pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
62503004	A	C	True	8	0.692	0.649	0.455	False	False	0.69/13	0.56/16	0.83/6	0.71/7	0.62/8	0.31/13	0.80/10	0.00/4	0.50/6
62503040	G	T	True	1		0.167	0.0	False	False	0.00/1	0.25/4		0.00/1	0.00/1	0.00/4	0.00/2		0.00/2
62503042	G	C	True	1		0.167	0.0	False	False	0.00/1	0.25/4		0.00/1	0.00/1	0.00/4	0.00/2		0.00/2
62503218	C	G	True	1	0.0	0.0	0.042	False	False	0.00/7	0.00/3	0.00/6	0.00/8	0.00/2	0.00/10	0.00/6	0.25/4	0.00/4
62503223	T	G	True	1	0.0	0.045	0.037	False	False	0.00/7	0.00/4	0.00/7	0.11/9	0.00/2	0.00/11	0.00/7	0.25/4	0.00/5
62503268	T	A	True	1	0.0	0.038	0.0	False	False	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/12	0.25/4	0.00/9	0.00/5	0.00/7	0.00/4
62503271	C	T	True	1	0.0	0.222	0.042	False	True	0.00/5	0.00/3	0.20/5	0.23/13	0.33/6	0.11/9	0.00/4	0.00/7	0.00/4
62503286	T	C	True	2	0.0	0.226	0.133	False	False	0.00/4	0.00/4	0.17/6	0.21/14	0.43/7	0.18/11	0.00/5	0.00/8	0.33/6
62503294	C	T	True	1	0.0	0.038	0.138	False	True	0.00/4	0.00/2	0.00/5	0.00/13	0.17/6	0.17/12	0.00/4	0.00/7	0.33/6
62503295	A	G	True	8	0.5	0.483	0.467	False	False	0.50/4	0.75/4	1.00/6	0.23/13	0.33/6	0.25/12	1.00/6	0.29/7	0.60/5
62503303	A	G	True	7	0.5	0.161	0.419	False	False	0.50/4	0.25/4	0.67/6	0.00/14	0.00/7	0.25/12	0.71/7	0.29/7	0.60/5
62503322	T	C	True	9	0.75	0.387	0.355	False	False	0.75/4	0.40/5	0.80/5	0.29/14	0.29/7	0.27/11	0.43/7	0.25/8	0.60/5
62503336	C	T	True	4	0.167	0.071	0.4	False	True	0.17/6	0.00/3	0.00/3	0.00/14	0.25/8	0.40/10	0.57/7	0.12/8	0.60/5
62503339	T	C	True	4	0.167	0.062	0.379	False	False	0.17/6	0.00/6	0.00/4	0.00/14	0.25/8	0.38/8	0.50/8	0.12/8	0.60/5
62503352	A	G	True	1	0.286	0.0	0.036	False	False	0.29/7	0.00/6	0.00/5	0.00/16	0.00/8	0.10/10	0.00/5	0.00/8	0.00/5
62503354	T	C	True	9	0.667	0.412	0.571	False	False	0.67/6	0.33/6	0.75/4	0.31/16	0.50/8	0.40/10	0.80/5	0.38/8	1.00/5
62503362	T	A	True	2	0.0	0.05	0.077	False	False	0.00/8	0.00/6	0.29/7	0.00/17	0.00/10	0.10/10	0.00/5	0.00/7	0.25/4
62503366	C	G	True	1	0.0	0.03	0.0	False	False	0.00/8	0.25/4	0.00/4	0.00/15	0.00/10	0.00/10	0.00/4	0.00/7	0.00/4
62503378	T	C	True	8	0.625	0.558	0.56	False	False	0.62/8	0.89/9	0.67/6	0.41/17	0.45/11	0.40/10	1.00/5	0.29/7	1.00/3
62503379	A	G	True	9	0.556	0.543	0.393	False	False	0.56/9	0.89/9	0.50/8	0.41/17	0.50/12	0.27/11	1.00/5	0.25/8	0.25/4
62503383	A	C	True	1	0.0	0.043	0.111	False	False	0.00/10	0.00/9	0.22/9	0.00/17	0.00/12	0.10/10	0.00/5	0.12/8	0.25/4
62503394	T	C	True	1	0.0	0.021	0.077	False	False	0.00/12	0.00/9	0.12/8	0.00/17	0.00/14	0.10/10	0.00/5	0.00/7	0.25/4
62503413	T	A	True	5	0.308	0.422	0.0	False	False	0.31/13	0.67/9	0.43/7	0.40/15	0.29/14	0.00/10	0.00/7	0.00/6	0.00/3
62503419	T	A	True	1	0.0	0.0	0.037	False	False	0.00/14	0.00/9	0.00/7	0.00/15	0.00/14	0.00/9	0.00/8	0.00/6	0.25/4
62503421	T	A	True	1	0.0	0.022	0.038	False	False	0.00/14	0.00/9	0.00/7	0.07/15	0.00/14	0.00/8	0.00/8	0.00/6	0.25/4
62503422	A	G	True	1	0.0	0.043	0.037	False	False	0.00/14	0.00/9	0.00/7	0.12/16	0.00/14	0.00/9	0.00/8	0.00/6	0.25/4
