pos ref alt in_target n_oysters_with_alt alt_freq_Pum alt_freq_Qui alt_freq_Rio pop_differentiated cpg_destroying Pum1 Qui1 Qui2 Qui3 Qui4 Rio1 Rio2 Rio3 Rio4 5210011 C A True 6 0.0 0.28 0.298 False False 0.00/8 0.27/15 0.18/11 0.36/14 0.30/10 0.18/22 0.25/8 0.60/5 0.42/12 5210040 C T True 5 0.0 0.273 0.238 False True 0.00/9 0.27/15 0.15/13 0.38/16 0.27/11 0.11/18 0.22/9 0.50/4 0.36/11 5210043 C A True 5 0.0 0.273 0.238 False False 0.00/9 0.27/15 0.15/13 0.38/16 0.27/11 0.11/18 0.22/9 0.50/4 0.36/11 5210048 T A True 1 0.0 0.054 0.068 False False 0.00/10 0.06/16 0.07/14 0.06/16 0.00/10 0.05/19 0.10/10 0.25/4 0.00/11 5210089 T A True 1 0.0 0.041 0.109 False False 0.00/13 0.06/16 0.08/12 0.00/12 0.00/9 0.11/19 0.09/11 0.33/6 0.00/10 5210103 C T True 1 0.3 0.021 0.111 False True 0.30/10 0.07/15 0.00/12 0.00/10 0.00/11 0.11/19 0.09/11 0.17/6 0.11/9 5210184 T C True 4 0.364 0.1 0.179 False False 0.36/11 0.08/12 0.00/7 0.00/4 0.29/7 0.00/12 0.43/7 0.25/4 0.20/5 5210187 T C True 3 0.417 0.107 0.2 False False 0.42/12 0.09/11 0.00/7 0.00/3 0.29/7 0.00/11 0.50/6 0.33/3 0.20/5 5210191 T C True 4 0.417 0.107 0.192 False False 0.42/12 0.09/11 0.00/7 0.00/3 0.29/7 0.00/11 0.50/6 0.25/4 0.20/5 5210272 C T True 2 0.083 0.0 0.25 False True 0.08/12 0.00/15 0.00/5 0.00/6 0.00/7 0.27/11 0.36/11 0.00/4 0.17/6 5210279 C A True 4 0.091 0.171 0.212 False False 0.09/11 0.12/16 0.00/5 0.29/7 0.29/7 0.17/12 0.27/11 0.00/4 0.33/6 5210349 C A True 1 0.182 0.097 0.088 False False 0.18/11 0.15/13 0.00/6 0.12/8 0.00/4 0.00/10 0.00/13 0.50/4 0.14/7 5210357 A G True 4 0.364 0.029 0.371 False False 0.36/11 0.07/14 0.00/5 0.00/8 0.00/7 0.40/10 0.40/15 0.33/3 0.29/7 5210401 C T True 5 0.0 0.308 0.321 False True 0.00/9 0.33/9 0.00/2 0.50/8 0.14/7 0.30/10 0.50/8 0.00/3 0.29/7 5210402 C A True 2 0.333 0.154 0.107 False False 0.33/9 0.22/9 0.00/2 0.12/8 0.14/7 0.00/10 0.00/8 0.33/3 0.29/7 5210411 C T True 4 0.111 0.269 0.28 False True 0.11/9 0.33/9 0.00/2 0.50/8 0.00/7 0.33/9 0.43/7 0.00/3 0.17/6 5210412 C T True 4 0.111 0.269 0.32 False True 0.11/9 0.33/9 0.00/2 0.50/8 0.00/7 0.33/9 0.57/7 0.00/3 0.17/6 5210430 G A True 0 0.25 False True 0.50/2 0.00/1 0.00/1 0.00/2 0.00/1 5210432 C T True 3 0.1 0.0 0.2 False True 0.10/10 0.00/7 0.00/2 0.00/4 0.00/7 0.33/6 0.00/6 0.25/4 0.25/4 5210442 T C True 1 0.125 0.0 0.19 False False 0.12/8 0.00/8 0.00/2 