pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
53878019	T	G	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/10	0.00/8	0.25/4	0.00/4	0.00/3	0.00/1		0.00/1	0.00/2
53878027	T	A	True	1	0.0	0.033	0.0	False	False	0.00/11	0.00/13	0.25/4	0.00/8	0.00/5	0.00/3		0.00/2	0.00/4
53878029	T	A	True	2	0.077	0.2	0.5	False	False	0.08/13	0.23/13	0.25/4	0.12/8	0.20/5	0.33/3	1.00/1	0.50/2	0.50/4
53878030	A	G	True	1	0.0	0.094	0.1	False	False	0.00/12	0.00/13	0.33/6	0.11/9	0.00/4	0.33/3	0.00/1	0.00/2	0.00/4
53878037	T	A	True	1	0.0	0.054	0.0	False	False	0.00/13	0.00/15	0.12/8	0.00/10	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/4
53878046	A	G	True	1	0.0	0.054	0.059	False	False	0.00/11	0.06/16	0.00/7	0.00/10	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/5	0.14/7
53878086	C	T	True	5	0.429	0.448	1.0	False	True	0.43/7	0.33/9	0.33/6	0.60/10	0.50/4	1.00/1	1.00/2		1.00/1
53878136	T	C	True	3	0.267	0.242	0.24	False	False	0.27/15	0.20/25	0.15/13	0.43/14	0.20/10	0.14/7	0.67/3	0.14/7	0.25/8
53878158	C	T	True	2	0.0	0.216	0.167	False	True	0.00/9	0.08/13	0.38/8	0.30/10	0.17/6	0.00/1	0.00/2	1.00/1	0.00/2
53878170	G	T	True	3	0.25	0.231	0.056	False	False	0.25/4	0.33/12	0.00/5	0.50/4	0.00/5	0.00/6	0.00/1	0.17/6	0.00/5
53878172	C	A	True	2	0.333	0.176	0.0	False	False	0.33/9	0.33/12	0.00/6	0.20/10	0.00/6	0.00/1	0.00/2	0.00/1	0.00/2
53878177	A	T	True	4	0.385	0.196	0.083	False	False	0.38/13	0.29/21	0.00/10	0.29/14	0.09/11	0.00/7	0.00/3	0.29/7	0.00/7
53878185	G	A	True	2		0.25	0.125	False	True	0.33/3	0.30/10	0.20/5	0.50/4	0.00/5	0.00/6	0.00/1	0.17/6	0.33/3
53878186	A	T	True	4	0.364	0.204	0.091	False	False	0.36/11	0.26/19	0.00/10	0.36/14	0.09/11	0.00/7	0.00/3	0.29/7	0.00/5
53878187	A	C	True	1	0.273	0.094	0.0	False	False	0.27/11	0.16/19	0.00/10	0.15/13	0.00/11	0.00/7	0.00/3	0.00/7	0.00/5
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53878217	C	T	True	4	0.5	0.484	1.0	False	True	0.50/8	0.50/12	0.20/5	0.67/9	0.40/5		1.00/2	1.00/1	1.00/2
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53878227	G	T	True	1		0.0	0.1	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/4	0.00/1	0.25/4	0.00/1
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53878251	C	A	True	1	0.0	0.0	0.1	False	False	0.00/11	0.00/11	0.00/8	0.00/9	0.00/4	0.00/2	0.25/4	0.00/1	0.00/3
53878253	A	G	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/13	0.00/16	0.00/12	0.00/14	0.00/8	0.00/5	0.25/4	0.00/5	0.00/3
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53878257	A	G	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/13	0.00/15	0.00/11	0.00/14	0.00/8	0.00/5	0.25/4	0.00/5	0.00/3
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53878260	T	G	True	1	0.0	0.0	0.059	False	False	0.00/14	0.00/16	0.00/11	0.00/13	0.00/8	0.00/5	0.25/4	0.00/5	0.00/3
53878261	C	G	True	1	0.0	0.0	0.1	False	False	0.00/11	0.00/10	0.00/7	0.00/10	0.00/4	0.00/2	0.25/4	0.00/1	0.00/3
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53878286	T	C	True	1	0.0	0.0	0.077	False	False	0.00/16	0.00/10	0.00/8	0.00/10	0.00/6	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/2
53878306	G	A	True	1	0.25	0.0		False	True	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/2			0.00/1	
53878349	C	G	True	1	0.0	0.0	0.111	False	False	0.00/16	0.00/6	0.00/5	0.00/5	0.00/4	0.00/3	0.25/4		0.00/2
53878354	T	A	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/18	0.00/8	0.00/6	0.00/5	0.00/4	0.25/4	0.00/4	0.00/1	0.00/2
