pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
62520002	T	C	True	4		0.194	0.588	False	False	1.00/2	0.17/6	0.00/6	0.08/13	0.67/6	0.80/5	0.67/6	0.00/1	0.40/5
62520011	A	T	True	7		0.562	1.0	False	False	1.00/3	0.50/6	0.50/6	0.46/13	0.86/7	1.00/5	1.00/6	1.00/1	1.00/6
62520039	C	T	True	2		0.312	0.0	False	True	1.00/2	0.00/3	0.00/3	0.40/5	0.60/5	0.00/4	0.00/4		0.00/2
62520042	A	T	True	7		0.583	1.0	False	False	1.00/3	0.50/8	0.50/6	0.50/14	0.88/8	1.00/4	1.00/7	1.00/1	1.00/6
62520052	G	A	True	4		0.727	1.0	False	True	1.00/1	0.67/6	1.00/3	0.56/9	1.00/4		1.00/3	1.00/1	1.00/5
62520053	G	T	True	4		0.727	1.0	False	False	1.00/1	0.67/6	1.00/3	0.56/9	1.00/4		1.00/3	1.00/1	1.00/5
62520139	A	T	True	7	0.5	0.595	1.0	False	False	0.50/6	0.67/6	0.57/7	0.29/14	1.00/10	1.00/5	1.00/6	1.00/1	1.00/3
62520145	G	T	True	1		0.045	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/9	0.00/6	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/3
62520168	T	C	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/6	0.00/12	0.00/10	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/2
62520171	T	C	True	1	0.0	0.062	0.0	False	False	0.00/4	0.50/4	0.00/6	0.00/12	0.00/10	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/2
62520172	T	C	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/6	0.00/12	0.00/10	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/2
62520173	T	C	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/6	0.00/12	0.00/10	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/2
62520175	A	C	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/6	0.00/12	0.00/10	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/2
62520177	A	C	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/6	0.00/12	0.00/10	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/2
62520196	G	T	True	1		0.133	0.0	False	False	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/8	0.40/5	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/2
62520214	A	T	True	2	0.0	0.238	0.778	True	False	0.00/4	0.00/2	0.20/5	0.10/10	0.75/4	0.75/4	0.50/2	1.00/1	1.00/2
62520222	T	G	True	1	0.0	0.118	0.0	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/5	0.25/8	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/1	0.00/2
62520229	T	C	True	2	0.25	0.0	0.111	False	False	0.25/4	0.00/1	0.00/4	0.00/8	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2
62520230	T	C	True	2	0.25	0.0	0.111	False	False	0.25/4	0.00/1	0.00/4	0.00/7	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2
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62520242	C	A	True	2		0.25	0.2	False	False	0.00/2	0.75/4	0.25/4	0.00/7	0.00/1	0.00/1	0.33/3	0.00/1	
62520247	A	G	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/3	0.00/6	0.00/6	0.00/10	0.00/4	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.25/4
62520261	A	G	True	1		0.036	0.0	False	False	0.00/2	0.00/8	0.00/6	0.00/10	0.25/4	0.00/1	0.00/4	0.00/3	0.00/4
62520263	T	A	True	4		0.414	1.0	True	False	0.00/3	0.88/8	0.20/5	0.30/10	0.17/6	1.00/1	1.00/4	1.00/3	1.00/4
62520273	A	G	True	1		0.034	0.071	False	False	0.00/3	0.11/9	0.00/4	0.00/11	0.00/5	0.00/2	0.00/4	0.25/4	0.00/4
62520304	C	A	True	1		0.0	0.071	False	False	0.00/3	0.00/8	0.00/4	0.00/10	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.25/4	0.00/4
62520328	C	T	True	6		0.593	1.0	False	True	0.50/2	1.00/8	0.25/4	0.45/11	0.50/4	1.00/3	1.00/3	1.00/4	1.00/5
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62520366	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/12	0.00/6	0.00/13	0.00/9	0.00/3	0.00/6	0.00/6	0.00/7
62520378	A	T	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/12	0.00/7	0.00/11	0.00/10	0.00/3	0.00/6	0.00/6	0.00/6
62520380	T	A	True	8	0.25	0.41	0.714	False	False	0.25/4	0.67/12	0.29/7	0.30/10	0.30/10	1.00/3	0.67/6	0.67/6	0.67/6
62520404	T	G	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/4	0.00/11	0.00/3	0.00/9	0.00/9	0.25/4	0.00/5	0.00/6	0.00/6