62503423	C	A	True	1	0.0	0.053	0.04	False	False	0.00/13	0.00/6	0.00/5	0.14/14	0.00/13	0.00/7	0.00/8	0.00/6	0.25/4
62503424	T	A	True	1	0.0	0.0	0.038	False	False	0.00/14	0.00/8	0.00/6	0.00/15	0.00/14	0.00/8	0.00/8	0.00/6	0.25/4
62503441	T	C	True	6	0.4	0.146	0.731	True	False	0.40/15	0.25/8	0.14/7	0.00/13	0.23/13	0.62/8	1.00/7	0.33/6	1.00/5
62503457	G	T	True	0		0.6		False	False	0.00/1	1.00/1	0.50/2	0.00/1	1.00/1	0.00/1	0.00/1		
62503487	G	A	True	0		0.5	0.0	False	True	0.00/1	1.00/1	0.50/2	0.00/2	1.00/1	0.00/4	0.00/1		
62503509	T	A	True	8	0.75	0.6	1.0	False	False	0.75/16	0.90/10	0.29/7	0.47/17	0.73/11	1.00/7	1.00/11	1.00/3	1.00/5
62503518	G	A	True	1		0.4	0.8	False	True	0.00/1	1.00/1	0.00/1	0.00/2	1.00/1	0.75/4	1.00/1		
62503528	C	T	True	4	0.357	0.378	0.0	False	True	0.36/14	0.33/6	0.20/5	0.50/16	0.30/10	0.00/4	0.00/9	0.00/2	0.00/5
62503584	C	T	True	3	0.125	0.366	0.0	False	True	0.12/8	0.38/8	0.20/5	0.50/16	0.25/12	0.00/6	0.00/9	0.00/3	0.00/4
62503600	A	C	True	3	0.167	0.375	0.0	False	False	0.17/12	0.27/11	0.17/6	0.50/18	0.38/13	0.00/10	0.00/10	0.00/4	0.00/3
62503668	C	G	True	1	0.0	0.033	0.0	False	False	0.00/10	0.00/6	0.25/4	0.00/13	0.00/7	0.00/7	0.00/5	0.00/5	0.00/5
62503669	C	G	True	1	0.0	0.033	0.0	False	False	0.00/10	0.00/6	0.25/4	0.00/13	0.00/7	0.00/7	0.00/5	0.00/5	0.00/5
62503670	C	A	True	1	0.0	0.033	0.0	False	False	0.00/10	0.00/6	0.25/4	0.00/13	0.00/7	0.00/7	0.00/5	0.00/5	0.00/5
62503683	G	A	True	1		0.429	0.6	False	True	0.50/2	1.00/2	1.00/1	0.00/2	0.00/2	1.00/4	1.00/1	0.00/4	1.00/1
62503728	G	A	True	2		0.385	0.556	False	True	0.50/2	0.75/4	0.25/4	0.00/3	0.50/2	1.00/2	1.00/1	0.00/4	1.00/2
62503751	A	C	True	4	0.2	0.143	0.556	False	False	0.20/10	0.22/9	0.12/8	0.00/10	0.25/8	0.62/8	0.50/2	0.38/8	0.67/9
62503754	C	T	True	6	0.333	0.4	0.941	True	True	0.33/6	0.60/5	0.50/4	0.17/6	0.40/5	0.86/7	1.00/1	1.00/3	1.00/6
62503769	A	C	True	4	0.222	0.156	0.643	False	False	0.22/9	0.25/8	0.17/6	0.00/9	0.22/9	0.89/9	0.50/2	0.33/9	0.75/8
62503781	T	A	True	7	0.333	0.281	0.778	False	False	0.33/9	0.50/8	0.33/6	0.00/9	0.33/9	0.89/9	1.00/2	0.38/8	1.00/8
62503824	A	C	True	1	0.091	0.031	0.04	False	False	0.09/11	0.00/10	0.25/4	0.00/8	0.00/10	0.00/7	0.00/3	0.00/6	0.11/9
62503825	T	C	True	6	0.273	0.333	0.8	False	False	0.27/11	0.60/10	0.00/2	0.00/8	0.40/10	1.00/7	1.00/3	0.43/7	0.88/8
62503836	G	T	True	0	0.0	0.0	0.3	False	False	0.00/5	0.00/5	0.00/3	0.00/5	0.00/5	0.00/2	0.00/2	1.00/3	0.00/3
62503877	G	C	True	1	0.0	0.0	0.083	False	False	0.00/6	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/6	0.00/3	0.00/1	0.00/4	0.25/4
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62503980	T	C	True	1	0.222	0.065	0.107	False	False	0.22/9	0.00/5	0.11/9	0.00/8	0.11/9	0.00/7	0.29/7	0.00/6	0.12/8
62503982	A	G	True	5	0.375	0.226	0.556	False	False	0.38/8	0.60/5	0.22/9	0.00/8	0.22/9	0.57/7	0.86/7	0.20/5	0.50/8
62503995	G	A	True	1	0.0	0.0	0.105	False	True	0.00/8	0.00/5	0.00/3	0.00/9	0.00/7	0.20/5	0.00/6	0.25/4	0.00/4
62503996	G	A	True	1	0.0	0.0	0.105	False	True	0.00/8	0.00/5	0.00/3	0.00/9	0.00/7	0.20/5	0.00/6	0.25/4	0.00/4
