pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
62488028	T	C	True	1	0.5	0.029	0.0	False	False	0.50/4	0.00/8	0.00/7	0.09/11	0.00/9	0.00/7	0.00/5	0.00/3	0.00/12
62488038	A	G	True	1	0.0	0.0	0.045	False	False	0.00/4	0.00/8	0.00/7	0.00/10	0.00/9	0.00/5	0.25/4	0.00/2	0.00/11
62488039	C	G	True	1		0.062	0.0	False	False	0.00/3	0.00/4	0.00/4	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/4
62488043	C	G	True	1		0.062	0.0	False	False	0.00/2	0.00/4	0.00/4	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/4
62488053	A	C	True	1		0.121	0.0	False	False	0.00/3	0.25/8	0.00/7	0.22/9	0.00/9	0.00/5	0.00/6	0.00/2	0.00/10
62488054	A	G	True	1		0.121	0.0	False	False	0.00/3	0.25/8	0.00/7	0.22/9	0.00/9	0.00/5	0.00/7	0.00/2	0.00/11
62488059	G	T	True	1		0.176	0.0	False	False	0.00/1	0.33/3	0.00/3	0.33/6	0.00/5	0.00/2	0.00/4	0.00/1	0.00/7
62488080	A	C	True	1		0.0	0.034	False	False	0.00/2	0.00/8	0.00/8	0.00/8	0.00/9	0.00/9	0.00/7	0.25/4	0.00/9
62488095	G	T	True	1		0.0	0.071	False	False	0.00/1	0.00/4	0.00/6	0.00/5	0.00/6	0.00/4	0.00/4	0.00/2	0.25/4
62488097	C	G	True	1		0.077	0.0	False	False	0.00/2	0.00/6	0.00/2	0.25/4	0.00/1	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.00/5
62488104	T	C	True	1		0.152	0.0	False	False	0.00/3	0.20/10	0.00/8	0.33/9	0.00/6	0.00/9	0.00/6	0.00/2	0.00/8
62488124	T	C	True	1	0.0	0.147	0.0	False	False	0.00/6	0.22/9	0.00/9	0.33/9	0.00/7	0.00/9	0.00/6	0.00/2	0.00/7
62488143	G	A	True	1		0.182	0.0	False	True	0.00/3	0.00/3	0.00/7	0.50/8	0.00/4	0.00/5	0.00/4	0.00/2	0.00/2
62488146	A	G	True	1	0.0	0.231	0.0	False	False	0.00/6	0.20/10	0.00/10	0.54/13	0.00/6	0.00/10	0.00/4	0.00/2	0.00/6
62488156	T	C	True	2	0.0	0.279	0.0	False	False	0.00/6	0.25/12	0.08/12	0.62/13	0.00/6	0.00/9	0.00/4	0.00/4	0.00/5
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62488233	A	G	True	1	0.0	0.175	0.0	False	False	0.00/8	0.11/9	0.09/11	0.38/13	0.00/7	0.00/10	0.00/7	0.00/7	0.00/9
62488243	C	T	True	1	0.0	0.333	0.0	False	True	0.00/6	0.20/5	0.33/3	0.60/5	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/3
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62488293	C	T	True	1	0.0	0.308	0.0	False	True	0.00/6	0.20/5	0.50/2	0.50/4	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/3
62488299	A	T	True	1	0.0	0.194	0.0	False	False	0.00/10	0.12/8	0.12/8	0.40/10	0.00/5	0.00/9	0.00/10	0.00/8	0.00/13
62488303	A	G	True	1	0.0	0.194	0.0	False	False	0.00/10	0.12/8	0.12/8	0.40/10	0.00/5	0.00/9	0.00/11	0.00/8	0.00/13
62488328	T	A	True	2	0.0	0.2	0.0	False	False	0.00/10	0.25/4	0.17/6	0.33/6	0.00/4	0.00/10	0.00/8	0.00/7	0.00/13
62488339	G	T	True	2		0.308	0.0	False	False	0.00/3	0.33/3	0.25/4	0.50/4	0.00/2	0.00/8	0.00/6	0.00/5	0.00/10
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62488360	G	A	True	2		0.25	0.0	False	True	0.00/3	0.25/4	0.25/4	0.33/3	0.00/1	0.00/5	0.00/8	0.00/4	0.00/9
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62488417	A	G	True	1	0.0	0.083	0.0	False	False	0.00/7	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.00/10	0.00/6	0.00/13
62488419	A	G	True	1	0.0	0.083	0.0	False	False	0.00/7	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.00/10	0.00/6	0.00/12
62488420	C	A	True	0	0.0	0.25	0.0	False	False	0.00/4	0.00/1		0.50/2	0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/2
62488421	T	A	True	1	0.143	0.1	0.0	False	False	0.14/7	0.00/3	0.00/2	0.25/4	0.00/1	0.00/6	0.00/10	0.00/6	0.00/11
62488454	G	A	True	1		0.273	0.0	False	True	0.00/2	0.25/4	0.33/3	0.00/3	1.00/1	0.00/6	0.00/10	0.00/3	0.00/8
62488464	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/2	0.00/2	0.00/2		0.00/2		0.00/2	0.00/1
