pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
53657018	T	C	True	0	0.125	0.136	0.333	False	False	0.12/8	0.14/7	1.00/1	0.00/6	0.12/8	1.00/1	0.00/1	0.33/3	0.00/1
53657059	C	T	True	1	0.0	0.056	0.0	False	True	0.00/7	0.25/4	0.00/1	0.00/7	0.00/6	0.00/3		0.00/3	
53657062	A	T	True	1	0.111	0.04	0.2	False	False	0.11/9	0.00/7	1.00/1	0.00/9	0.00/8	0.33/3	0.00/1	0.25/4	0.00/2
53657071	A	T	True	1	0.0	0.0	0.273	False	False	0.00/8	0.00/8	0.00/1	0.00/9	0.00/8	0.33/3	0.00/1	0.25/4	0.33/3
53657074	A	T	True	0	0.143	0.04	0.25	False	False	0.14/7	0.00/7	1.00/1	0.00/9	0.00/8	0.50/2	0.00/1	0.33/3	0.00/2
53657082	A	T	True	1	0.0	0.0	0.091	False	False	0.00/9	0.00/9	0.00/1	0.00/9	0.00/10	0.00/3		0.25/4	0.00/4
53657103	A	T	True	1	0.0	0.0	0.143	False	False	0.00/9	0.00/10	0.00/2	0.00/9	0.00/10	0.00/3	0.00/1	0.17/6	0.25/4
53657105	T	A	True	1	0.111	0.033	0.143	False	False	0.11/9	0.00/10	0.50/2	0.00/8	0.00/10	0.25/4	0.00/1	0.20/5	0.00/4
53657106	A	T	True	1	0.0	0.0	0.067	False	False	0.00/9	0.00/10	0.00/2	0.00/8	0.00/10	0.25/4	0.00/1	0.00/6	0.00/4
53657107	A	G	True	1	0.0	0.0	0.071	False	False	0.00/8	0.00/10	0.00/2	0.00/9	0.00/10	0.25/4	0.00/1	0.00/5	0.00/4
53657113	A	G	True	1	0.0	0.03	0.143	False	False	0.00/9	0.00/10	0.00/3	0.00/9	0.09/11	0.00/4	0.00/1	0.20/5	0.25/4
53657126	G	A	True	1		0.0	0.125	False	True	0.00/3	0.00/7		0.00/4	0.00/4	0.00/1		0.00/3	0.25/4
53657132	C	T	True	1	0.143	0.05	0.125	False	True	0.14/7	0.00/3	0.33/3	0.00/7	0.00/7	0.25/4	0.00/1	0.00/2	0.00/1
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53657160	G	A	True	1		0.0	0.182	False	True	0.00/2	0.00/7		0.00/4	0.00/4	0.00/2		0.20/5	0.25/4
53657199	C	T	True	0	0.0	0.0	0.25	False	True	0.00/8	0.00/2	0.00/3	0.00/6	0.00/4	0.33/3		0.00/1	
53657216	C	T	True	0	0.0	0.0	0.25	False	True	0.00/8	0.00/3	0.00/3	0.00/7	0.00/4	0.33/3		0.00/1	
53657230	C	T	True	1	0.0	0.077	0.2	False	True	0.00/7	0.00/3	0.00/2	0.20/5	0.00/3	0.25/4		0.00/1	
53657249	C	T	True	1	0.0	0.077	0.2	False	True	0.00/7	0.33/3	0.00/3	0.00/5	0.00/2	0.25/4		0.00/1	
53657250	T	A	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/10	0.00/7	0.25/8	0.00/16	0.00/7	0.00/9	0.00/2	0.00/5	0.00/6
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53657257	C	T	True	2	0.0	0.133	0.429	False	True	0.00/8	0.25/4	0.33/3	0.00/5	0.00/3	0.40/5	1.00/1	0.00/1	
53657258	G	A	True	1		0.04	0.059	False	True	0.00/2	0.00/3	0.17/6	0.00/11	0.00/5	0.00/4	0.25/4	0.00/4	0.00/5
