pos ref alt in_target n_oysters_with_alt alt_freq_Pum alt_freq_Qui alt_freq_Rio pop_differentiated cpg_destroying Pum1 Qui1 Qui2 Qui3 Qui4 Rio1 Rio2 Rio3 Rio4 10451030 T G True 1 0.0 0.111 False False 0.00/6 0.00/9 0.00/7 0.00/7 0.00/5 0.25/4 10451031 T G True 1 0.0 0.111 False False 0.00/6 0.00/9 0.00/7 0.00/7 0.00/5 0.25/4 10451032 T A True 1 0.0 0.1 False False 0.00/6 0.00/8 0.00/7 0.00/7 0.00/6 0.25/4 10451035 T A True 1 0.0 0.1 False False 0.00/5 0.00/8 0.00/7 0.00/7 0.00/6 0.25/4 10451084 T A True 2 0.121 0.235 False False 0.00/6 0.31/13 0.00/6 0.00/8 0.27/11 0.00/1 0.20/5 10451117 C A True 1 0.062 0.0 False False 0.00/3 0.00/6 0.00/3 0.25/4 0.00/10 0.00/1 0.00/4 10451122 G A True 2 0.08 0.312 False True 1.00/1 0.00/4 0.00/10 0.00/4 0.29/7 0.29/7 0.00/2 1.00/2 0.20/5 10451133 A T True 2 0.195 0.394 False False 1.00/1 0.00/7 0.31/16 0.14/7 0.18/11 0.44/18 0.00/2 1.00/3 0.20/10 10451134 C A True 1 0.062 0.0 False False 0.00/3 0.00/6 0.00/3 0.25/4 0.00/11 0.00/1 0.00/4 10451145 G T True 1 0.115 0.182 False False 0.00/1 0.00/5 0.00/9 0.60/5 0.00/7 0.00/8 0.50/2 0.33/3 0.22/9 10451146 A T True 1 0.073 0.1 False False 0.00/2 0.00/8 0.00/15 0.43/7 0.00/11 0.00/19 0.50/2 0.20/5 0.14/14 10451178 G A True 7 0.25 0.32 0.52 False True 0.25/4 0.00/4 0.40/10 0.33/6 0.40/5 0.67/9 0.33/3 0.50/4 0.44/9 10451202 T C True 2 0.333 0.075 0.208 False False 0.33/6 0.14/7 0.12/17 0.00/9 0.00/7 0.22/23 0.00/4 0.14/7 0.26/19 10451210 T A True 7 0.5 0.25 0.472 False False 0.50/6 0.14/7 0.31/16 0.22/9 0.25/8 0.52/23 0.50/4 0.43/7 0.42/19 10451217 G T True 1 0.0 0.037 0.0 False False 0.00/4 0.25/4 0.00/11 0.00/7 0.00/5 0.00/12 0.00/4 0.00/6 0.00/10 10451219 G C True 1 0.0 0.037 0.0 False False 0.00/4 0.25/4 0.00/11 0.00/7 0.00/5 0.00/12 0.00/5 0.00/6 0.00/10 10451232 C T True 4 0.25 0.364 False True 1.00/2 0.50/4 0.20/5 0.33/3 0.00/4 0.30/10 0.25/4 0.50/8 10451238 G T True 8 0.25 0.321 0.594 False False 0.25/4 0.20/5 0.36/11 0.29/7 0.40/5 0.73/11 0.50/6 0.67/6 0.44/9 10451239 C A True 1 0.077 0.091 False False 0.00/2 0.00/4 0.00/3 0.00/3 0.33/3 0.00/10 0.50/4 0.00/8 10451326 G T True 3 0.15 0.182 False False 0.00/3 0.25/4 0.29/7 0.00/6 0.00/3 0.25/12 0.00/4 0.00/4 0.50/2 10451343 A G True 1 0.0 0.0 0.034 False False 0.00/4 0.00/7 0.00/13 0.00/8 