pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
1033	C	A	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/11	0.00/5	0.25/4	0.00/3	0.00/6	0.00/9		0.00/7	0.00/8
1034	G	C	True	1			0.062	False	False	0.00/1				0.00/2	0.25/4	0.00/5	0.00/5	0.00/2
1048	G	T	True	1		0.0	0.083	False	False	0.00/1		0.00/1	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/4	0.25/4	0.00/1
1054	C	T	True	1	0.0	0.1	0.036	False	True	0.00/11	0.40/5	0.00/3	0.00/4	0.00/8	0.00/11	0.00/2	0.00/8	0.14/7
1079	C	T	True	2	0.0	0.077	0.188	False	True	0.00/12	0.00/6	0.25/4	0.00/6	0.10/10	0.08/13	0.00/2	0.20/10	0.43/7
1091	C	A	True	1	0.0	0.0	0.028	False	False	0.00/14	0.00/6	0.00/6	0.00/6	0.00/9	0.00/13	0.25/4	0.00/10	0.00/9
1094	A	C	True	1	0.0	0.062	0.156	False	False	0.00/16	0.00/7	0.12/8	0.00/7	0.10/10	0.07/15	0.00/8	0.18/11	0.36/11
1101	A	T	True	3	0.188	0.294	0.167	False	False	0.19/16	0.17/6	0.00/11	0.43/7	0.60/10	0.07/14	0.00/8	0.20/10	0.40/10
1174	C	T	True	8	0.5	0.519	0.343	False	True	0.50/14	0.60/5	0.78/9	0.17/6	0.43/7	0.50/12	0.25/8	0.29/7	0.25/8
1175	T	A	True	1	0.059	0.081	0.024	False	False	0.06/17	0.00/8	0.09/11	0.25/8	0.00/10	0.00/13	0.10/10	0.00/8	0.00/10
1186	C	T	True	1	0.083	0.069	0.054	False	True	0.08/12	0.00/8	0.10/10	0.00/4	0.14/7	0.00/14	0.00/7	0.25/8	0.00/8
1195	C	T	True	1	0.118	0.091	0.073	False	True	0.12/17	0.12/8	0.09/11	0.00/7	0.14/7	0.00/14	0.00/11	0.25/8	0.12/8
1198	C	T	True	1	0.0	0.143	0.0	False	True	0.00/17	0.38/8	0.15/13	0.00/7	0.00/7	0.00/14	0.00/11	0.00/8	0.00/8
1220	C	T	True	1	0.056	0.1	0.045	False	True	0.06/18	0.00/9	0.12/16	0.25/8	0.00/7	0.00/14	0.18/11	0.00/7	0.00/12
1229	T	C	True	1	0.0	0.096	0.109	False	False	0.00/18	0.17/12	0.10/20	0.00/10	0.10/10	0.05/19	0.00/13	0.30/10	0.15/13
1230	T	A	True	2	0.176	0.14	0.173	False	False	0.18/17	0.17/12	0.16/19	0.10/10	0.11/9	0.06/18	0.15/13	0.30/10	0.27/11
1231	T	A	True	1	0.176	0.077	0.019	False	False	0.18/17	0.00/12	0.05/19	0.25/12	0.00/9	0.06/18	0.00/13	0.00/10	0.00/11
1260	T	C	True	3	0.214	0.224	0.232	False	False	0.21/14	0.33/12	0.24/17	0.14/14	0.17/6	0.11/19	0.20/15	0.40/10	0.33/12
1275	C	T	True	5	0.067	0.237	0.273	False	True	0.07/15	0.25/8	0.27/15	0.20/10	0.20/5	0.08/13	0.25/12	0.50/8	0.36/11
1315	T	A	True	4	0.111	0.22	0.2	False	False	0.11/9	0.22/9	0.29/14	0.14/14	0.25/4	0.07/14	0.07/15	0.36/11	0.40/10
1328	T	A	True	5	0.375	0.22	0.234	False	False	0.38/8	0.29/7	0.29/14	0.13/15	0.20/5	0.18/11	0.07/15	0.40/10	0.36/11
1329	T	A	True	2	0.25	0.098	0.062	False	False	0.25/8	0.29/7	0.00/14	0.07/15	0.20/5	0.08/12	0.07/15	0.10/10	0.00/11
1333	C	T	True	8	0.375	0.333	0.308	False	True	0.38/8	0.50/4	0.33/12	0.30/10	0.25/4	0.25/8	0.08/12	0.56/9	0.40/10
1335	C	A	True	1	0.0	0.071	0.0	False	False	0.00/8	0.50/4	0.00/10	0.00/10	0.00/4	0.00/8	0.00/12	0.00/9	0.00/10
1338	T	C	True	1	0.25	0.051	0.067	False	False	0.25/8	0.00/6	0.00/12	0.07/15	0.17/6	0.10/10	0.07/14	0.10/10	0.00/11
