0.0	0.043	False	False	0.00/21	0.00/11	0.00/6	0.00/10	0.00/1	0.00/3	0.00/7	0.00/9	0.25/4
39076594	G	A	True	0		0.4		False	True	0.00/1	0.50/2	0.50/2	0.00/1					
39076596	C	A	True	1	0.0	0.0	0.043	False	False	0.00/19	0.00/8	0.00/3	0.00/9	0.00/2	0.25/4	0.00/7	0.00/9	0.00/3
39076597	A	G	True	1	0.0	0.0	0.043	False	False	0.00/18	0.00/10	0.00/6	0.00/10	0.00/2	0.25/4	0.00/7	0.00/9	0.00/3
39076628	T	C	True	5	0.467	0.55	0.12	False	False	0.47/15	0.40/10	0.50/4	0.75/4	1.00/2	0.00/5	0.00/6	0.33/9	0.00/5
39076656	T	A	True	2	0.364	0.286	0.125	False	False	0.36/11	0.00/7	0.33/3	0.50/2	1.00/2	0.00/6	0.17/6	0.29/7	0.00/5
39076750	C	A	True	1	0.077	0.0	0.083	False	False	0.08/13	0.00/4	0.00/3			0.00/7	0.00/6	0.00/4	0.29/7
39076767	T	A	True	3	0.333	0.25	0.238	False	False	0.33/12	0.00/3	0.67/3	0.00/1	0.00/1	0.17/6	0.17/6	0.25/4	0.40/5
39076875	T	A	True	1	0.0	0.1	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/1	0.00/7	0.00/6	0.00/2	0.00/8
39076877	C	A	True	0	0.2	0.286	0.0	False	False	0.20/5	0.67/3	0.00/3	0.00/1		0.00/7	0.00/5	0.00/2	0.00/7
39076880	T	C	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/3	0.00/7	0.00/6	0.00/2	0.00/8
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39076979	G	T	True	0		0.25		False	False		0.50/2			0.00/2		0.00/1