0.00/6 0.00/16 0.00/4 0.00/5 0.25/4 10451344 C T True 1 0.3 0.75 False True 1.00/1 0.67/3 0.00/3 0.50/2 0.00/2 0.75/4 0.00/1 1.00/3 10451360 A T True 1 0.0 0.0 0.033 False False 0.00/4 0.00/8 0.00/14 0.00/6 0.00/7 0.00/15 0.25/4 0.00/5 0.00/6 10451361 A C True 1 0.0 0.0 0.033 False False 0.00/4 0.00/8 0.00/14 0.00/6 0.00/7 0.00/15 0.25/4 0.00/5 0.00/6 10451362 A T True 1 0.0 0.0 0.033 False False 0.00/4 0.00/8 0.00/14 0.00/6 0.00/6 0.00/15 0.25/4 0.00/5 0.00/6 10451363 A C True 1 0.0 0.0 0.033 False False 0.00/4 0.00/7 0.00/14 0.00/6 0.00/6 0.00/15 0.25/4 0.00/5 0.00/6 10451369 T A True 6 0.25 0.2 0.654 False False 0.25/4 0.29/7 0.21/14 0.29/7 0.00/7 0.69/13 0.67/3 0.75/4 0.50/6 10451383 A G True 1 0.0 0.0 0.043 False False 0.00/4 0.00/8 0.00/15 0.00/7 0.00/6 0.00/12 0.00/2 0.25/4 0.00/5 10451385 T C True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/8 0.00/14 0.00/7 0.00/7 0.00/12 0.00/2 0.00/4 0.00/5 10451386 T C True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/8 0.00/13 0.00/7 0.00/7 0.00/12 0.00/2 0.00/4 0.00/5 10451410 G T True 1 0.087 0.5 False False 0.00/1 0.33/3 0.12/8 0.00/6 0.00/6 0.33/6 1.00/2 1.00/2 0.00/2 10451411 C A True 1 0.231 0.25 False False 1.00/1 0.25/4 0.20/5 0.50/2 0.00/2 0.50/2 0.00/2 10451441 G T True 1 0.045 0.125 False False 0.00/2 0.00/9 0.17/6 0.00/5 0.25/4 0.00/1 0.00/3 10451444 G C True 1 0.045 0.125 False False 0.00/2 0.00/9 0.17/6 0.00/5 0.25/4 0.00/1 0.00/3 10451445 G T True 1 0.045 0.125 False False 0.00/2 0.00/9 0.17/6 0.00/5 0.25/4 0.00/1 0.00/3 10451473 G T True 1 0.0 0.125 False False 0.00/3 0.00/9 0.00/6 0.00/5 0.00/4 0.25/4 10451474 G T True 1 0.0 0.125 False False 0.00/3 0.00/9 0.00/6 0.00/5 0.00/4 0.25/4 10451477 C A True 0 0.0 0.25 False False 0.00/4 0.00/4 0.00/3 0.50/2 0.00/1 0.00/1 10451484 T C True 1 0.0 0.111 False False 0.00/8 0.00/13 0.00/5 0.00/8 0.25/4 0.00/1 0.00/4 10451539 C A True 1 0.167 False False 0.00/2 0.25/4 0.00/1 0.00/1 0.00/1 10451540 C A True 1 0.167 False False 0.00/2 0.25/4 0.00/1 0.00/1 0.00/1 10451544 C G True 1 0.167 False False 0.00/2 0.25/4 0.00/1 0.00/1 10451545 C A True 1 0.167 False False 0.00/2 0.25/4 0.00/1 0.00/1 0.00/1 10451550 A G True 1 0.0 0.111 False False 0.00/8 0.00/8 0.00/5 0.00/1 0.25/4 0.00/5 10451580 T A True 1 0.04 0.0 