pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
31754030	C	T	True	1	0.0	0.083	0.0	False	True	0.00/5	0.25/4		0.00/3	0.00/5	0.00/3		0.00/2	0.00/5
31754054	C	T	True	2	0.5	0.4	0.0	False	True	0.50/6	0.67/6	0.00/1	0.67/3	0.00/5	0.00/3		0.00/3	0.00/4
31754058	C	T	True	1	0.0	0.176	0.0	False	True	0.00/7	0.14/7	0.00/1	0.00/3	0.33/6	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/5
31754080	C	A	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/6	0.00/8	0.00/1	0.25/4	0.00/6	0.00/5	0.00/3	0.00/1	0.00/5
31754081	C	A	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/6	0.00/8	0.00/1	0.25/4	0.00/5	0.00/5	0.00/3	0.00/1	0.00/5
31754082	T	C	True	1	0.0	0.129	0.036	False	False	0.00/10	0.08/13	0.00/1	0.33/6	0.09/11	0.12/8	0.00/8	0.00/2	0.00/10
31754083	T	A	True	4	0.4	0.645	0.0	True	False	0.40/10	0.62/13	0.00/1	0.83/6	0.64/11	0.00/8	0.00/8	0.00/2	0.00/9
31754084	C	A	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/6	0.00/8	0.00/1	0.25/4	0.00/5	0.00/5	0.00/4	0.00/1	0.00/5
31754086	C	A	True	1	0.0	0.105	0.0	False	False	0.00/6	0.11/9	0.00/1	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/1	0.00/5
31754090	G	T	True	2	0.0	0.385	0.0	False	False	0.00/4	0.40/5		0.33/3	0.40/5	0.00/3	0.00/5	0.00/1	0.00/5
31754094	A	G	True	1	0.1	0.25	0.0	False	False	0.10/10	0.21/14	0.00/1	0.14/7	0.40/10	0.00/9	0.00/10	0.00/2	0.00/10
31754138	C	T	True	2	0.143	0.273	0.056	False	True	0.14/7	0.18/11	0.00/1	0.40/5	0.40/5	0.14/7	0.00/6	0.00/2	0.00/3
31754147	T	C	True	1	0.1	0.206	0.0	False	False	0.10/10	0.15/13	0.00/2	0.50/6	0.15/13	0.00/11	0.00/14	0.00/4	0.00/7
31754154	T	C	True	1	0.167	0.258	0.0	False	False	0.17/12	0.23/13	0.00/2	0.60/5	0.18/11	0.00/11	0.00/14	0.00/4	0.00/7
31754166	T	C	True	1	0.071	0.133	0.029	False	False	0.07/14	0.31/13	0.00/2	0.00/5	0.00/10	0.08/12	0.00/11	0.00/4	0.00/7
31754182	T	C	True	1	0.143	0.276	0.029	False	False	0.14/14	0.23/13	0.00/1	0.60/5	0.20/10	0.00/12	0.00/10	0.00/3	0.11/9
31754208	A	G	True	1	0.0	0.0	0.031	False	False	0.00/10	0.00/10	0.00/2	0.00/4	0.00/10	0.00/10	0.00/11	0.25/4	0.00/7
31754217	G	T	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/1		0.00/4	0.00/5	0.00/5	0.00/2	0.25/4
31754262	T	A	True	3	0.5	0.409	0.0	False	False	0.50/4	0.29/7	0.00/3	1.00/2	0.50/10	0.00/8	0.00/11	0.00/3	0.00/11
31754263	C	T	True	2		0.429	0.0	False	True	0.33/3	0.33/6	0.00/2	1.00/2	0.50/4	0.00/4	0.00/7	0.00/1	0.00/6
31754264	T	A	True	3	0.5	0.409	0.0	False	False	0.50/4	0.29/7	0.00/3	1.00/2	0.50/10	0.00/8	0.00/11	0.00/3	0.00/11
31754282	T	A	True	3	0.6	0.385	0.033	False	False	0.60/5	0.29/7	0.00/4	0.67/3	0.50/12	0.00/6	0.00/8	0.00/3	0.08/13
31754311	C	G	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/7
31754314	C	A	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/1	0.00/7
31754321	A	G	True	1	0.0	0.0	0.031	False	False	0.00/7	0.00/7	0.00/6	0.00/2	0.00/10	0.00/7	0.00/7	0.25/4	0.00/14
31754323	A	G	True	1	0.0	0.0	0.03	False	False	0.00/7	0.00/9	0.00/6	0.00/2	0.00/10	0.00/7	0.00/8	0.25/4	0.00/14
