pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
1424328	T	C	True	3	0.0	0.0	0.864	True	False	0.00/5	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/4	1.00/9	1.00/2	0.50/4	0.86/7
1424399	T	A	True	1	0.0	0.0	0.071	False	False	0.00/7	0.00/4	0.00/3	0.00/1	0.00/4	0.00/6	0.00/2	0.25/4	0.00/2
1424422	G	A	True	0		0.0	0.25	False	True	0.00/1	0.00/3			0.00/2		0.00/1	1.00/1	0.00/2
1424445	A	C	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/6	0.00/6	0.00/4	0.00/1	0.25/4	0.00/5	0.00/3	0.00/6	0.00/3
1424452	T	C	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/6	0.00/6	0.00/4	0.00/1	0.25/4	0.00/5	0.00/4	0.00/6	0.00/3
1424465	C	A	True	2	0.0	0.0	0.714	True	False	0.00/5	0.00/3	0.00/4	0.00/1	0.00/2	1.00/4	1.00/4	0.20/5	1.00/1
1424483	T	A	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/5	0.00/5	0.00/4	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/6	0.00/6	0.00/3
1424484	T	A	True	1	0.0	0.071	0.0	False	False	0.00/5	0.00/5	0.00/3	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/6	0.00/6	0.00/3
1424487	A	G	True	1	0.0	0.083	0.0	False	False	0.00/4	0.00/3	0.00/3	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/5	0.00/6	0.00/3
1424507	G	A	True	0		0.0	0.25	False	True	0.00/1	0.00/2		0.00/2	0.00/1		0.00/1	1.00/1	0.00/2
1424510	G	A	True	0		0.0	0.25	False	True	0.00/1	0.00/2		0.00/2	0.00/1		0.00/1	1.00/1	0.00/2
1424520	G	T	True	0		0.0	0.25	False	False	0.00/1	0.00/1		0.00/2	0.00/1		0.00/1	1.00/1	0.00/2
1424536	A	G	True	1		0.067	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/5	0.00/3	0.00/3
1424538	T	G	True	1		0.067	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/5	0.00/3	0.00/3
1424539	T	G	True	1		0.067	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/5	0.00/3	0.00/3
1424540	T	A	True	1		0.067	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/5	0.00/3	0.00/3	0.00/1	0.00/5	0.00/4	0.00/3
1424611	T	C	True	1		0.077	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/3	0.00/3		0.00/2	0.00/2	0.00/2
1424627	A	G	True	1		0.077	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/3	0.00/3		0.00/2	0.00/2	0.00/2
1424654	A	G	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3		0.00/1	0.00/3	0.00/3
1424655	T	A	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3		0.00/1	0.00/3	0.00/3
1424656	A	G	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3		0.00/1	0.00/3	0.00/3
1424657	T	A	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/2	0.25/4	0.00/3	0.00/4	0.00/3		0.00/1	0.00/3	0.00/4
1424658	A	T	True	1		0.071	0.0	False	False	0.00/2	0.00/4	0.00/3	0.25/4	0.00/3		0.00/1	0.00/3	0.00/4
1424694	A	C	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/5	0.00/6	0.00/2		0.00/2	0.00/4	0.00/6
1424696	A	C	True	2	0.0	0.125	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.25/4	0.00/6	0.00/2		0.00/2	0.00/4	0.00/6
1424701	T	G	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/3	0.00/6	0.00/2		0.00/2	0.00/4	0.00/6
1424706	A	G	True	1	0.25	0.059	0.0	False	False	0.25/4	0.17/6	0.00/3	0.00/6	0.00/2		0.00/3	0.00/4	0.00/6
1424707	A	G	True	1	0.0	0.105	0.0	False	False	0.00/4	0.17/6	0.25/4	0.00/6	0.00/3		0.00/3	0.00/4	0.00/6
1424715	A	G	True	3	0.25	0.0	0.429	False	False	0.25/4	0.00/6	0.00/5	0.00/6	0.00/2	0.00/1	0.00/4	0.50/4	0.80/5
1424773	A	T	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/6	0.00/10	0.00/4	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/6
1424789	A	G	True	1		0.032	0.0	False	False	0.00/3	0.00/10	0.00/6	0.00/11	0.25/4	0.00/1	0.00/4	0.00/1	0.00/7
1424800	T	C	True	1		0.0	0.071	False	False	0.00/3	0.00/10	0.00/7	0.00/10	0.00/5	0.00/1	0.25/4	0.00/2	0.00/7
1424851	G	C	True	1		0.0	0.2	False	False		0.00/3	0.00/3	0.00/6	0.00/2	0.00/1			0.25/4
1424852	G	T	True	1		0.0	0.2	False	False		0.00/3	0.00/2	0.00/6	0.00/2	0.00/1			0.25/4
1424883	A	G	True	1		0.0	0.077	False	False	0.00/1	0.00/8	0.00/9	0.00/9	0.00/6	0.00/2	0.00/1	0.25/4	0.00/6
1424895	A	G	True	1		0.065	0.0	False	False	0.00/1	0.25/8	0.00/9	0.00/9	0.00/5	0.00/2	0.00/1	0.00/5	0.00/3
1424904	C	A	True	1		0.0	0.667	True	False		0.00/6	0.00/5	0.00/2	0.00/2	0.50/2	1.00/1	0.50/4	1.00/2
1424936	A	C	True	1		0.0	0.059	False	False	0.00/3	0.00/8	0.00/10	0.00/11	0.00/6	0.25/4	0.00/3	0.00/5	0.00/5
1424939	C	G	True	1		0.062	0.0	False	False	0.00/2	0.00/4	0.00/5	0.25/4	0.00/3	0.00/2	0.00/2	0.00/4	0.00/2
1424978	T	A	True	1	0.0	0.0	0.056	False	False	0.00/4	0.00/10	0.00/10	0.00/11	0.00/6	0.00/5	0.00/3	0.00/6	0.25/4
1424983	T	A	True	1	0.0	0.0	0.053	False	False	0.00/4	0.00/9	0.00/11	0.00/11	0.00/6	0.00/6	0.00/3	0.00/6	0.25/4
1424999	A	C	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/9	0.00/11	0.00/8	0.00/6	0.00/5	0.00/4	0.00/4	0.00/6
