pos ref alt in_target n_oysters_with_alt alt_freq_Pum alt_freq_Qui alt_freq_Rio pop_differentiated cpg_destroying Pum1 Qui1 Qui2 Qui3 Qui4 Rio1 Rio2 Rio3 Rio4 52058009 G A True 1 0.0 0.062 0.0 False True 0.00/5 0.00/7 0.25/4 0.00/3 0.00/2 0.00/1 0.00/3 0.00/4 0.00/1 52058051 G T True 1 0.0 0.0 0.1 False False 0.00/8 0.00/6 0.00/6 0.00/4 0.00/2 0.00/1 0.00/3 0.25/4 0.00/2 52058053 T C True 1 0.0 0.0 0.1 False False 0.00/11 0.00/8 0.00/7 0.00/6 0.00/2 0.00/1 0.00/3 0.25/4 0.00/2 52058054 T C True 1 0.0 0.0 0.1 False False 0.00/11 0.00/8 0.00/7 0.00/6 0.00/2 0.00/1 0.00/3 0.25/4 0.00/2 52058114 G T True 1 0.0 0.05 0.0 False False 0.00/11 0.25/4 0.00/8 0.00/7 0.00/1 0.00/2 0.00/2 0.00/1 0.00/2 52058122 A T True 1 0.0 0.0 0.083 False False 0.00/12 0.00/4 0.00/8 0.00/11 0.00/3 0.00/2 0.00/3 0.25/4 0.00/3 52058124 A T True 1 0.0 0.0 0.083 False False 0.00/13 0.00/4 0.00/9 0.00/11 0.00/3 0.00/2 0.00/3 0.25/4 0.00/3 52058128 A G True 1 0.0 0.033 0.083 False False 0.00/13 0.00/5 0.00/9 0.08/13 0.00/3 0.00/2 0.00/3 0.25/4 0.00/3 52058132 G T True 1 0.0 0.0 0.182 False False 0.00/11 0.00/2 0.00/9 0.00/8 0.00/3 0.00/2 0.00/2 0.25/4 0.33/3 52058143 G T True 2 0.0 0.136 0.467 False False 0.00/11 0.00/2 0.12/8 0.22/9 0.00/3 0.50/2 0.60/5 0.40/5 0.33/3 52058165 G A True 3 0.0 0.32 0.526 False True 0.00/9 0.00/1 0.29/7 0.43/14 0.00/3 0.67/3 0.62/8 0.00/5 1.00/3 52058166 A G True 1 0.0 0.0 0.037 False False 0.00/11 0.00/4 0.00/8 0.00/21 0.00/4 0.25/4 0.00/13 0.00/5 0.00/5 52058167 T A True 1 0.0 0.0 0.038 False False 0.00/11 0.00/4 0.00/8 0.00/21 0.00/4 0.25/4 0.00/12 0.00/5 0.00/5 52058186 G T True 1 0.0 0.0 0.048 False False 0.00/10 0.00/2 0.00/9 0.00/15 0.00/2 0.00/4 0.00/8 0.25/4 0.00/5 52058190 A G True 1 0.0 0.024 0.065 False False 0.00/11 0.00/5 0.00/9 0.04/24 0.00/3 0.00/6 0.00/13 0.25/4 0.12/8 52058191 C G True 1 0.077 0.182 False False 0.00/1 0.00/3 0.11/9 0.00/1 0.00/2 0.00/5 0.50/4 52058192 C A True 1 0.077 0.091 False False 0.00/1 0.00/3 0.11/9 0.00/1 0.00/2 0.00/5 0.25/4 52058229 G T True 1 0.111 0.095 0.031 False False 0.11/9 0.50/2 0.08/12 0.08/25 0.00/3 0.00/6 0.00/11 0.25/4 0.00/11 52058239 C G True 1 0.053 0.0 False False 0.25/4 0.00/3 0.00/11 0.00/1 0.00/2 0.00/6 0.00/1 0.00/6 52058249 C A True 1 0.048 0.0 False False 0.00/4 0.25/4 0.00/12 0.00/1 0.00/2 0.00/7 0.00/1 0.00/9 52058250 C A True 1 0.048 0.0 False False 0.00/4 0.25/4 0.00/12 0.00/1 0.00/2 0.00/7 0.00/1 0.00/9 52058404 T G True 1 0.0 0.015 0.0 False