pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
62501034	T	C	True	3	0.176	0.254	0.0	False	False	0.18/17	0.18/11	0.29/17	0.26/23	0.25/12	0.00/19	0.00/17	0.00/7	0.00/13
62501041	C	T	True	9	0.571	0.533	0.737	False	True	0.57/14	0.86/7	0.58/12	0.38/16	0.50/10	0.50/16	1.00/10	0.60/5	1.00/7
62501044	G	T	True	6	1.0	0.579	0.842	False	False	1.00/4	1.00/5	0.50/6	0.33/6	0.50/2	0.33/3	1.00/7	0.67/3	1.00/6
62501075	G	T	True	6	1.0	0.476	0.824	False	False	1.00/4	1.00/6	0.50/6	0.14/7	0.00/2	0.00/2	1.00/5	0.75/4	1.00/6
62501081	A	G	True	5	0.267	0.13	0.25	False	False	0.27/15	0.40/15	0.15/20	0.00/21	0.00/13	0.00/13	0.33/15	0.27/11	0.38/13
62501096	C	T	True	9	0.6	0.521	0.778	False	True	0.60/10	0.78/9	0.50/12	0.38/16	0.55/11	0.50/12	1.00/11	0.60/5	1.00/8
62501118	G	C	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/2	0.00/5	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/3
62501123	C	A	True	4	0.3	0.357	0.037	False	False	0.30/10	0.17/6	0.36/11	0.50/12	0.31/13	0.00/12	0.00/6	0.14/7	0.00/2
62501158	T	C	True	5	0.273	0.154	0.361	False	False	0.27/11	0.27/11	0.14/14	0.00/13	0.21/14	0.31/13	0.57/7	0.17/12	0.75/4
62501161	A	T	True	5	0.3	0.173	0.472	False	False	0.30/10	0.36/11	0.14/14	0.00/13	0.21/14	0.29/14	1.00/5	0.36/14	1.00/3
62501180	T	C	True	7	0.667	0.459	0.375	False	False	0.67/9	0.71/7	0.50/8	0.36/11	0.36/11	0.18/11	1.00/4	0.29/14	0.67/3
62501185	G	C	True	1		0.143	0.077	False	False	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.50/2	0.25/4	0.00/2	0.00/6	0.00/1
62501201	C	T	True	3	0.286	0.286	0.0	False	True	0.29/7	0.00/4	0.50/4	0.60/5	0.12/8	0.00/7	0.00/2	0.00/7	0.00/1
62501211	T	C	True	1	0.0	0.077	0.0	False	False	0.00/7	0.00/5	0.33/6	0.00/6	0.00/9	0.00/9	0.00/3	0.00/11	0.00/2
62501212	G	C	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/1	0.00/1	1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/4	0.00/1
62501214	G	C	True	1			0.111	False	False	0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.25/4	0.00/1
62501271	C	A	True	1	0.2	0.083	0.2	False	False	0.20/5	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.20/5	0.25/4		0.17/6	
62501277	C	G	True	1	0.0	0.077	0.0	False	False	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/5	0.00/4		0.00/6	
62501278	A	G	True	1	0.0	0.062	0.0	False	False	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/3	0.00/6	0.00/7	0.00/1	0.00/7	
62501280	A	G	True	1	0.0	0.062	0.0	False	False	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/3	0.00/6	0.00/7	0.00/1	0.00/7	
62501281	T	A	True	1	0.0	0.062	0.0	False	False	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/3	0.00/6	0.00/7	0.00/1	0.00/7	
62501282	C	A	True	1	0.0	0.077	0.0	False	False	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/5	0.00/4		0.00/6	
62501300	C	A	True	4	0.6	0.214	0.2	False	False	0.60/5	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.40/5	0.25/4		0.17/6	
