pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
66040009	T	A	True	1	0.167	0.095	0.0	False	False	0.17/6	0.17/6	0.00/8	0.25/4	0.00/3	0.00/10	0.00/2	0.00/6	0.00/7
66040014	T	C	True	1	0.0	0.048	0.0	False	False	0.00/6	0.00/6	0.00/8	0.25/4	0.00/3	0.00/12	0.00/2	0.00/6	0.00/7
66040019	C	T	True	1	0.0	0.053	0.0	False	True	0.00/5	0.00/5	0.00/7	0.25/4	0.00/3	0.00/12	0.00/2	0.00/5	0.00/5
66040042	T	A	True	1	0.0	0.071	0.034	False	False	0.00/7	0.00/9	0.08/13	0.25/4	0.00/2	0.08/12	0.00/2	0.00/6	0.00/9
66040050	T	A	True	2	0.333	0.115	0.037	False	False	0.33/6	0.00/7	0.08/12	0.25/4	0.33/3	0.08/12	0.00/2	0.00/6	0.00/7
66040068	T	A	True	4	0.25	0.5	0.045	False	False	0.25/8	0.75/8	0.38/13	0.50/6	0.33/3	0.09/11	0.00/2	0.00/4	0.00/5
66040069	C	T	True	1	0.286	0.167	0.048	False	True	0.29/7	0.20/5	0.09/11	0.20/5	0.33/3	0.09/11	0.00/2	0.00/4	0.00/4
66040098	C	T	True	1	0.0	0.179	0.0	False	True	0.00/7	0.12/8	0.09/11	0.33/6	0.33/3	0.00/11	0.00/4	0.00/7	0.00/7
66040124	A	T	True	1	0.111	0.139	0.059	False	False	0.11/9	0.08/12	0.08/13	0.25/8	0.33/3	0.00/9	0.00/6	0.10/10	0.11/9
66040128	C	T	True	1	0.0	0.071	0.0	False	True	0.00/8	0.00/8	0.00/11	0.33/6	0.00/3	0.00/8	0.00/5	0.00/7	0.00/7
66040147	T	A	True	2	0.222	0.162	0.097	False	False	0.22/9	0.08/12	0.08/12	0.33/9	0.25/4	0.17/6	0.17/6	0.00/10	0.11/9
66040156	T	A	True	1	0.222	0.029	0.1	False	False	0.22/9	0.00/11	0.00/12	0.14/7	0.00/5	0.25/4	0.17/6	0.00/11	0.11/9
66040161	T	A	True	4	0.222	0.243	0.133	False	False	0.22/9	0.25/12	0.33/12	0.25/8	0.00/5	0.00/4	0.50/6	0.00/11	0.11/9
66040178	G	A	True	1		1.0	0.0	False	True	0.00/1	1.00/4	1.00/1	1.00/1			0.00/1	0.00/2	0.00/2
66040181	C	A	True	1	0.125	0.0	0.08	False	False	0.12/8	0.00/6	0.00/10	0.00/4	0.00/4	0.00/7	0.25/4	0.00/9	0.20/5
66040182	C	T	True	1	0.125	0.0	0.08	False	True	0.12/8	0.00/6	0.00/10	0.00/4	0.00/4	0.00/7	0.25/4	0.00/9	0.20/5
66040188	T	A	True	2	0.0	0.276	0.067	False	False	0.00/9	0.50/10	0.22/9	0.17/6	0.00/4	0.00/7	0.40/5	0.00/11	0.00/7
66040189	T	A	True	1	0.0	0.107	0.0	False	False	0.00/9	0.00/9	0.11/9	0.17/6	0.25/4	0.00/7	0.00/5	0.00/11	0.00/7
66040199	T	C	True	1	0.0	0.107	0.0	False	False	0.00/9	0.00/11	0.25/8	0.17/6	0.00/3	0.00/6	0.00/4	0.00/11	0.00/8
66040203	T	C	True	4	0.0	0.385	0.103	False	False	0.00/8	0.33/9	0.62/8	0.33/6	0.00/3	0.17/6	0.50/4	0.00/11	0.00/8
66040208	G	T	True	0		0.4	0.0	False	False	0.00/1	0.00/2	1.00/1	0.50/2			0.00/1	0.00/2	0.00/2
66040227	T	C	True	1	0.0	0.2	0.0	False	False	0.00/4	0.20/5	0.33/3	0.25/4	0.00/3	0.00/5	0.00/3	0.00/7	0.00/8
66040232	A	T	True	2	0.25	0.0	0.042	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.25/4	0.00/9	0.00/7
66040235	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/6	0.00/4
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66040254	T	C	True	2	0.25	0.167	0.059	False	False	0.25/4	0.00/2	0.33/3	0.25/4	0.00/3	0.00/3	1.00/1	0.00/8	0.00/5
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66040269	C	G	True	1	0.0	0.0	0.071	False	False	0.00/4	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.00/4	0.00/5
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66040290	T	A	True	2	0.25	0.333	0.105	False	False	0.25/4	0.67/6	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/6	1.00/1	0.00/3	0.11/9
66040292	A	C	True	1	0.25	0.0	0.056	False	False	0.25/4	0.00/6	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.11/9
66040299	A	T	True	1	0.0	0.2	0.053	False	False	0.00/4	0.50/6	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.00/6	1.00/1	0.00/3	0.00/9
66040301	A	T	True	1	0.0	0.067	0.05	False	False	0.00/4	0.00/6	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/6	1.00/1	0.00/3	0.00/10
66040329	C	T	True	1		0.154	0.0	False	True	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.33/3	0.00/4	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/8
66040339	C	G	True	1		0.0	0.05	False	False	0.00/3	0.00/4	0.00/2	0.00/3	0.00/4	0.00/4	0.25/4	0.00/2	0.00/10
66040340	A	T	True	3		0.3	0.04	False	False	0.00/3	0.14/7	0.00/3	0.50/6	0.50/4	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/12