False False 0.00/7 0.00/9 0.00/5 0.25/4 0.00/5 0.00/5 10451691 T C True 1 0.05 0.0 False False 0.00/1 0.00/3 0.00/5 0.00/8 0.25/4 0.00/4 0.00/1 0.00/3 10451727 G A True 2 0.2 False True 0.00/2 0.29/7 0.25/4 0.00/2 0.00/1 0.00/1 10451728 A G True 1 0.056 0.167 False False 1.00/1 0.00/3 0.00/8 0.17/6 0.00/1 0.25/4 0.00/2 10451738 C T True 0 0.25 0.25 False True 1.00/1 0.00/1 0.00/1 0.50/2 0.33/3 0.00/1 10451743 C A True 0 0.25 0.0 False False 0.00/1 0.50/2 0.00/1 0.00/1 0.00/3 0.00/1 10451745 T C True 1 0.125 0.167 False False 1.00/1 0.00/6 0.00/9 0.20/5 0.50/4 0.33/3 0.00/1 0.00/2 10451754 A G True 1 0.08 0.0 False False 0.00/1 0.00/6 0.00/9 0.00/5 0.40/5 0.00/3 0.00/1 0.00/3 10451766 C T True 0 0.25 0.0 False True 0.00/1 0.50/2 0.00/1 0.00/1 0.00/3 0.00/1 0.00/1 10451783 T A True 1 0.156 0.25 False False 1.00/1 0.11/9 0.00/9 0.12/8 0.50/6 0.33/3 0.50/2 0.00/1 0.00/2 10451787 T C True 1 0.0 0.091 False False 0.00/1 0.00/9 0.00/9 0.00/8 0.00/6 0.25/4 0.00/3 0.00/2 0.00/2 10451789 A G True 3 0.344 0.182 False False 0.00/1 0.11/9 0.56/9 0.25/8 0.50/6 0.00/4 0.33/3 0.50/2 0.00/2 10451810 C T True 0 0.167 0.4 False True 0.00/1 0.33/3 0.00/1 0.00/2 0.00/2 0.50/2 1.00/1 10451829 A G True 1 0.0 0.056 False False 0.00/3 0.00/10 0.00/13 0.00/9 0.00/9 0.00/6 0.00/4 0.25/4 0.00/4 10451833 A G True 1 0.0 0.053 False False 0.00/3 0.00/9 0.00/14 0.00/9 0.00/9 0.00/6 0.00/4 0.25/4 0.00/5 10451834 A G True 1 0.0 0.053 False False 0.00/3 0.00/9 0.00/14 0.00/8 0.00/9 0.00/6 0.00/4 0.25/4 0.00/5 10451840 A C True 1 0.048 0.095 False False 0.33/3 0.00/10 0.00/13 0.11/9 0.10/10 0.14/7 0.25/4 0.00/4 0.00/6 10451852 A G True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/12 0.00/16 0.00/10 0.00/10 0.00/7 0.00/5 0.00/5 0.00/7 10451859 G A True 1 0.073 0.0 False True 0.00/2 0.12/8 0.00/16 0.00/9 0.25/8 0.00/4 0.00/3 0.00/3 0.00/6 10451917 C T True 1 0.2 0.167 False True 0.50/2 0.00/2 0.00/3 0.25/4 1.00/1 0.00/1 0.50/2 0.00/2 0.00/1 10451973 G C True 1 0.025 0.0 False False 0.00/2 0.25/4 0.00/20 0.00/8 0.00/8 0.00/5 0.00/3 0.00/3 0.00/8 10451975 G C True 1 0.025 0.0 False False 0.00/2 0.25/4 0.00/20 0.00/8 0.00/8 0.00/5 0.00/2 0.00/3 0.00/8 10451981 G C True 1 0.024 0.0 False False 0.00/2 0.25/4 0.00/21 0.00/8 0.00/8 0.00/5 0.00/2 0.00/3 0.00/8