pos ref alt in_target n_oysters_with_alt alt_freq_Pum alt_freq_Qui alt_freq_Rio pop_differentiated cpg_destroying Pum1 Qui1 Qui2 Qui3 Qui4 Rio1 Rio2 Rio3 Rio4 59955022 A C True 1 0.0 0.176 0.018 False False 0.00/8 0.29/7 0.15/20 0.33/3 0.00/4 0.00/17 0.00/7 0.00/10 0.05/21 59955025 A C True 2 0.125 0.235 0.088 False False 0.12/8 0.43/7 0.20/20 0.33/3 0.00/4 0.06/17 0.25/8 0.00/10 0.09/22 59955026 T C True 4 0.25 0.303 0.158 False False 0.25/8 0.43/7 0.21/19 0.67/3 0.25/4 0.12/17 0.50/8 0.00/10 0.14/22 59955027 T C True 4 0.125 0.364 0.172 False False 0.12/8 0.71/7 0.26/19 0.33/3 0.25/4 0.12/17 0.50/8 0.00/10 0.17/23 59955029 A C True 1 0.286 0.053 0.061 False False 0.29/7 0.00/2 0.00/13 1.00/1 0.00/3 0.00/14 0.20/5 0.00/10 0.10/20 59955187 G T True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/3 0.00/2 0.00/2 0.00/2 0.00/2 0.00/3 0.00/5 59955188 T C True 1 0.2 0.0 0.05 False False 0.20/5 0.00/1 0.00/5 0.00/2 0.00/4 0.25/4 0.00/4 0.00/3 0.00/9 59955192 T C True 1 0.167 0.0 0.048 False False 0.17/6 0.00/5 0.00/2 0.00/3 0.25/4 0.00/4 0.00/3 0.00/10 59955199 C A True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/1 0.00/1 0.00/2 0.00/1 0.00/2 0.00/4 59955204 C A True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/4 0.00/1 0.00/1 0.00/2 0.00/1 0.00/2 0.00/4 59955206 A T True 1 0.0 0.091 0.0 False False 0.00/8 0.00/1 0.25/4 0.00/2 0.00/4 0.00/2 0.00/4 0.00/3 0.00/10 59955209 A T True 1 0.0 0.091 0.0 False False 0.00/8 0.00/1 0.25/4 0.00/2 0.00/4 0.00/4 0.00/4 0.00/4 0.00/10 59955210 A T True 1 0.0 0.091 0.0 False False 0.00/8 0.00/1 0.25/4 0.00/2 0.00/4 0.00/4 0.00/4 0.00/4 0.00/9 59955212 A T True 1 0.0 0.091 0.0 False False 0.00/8 0.00/1 0.25/4 0.00/2 0.00/4 0.00/4 0.00/4 0.00/4 0.00/8 59955216 T C True 1 0.0 0.091 0.0 False False 0.00/9 0.00/1 0.25/4 0.00/2 0.00/4 0.00/4 0.00/4 0.00/4 0.00/8 59955236 A G True 1 0.0 0.059 0.0 False False 0.00/11 0.25/4 0.00/6 0.00/2 0.00/5 0.00/4 0.00/4 0.00/5 0.00/10 59955237 T A True 1 0.0 0.059 0.0 False False 0.00/11 0.25/4 0.00/6 0.00/2 0.00/5 0.00/3 0.00/4 0.00/5 0.00/10 59955243 C T True 2 0.0 0.333 0.167 False True 0.00/6 0.25/4 1.00/2 0.00/3 0.00/1 0.00/4 0.00/3 0.50/4 59955273 A C True 1 0.143 0.0 0.077 False False 0.14/14 0.00/5 0.00/6 0.00/1 0.00/9 0.00/6 0.00/6 0.50/4 0.00/10 59955316 G A True 1 0.0 0.045 0.0 False True 0.00/7 0.00/6 0.00/8 0.25/4 0.00/4 0.00/7 0.00/5 0.00/8 0.00/8 