pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
12839033	T	A	True	1		0.0	0.091	False	False	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/2
12839036	T	A	True	1		0.0	0.091	False	False	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/2
12839038	T	A	True	1		0.0	0.091	False	False	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/2
12839130	T	A	True	1		0.067	0.062	False	False	0.00/3	0.14/7	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.25/4	0.00/6	0.00/3	0.00/3
12839131	A	G	True	1		0.067	0.062	False	False	0.00/3	0.14/7	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.25/4	0.00/6	0.00/3	0.00/3
12839148	G	T	True	1		0.111	0.0	False	False		0.25/4	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/4	0.00/2	0.00/2
12839149	T	C	True	1		0.0	0.125	False	False	0.00/2	0.00/6	0.00/3	0.00/3	0.00/2	0.25/4	0.17/6	0.00/4	0.00/2
12839197	T	G	True	1		0.0	0.118	False	False	0.00/3	0.00/6	0.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.20/5	0.00/3	0.25/4
12839198	T	G	True	1		0.0	0.059	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/5	0.00/3	0.25/4
12839231	T	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/6	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/6	0.00/4	0.00/3	0.00/5
12839232	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/5	0.00/2	0.00/2	0.00/2
12839234	C	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/5	0.00/2	0.00/2	0.00/2
12839235	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/6	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/5	0.00/4	0.00/3	0.00/4
12839236	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/6	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/7	0.00/4	0.00/3	0.00/5
12839250	C	A	True	1		0.1	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/6	0.00/1	0.00/1	0.00/2
12839256	A	G	True	1		0.0	0.056	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/3	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/3	0.25/4	0.00/5
12839258	A	G	True	1		0.0	0.053	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/3	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/4	0.25/4	0.00/5
12839260	A	G	True	1		0.0	0.053	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/2	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/4	0.25/4	0.00/5
12839261	T	G	True	1		0.0	0.053	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/2	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/4	0.25/4	0.00/5
12839264	T	A	True	1		0.0	0.053	False	False	0.00/3	0.00/6	0.00/2	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/4	0.25/4	0.00/5
12839285	T	G	True	1	0.0	0.048	0.0	False	False	0.00/4	0.00/6	0.25/4	0.00/6	0.00/5	0.00/8	0.00/6	0.00/2	0.00/6
12839356	A	T	True	1	0.0	0.0	0.05	False	False	0.00/4	0.00/6	0.00/4	0.00/12	0.00/5	0.00/6	0.00/6	0.00/4	0.25/4
12839362	T	C	True	1	0.0	0.0	0.05	False	False	0.00/4	0.00/6	0.00/5	0.00/12	0.00/5	0.00/6	0.00/6	0.00/4	0.25/4
12839363	T	C	True	1	0.0	0.0	0.056	False	False	0.00/4	0.00/6	0.00/5	0.00/12	0.00/5	0.00/5	0.00/5	0.00/4	0.25/4
12839375	A	C	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/4	0.00/5	0.00/5	0.00/12	0.00/6	0.00/5	0.00/5	0.25/4	0.00/3
12839450	T	C	True	1	0.286	0.0	0.0	False	False	0.29/7	0.00/4	0.00/6	0.00/15	0.00/10	0.00/7	0.00/4	0.00/4	0.00/7
12839496	T	G	True	1	0.0	0.027	0.061	False	False	0.00/6	0.00/4	0.00/7	0.06/16	0.00/10	0.00/10	0.33/6	0.00/7	0.00/10
12839554	G	T	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/6	0.25/4	0.00/6	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/4
12839556	G	A	True	1	0.833	0.0	0.0	False	True	0.83/6	0.00/4	0.00/6	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/5	0.00/4
12839711	G	T	True	1	0.25	0.0	0.143	False	False	0.25/4	0.00/5	0.00/5	0.00/6	0.00/2	0.00/1	1.00/1	0.00/2	0.00/3
12839718	A	G	True	1	0.0	0.0	0.042	False	False	0.00/4	0.00/5	0.00/6	0.00/11	0.00/3	0.00/7	0.00/1	0.25/4	0.00/12
12839722	A	G	True	1	0.0	0.056	0.05	False	False	0.00/4	0.00/3	0.20/5	0.00/8	0.00/2	0.00/7	0.00/1	0.25/4	0.00/8
12839724	T	C	True	1	0.0	0.038	0.0	False	False	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/12	0.25/4	0.00/6	0.00/1	0.00/4	0.00/12
12839725	C	T	True	1		0.0	0.2	False	True			0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/4	0.00/1	1.00/1	0.25/4
12839729	C	T	True	1			0.25	False	True	1.00/1		1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.25/4		1.00/1	0.00/3
12839732	A	T	True	1	0.0	0.111	0.071	False	False	0.00/4	0.00/3	0.40/5	0.00/8	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.11/9
12839746	A	T	True	2		0.19	0.067	False	False	0.00/1	0.00/2	0.00/4	0.33/12	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/8
12839775	T	A	True	1		0.0	0.059	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/6	0.00/7	0.00/2	0.25/4	0.00/2	0.00/3	0.00/8
12839987	T	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/5	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/6	0.00/1	0.00/1	0.00/3
12839994	A	C	True	1	0.0	0.0	0.1	False	False	0.00/5	0.00/6	0.00/7	0.00/6	0.00/2	0.00/5	0.00/1		0.25/4