53657268	C	A	True	1	0.0	0.062	0.111	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/4	0.00/4	0.00/4	0.17/6	0.00/2	0.00/1	
53657273	C	A	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/7	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/5	0.00/3	0.00/1	
53657280	T	C	True	3	0.0	0.114	0.265	False	False	0.00/11	0.00/7	0.27/11	0.06/17	0.11/9	0.42/12	0.38/8	0.14/7	0.00/7
53657435	G	T	True	1	0.0	0.0	0.1	False	False	0.00/6	0.00/3	0.00/4	0.00/10	0.00/5	0.25/4	0.00/6	0.14/7	0.00/3
53657438	C	G	True	1	0.0	0.077	0.0	False	False	0.00/8	0.25/4	0.00/1	0.00/4	0.00/4	0.00/4		0.00/3	0.00/4
53657440	G	T	True	1	0.0	0.045	0.0	False	False	0.00/6	0.00/3	0.25/4	0.00/11	0.00/4	0.00/3	0.00/6	0.00/6	0.00/3
53657473	T	G	True	1	0.0	0.079	0.1	False	False	0.00/12	0.17/12	0.00/4	0.07/15	0.00/7	0.33/6	0.00/5	0.00/9	0.10/10
53657476	C	G	True	1	0.0	0.118	0.111	False	False	0.00/5	0.29/7	0.00/2	0.00/4	0.00/4	0.17/6		0.00/4	0.12/8
53657477	A	T	True	1	0.0	0.027	0.0	False	False	0.00/12	0.00/12	0.25/4	0.00/15	0.00/6	0.00/7	0.00/5	0.00/8	0.00/11
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53657484	G	A	True	3	0.0	0.2	1.0	True	True	0.00/7	0.33/6	1.00/1	0.09/11	0.00/2	1.00/1	1.00/4	1.00/4	1.00/3
53657504	A	T	True	1	0.0	0.024	0.029	False	False	0.00/13	0.00/17	0.25/4	0.00/15	0.00/5	0.14/7	0.00/3	0.00/11	0.00/14
53657524	T	A	True	5	0.0	0.163	0.421	False	False	0.00/15	0.16/19	0.44/9	0.07/15	0.00/6	0.45/11	0.50/4	0.50/10	0.31/13
53657536	C	A	True	1	0.0	0.036	0.05	False	False	0.00/9	0.00/11	0.00/8	0.00/5	0.25/4	0.12/8	0.00/2	0.00/5	0.00/5
53657549	G	A	True	1	0.0	0.043	0.105	False	True	0.00/7	0.00/9	0.33/3	0.00/9	0.00/2	0.40/5	0.00/4	0.00/4	0.00/6
53657627	G	C	True	1	0.0	0.097	0.0	False	False	0.00/4	0.18/11	0.25/4	0.00/13	0.00/3	0.00/7	0.00/3	0.00/6	0.00/7
53657648	A	C	True	6	0.071	0.243	0.613	False	False	0.07/14	0.17/18	0.44/16	0.29/28	0.00/12	0.47/17	0.67/9	0.62/13	0.70/23
53657657	T	A	True	1	0.0	0.108	0.076	False	False	0.00/13	0.29/21	0.00/15	0.08/26	0.00/12	0.16/19	0.00/10	0.13/15	0.00/22
53657658	G	A	True	1		0.042	0.167	False	True	0.00/3	0.00/7	0.33/3	0.00/11	0.00/3	0.29/7	0.00/3	0.14/7	0.14/7
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53657785	C	A	True	7	0.0	0.491	1.0	True	False	0.00/9	0.56/9	0.56/18	0.63/19	0.00/9	1.00/16	1.00/8	1.00/12	1.00/20
53657856	T	C	True	6	0.0	0.324	0.812	False	False	0.00/5	0.40/5	0.50/8	0.42/12	0.00/9	0.92/12	1.00/2	0.80/5	0.69/13
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