pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
56136027	T	A	True	0	0.167	0.4	0.125	False	False	0.17/6	1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.50/2	0.33/3	0.00/2	0.00/1	0.00/2
56136058	T	C	True	0	0.2	0.5	0.0	False	False	0.20/5	1.00/1	0.00/2		1.00/1	0.00/5	0.00/1	0.00/1	0.00/3
56136066	A	G	True	0	0.167	0.0	0.3	False	False	0.17/6	0.00/1	0.00/2		0.00/1	0.20/5	0.00/1	1.00/1	0.33/3
56136198	T	A	True	1	0.0	0.077		False	False	0.00/5	0.00/1	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/2			0.00/1
56136210	A	G	True	0	0.0	0.0	0.25	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/2		1.00/1	0.00/1
56136215	C	A	True	1		0.091		False	False	0.00/3	0.00/1	0.00/5	0.00/1	0.25/4			0.00/1	0.00/1
56136228	T	G	True	1	0.0	0.05	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/7	0.00/3	0.00/6	0.00/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2
56136235	A	T	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/5	0.00/7	0.00/4	0.00/6	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.00/3
56136236	A	C	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/5	0.00/7	0.00/4	0.00/7	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.00/3
56136243	C	A	True	2	0.25	0.0	0.111	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/6	0.00/1	0.00/5	0.25/4	0.00/1	0.00/1	0.00/3
56136244	A	G	True	2	0.2	0.04	0.2	False	False	0.20/5	0.00/5	0.00/8	0.00/3	0.11/9	0.25/8	0.00/2	0.00/1	0.25/4
56136246	T	G	True	1	0.0	0.038	0.133	False	False	0.00/5	0.00/5	0.00/8	0.00/4	0.11/9	0.12/8	0.00/2	0.00/1	0.25/4
56136354	A	T	True	1	0.25	0.0	0.045	False	False	0.25/4	0.00/8	0.00/9	0.00/6	0.00/8	0.00/10	0.00/2	0.17/6	0.00/4
56136403	T	A	True	1	0.0	0.0	0.043	False	False	0.00/9	0.00/9	0.00/6	0.00/7	0.00/8	0.00/6	0.25/4	0.00/8	0.00/5
56136450	C	T	True	2	0.286	0.067	0.25	False	True	0.29/7	0.00/7	0.25/4	0.00/2	0.00/2	0.00/2	1.00/2	0.00/1	0.00/3
56136561	C	T	True	1	0.286	0.071	0.111	False	True	0.29/7	0.00/7	0.50/2	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.33/3		0.00/3
56136573	G	T	True	1		0.111	0.0	False	False	0.00/3	0.00/1		0.25/4	0.00/4	0.00/5	0.00/2		0.00/4
56136603	T	C	True	1	0.0	0.0	0.15	False	False	0.00/8	0.00/7	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.38/8	0.00/3	0.00/1	0.00/8
56136610	A	T	True	1	0.0	0.0	0.1	False	False	0.00/8	0.00/7	0.00/4	0.00/5	0.00/6	0.29/7	0.00/3	0.00/2	0.00/8
56136628	T	A	True	1	0.286	0.045	0.105	False	False	0.29/7	0.12/8	0.00/3	0.00/5	0.00/6	0.14/7	0.33/3	0.00/3	0.00/6
56136643	A	C	True	2	0.333	0.08	0.174	False	False	0.33/6	0.12/8	0.20/5	0.00/6	0.00/6	0.33/9	0.33/3	0.00/3	0.00/8
56136667	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/7	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/2
56136676	G	T	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/5	0.25/4	0.00/8	0.00/1	0.00/2	0.00/7
56136731	A	G	True	1	0.0	0.077	0.024	False	False	0.00/11	0.00/7	0.00/5	0.00/9	0.40/5	0.00/20	0.00/2	0.12/8	0.00/11
56136737	C	A	True	2	0.0	0.0	0.2	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.29/7	0.00/1	0.00/3	0.25/4
56136765	C	T	True	1	0.0	0.25	0.083	False	True	0.00/4	0.33/3	0.00/1	0.00/2	0.50/2	0.25/4	0.00/2	0.00/2	0.00/4
56136775	T	G	True	1	0.0	0.0	0.025	False	False	0.00/12	0.00/8	0.00/6	0.00/12	0.00/8	0.00/15	0.25/4	0.00/7	0.00/14
56136890	T	C	True	1	0.0	0.0	0.024	False	False	0.00/6	0.00/7	0.00/7	0.00/10	0.00/9	0.00/15	0.00/7	0.25/4	0.00/15
56136965	A	C	True	1	0.286	0.0	0.0	False	False	0.29/7	0.00/9	0.00/10	0.00/9	0.00/13	0.00/14	0.00/8	0.00/6	0.00/13
56136971	A	G	True	1	0.286	0.0	0.024	False	False	0.29/7	0.00/9	0.00/10	0.00/9	0.00/12	0.00/12	0.12/8	0.00/7	0.00/14