31754327	A	G	True	1	0.0	0.0	0.031	False	False	0.00/7	0.00/10	0.00/6	0.00/3	0.00/10	0.00/7	0.00/7	0.25/4	0.00/14
31754329	A	G	True	1	0.0	0.0	0.03	False	False	0.00/7	0.00/10	0.00/6	0.00/3	0.00/10	0.00/7	0.00/8	0.25/4	0.00/14
31754387	T	A	True	4	0.571	0.515	0.0	True	False	0.57/7	0.50/10	0.00/6	0.71/7	0.70/10	0.00/10	0.00/8	0.00/5	0.00/11
31754453	G	T	True	4	0.75	0.722	0.0	True	False	0.75/4	0.60/5	0.00/1	1.00/6	0.67/6	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/4
31754458	T	C	True	1	0.0	0.0	0.034	False	False	0.00/9	0.00/9	0.00/8	0.00/11	0.00/9	0.00/10	0.25/4	0.00/7	0.00/8
31754459	A	T	True	1	0.0	0.0	0.033	False	False	0.00/9	0.00/9	0.00/8	0.00/11	0.00/8	0.00/10	0.25/4	0.00/7	0.00/9
31754461	A	T	True	1	0.0	0.0	0.033	False	False	0.00/9	0.00/9	0.00/8	0.00/11	0.00/8	0.00/10	0.25/4	0.00/7	0.00/9
31754463	A	T	True	1	0.0	0.0	0.033	False	False	0.00/9	0.00/9	0.00/7	0.00/11	0.00/8	0.00/10	0.25/4	0.00/7	0.00/9
31754464	T	C	True	1	0.0	0.028	0.033	False	False	0.00/9	0.11/9	0.00/8	0.00/11	0.00/8	0.00/10	0.25/4	0.00/7	0.00/9
31754518	G	T	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/6	0.00/4	0.00/1	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.00/2
31754521	A	T	True	3	0.444	0.296	0.0	False	False	0.44/9	0.17/6	0.00/7	0.56/9	0.40/5	0.00/10	0.00/6	0.00/10	0.00/6
31754538	A	G	True	4	0.429	0.24	0.0	False	False	0.43/7	0.25/4	0.00/7	0.40/10	0.25/4	0.00/10	0.00/6	0.00/9	0.00/5
31754542	T	G	True	4	0.5	0.217	0.0	False	False	0.50/6	0.25/4	0.00/7	0.38/8	0.25/4	0.00/10	0.00/6	0.00/8	0.00/5
31754590	T	C	True	1	0.0	0.04	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/6	0.00/8	0.00/7	0.00/10	0.00/6	0.00/7	0.00/5
31754595	A	C	True	1	0.0	0.04	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/6	0.00/8	0.00/7	0.00/10	0.00/6	0.00/7	0.00/4
31754596	T	C	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/5	0.00/8	0.00/7	0.00/10	0.00/6	0.00/7	0.00/4
31754598	A	C	True	1	0.0	0.043	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/4	0.00/8	0.00/7	0.00/10	0.00/6	0.00/7	0.00/4
31754612	G	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	True	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/4	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/2	0.00/1
31754613	A	T	True	1	0.333	0.0	0.0	False	False	0.33/6	0.00/3	0.00/3	0.00/7	0.00/7	0.00/9	0.00/6	0.00/7	0.00/3
31754621	T	C	True	2	0.125	0.25	0.0	False	False	0.12/8	0.00/3	0.00/3	0.43/7	0.29/7	0.00/9	0.00/6	0.00/5	0.00/3
31754641	G	C	True	1	0.0	0.091	0.0	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/2	0.00/4	0.25/4	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/1
31754645	A	T	True	1	0.0	0.045	0.056	False	False	0.00/7	0.00/3	0.00/4	0.00/8	0.14/7	0.00/6	0.00/5	0.25/4	0.00/3
31754646	T	C	True	1	0.0	0.045	0.056	False	False	0.00/7	0.00/3	0.00/4	0.00/8	0.14/7	0.00/6	0.00/5	0.25/4	0.00/3
31754648	A	C	True	1	0.0	0.0	0.056	False	False	0.00/7	0.00/3	0.00/4	0.00/8	0.00/6	0.00/6	0.00/5	0.25/4	0.00/3
