pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
53879010	T	C	True	1	0.0	0.118	0.143	False	False	0.00/4	0.20/5	0.00/2	0.00/6	0.25/4	0.33/3	0.00/2	0.00/1	0.00/1
53879060	T	A	True	1		0.111	0.167	False	False	0.33/3	0.00/4	0.25/4	0.14/7	0.00/3	0.20/5	0.00/2	0.00/3	0.50/2
53879065	T	C	True	1	0.0	0.111	0.083	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/4	0.14/7	0.00/3	0.00/6	0.50/2	0.00/3	0.00/1
53879086	A	C	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/6	0.00/3	0.00/3	0.00/2
53879118	C	T	True	1		0.083	0.0	False	True	0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/3
53879119	C	T	True	1		0.0	0.182	False	True	0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.00/4	0.00/2	0.25/4	0.00/2	0.00/2	0.33/3
53879183	C	T	True	1		0.111	0.0	False	True	0.00/2	0.00/4		0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/2
53879187	C	T	True	1		0.111	0.0	False	True	0.00/2	0.00/4		0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/2
53879228	C	A	True	0		0.6		False	False		0.00/2		1.00/3			1.00/1		0.00/1
53879229	A	G	True	1		0.167	0.227	False	False	0.00/2	0.00/3	0.20/5	0.20/10		0.43/7	0.17/6	0.20/5	0.00/4
53879241	A	T	True	1		0.062	0.056	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/5	0.12/8	0.00/1	0.00/7	0.25/4	0.00/4	0.00/3
53879242	A	G	True	1		0.0	0.1	False	False	0.00/2	0.00/2	0.00/4	0.00/9	0.00/1	0.12/8	0.00/4	0.00/4	0.25/4
53879250	A	T	True	2		0.429	0.867	False	False	0.00/1	1.00/1	0.33/3	0.33/3		0.83/6	1.00/5	0.50/2	1.00/2
53879294	G	A	True	1	0.2	0.25	0.353	False	True	0.20/5	1.00/1	0.25/4	0.00/5	0.50/2	0.12/8	0.33/3	1.00/3	0.33/3
53879295	A	G	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/6	0.00/3	0.00/4	0.00/6	0.00/2	0.00/9	0.25/4	0.00/3	0.00/5
53879314	A	C	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/8	0.00/3	0.25/4	0.00/6	0.00/2	0.00/9	0.00/3	0.00/2	0.00/5
53879328	C	T	True	0		0.0	0.25	False	True	0.00/1	0.00/3		0.00/2		0.00/1	1.00/1		0.00/2
53879340	A	T	True	1	0.0	0.0	0.04	False	False	0.00/11	0.00/4	0.00/4	0.00/8	0.00/3	0.00/10	0.00/6	0.25/4	0.00/5
53879345	C	T	True	0		0.0	0.25	False	True	0.00/1	0.00/3		0.00/3		0.00/1	0.00/1		0.50/2
53879347	A	T	True	3	0.0	0.1	0.192	False	False	0.00/10	0.00/4	0.25/4	0.11/9	0.00/3	0.30/10	0.29/7	0.00/4	0.00/5
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53879374	C	T	True	0		0.0	0.25	False	True	0.00/1	0.00/3		0.00/4		0.00/1	0.00/1		0.50/2
53879380	C	A	True	0		0.111	0.25	False	False	0.00/1	0.00/3		0.00/4	0.50/2	0.00/1	1.00/1		0.00/2
53879426	T	A	True	1	0.0	0.069	0.15	False	False	0.00/13	0.25/4	0.00/7	0.00/9	0.11/9	0.00/5	0.22/9	0.00/5	1.00/1
53879459	A	G	True	1	0.0	0.0	0.045	False	False	0.00/12	0.00/3	0.00/7	0.00/7	0.00/9	0.25/4	0.00/10	0.00/6	0.00/2
53879484	T	C	True	1	0.0	0.033	0.0	False	False	0.00/16	0.00/4	0.00/9	0.25/4	0.00/13	0.00/3	0.00/10	0.00/6	0.00/2
53879496	G	A	True	5	0.909	0.333	1.0	True	True	0.91/11	0.00/2	0.45/11	0.00/1	0.30/10	1.00/2	1.00/8	1.00/6	
53879506	A	G	True	1	0.0	0.0	0.048	False	False	0.00/20	0.00/5	0.00/10	0.00/5	0.00/16	0.25/4	0.00/8	0.00/8	0.00/1
53879654	A	G	True	2	0.25	0.179	0.7	True	False	0.25/12	0.00/3	0.33/9	0.00/3	0.15/13	0.67/3	1.00/3	0.67/3	0.00/1
53879676	T	A	True	2	0.154	0.04	0.7	True	False	0.15/13	0.00/4	0.00/8	0.25/4	0.00/9	1.00/1	0.60/5	1.00/3	0.00/1
53879691	T	A	True	4	0.312	0.167	1.0	False	False	0.31/16	0.00/4	0.29/7	0.25/4	0.11/9	1.00/1	1.00/4	1.00/2	
53879729	T	C	True	1	0.0	0.0	0.111	False	False	0.00/16	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/8	0.00/1	0.25/4	0.00/3	0.00/1
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53879774	C	A	True	1	0.0	0.071		False	False	0.00/9	0.00/3	0.00/1	0.25/4	0.00/6		0.00/1	0.00/2	
53879780	A	C	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/14	0.00/5	0.00/3	0.00/6	0.00/8	0.00/1	0.25/4	0.00/4	0.00/2
53879872	A	G	True	1	0.0	0.048	0.0	False	False	0.00/10	0.25/4	0.00/4	0.00/8	0.00/5	0.00/2		0.00/1	0.00/1
53879886	T	C	True	1	0.0	0.043		False	False	0.00/10	0.00/5	0.25/4	0.00/6	0.00/8	0.00/1			0.00/1