66040341	T	G	True	1		0.0	0.04	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/3	0.00/6	0.00/4	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/12
66040342	T	A	True	1		0.0	0.04	False	False	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/6	0.00/4	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/12
66040343	T	A	True	1	0.0	0.0	0.04	False	False	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/6	0.00/4	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/12
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66040366	G	A	True	1		0.111	0.0	False	True	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.25/4	0.00/1	0.00/2			0.00/2
66040391	G	A	True	1		0.125		False	True	0.00/1	0.00/3		0.25/4	0.00/1	0.00/3			
66040392	G	A	True	1		0.111		False	True	0.00/1	0.00/4		0.25/4	0.00/1	0.00/3			
66040394	A	G	True	2		0.25	0.0	False	False	0.00/3	0.57/7	0.00/2	0.09/11	0.25/4	0.00/7	0.00/6	0.00/1	0.00/9
66040397	A	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/7	0.00/3	0.00/11	0.00/4	0.00/7	0.00/6	0.00/1	0.00/9
66040398	C	A	True	1		0.0	0.05	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.00/7	0.00/3	0.25/4	0.00/6	0.00/1	0.00/9
66040406	C	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/3	0.00/7	0.00/3	0.00/3	0.00/7	0.00/1	0.00/9
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66040426	A	C	True	1	0.0	0.24	0.0	False	False	0.00/8	0.20/5	0.00/3	0.23/13	0.50/4	0.00/6	0.00/6	0.00/1	0.00/8
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66040498	T	G	True	1	0.0	0.0	0.045	False	False	0.00/8	0.00/7	0.00/4	0.00/9	0.00/3	0.00/7	0.00/6	0.25/4	0.00/5
66040516	C	A	True	1	0.0	0.0	0.111	False	False	0.00/4	0.00/4	0.00/4	0.00/10	0.00/3	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.20/5
66040540	T	G	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/11	0.00/1	0.00/11	0.00/6	0.00/4	0.00/7
66040542	A	G	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/11	0.00/1	0.00/11	0.00/6	0.00/5	0.00/7
66040543	C	G	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/4	0.00/4	0.25/4	0.00/10	0.00/1	0.00/6	0.00/2	0.00/4	0.00/5
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66040545	T	A	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/6	0.00/6	0.25/4	0.00/11	0.00/1	0.00/11	0.00/5	0.00/5	0.00/6
66040552	A	T	True	3	0.0	0.579	0.179	False	False	0.00/6	0.80/5	0.67/3	0.44/9	0.50/2	0.00/11	1.00/5	0.00/6	0.00/6
66040570	A	T	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/6	0.00/3	0.00/10	0.00/2	0.00/10	0.00/6	0.00/5	0.00/6
66040602	C	T	True	1		0.13	0.0	False	True	0.00/3	0.33/6	0.00/4	0.09/11	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.00/5	0.00/4
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66040612	G	T	True	1		0.143	0.0	False	False	0.00/3	0.25/4		0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/1
66040622	C	T	True	1		0.13	0.0	False	True	0.00/1	0.33/6	0.00/3	0.08/12	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/5	0.00/4
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66040678	A	T	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/7	0.00/6	0.00/5	0.00/9	0.25/4	0.00/5	0.00/6	0.00/6	0.00/5
66040680	A	C	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/7	0.00/6	0.00/5	0.00/9	0.25/4	0.00/5	0.00/6	0.00/7	0.00/5
66040682	T	C	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/7	0.00/6	0.00/5	0.00/9	0.25/4	0.00/5	0.00/6	0.00/6	0.00/5
66040684	T	C	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/7	0.00/6	0.00/5	0.00/9	0.25/4	0.00/5	0.00/6	0.00/6	0.00/5
66040697	A	T	True	5	0.125	0.6	0.174	False	False	0.12/8	0.60/5	0.50/6	0.70/10	0.50/4	0.00/6	0.67/6	0.00/6	0.00/5
66040708	T	G	True	1	0.0	0.043	0.0	False	False	0.00/8	0.25/4	0.00/6	0.00/10	0.00/3	0.00/6	0.00/5	0.00/6	0.00/6
66040714	T	C	True	1	0.0	0.043	0.0	False	False	0.00/9	0.25/4	0.00/6	0.00/9	0.00/4	0.00/7	0.00/3	0.00/6	0.00/5
66040718	A	G	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/9	0.25/4	0.00/6	0.00/10	0.00/4	0.00/6	0.00/3	0.00/7	0.00/5
66040729	A	G	True	1	0.0	0.05	0.043	False	False	0.00/10	0.25/4	0.00/5	0.00/7	0.00/4	0.00/7	0.00/2	0.12/8	0.00/6
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