0.00/5 0.00/7 0.40/5 0.00/7 0.17/6 0.33/3 5210447 T A True 1 0.125 0.0 0.2 False False 0.12/8 0.00/8 0.00/2 0.00/5 0.00/7 0.40/5 0.14/7 0.17/6 0.00/2 5210473 C A True 7 0.625 0.35 0.6 False False 0.62/8 0.50/6 0.00/1 0.25/4 0.33/9 0.50/4 0.60/5 0.60/5 1.00/1 5210477 T C True 1 0.0 0.0 0.059 False False 0.00/7 0.00/9 0.00/2 0.00/3 0.00/9 0.25/4 0.00/6 0.00/6 0.00/1 5210514 C T True 1 0.2 0.0 0.182 False True 0.20/5 0.00/6 0.00/3 0.00/7 0.00/2 0.40/5 0.00/3 0.00/1 5210530 A T True 1 0.0 0.0 0.077 False False 0.00/5 0.00/8 0.00/2 0.00/3 0.00/7 0.00/2 0.00/6 0.25/4 0.00/1 5210541 A T True 1 0.0 0.15 0.167 False False 0.00/5 0.12/8 0.00/2 0.33/3 0.14/7 0.00/2 0.29/7 0.00/2 0.00/1 5210564 T A True 1 0.0 0.111 0.167 False False 0.00/6 0.00/6 0.00/2 0.33/3 0.14/7 0.00/1 0.29/7 0.00/2 0.00/2 5210574 A C True 1 0.2 0.0 0.182 False False 0.20/5 0.00/6 0.00/2 0.00/3 0.00/5 0.00/1 0.33/6 0.00/2 0.00/2 5210596 A C True 2 0.25 0.0 0.133 False False 0.25/4 0.00/6 0.00/2 0.00/3 0.00/3 0.00/2 0.25/8 0.00/2 0.00/3 5210606 C A True 1 0.0 0.077 False False 0.00/3 0.00/6 0.00/2 0.00/3 0.00/3 0.00/2 0.00/6 0.00/1 0.25/4 5210607 C A True 1 0.0 0.077 False False 0.00/3 0.00/6 0.00/2 0.00/3 0.00/3 0.00/2 0.00/6 0.00/1 0.25/4 5210618 T C True 1 0.0 0.077 False False 0.00/3 0.00/6 0.00/2 0.00/3 0.00/4 0.00/2 0.00/6 0.00/1 0.25/4 5210637 T A True 1 0.077 0.0 False False 0.00/3 0.25/4 0.00/3 0.00/3 0.00/3 0.00/3 0.00/4 0.00/1 0.00/5 5210647 C A True 1 0.077 0.0 False False 0.00/3 0.00/5 0.25/4 0.00/3 0.00/1 0.00/3 0.00/3 0.00/1 0.00/5 5210672 T C True 1 0.083 0.182 False False 0.00/1 0.00/4 0.00/3 0.33/3 0.00/2 0.00/2 0.00/3 0.00/2 0.50/4 5210675 A C True 1 0.091 0.167 False False 0.00/1 0.00/4 0.00/3 0.50/2 0.00/2 0.00/3 0.00/3 0.00/2 0.50/4 5210684 A T True 1 0.083 0.091 False False 0.00/1 0.00/5 0.00/3 1.00/1 0.00/3 0.00/3 0.00/2 0.00/2 0.25/4 5210689 T C True 1 0.083 0.273 False False 0.00/1 0.00/5 0.00/3 1.00/1 0.00/3 0.00/3 0.50/2 0.00/2 0.50/4 5210861 C G True 1 0.077 0.0 False False 0.00/2 0.00/4 0.00/3 0.00/2 0.25/4 0.00/2 0.00/1 0.00/2 5210862 A G True 1 0.071 0.0 False False 0.00/3 0.00/5 0.00/3 0.00/2 0.25/4 0.00/2 0.00/1 0.00/2 5210864 C A True 1 0.077 0.0 False False 0.00/1 0.00/4 0.00/3 0.00/2 0.25/4 0.00/2 0.00/1 0.00/2 5210910 C G True 1 0.25 0.0 False False 0.25/4 0.00/5 0.00/3 0.00/1 0.00/2 0.00/1 0.00/1 0.00/1