59955414 T C True 2 0.188 0.129 0.178 False False 0.19/16 0.25/8 0.10/10 0.20/5 0.00/8 0.15/13 0.22/9 0.25/12 0.09/11 59955415 T C True 3 0.062 0.156 0.178 False False 0.06/16 0.38/8 0.00/10 0.20/5 0.11/9 0.15/13 0.33/9 0.25/12 0.00/11 59955416 A C True 7 0.25 0.3 0.283 False False 0.25/16 0.38/8 0.38/8 0.40/5 0.11/9 0.29/14 0.50/10 0.33/12 0.00/10 59955417 T C True 3 0.111 0.224 0.123 False False 0.11/27 0.31/13 0.33/12 0.29/7 0.06/17 0.13/23 0.12/17 0.17/18 0.07/15 59955418 T C True 1 0.115 0.125 0.099 False False 0.12/26 0.31/13 0.08/12 0.20/5 0.00/18 0.08/24 0.12/16 0.12/16 0.07/15 59955596 C T True 2 0.091 0.13 0.0 False True 0.09/11 0.25/4 0.33/6 0.00/5 0.00/8 0.00/11 0.00/4 0.00/7 0.00/8 59955622 G T True 1 0.0 0.143 0.0 False False 0.00/4 0.00/1 0.00/2 0.25/4 0.00/9 0.00/6 0.00/1 0.00/10 59955664 A T True 2 0.0 0.111 0.064 False False 0.00/13 0.00/2 0.00/7 0.50/4 0.00/5 0.09/23 0.00/6 0.25/4 0.00/14 59955694 T C True 1 0.0 0.048 0.023 False False 0.00/7 0.25/4 0.00/9 0.00/4 0.00/4 0.00/19 0.00/7 0.00/2 0.07/15 59955697 T C True 1 0.0 0.095 0.045 False False 0.00/7 0.00/4 0.11/9 0.25/4 0.00/4 0.11/19 0.00/7 0.00/2 0.00/16 59955700 C T True 1 0.25 0.0 0.0 False True 0.25/4 0.00/4 0.00/8 0.00/4 0.00/3 0.00/14 0.00/3 0.00/1 0.00/8 59955707 G A True 1 0.056 False True 0.00/2 0.00/1 0.00/1 0.00/6 0.25/4 0.00/2 0.00/6 59955714 T A True 1 0.2 0.05 0.022 False False 0.20/5 0.00/5 0.00/9 0.00/2 0.25/4 0.05/21 0.00/6 0.00/4 0.00/15 59955715 A T True 2 0.2 0.2 0.044 False False 0.20/5 0.40/5 0.11/9 0.00/2 0.25/4 0.05/21 0.00/5 0.00/4 0.07/15 59955847 G C True 1 0.111 False False 0.00/2 0.00/1 0.00/3 0.00/2 0.25/4 59955848 G T True 1 0.111 False False 0.00/2 0.00/1 0.00/3 0.00/2 0.25/4 59955865 C A True 1 0.0 0.15 0.194 False False 0.00/8 0.00/5 0.09/11 0.50/2 0.50/2 0.29/17 0.00/5 0.00/4 0.20/10 59955873 C A True 2 0.0 0.143 0.161 False False 0.00/8 0.00/6 0.00/10 1.00/2 0.33/3 0.12/16 0.25/4 0.25/4 0.14/7 59955876 C A True 1 0.0 0.0 0.094 False False 0.00/8 0.00/6 0.00/11 0.00/2 0.00/3 0.12/17 0.00/4 0.25/4 0.00/7 59955878 T C True 1 0.0 0.038 0.054 False False 0.00/9 0.00/6 0.00/12 0.20/5 0.00/3 0.05/19 0.25/4 0.00/5 0.00/9 59955886 A T True 1 0.0 0.0 0.059 False False 0.00/8 0.00/5 0.00/11 0.00/5 0.00/3 0.06/16 0.25/4 0.00/5 0.00/9 59955911 C A True 1 0.0 0.056 0.0 False False 0.00/6 0.00/5 0.00/7 0.25/4 0.00/2 0.00/12 0.00/3 0.00/5 0.00/5