pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
59258001	A	T	True	1	0.0	0.0	0.083	False	False	0.00/8	0.00/5	0.00/5	0.00/7	0.00/5	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2
59258004	T	C	True	2	0.0	0.045	0.083	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/6	0.00/7	0.00/5	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2
59258005	T	C	True	1	0.0	0.0	0.083	False	False	0.00/8	0.00/5	0.00/6	0.00/6	0.00/5	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2
59258006	A	T	True	1	0.0	0.0	0.083	False	False	0.00/7	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.00/5	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2
59258007	T	C	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/8	0.00/4	0.00/6	0.00/6	0.00/5	0.25/4	0.00/2	0.00/3	0.00/2
59258008	G	T	True	0		0.0	0.25	False	False	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/2	1.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1
59258026	G	T	True	0		1.0		False	False	0.50/2	1.00/1	1.00/3	1.00/1	1.00/2	0.00/1	0.00/1		1.00/1
59258061	C	G	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/4	0.00/2	0.25/4	0.00/9	0.00/2	0.00/4	0.00/1	0.00/3	0.00/1
59258147	T	A	True	1	0.0	0.037	0.0	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/9	0.00/12	0.00/2	0.00/10	0.00/3	0.00/2	0.00/3
59258159	G	A	True	1		0.778	0.0	False	True	0.33/3	0.33/3	1.00/2	1.00/4		0.00/2	0.00/2		0.00/1
59258161	A	C	True	1	0.0	0.037	0.0	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/9	0.00/12	0.00/2	0.00/9	0.00/3	0.00/3	0.00/3
59258162	T	C	True	1	0.0	0.036	0.0	False	False	0.00/6	0.25/4	0.00/9	0.00/13	0.00/2	0.00/9	0.00/3	0.00/3	0.00/3
59258164	C	A	True	2		0.895	0.077	True	False	0.67/3	1.00/1	1.00/7	1.00/9	0.00/2	0.00/7	0.00/1	0.00/3	0.50/2
59258198	T	C	True	1	0.0	0.0	0.083	False	False	0.00/6	0.00/4	0.00/9	0.00/9	0.00/1	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.25/4
59258274	C	T	True	4	0.75	0.857	0.2	True	True	0.75/4	0.50/2	1.00/7	1.00/4	0.00/1	0.00/3	0.00/4	0.00/2	0.50/6
59258290	C	T	True	3		0.824	0.188	True	True	0.67/3	0.50/2	1.00/7	1.00/5	0.33/3	0.00/4	0.00/4	0.00/2	0.50/6
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59258308	T	G	True	1	0.0	0.043	0.0	False	False	0.00/6	0.25/4	0.00/8	0.00/6	0.00/5	0.00/8	0.00/8	0.00/2	0.00/8
59258309	C	G	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/6	0.00/5	0.00/4	0.00/5	0.00/6	0.00/2	0.00/7
59258311	T	A	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/6	0.25/4	0.00/8	0.00/5	0.00/5	0.00/7	0.00/7	0.00/2	0.00/9
59258318	C	A	True	1	0.333	0.0	0.0	False	False	0.33/6	0.00/4	0.00/7	0.00/5	0.00/4	0.00/5	0.00/6	0.00/2	0.00/7
59258325	T	A	True	1	0.0	0.0	0.037	False	False	0.00/8	0.00/5	0.00/8	0.00/5	0.00/5	0.00/8	0.00/6	0.25/4	0.00/9
59258327	T	A	True	1	0.0	0.0	0.045	False	False	0.00/5	0.00/3		0.00/1	0.00/3	0.00/7	0.00/6	0.25/4	0.00/5
59258331	A	T	True	0	0.0	0.3	0.045	False	False	0.00/5	0.00/4	1.00/1	1.00/2	0.00/3	0.00/7	0.00/6	0.00/4	0.20/5
59258332	C	A	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/4	0.00/4		0.00/1	0.00/2	0.00/5	0.00/5	0.00/3	0.25/4
