pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
61178024	T	C	True	1	0.0	0.065	0.073	False	False	0.00/5	0.00/10	0.15/13	0.05/19	0.00/4	0.00/15	0.25/4	0.22/9	0.00/13
61178049	C	T	True	1		0.088	0.069	False	True	0.00/3	0.00/6	0.33/9	0.00/15	0.00/4	0.00/10	0.20/5	0.11/9	0.00/5
61178119	G	A	True	1	0.0	0.111	0.0	False	True	0.00/4	0.25/8	0.00/2	0.00/5	0.00/3	0.00/5		0.00/2	0.00/7
61178144	A	T	True	1	0.0	0.065	0.118	False	False	0.00/6	0.00/8	0.00/12	0.10/20	0.17/6	0.17/18	0.00/4	0.33/9	0.00/20
61178165	G	T	True	1		0.1	0.0	False	False	0.00/1	0.29/7	0.00/3	0.00/5	0.00/5	0.00/8		0.00/2	0.00/7
61178182	T	A	True	1	0.0	0.069	0.0	False	False	0.00/9	0.29/14	0.00/16	0.00/21	0.00/7	0.00/14	0.00/4	0.00/11	0.00/23
61178196	C	T	True	1	0.0	0.033	0.067	False	True	0.00/7	0.00/5	0.08/12	0.00/12	0.00/1	0.00/7	0.00/4	0.29/7	0.00/12
61178217	G	A	True	1	0.0	0.04	0.0	False	True	0.00/4	0.00/8	0.25/4	0.00/6	0.00/7	0.00/6		0.00/3	0.00/8
61178325	G	C	True	1	0.0	0.071	0.0	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.25/4	0.00/5	0.00/3	0.00/2	0.00/5
61178326	T	C	True	4	0.0	0.314	0.083	False	False	0.00/11	0.46/13	0.25/16	0.17/12	0.40/10	0.00/12	0.00/3	0.30/10	0.00/11
61178353	C	T	True	5	0.0	0.41	0.154	False	True	0.00/13	0.56/9	0.28/18	0.29/7	0.80/5	0.00/10		0.36/11	0.00/5
61178446	G	T	True	1		0.083	0.286	False	False	0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.67/3	0.00/1	0.00/2
61178449	A	T	True	2	0.0	0.222	0.05	False	False	0.00/9	0.27/11	0.10/10	0.20/10	0.40/5	0.00/8	0.00/1	0.12/8	0.00/3
61178451	A	T	True	3	0.0	0.257	0.05	False	False	0.00/9	0.27/11	0.18/11	0.25/8	0.40/5	0.00/8	0.00/1	0.12/8	0.00/3
61178457	A	T	True	3	0.0	0.265	0.05	False	False	0.00/8	0.30/10	0.18/11	0.25/8	0.40/5	0.00/8	0.00/1	0.12/8	0.00/3
61178458	A	T	True	3	0.0	0.265	0.05	False	False	0.00/8	0.30/10	0.18/11	0.25/8	0.40/5	0.00/8	0.00/1	0.12/8	0.00/3
61178459	A	T	True	3	0.0	0.286	0.095	False	False	0.00/8	0.36/11	0.18/11	0.25/8	0.40/5	0.00/8	0.50/2	0.12/8	0.00/3
61178570	T	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/3		0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/1
61178599	T	A	True	1	0.25	0.0	0.25	False	False	0.25/4	0.00/2	0.00/3	0.00/3		0.00/1	0.50/2		0.00/1
61178627	A	G	True	1		0.091	0.0	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.25/4		0.00/2	0.00/2		0.00/1
61178628	A	G	True	1		0.083	0.0	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1		0.00/1
61178629	T	A	True	1		0.083	0.0	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/2		0.00/1
61178635	G	A	True	0		0.25		False	True			0.50/2	0.00/2		0.00/1	0.00/1		
61178639	A	T	True	1		0.083	0.125	False	False	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.33/3	0.00/4		0.00/1
61178640	G	T	True	0		0.4		False	False	0.00/1		0.50/2	0.00/2	1.00/1	0.00/1	0.00/1		
61178647	G	A	True	0		0.5		False	True	0.00/1		0.50/2	0.00/1	1.00/1	0.00/1	0.00/1		0.00/1
61178660	T	C	True	2		0.182	0.273	False	False	0.00/2	0.50/4	0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.60/5		0.00/3
61178678	T	A	True	1		0.0	0.083	False	False	0.00/3	0.00/4	0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/5		0.25/4
61178722	T	C	True	1		0.0	0.091	False	False	0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/4		0.25/4
61178777	A	G	True	1		0.0	0.111	False	False	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/2		0.00/1	0.25/4		0.00/4
61178783	C	G	True	1		0.143	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/1	0.00/2		0.00/2	0.00/4		0.00/3
61178812	C	A	True	1		0.0	0.111	False	False	0.00/2	0.00/3	0.00/1	0.00/2		0.00/1	0.25/4	0.00/1	0.00/3
61178870	T	C	True	1	0.0	0.083	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/6	0.00/5	0.00/1	0.00/7
61178878	C	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/4
61178888	A	T	True	1	0.0	0.0	0.118	False	False	0.00/6	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/6	0.00/3	0.00/1	0.29/7
61178889	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/4
61178892	C	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/5
61178896	T	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/1	0.00/6
61178937	G	C	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/2		1.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/5			0.00/2
61178988	T	C	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/4	0.00/8	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/8	0.00/1	0.00/2	0.00/10
61178990	A	C	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/4	0.00/8	0.00/3	0.25/4	0.00/4	0.00/8	0.00/1	0.00/2	0.00/10