False 0.00/6 0.00/8 0.00/16 0.00/39 0.25/4 0.00/7 0.00/35 0.00/26 52058439 T C True 1 0.0 0.015 0.032 False False 0.00/5 0.00/9 0.00/15 0.03/38 0.00/4 0.25/8 0.00/32 0.00/22 52058475 T A True 1 0.017 0.0 False False 0.00/2 0.00/7 0.00/12 0.00/37 0.25/4 0.00/6 0.00/28 0.00/15 52058533 G T True 5 0.242 0.645 False False 0.00/1 0.00/6 0.40/5 0.32/19 0.00/3 0.86/7 0.64/14 0.00/1 0.56/9 52058667 C G True 0 0.286 False False 0.00/1 0.50/2 0.33/3 0.00/1 52058687 T C True 3 0.0 0.149 0.222 False False 0.00/4 0.08/13 0.27/11 0.13/15 0.12/8 0.00/2 0.14/7 0.25/4 0.40/5 52058688 A C True 3 0.0 0.156 0.312 False False 0.00/4 0.08/12 0.18/11 0.13/15 0.29/7 0.50/2 0.00/6 0.50/4 0.50/4 52058689 T C True 1 0.0 0.109 0.214 False False 0.00/5 0.08/13 0.18/11 0.07/15 0.14/7 0.50/2 0.00/5 0.33/3 0.25/4 52058691 G C True 0 0.0 0.081 0.25 False False 0.00/5 0.00/11 0.11/9 0.08/12 0.20/5 0.50/2 0.00/5 0.50/2 0.33/3 52058721 A T True 2 0.0 0.17 0.2 False False 0.00/9 0.15/13 0.09/11 0.29/14 0.11/9 0.00/2 0.12/8 0.00/1 0.50/4 52058729 G T True 4 0.0 0.213 0.4 False False 0.00/9 0.25/12 0.08/12 0.38/13 0.10/10 0.33/3 0.29/7 0.00/1 0.75/4 52058746 G T True 1 0.25 0.0 0.0 False False 0.25/8 0.00/13 0.00/17 0.00/13 0.00/12 0.00/5 0.00/5 0.00/1 0.00/6 52058771 G T True 1 0.125 0.057 0.25 False False 0.12/8 0.00/11 0.19/16 0.00/13 0.00/13 0.60/5 0.00/5 0.00/1 0.20/5 52058812 G T True 1 0.333 0.0 0.0 False False 0.33/6 0.00/10 0.00/15 0.00/14 0.00/13 0.00/6 0.00/4 0.00/1 0.00/6 52058838 G A True 1 0.286 0.0 0.0 False True 0.29/7 0.00/8 0.00/16 0.00/14 0.00/11 0.00/6 0.00/5 0.00/2 0.00/6 52058839 G T True 2 0.0 0.2 0.167 False False 0.00/7 0.22/9 0.06/16 0.43/14 0.09/11 0.00/6 0.20/5 0.00/2 0.40/5 52058858 A G True 3 0.0 0.14 0.158 False False 0.00/8 0.00/9 0.06/16 0.38/13 0.08/12 0.00/7 0.25/4 0.00/3 0.40/5 52058875 A T True 1 0.0 0.0 0.056 False False 0.00/8 0.00/9 0.00/15 0.00/11 0.00/9 0.00/6 0.00/4 0.25/4 0.00/4 52058884 G A True 1 0.0 0.0 0.133 False True 0.00/6 0.00/7 0.00/15 0.00/11 0.00/6 0.25/4 0.00/4 0.33/3 0.00/4 52058935 G T True 1 0.25 0.05 0.273 False False 0.25/4 0.00/2 0.00/7 0.14/7 0.00/4 0.50/2 0.00/3 0.33/3 0.33/3 52058956 A T True 1 0.0 0.048 0.0 False False 0.00/4 0.00/2 0.00/9 0.00/6 0.25/4 0.00/3 0.00/3 0.00/3 0.00/3 52058981 A G True 2 0.05 0.25 False False 0.00/3 0.33/3 0.00/7 0.00/5 0.00/5 0.25/4 0.50/2 0.25/4 0.00/2 52058982 A T True 2 0.1 0.273 False False 0.67/3 0.33/3 0.00/7 0.00/5 0.20/5 0.25/4 0.50/2 0.25/4 0.00/1