62501302	A	T	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.25/4	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/7	
62501304	T	C	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.25/4	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/7	
62501333	C	T	True	2	0.5	0.2	0.0	False	True	0.50/4	0.00/3	0.00/5	0.00/2	0.60/5	0.00/5	0.00/1	0.00/6	0.00/3
62501334	T	A	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/6	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/7	0.00/3
62501344	C	G	True	1	0.0	0.062	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/5	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/6	0.00/4
62501349	G	C	True	0		0.0	0.25	False	False	0.00/2	0.00/2		0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/1	1.00/1	
62501416	G	T	True	1	0.25	0.429		False	False	0.25/4	0.50/2	0.00/1	0.67/3	0.00/1		0.00/2		0.00/1
62501417	C	A	True	5	0.429	0.5	0.0	True	False	0.43/7	0.57/7	0.40/5	0.38/8	0.67/6	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/5
62501439	C	T	True	4	0.0	0.111	0.824	True	True	0.00/5	0.25/8	0.00/5	0.00/8	0.17/6	0.67/3	1.00/5	0.50/4	1.00/5
62501458	A	G	True	4	0.182	0.114	0.882	True	False	0.18/11	0.27/11	0.00/7	0.00/11	0.17/6	1.00/4	1.00/6	0.50/4	1.00/3
62501478	A	G	True	5	0.2	0.152	0.895	True	False	0.20/15	0.30/10	0.00/6	0.00/10	0.29/7	0.80/5	1.00/6	0.67/3	1.00/5
62501510	A	T	True	8	0.632	0.639	0.913	False	False	0.63/19	0.67/9	0.33/9	0.62/8	0.90/10	0.83/6	1.00/7	0.67/3	1.00/7
62501518	T	A	True	5	0.158	0.143	0.704	True	False	0.16/19	0.33/9	0.00/9	0.00/7	0.20/10	0.50/6	0.75/8	0.50/4	0.89/9
62501521	G	A	True	1	0.5	0.429	1.0	False	True	0.50/6	1.00/1	0.00/1	0.00/3	1.00/2	1.00/2	1.00/2	1.00/1	1.00/1
62501542	C	A	True	8	0.5	0.545	0.87	False	False	0.50/10	0.62/8	0.22/9	0.43/7	0.89/9	0.60/5	1.00/5	0.75/4	1.00/9
62501626	C	A	True	1	0.0	0.0	0.05	False	False	0.00/7	0.00/10	0.00/12	0.00/3	0.00/7	0.00/6	0.00/3	0.25/4	0.00/7
62501644	A	G	True	3	0.25	0.111	0.357	False	False	0.25/12	0.21/14	0.09/11	0.00/3	0.00/8	0.17/6	0.62/8	0.40/5	0.22/9
62501648	C	A	True	6	0.6	0.625	1.0	False	False	0.60/5	0.71/7	0.44/9	0.67/3	0.80/5	1.00/5	1.00/3	1.00/3	1.00/7
62501656	A	T	True	1	0.0	0.0	0.364	False	False	0.00/7	0.00/4	0.00/7	0.00/2	0.00/6	0.00/3	1.00/2	0.50/4	0.00/2
62501657	T	A	True	1	0.182	0.161	0.036	False	False	0.18/11	0.09/11	0.10/10	0.50/2	0.25/8	0.00/7	0.00/8	0.20/5	0.00/8
62501663	G	T	True	1		0.167		False	False	0.00/2	0.00/2			0.25/4	0.00/1			
62501685	A	G	True	1	0.0	0.029	0.038	False	False	0.00/12	0.00/11	0.00/9	0.00/3	0.09/11	0.00/8	0.00/6	0.25/4	0.00/8
62501729	C	T	True	1	0.0	0.0	0.222	False	True	0.00/7	0.00/7	0.00/7	0.00/4	0.00/5	0.20/5	0.00/3	0.60/5	0.00/5
62501730	A	G	True	9	0.714	0.722	0.818	False	False	0.71/14	0.64/11	0.75/8	0.60/5	0.83/12	0.70/10	1.00/8	0.57/7	1.00/8
62501743	C	A	True	9	0.667	0.696	0.789	False	False	0.67/6	0.71/7	0.71/7	0.50/4	0.80/5	0.80/5	1.00/4	0.40/5	1.00/5
62501748	C	A	True	3	0.5	0.273	0.0	False	False	0.50/6	0.43/7	0.00/6	0.50/4	0.20/5	0.00/5	0.00/4	0.00/5	0.00/5
