pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
2338037	A	G	True	6	0.278	0.167	0.268	False	False	0.28/18	0.36/11	0.00/5	0.00/15	0.27/11	0.27/22	0.11/9	0.25/8	0.35/17
2338162	G	A	True	3		0.0	0.947	True	True	1.00/2		0.00/3	0.00/3	0.00/2	1.00/6	1.00/5	0.50/2	1.00/6
2338209	A	T	True	5	1.0	0.111	1.0	True	False	1.00/7	1.00/2	0.00/4	0.00/7	0.00/5	1.00/18	1.00/11	1.00/7	1.00/13
2338211	T	A	True	5	1.0	0.118	1.0	True	False	1.00/7	1.00/2	0.00/4	0.00/7	0.00/4	1.00/18	1.00/12	1.00/7	1.00/13
2338220	T	C	True	1	0.667	0.0	0.0	False	False	0.67/9	0.00/2	0.00/6	0.00/8	0.00/5	0.00/17	0.00/12	0.00/7	0.00/13
2338247	C	T	True	6	1.0	0.2	1.0	True	True	1.00/8	1.00/2	0.00/3	0.00/6	0.25/4	1.00/13	1.00/6	1.00/5	1.00/9
2338293	G	A	True	2		0.167	1.0	False	True	1.00/2	1.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/1	1.00/2	1.00/5	1.00/1	1.00/5
2338310	C	G	True	1	0.0	0.0	0.038	False	False	0.00/7	0.00/2	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/11	0.00/6	0.25/4	0.00/5
2338374	C	T	True	1	1.0	0.0	0.0	False	True	1.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/4	0.00/5	0.00/7	0.00/4	0.00/3	0.00/4
2338419	T	C	True	3		0.235	1.0	True	False	1.00/1	0.50/6	0.00/2	0.00/4	0.20/5	1.00/5	1.00/4	1.00/2	1.00/3
2338452	C	G	True	1		0.0	0.083	False	False		0.00/3	0.00/2	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.25/4	0.00/1	0.00/5
2338461	A	G	True	2		0.118	1.0	True	False	0.67/3	0.20/5	0.00/2	0.00/5	0.20/5	1.00/1	1.00/6	1.00/1	1.00/8
2338477	C	A	True	1		0.1	0.0	False	False	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/3	0.00/1	0.00/5
2338523	C	A	True	2		0.077	1.0	True	False	1.00/2	0.00/2	0.00/2	0.00/5	0.25/4	1.00/1	1.00/3		1.00/5
2338542	T	C	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/5	0.00/5	0.00/2	0.00/12	0.00/6	0.00/4	0.25/4		0.00/8
2338543	A	T	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/5	0.00/5	0.00/2	0.00/12	0.00/6	0.00/4	0.25/4		0.00/8
2338544	T	C	True	1	0.0	0.0	0.062	False	False	0.00/5	0.00/5	0.00/2	0.00/12	0.00/6	0.00/4	0.25/4		0.00/8
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2338575	A	G	True	3	0.6	0.038	0.545	True	False	0.60/5	0.00/6	0.00/1	0.00/13	0.17/6	0.62/8	0.33/3	0.00/1	0.60/10
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2338600	A	G	True	4		0.125	0.963	True	False	0.00/3	0.17/6	0.00/1	0.00/13	0.50/4	1.00/9	1.00/5	0.67/3	1.00/10
2338602	A	G	True	1		0.042	0.0	False	False	0.00/3	0.00/6	0.00/1	0.00/13	0.25/4	0.00/9	0.00/5	0.00/3	0.00/10
2338620	T	A	True	1	0.0	0.04	0.0	False	False	0.00/5	0.00/9	0.00/1	0.00/11	0.25/4	0.00/10	0.00/5	0.00/3	0.00/8
2338770	T	A	True	1	0.0	0.053	0.0	False	False	0.00/4	0.00/8	0.00/2	0.00/5	0.25/4	0.00/10	0.00/3	0.00/9	0.00/10
2338824	A	G	True	1		0.0	0.333	False	False		0.00/1	0.00/1	0.00/8	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.50/4	
2338851	T	A	True	0		0.056	0.667	False	False	1.00/2	0.50/2	0.00/4	0.00/8	0.00/4	0.67/3		1.00/1	0.50/2
2338852	A	T	True	0		0.056	0.5	False	False	0.00/2	0.50/2	0.00/4	0.00/8	0.00/4	0.67/3		1.00/1	0.00/2
2338853	T	C	True	0		0.0	0.333	False	False	0.50/2	0.00/2	0.00/4	0.00/8	0.00/4	0.33/3		0.00/1	0.50/2
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2338857	G	T	True	0		0.0	0.25	False	False		0.00/1	0.00/2	0.00/5	0.00/1	0.50/2		0.00/1	0.00/1
2338858	A	T	True	1		0.053	0.2	False	False	0.00/3	0.50/2	0.00/4	0.00/9	0.00/4	0.25/4		0.33/3	0.00/3
2338859	G	T	True	0		0.0	0.5	False	False	1.00/1	0.00/1	0.00/3	0.00/5	0.00/1	0.50/2		0.00/1	1.00/1
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2338999	A	T	True	6	1.0	0.179	1.0	True	False	1.00/8	0.83/6	0.00/5	0.00/11	0.00/6	1.00/9	1.00/10	1.00/7	1.00/10