59258333	A	C	True	1	0.0	0.1	0.0	False	False	0.00/6	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/3	0.00/7	0.00/6	0.00/4	0.00/4
59258376	T	A	True	6	0.455	0.759	0.182	True	False	0.45/11	0.50/8	1.00/7	1.00/8	0.50/6	0.00/8	0.00/5	0.00/8	0.50/12
59258379	C	T	True	6	0.571	0.619	0.13	False	True	0.57/7	0.50/8	0.75/4	1.00/4	0.40/5	0.00/6	0.00/4	0.00/7	0.50/6
59258427	G	T	True	1	0.0	0.0	0.083	False	False	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/5
59258434	C	T	True	5	0.4	0.76	0.08	True	True	0.40/10	0.60/10	1.00/4	1.00/5	0.67/6	0.00/6	0.00/8	0.00/8	0.67/3
59258455	T	A	True	5	0.286	0.594	0.049	True	False	0.29/14	0.54/13	0.75/4	0.56/9	0.67/6	0.00/11	0.00/10	0.00/10	0.20/10
59258457	T	C	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/14	0.00/12	0.25/4	0.00/10	0.00/6	0.00/11	0.00/10	0.00/10	0.00/10
59258485	C	G	True	1	0.0	0.042	0.0	False	False	0.00/8	0.00/10	0.25/4	0.00/5	0.00/5	0.00/7	0.00/9	0.00/10	0.00/5
59258517	C	G	True	1	0.0	0.0	0.037	False	False	0.00/5	0.00/10	0.00/5	0.00/6	0.00/2	0.00/8	0.00/9	0.00/6	0.25/4
59258601	G	T	True	3		0.867	0.15	True	False	0.00/1	0.33/3	1.00/6	1.00/5	1.00/1	0.00/5	0.00/3	0.00/6	0.50/6
59258608	A	T	True	6	0.25	0.795	0.143	True	False	0.25/8	0.50/10	1.00/13	0.92/12	0.50/4	0.00/12	0.00/7	0.00/11	0.50/12
59258634	C	G	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/8	0.25/4	0.00/5	0.00/6	0.00/3	0.00/6	0.00/1	0.00/4	0.00/6
59258635	T	C	True	1	0.0	0.0	0.026	False	False	0.00/9	0.00/7	0.00/12	0.00/15	0.00/5	0.00/12	0.25/4	0.00/11	0.00/12
59258636	T	C	True	1	0.0	0.0	0.026	False	False	0.00/9	0.00/6	0.00/12	0.00/15	0.00/5	0.00/12	0.25/4	0.00/11	0.00/12
59258638	T	C	True	1	0.0	0.0	0.026	False	False	0.00/9	0.00/6	0.00/12	0.00/15	0.00/5	0.00/12	0.25/4	0.00/11	0.00/12
59258639	T	C	True	1	0.0	0.0	0.026	False	False	0.00/9	0.00/6	0.00/12	0.00/15	0.00/5	0.00/12	0.25/4	0.00/11	0.00/12
59258676	A	G	True	1	0.0	0.0	0.034	False	False	0.00/8	0.00/5	0.00/11	0.00/12	0.00/4	0.00/8	0.25/4	0.00/7	0.00/10
59258679	T	G	True	1	0.0	0.0	0.034	False	False	0.00/6	0.00/5	0.00/11	0.00/12	0.00/4	0.00/8	0.25/4	0.00/7	0.00/10
59258680	T	G	True	1	0.0	0.0	0.036	False	False	0.00/6	0.00/5	0.00/11	0.00/12	0.00/4	0.00/8	0.25/4	0.00/7	0.00/9
59258732	T	C	True	3	0.167	0.344	0.143	False	False	0.17/6	0.17/6	0.36/11	0.56/9	0.17/6	0.00/8	0.00/5	0.00/3	0.60/5
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59258751	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.00/4	0.00/1	0.00/3
59258773	A	C	True	1	0.0	0.033	0.0	False	False	0.00/8	0.00/7	0.00/10	0.25/4	0.00/9	0.00/6	0.00/6	0.00/2	0.00/4
59258792	C	A	True	1	0.0	0.0	0.083	False	False	0.00/7	0.00/2	0.00/3		0.00/4	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/3
59258799	A	T	True	4	0.273	0.286	0.16	False	False	0.27/11	0.25/8	0.56/9	0.00/2	0.11/9	0.00/11	0.00/5	0.00/3	0.67/6
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59258874	A	G	True	1	0.0	0.056	0.0	False	False	0.00/12	0.00/5	0.25/4	0.00/2	0.00/7	0.00/10	0.00/5	0.00/4	0.00/4