62488466	T	A	True	2	0.167	0.286	0.0	False	False	0.17/6	0.25/8	0.40/5	0.14/7	1.00/1	0.00/5	0.00/9	0.00/6	0.00/8
62488472	G	T	True	1		0.0	0.045	False	False	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/4	0.00/9	0.25/4	0.00/5
62488474	G	C	True	1		0.0	0.043	False	False	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/5	0.00/9	0.25/4	0.00/5
62488504	G	T	True	1		0.0	0.048	False	False	0.00/3	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/5
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62488560	C	G	True	0	0.0	0.0	0.25	False	False	0.00/6	0.00/5	0.00/5	0.00/2	0.00/4	0.00/1		0.00/1	0.50/2
62488579	C	G	True	1	0.0	0.048	0.0	False	False	0.00/5	0.00/7	0.00/4	0.25/4	0.00/6	0.00/1		0.00/2	0.00/2
62488597	G	T	True	2	0.125	0.292	0.0	False	False	0.12/8	0.38/8	0.17/6	0.60/5	0.00/5	0.00/9	0.00/4	0.00/8	0.00/6
62488610	T	A	True	3	0.077	0.356	0.0	False	False	0.08/13	0.33/15	0.36/11	0.75/8	0.09/11	0.00/11	0.00/6	0.00/11	0.00/8
62488634	A	G	True	1	0.118	0.156	0.0	False	False	0.12/17	0.14/14	0.18/11	0.33/9	0.00/11	0.00/8	0.00/6	0.00/13	0.00/9
62488658	G	A	True	1	0.111	0.25	0.0	False	True	0.11/9	0.20/5	0.29/7	0.67/3	0.00/5	0.00/6	0.00/4	0.00/10	0.00/6
62488661	C	A	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/6	0.00/6	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/2
62488662	C	A	True	1	0.0	0.048	0.0	False	False	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/6	0.00/5	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/2
62488667	C	T	True	4	0.167	0.35	0.0	False	True	0.17/6	0.33/6	0.25/4	0.50/6	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/2
62488678	A	G	True	2	0.059	0.163	0.0	False	False	0.06/17	0.08/12	0.27/11	0.27/11	0.00/9	0.00/8	0.00/6	0.00/11	0.00/8
62488683	C	G	True	3	0.167	0.304	0.0	False	False	0.17/6	0.25/8	0.20/5	0.50/6	0.25/4		0.00/2	0.00/2	0.00/2
62488702	C	A	True	2	0.4	0.286	0.0	False	False	0.40/5	0.14/7	0.20/5	0.50/6	0.33/3	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/2
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62488708	C	T	True	2	0.4	0.3	0.0	False	True	0.40/5	0.14/7	0.20/5	0.50/6	0.50/2	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/2
62488709	A	G	True	1	0.067	0.19	0.0	False	False	0.07/15	0.18/11	0.27/11	0.21/14	0.00/6	0.00/9	0.00/5	0.00/11	0.00/7
62488798	C	A	True	1	0.25	0.118	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.17/6	0.20/5	0.00/2	0.00/5	0.00/2		0.00/2
62488803	T	C	True	5	0.333	0.243	0.323	False	False	0.33/15	0.22/9	0.50/10	0.08/13	0.20/5	0.36/14	0.50/4	0.25/4	0.22/9
62488810	A	T	True	1	0.071	0.25	0.0	False	False	0.07/14	0.22/9	0.40/10	0.17/12	0.20/5	0.00/17	0.00/5	0.00/5	0.00/8
62488822	A	G	True	1	0.0	0.139	0.0	False	False	0.00/13	0.25/8	0.20/10	0.00/12	0.17/6	0.00/16	0.00/4	0.00/4	0.00/8
62488827	G	A	True	2	0.0	0.25	0.0	False	True	0.00/9	0.33/6	0.67/3	0.00/7	0.25/4	0.00/9	0.00/2	0.00/3	0.00/7
62488959	G	T	True	1	0.0	0.0	0.083	False	False	0.00/8	0.00/4	0.00/4	0.00/7	0.00/3	0.25/4	0.00/3	0.00/1	0.00/4
62488979	A	C	True	1	0.0	0.0	0.056	False	False	0.00/9	0.00/5	0.00/8	0.00/10	0.00/2	0.00/8	0.00/5	0.00/1	0.25/4
62488990	T	A	True	0			0.4	False	False	0.00/1			0.00/2		0.67/3	0.00/2		
62488991	T	C	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/9	0.00/5	0.00/8	0.00/9	0.00/2	0.00/8	0.25/4	0.00/1	0.00/3
62488995	T	C	True	1	0.0	0.043	0.062	False	False	0.00/9	0.00/5	0.00/8	0.12/8	0.00/2	0.00/8	0.25/4	0.00/1	0.00/3
62488999	T	C	True	1	0.0	0.043	0.062	False	False	0.00/8	0.00/5	0.00/8	0.12/8	0.00/2	0.00/8	0.25/4	0.00/1	0.00/3