62501812	A	T	True	8	0.429	0.367	0.759	False	False	0.43/7	0.33/6	0.75/4	0.00/10	0.60/10	0.55/11	1.00/8	0.50/4	1.00/6
62501813	G	C	True	1		0.125	0.0	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/5	0.29/7	0.00/6	0.00/1		0.00/1
62501839	C	A	True	3		0.2	0.824	True	False	0.33/3	0.00/1	1.00/1	0.00/6	0.50/2	0.50/4	1.00/7	0.50/2	1.00/4
62501846	T	A	True	4		0.238	0.586	False	False	0.67/3	0.00/3		0.31/13	0.20/5	0.33/12	0.78/9	0.67/3	0.80/5
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62501855	C	T	True	2		0.143	0.812	False	True	0.50/2			0.00/6	1.00/1	0.50/4	1.00/7	0.50/2	1.00/3
62501857	G	C	True	1		0.077	0.0	False	False	0.00/1	0.00/2		0.00/7	0.25/4	0.00/8	0.00/2	0.00/1	0.00/1
62501858	T	C	True	1		0.222	0.0	False	False	0.33/3	0.00/1		0.31/13	0.00/4	0.00/12	0.00/9	0.00/4	0.00/4
62501873	G	A	True	1		0.25	0.0	False	True	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.43/7	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/1	0.00/1
62501874	G	T	True	1		0.25	0.0	False	False	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.43/7	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/1	0.00/1
62501893	C	A	True	2		0.75	0.923	False	False	1.00/1			0.75/4		1.00/3	1.00/5	0.67/3	1.00/2
62501894	C	A	True	1		0.75	0.0	False	False	0.00/1			0.75/4		0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/2
62501897	T	C	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/2	0.00/12	0.25/4	0.00/10	0.00/7	0.00/4	0.00/3
62501925	A	C	True	1	0.25	0.0	0.048	False	False	0.25/4	0.00/1	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/10	0.17/6	0.00/3	0.00/2
62501926	A	C	True	1	0.25	0.0	0.048	False	False	0.25/4	0.00/2	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/10	0.17/6	0.00/3	0.00/2
62501929	A	T	True	1	0.0	0.0	0.143	False	False	0.00/4	0.00/2	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.30/10	0.00/5	0.00/4	0.00/2
62501930	A	T	True	3		0.143	0.409	False	False	0.50/2	0.50/2	0.00/3	0.00/6	0.33/3	0.40/10	0.50/6	0.25/4	0.50/2
62501931	C	A	True	0			0.3	False	False		0.00/1	0.00/1		0.00/1	0.33/3	0.33/3	0.33/3	0.00/1
62501943	C	A	True	0		0.8	1.0	False	False			1.00/1	1.00/2	0.50/2	1.00/1	1.00/2	1.00/1	
62501944	C	A	True	0		0.6	1.0	False	False			1.00/1	0.00/2	1.00/2	1.00/1	1.00/2	1.00/1	
62501952	C	T	True	0		0.25	0.0	False	True		0.00/1	0.00/2	0.67/3	0.00/2	0.00/3	0.00/4	0.00/2	0.00/1
62501959	C	T	True	1		0.4	0.0	False	True		0.00/2	0.00/2	1.00/4	0.00/2	0.00/3	0.00/6	0.00/2	0.00/1
62501961	G	A	True	1		0.182	0.0	False	True	0.50/2	0.00/1	0.00/3	0.33/6	0.00/1	0.00/4	0.00/2	0.00/1	
62501969	C	T	True	1		0.5	0.0	True	True	0.00/1	0.00/2	0.33/3	1.00/5	0.00/2	0.00/3	0.00/6	0.00/2	0.00/2
62501985	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/6	0.00/6	0.00/10	0.00/3	0.00/6	0.00/9	0.00/2	0.00/3
62501996	C	A	True	1		0.062	0.0	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.25/4	0.00/3	0.00/7	0.00/2	0.00/3
