pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
20391009	T	C	True	1		0.0	0.056	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/7	0.00/7	0.00/3	0.00/6	0.25/4	0.00/4	0.00/4
20391011	A	C	True	1		0.0	0.059	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/6	0.00/7	0.00/3	0.00/5	0.25/4	0.00/4	0.00/4
20391023	A	G	True	1		0.167		False	False		0.00/1	0.00/1	0.25/4			0.00/1		0.00/2
20391024	C	T	True	0		0.25		False	True		1.00/1	0.00/1	0.00/2			0.00/1	1.00/1	0.00/1
20391025	A	G	True	1		0.167		False	False		0.00/1	0.00/1	0.25/4				0.00/1	0.00/2
20391054	G	T	True	1		0.0	0.143	False	False		0.00/1	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.25/4		0.00/1	0.00/2
20391068	T	A	True	1	0.0	0.0	0.067	False	False	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/6	0.00/2	0.00/4	0.25/4	0.00/2	0.00/5
20391069	C	A	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/3
20391077	T	G	True	1		0.059	0.056	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/6	0.17/6	0.00/2	0.00/4	0.00/5	0.25/4	0.00/5
20391086	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/4	0.00/4
20391107	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/6	0.00/7	0.00/3	0.00/5	0.00/6	0.00/4	0.00/4
20391108	T	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/6	0.00/7	0.00/3	0.00/4	0.00/6	0.00/4	0.00/5
20391109	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.00/3	0.00/4	0.00/6	0.00/5	0.00/5
20391110	T	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.00/3	0.00/4	0.00/6	0.00/5	0.00/5
20391111	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.00/3	0.00/4	0.00/6	0.00/5	0.00/5
20391113	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.00/3	0.00/4	0.00/6	0.00/5	0.00/4
20391250	A	G	True	1	0.0	0.025	0.037	False	False	0.00/8	0.00/7	0.00/12	0.08/13	0.00/8	0.00/6	0.25/4	0.00/8	0.00/9
20391368	C	G	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/6	0.00/4	0.00/6	0.25/4	0.00/2	0.00/4
20391492	T	A	True	9	1.0	1.0	0.943	False	False	1.00/15	1.00/8	1.00/21	1.00/11	1.00/13	1.00/18	1.00/12	0.92/13	0.80/10
20391702	A	G	True	1	0.0	0.018	0.016	False	False	0.00/19	0.00/14	0.00/21	0.00/17	0.25/4	0.00/15	0.06/18	0.00/12	0.00/17
20391703	T	G	True	1	0.0	0.018	0.016	False	False	0.00/19	0.00/13	0.00/22	0.00/18	0.25/4	0.06/16	0.00/18	0.00/12	0.00/17
20391704	A	G	True	1	0.0	0.017	0.016	False	False	0.00/19	0.00/14	0.00/23	0.00/19	0.25/4	0.06/16	0.00/17	0.00/12	0.00/17
20391770	T	C	True	9	0.5	0.5	0.365	False	False	0.50/14	0.50/16	0.26/19	0.70/20	0.56/9	0.57/14	0.29/17	0.36/14	0.28/18
20391799	C	G	True	1	0.0	0.0	0.077	False	False	0.00/8	0.00/6	0.00/6	0.00/16	0.00/6	0.00/8	0.00/4	0.33/6	0.00/8
20391802	C	G	True	1	0.0	0.0	0.077	False	False	0.00/9	0.00/6	0.00/6	0.00/16	0.00/5	0.00/8	0.00/4	0.33/6	0.00/8
20391906	G	T	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/4	0.00/6	0.00/11	0.00/6	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/5
20391975	T	C	True	9	0.833	0.5	0.485	False	False	0.83/12	0.56/9	0.45/22	0.62/8	0.45/11	0.75/8	0.29/7	0.50/6	0.42/12
20391996	A	T	True	9	1.0	0.979	0.8	False	False	1.00/10	0.92/12	1.00/19	1.00/8	1.00/9	1.00/6	1.00/5	1.00/7	0.50/12
20391998	A	T	True	0		0.5	0.111	False	False	1.00/1	0.00/4	0.67/3		1.00/3		1.00/1	0.00/2	0.00/6
20391999	A	T	True	1		0.5	0.111	False	False	0.00/1	0.75/4	0.33/3		0.33/3		0.00/1	0.50/2	0.00/6