1343	C	A	True	6	0.375	0.36	0.297	False	False	0.38/8	0.67/3	0.50/8	0.20/10	0.25/4	0.25/8	0.09/11	0.44/9	0.44/9
1345	T	A	True	5	0.375	0.306	0.275	False	False	0.38/8	0.50/6	0.40/10	0.21/14	0.17/6	0.22/9	0.08/12	0.40/10	0.44/9
1353	T	C	True	6	0.429	0.344	0.256	False	False	0.43/7	0.40/5	0.50/10	0.25/12	0.20/5	0.11/9	0.09/11	0.40/10	0.44/9
1355	G	A	True	0		0.375		False	True		0.33/3	0.00/1	0.50/2	0.50/2	0.00/1	0.00/1	0.00/1	
1361	C	T	True	5	0.333	0.429	0.306	False	True	0.33/6	1.00/2	0.50/8	0.25/8	0.33/3	0.20/10	0.10/10	0.50/8	0.50/8
1363	T	C	True	6	0.5	0.4	0.289	False	False	0.50/6	0.50/4	0.57/7	0.33/9	0.20/5	0.18/11	0.10/10	0.44/9	0.50/8
1366	A	T	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/7	0.00/4	0.00/7	0.00/9	0.25/4	0.00/11	0.00/10	0.00/8	0.00/8
1368	T	C	True	4	0.429	0.304	0.306	False	False	0.43/7	0.33/3	0.57/7	0.22/9	0.00/4	0.20/10	0.10/10	0.50/8	0.50/8
1374	A	T	True	7	0.286	0.429	0.324	False	False	0.29/7	0.67/3	0.57/7	0.29/7	0.25/4	0.20/10	0.30/10	0.33/6	0.50/8
1388	C	A	True	3	0.167	0.312	0.207	False	False	0.17/6	1.00/1	0.50/6	0.14/7	0.00/2	0.12/8	0.10/10	0.40/5	0.33/6
1398	C	T	True	1	0.0	0.0	0.087	False	True	0.00/5	0.00/1	0.00/4	0.00/6	0.00/2	0.00/8	0.33/6	0.00/3	0.00/6
1399	C	T	True	3	0.167	0.308	0.087	False	True	0.17/6	1.00/1	0.25/4	0.33/6	0.00/2	0.00/8	0.00/6	0.00/3	0.33/6
1407	G	A	True	0		0.375	0.0	False	True	0.00/3	0.50/2	0.00/1	0.33/3	0.50/2	0.00/3	0.00/2	0.00/1	0.00/1
1423	G	A	True	1		0.125	0.0	False	True	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/1	0.00/1
1424	G	T	True	1		0.125	0.0	False	False	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/1	0.00/1
1433	G	T	True	1		0.143	0.0	False	False	0.00/3		0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.00/2	0.00/1
1435	G	A	True	2		0.286	0.3	False	True	0.00/3		1.00/1	0.25/4	0.00/2	0.25/4	0.67/3	0.00/2	0.00/1
1450	T	C	True	2	0.25	0.154	0.042	False	False	0.25/8		0.00/2	0.25/8	0.00/3	0.09/11	0.00/5	0.00/3	0.00/5
1458	G	A	True	1		0.125	0.0	False	True	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/2	0.00/1
1459	G	A	True	1		0.125	0.0	False	True	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/2	0.00/1
1462	T	A	True	2	0.25	0.167	0.091	False	False	0.25/8	0.00/1	0.00/2	0.33/6	0.00/3	0.10/10	0.00/5	0.50/2	0.00/5
1463	T	C	True	2	0.25	0.167	0.045	False	False	0.25/8	0.00/1	0.00/2	0.33/6	0.00/3	0.10/10	0.00/5	0.00/2	0.00/5
1470	A	T	True	2	0.286	0.167	0.1	False	False	0.29/7	0.00/1	0.00/2	0.33/6	0.00/3	0.10/10	0.00/5	0.50/2	0.00/3
1480	C	A	True	1	0.5		0.111	False	False	0.50/4			0.67/3		0.20/5	0.00/2		0.00/2
1510	T	G	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/7	0.00/1	0.00/1	0.00/6	0.00/2	0.00/9	0.00/3	0.25/4	0.00/3
1511	C	T	True	1			0.143	False	True	0.67/3			0.67/3		0.25/4		0.00/1	0.00/2
1513	T	A	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/6	0.00/1	0.00/1	0.00/6	0.00/2	0.00/9	0.00/3	0.25/4	0.00/3
