pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
46144001	A	G	True	1	0.0	0.042	0.026	False	False	0.00/8	0.25/4	0.00/4	0.00/9	0.00/7	0.06/16	0.00/6	0.00/4	0.00/12
46144002	T	G	True	1	0.0	0.043	0.0	False	False	0.00/8	0.25/4	0.00/4	0.00/8	0.00/7	0.00/15	0.00/7	0.00/4	0.00/12
46144007	T	A	True	1	0.0	0.043	0.0	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/4	0.00/8	0.00/7	0.00/16	0.00/7	0.00/4	0.00/12
46144009	G	T	True	5		0.667	0.464	False	False	1.00/2	0.67/3	1.00/3	0.33/6	1.00/3	0.36/11	0.33/6	1.00/4	0.43/7
46144031	A	G	True	1	0.111	0.0	0.024	False	False	0.11/9	0.00/5	0.00/5	0.00/8	0.00/8	0.00/17	0.00/8	0.25/4	0.00/13
46144035	T	A	True	9	0.889	0.692	0.475	False	False	0.89/9	0.33/6	1.00/4	0.50/8	1.00/8	0.29/17	0.62/8	1.00/4	0.45/11
46144047	A	T	True	6	0.4	0.407	0.333	False	False	0.40/10	0.40/5	0.60/5	0.22/9	0.50/8	0.18/17	0.50/8	1.00/4	0.20/10
46144052	G	A	True	8	1.0	0.647	0.481	False	True	1.00/5	0.50/4	1.00/3	0.33/6	1.00/4	0.27/11	0.57/7	1.00/4	0.40/5
46144071	C	G	True	1	0.0	0.071	0.0	False	False	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/9	0.00/3	0.00/1	0.00/6
46144074	C	G	True	1	0.0	0.071	0.0	False	False	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3	0.00/9	0.00/4	0.00/1	0.00/6
46144112	G	T	True	6	1.0	0.579	0.556	False	False	1.00/5	0.57/7	1.00/3	0.29/7	1.00/2	0.50/8	0.80/5	1.00/1	0.25/4
46144132	G	T	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/5	0.00/7	0.00/2	0.00/6	0.00/1	0.00/7	0.00/5	0.00/1	0.25/4
46144148	C	A	True	1	0.0	0.048	0.0	False	False	0.00/5	0.00/6	0.25/4	0.00/7	0.00/4	0.00/10	0.00/5	0.00/1	0.00/8
46144185	A	G	True	7	0.455	0.244	0.6	False	False	0.45/11	0.27/11	0.33/9	0.15/13	0.25/8	0.50/12	0.69/13	1.00/3	0.50/12
46144242	G	C	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/3	0.00/4	0.00/4	0.00/3
46144254	C	G	True	1	0.0	0.069	0.0	False	False	0.00/4	0.33/6	0.00/9	0.00/8	0.00/6	0.00/9	0.00/12	0.00/2	0.00/4
46144255	G	C	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.25/4	0.00/3
46144307	G	C	True	1	0.0	0.111	0.0	False	False	0.00/5	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/2
46144327	T	C	True	1	0.0	0.0	0.032	False	False	0.00/7	0.00/8	0.00/15	0.00/12	0.00/6	0.00/10	0.00/10	0.00/7	0.25/4
46144400	G	T	True	1		0.111	0.0	False	False	0.00/2	0.00/2		0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/1
46144620	G	T	True	1		0.1	0.0	False	False		0.00/5	0.00/1	0.25/4		0.00/1	0.00/2		0.00/1