31754678	G	T	True	1	0.0	0.1	0.0	False	False	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.25/4	0.00/2	0.00/3	0.00/2		0.00/2
31754679	T	A	True	1	0.0	0.05	0.0	False	False	0.00/8	0.25/4	0.00/5	0.00/7	0.00/4	0.00/6	0.00/5	0.00/1	0.00/3
31754690	C	A	True	1	0.0	0.083	0.0	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/5	0.00/3		0.00/2
31754711	G	C	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/4	0.00/2		0.00/2
31754732	A	T	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/8	0.00/4		0.00/5
31754733	T	A	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/8	0.00/4		0.00/5
31754734	T	A	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/8	0.00/4		0.00/5
31754738	A	T	True	2	0.286	0.056	0.0	False	False	0.29/7	0.00/5	0.00/5	0.00/4	0.25/4	0.00/8	0.00/4		0.00/6
31754745	C	T	True	1		0.364	0.0	False	True	0.33/3	0.50/4	0.00/3	0.67/3	0.00/1	0.00/5	0.00/2		0.00/3
31754774	C	T	True	1	0.25	0.5	0.0	True	True	0.25/4	1.00/2	0.00/3	0.67/3		0.00/5	0.00/2		0.00/4
31754779	A	G	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/6	0.00/4	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/9	0.00/3		0.00/7
31754805	C	T	True	1		0.667	0.0	True	True	0.00/3	1.00/2	0.00/2	0.75/4	1.00/1	0.00/3	0.00/2	0.00/1	0.00/4
31754807	T	C	True	1	0.0	0.0	0.05	False	False	0.00/5	0.00/4	0.00/2	0.00/4	0.00/5	0.00/7	0.25/4	0.00/1	0.00/8
31754811	G	C	True	1		0.143	0.125	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/1		0.25/4	0.00/2	0.50/2		0.00/4
31754812	A	C	True	1	0.0	0.0	0.056	False	False	0.00/5	0.00/4	0.00/2	0.00/5	0.00/4	0.00/5	0.25/4	0.00/1	0.00/8
31754813	T	C	True	1	0.0	0.0	0.056	False	False	0.00/5	0.00/3	0.00/2	0.00/5	0.00/4	0.00/5	0.25/4	0.00/1	0.00/8
31754833	T	C	True	1		0.067	0.059	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/2	0.00/6	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/1	0.12/8
31754883	A	T	True	1		0.0	0.091	False	False	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/5	0.00/1		0.00/4	0.00/3	0.25/4
31754886	A	T	True	1		0.0	0.091	False	False	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/5	0.00/2		0.00/4	0.00/3	0.25/4
31754920	A	G	True	1		0.053	0.062	False	False	0.00/2	0.00/4	0.00/5	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/5	0.00/3	0.20/5
31754923	T	A	True	1		0.053	0.0	False	False	0.00/2	0.00/4	0.00/5	0.00/6	0.25/4	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/5
31754925	A	G	True	1		0.05	0.0	False	False	0.00/3	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/5
31754948	A	G	True	2		0.158	0.0	False	False	0.00/3	0.33/6	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/7	0.00/6	0.00/5	0.00/7
31754973	T	G	True	1		0.05	0.0	False	False	0.00/2	0.00/7	0.00/4	0.25/4	0.00/5	0.00/8	0.00/7	0.00/5	0.00/9
31754976	T	G	True	1		0.053	0.0	False	False	0.00/2	0.00/7	0.00/3	0.25/4	0.00/5	0.00/8	0.00/7	0.00/5	0.00/9
31754990	C	A	True	1		0.062	0.0	False	False	0.00/1	0.00/3	0.00/3	0.25/4	0.00/6	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/8