1514	T	C	True	2	0.333	0.2	0.05	False	False	0.33/6	0.00/1	0.00/1	0.33/6	0.00/2	0.11/9	0.00/3	0.00/4	0.00/4
1516	A	T	True	3	0.333	0.222	0.1	False	False	0.33/6	0.00/1	0.00/1	0.40/5	0.00/2	0.11/9	0.00/3	0.25/4	0.00/4
1545	T	C	True	2	0.5	0.333	0.062	False	False	0.50/4	0.00/1		0.50/4	0.00/1	0.14/7	0.00/1	0.00/5	0.00/3
1565	C	A	True	1			0.143	False	False	1.00/1			0.50/2		0.25/4		0.00/3	
1567	A	C	True	1	0.25	0.25	0.071	False	False	0.25/4	0.00/1		0.50/2	0.00/1	0.17/6	0.00/2	0.00/5	0.00/1
1592	C	A	True	1			0.222	False	False	1.00/1			1.00/1		0.25/4	0.00/1	0.00/3	1.00/1
1599	G	A	True	1			0.143	False	True	0.00/3						0.00/2	0.25/4	0.00/1
1606	C	G	True	1			0.077	False	False	0.00/1					0.00/6	0.00/1	0.25/4	0.00/2
1679	A	C	True	1		0.0	0.038	False	False	0.00/3		0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/11	0.00/5	0.00/6	0.25/4
1688	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4		0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/13	0.00/5	0.00/5	0.00/5
1697	G	T	True	0		0.4	0.0	False	False	0.00/3		0.50/2	0.00/1	0.50/2	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/2
1714	G	T	True	0		0.4	0.0	False	False	0.00/2		0.50/2	0.00/1	0.50/2	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/2
1739	T	C	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4		0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/12	0.00/4	0.00/5	0.00/4
1740	A	G	True	0	0.0	0.6	0.0	False	False	0.00/4		0.50/2	1.00/1	0.50/2	0.00/12	0.00/4	0.00/5	0.00/4
1744	T	G	True	0	0.0	1.0	0.0	False	False	0.00/4		1.00/2	1.00/1	1.00/2	0.00/12	0.00/4	0.00/6	0.00/4
1759	G	C	True	1	0.0		0.077	False	False	0.00/4		0.00/1		0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/2
1760	G	C	True	1	0.0	0.0	0.077	False	False	0.00/4		0.00/1	0.00/1	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/2
1842	C	A	True	1			0.077	False	False	0.00/1					0.00/5	0.00/1	0.25/4	0.00/3
1913	T	G	True	1	0.0	0.0	0.043	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/6		0.00/13	0.25/4
1918	A	G	True	1	0.0	0.0	0.043	False	False	0.00/4	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/6		0.00/13	0.25/4
1929	A	G	True	1		0.0	0.048	False	False	0.00/3	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/5		0.00/12	0.25/4
1959	C	T	True	1		0.0	0.071	False	True	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/2		0.25/4	0.00/1	0.00/5	0.00/4
1974	T	C	True	1	0.0	0.091	0.0	False	False	0.00/6	0.00/2	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/8	0.00/4	0.00/12	0.00/6
1979	T	A	True	1	0.0	0.083	0.0	False	False	0.00/6	0.00/3	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.00/8	0.00/4	0.00/12	0.00/6
1993	T	A	True	2	0.333	0.182	0.094	False	False	0.33/6	0.33/3	0.00/3	0.25/4	0.00/1	0.10/10	0.00/4	0.17/12	0.00/6
1996	T	A	True	0	0.167	0.556	0.0	True	False	0.17/6	0.00/3	1.00/3	0.50/2	1.00/1	0.00/10	0.00/4	0.00/12	0.00/6