62520405	A	G	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/4	0.00/11	0.00/3	0.00/8	0.00/9	0.25/4	0.00/5	0.00/6	0.14/7
62520406	A	T	True	1	0.0	0.0	0.1	False	False	0.00/4	0.00/11	0.00/3	0.00/9	0.00/9	0.00/4	0.00/5	0.00/4	0.29/7
62520407	C	T	True	1		0.0	0.125	False	True	0.00/3	0.00/9	0.00/3	0.00/8	0.00/7	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.20/5
62520408	T	G	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/5	0.00/11	0.00/3	0.00/9	0.00/9	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/6
62520409	T	A	True	1	0.0	0.0	0.167	False	False	0.00/5	0.00/11	0.00/3	0.00/9	0.00/8	0.33/3	0.00/5	0.25/4	0.17/6
62520423	C	A	True	1		0.036	0.0	False	False	0.00/3	0.00/9	0.25/4	0.00/8	0.00/7	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/5
62520436	C	A	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/4	0.00/8	0.00/5	0.00/6	0.00/5	0.00/3	0.00/5	0.25/4	0.00/7
62520439	G	C	True	0		0.5		False	False	0.50/2		0.00/1	0.00/1	1.00/2		1.00/1	1.00/1	
62520444	C	A	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/4	0.00/7	0.00/5	0.00/6	0.00/4	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/6
62520445	T	A	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/6	0.00/7	0.00/6	0.00/7	0.00/6	0.25/4	0.00/6	0.00/5	0.00/6
62520472	A	T	True	2	0.0	0.0	0.24	False	False	0.00/6	0.00/8	0.00/7	0.00/10	0.00/9	0.75/4	0.00/6	0.43/7	0.00/8
62520577	T	A	True	9	1.0	0.69	1.0	False	False	1.00/7	0.56/9	0.50/8	0.92/13	0.67/12	1.00/5	1.00/5	1.00/9	1.00/12
62520580	T	C	True	9	0.857	0.571	0.903	False	False	0.86/7	0.56/9	0.50/8	0.77/13	0.42/12	1.00/5	0.80/5	0.78/9	1.00/12
62520618	G	C	True	0		0.0	0.25	False	False	0.00/1		0.00/3	0.00/2	0.00/3		0.00/1	0.50/2	0.00/1
62520623	G	A	True	0		0.556		False	True	1.00/1		0.00/3	0.67/3	1.00/3		1.00/1	1.00/1	1.00/1
62520631	T	C	True	9	1.0	0.675	1.0	False	False	1.00/6	0.64/11	0.57/7	0.75/12	0.70/10	1.00/7	1.00/4	1.00/6	1.00/10
62520675	G	A	True	0		0.667	1.0	False	True	1.00/2	1.00/1	0.00/2	0.67/3	1.00/3	1.00/2	1.00/1	1.00/1	1.00/2
62520719	G	A	True	1		0.636	1.0	False	True	1.00/2	1.00/3	0.00/1	0.75/4	0.33/3	1.00/2		1.00/1	1.00/2
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62520820	G	A	True	3		0.722	1.0	False	True	1.00/1	1.00/4	0.50/6	0.67/3	0.80/5	1.00/3	1.00/1	1.00/2	1.00/2
62520827	C	T	True	5	0.75	0.6	1.0	False	True	0.75/4	0.80/5	0.00/2	0.58/12	1.00/1	1.00/4	1.00/1		1.00/5
62520828	A	G	True	5	0.2	0.35	0.474	False	False	0.20/5	0.44/9	0.44/9	0.13/15	0.57/7	0.43/7	0.50/2	1.00/3	0.29/7
62520837	A	T	True	8	0.8	0.641	1.0	False	False	0.80/5	0.78/9	0.44/9	0.64/14	0.71/7	1.00/5	1.00/2	1.00/4	1.00/7
62520876	C	T	True	4	0.75	0.588	1.0	False	True	0.75/4	0.60/5	0.00/2	0.67/9	1.00/1	1.00/3	1.00/1	1.00/2	1.00/5
62520894	A	G	True	1	0.0	0.0	0.04	False	False	0.00/6	0.00/10	0.00/8	0.00/12	0.00/7	0.00/6	0.25/4	0.00/6	0.00/9
62520895	A	T	True	8	0.167	0.351	0.44	False	False	0.17/6	0.30/10	0.50/8	0.25/12	0.43/7	0.33/6	0.50/4	0.67/6	0.33/9
62520904	A	C	True	7	0.375	0.257	0.56	False	False	0.38/8	0.25/12	0.00/6	0.50/12	0.00/5	0.71/7	0.50/4	0.33/6	0.62/8
62520910	T	C	True	7	0.375	0.235	0.583	False	False	0.38/8	0.30/10	0.00/6	0.45/11	0.00/7	0.75/8	0.50/4	0.33/6	0.67/6
62520931	C	T	True	4	0.5	0.438	1.0	True	True	0.50/4	0.43/7	0.00/2	0.50/6	1.00/1	1.00/7	1.00/2	1.00/2	1.00/3
62520941	C	A	True	4	0.5	0.5	1.0	True	False	0.50/4	0.43/7	0.00/2	0.67/6	1.00/1	1.00/8	1.00/2	1.00/2	1.00/3
62520945	T	C	True	5	0.25	0.194	0.538	False	False	0.25/8	0.22/9	0.00/8	0.38/8	0.17/6	0.73/11	0.67/3	0.40/5	0.29/7
62520963	G	T	True	1	0.0	0.05	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/6	0.00/4	0.00/6	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/4
62520965	T	C	True	6	0.143	0.242	0.565	False	False	0.14/7	0.30/10	0.00/7	0.38/8	0.25/8	0.78/9	0.50/2	0.40/5	0.43/7
62520970	C	A	True	3		0.583	1.0	False	False	0.50/2	0.33/6		0.75/4	1.00/2	1.00/7	1.00/1	1.00/2	1.00/3