53878355	G	T	True	0		0.25		False	False	0.00/3	0.00/2	1.00/1	0.00/1				0.00/1	
53878375	A	G	True	1	0.0	0.071	0.0	False	False	0.00/16	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/2	0.00/2	0.00/4	0.00/1	0.00/2
53878391	T	C	True	2	0.643	0.667	1.0	False	False	0.64/14	0.25/4	1.00/2	0.67/3	1.00/3	1.00/2	1.00/3		1.00/1
53878400	A	G	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/13	0.00/4	0.00/4	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/4		0.00/1
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53878420	C	T	True	1	0.091	0.0	0.111	False	True	0.09/11	0.00/4	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/3	0.25/4		0.00/2
53878446	T	C	True	1	0.0	0.05	0.0	False	False	0.00/12	0.00/6	0.00/5	0.25/4	0.00/5	0.00/5	0.00/3		0.00/2
53878452	C	T	True	1	0.0	0.1	0.071	False	True	0.00/14	0.00/6	0.20/5	0.00/3	0.17/6	0.00/8	0.25/4		0.00/2
53878468	A	C	True	1	0.0	0.048	0.067	False	False	0.00/15	0.00/7	0.20/5	0.00/3	0.00/6	0.00/9	0.25/4		0.00/2
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53878497	C	A	True	2	0.0	0.0	0.278	False	False	0.00/13	0.00/5	0.00/5	0.00/3	0.00/5	0.33/9	0.40/5	0.00/1	0.00/3
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53878607	C	A	True	2	0.167	0.0	0.231	False	False	0.17/6	0.00/8	0.00/5	0.00/7	0.00/6	0.25/4	0.29/7	0.00/1	0.00/1
53878621	C	A	True	1	0.0	0.036	0.077	False	False	0.00/7	0.12/8	0.00/4	0.00/8	0.00/8	0.25/4	0.00/7	0.00/1	0.00/1
53878622	T	G	True	1	0.0	0.0	0.154	False	False	0.00/8	0.00/9	0.00/3	0.00/8	0.00/8	0.25/4	0.14/7	0.00/1	0.00/1
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53878668	C	T	True	2	0.0	0.161	0.143	False	True	0.00/11	0.12/8	0.25/4	0.14/7	0.17/12	0.33/6	0.00/7	0.00/1	
53878687	T	A	True	1	0.0	0.042	0.083	False	False	0.00/11	0.00/7	0.00/2	0.00/7	0.12/8	0.25/4	0.00/7	0.00/1	
53878689	T	A	True	1	0.0	0.04	0.083	False	False	0.00/12	0.00/7	0.00/2	0.12/8	0.00/8	0.25/4	0.00/7	0.00/1	
53878697	A	C	True	2	0.6	0.2	0.667	False	False	0.60/5	0.20/5		1.00/1	0.00/4	1.00/1	0.75/4		0.00/1
53878699	A	C	True	1	0.2	0.036	0.231	False	False	0.20/10	0.11/9	0.00/2	0.00/7	0.00/10	0.17/6	0.33/6		0.00/1
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53878781	T	C	True	1	0.2	0.152	0.083	False	False	0.20/10	0.08/12	0.00/2	0.11/9	0.30/10	0.00/4	0.20/5	0.00/2	0.00/1
53878868	T	A	True	1	0.0	0.143	0.2	False	False	0.00/6	0.22/9		0.00/5	0.14/7	0.33/3	0.25/4	0.00/1	0.00/2
53878882	C	T	True	2	0.0	0.174	0.333	False	True	0.00/7	0.11/9		0.14/7	0.29/7	0.00/3	0.25/4		1.00/2
53878894	A	C	True	0	0.0	0.0	0.25	False	False	0.00/6	0.00/8		0.00/7	0.00/7	0.00/3	1.00/2	0.00/1	0.00/2
53878905	T	C	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/6		0.00/6	0.00/5	0.00/4	0.00/2		0.00/2
53878912	C	T	True	1	0.0	0.118	0.0	False	True	0.00/6	0.29/7		0.00/6	0.00/4	0.00/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2
53878925	C	T	True	1	0.167	0.417	0.0	False	True	0.17/6	0.80/5		0.20/5	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/2
53878928	T	C	True	1	0.167	0.273	0.8	False	False	0.17/6	0.00/4		0.40/5	0.50/2	1.00/2	1.00/1	0.00/1	1.00/1
53878948	T	A	True	1	0.0	0.143	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/1	0.14/7	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/1
53878954	C	T	True	1		0.125	0.0	False	True	0.00/3	0.25/4	0.00/2	0.12/8	0.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/1
