pos	ref	alt	in_target	n_oysters_with_alt	alt_freq_Pum	alt_freq_Qui	alt_freq_Rio	pop_differentiated	cpg_destroying	Pum1	Qui1	Qui2	Qui3	Qui4	Rio1	Rio2	Rio3	Rio4
6561025	A	T	True	4	0.0	0.442	0.0	False	False	0.00/12	0.36/11	0.50/12	0.50/12	0.38/8	0.00/10	0.00/7	0.00/7	0.00/16
6561043	C	A	True	0		0.25	0.0	False	False	0.00/1		0.00/2		0.50/2			0.00/2	0.00/2
6561113	A	G	True	1	0.0	0.0	0.036	False	False	0.00/10	0.00/11	0.00/8	0.00/15	0.00/7	0.00/9	0.00/5	0.25/4	0.00/10
6561120	G	A	True	1	0.0	0.125	0.0	False	True	0.00/10	0.44/9	0.00/6	0.00/13	0.00/4	0.00/8	0.00/5	0.00/2	0.00/9
6561204	C	G	True	0			0.25	False	False	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/1		0.00/1	1.00/1	0.00/1	0.00/1
6561206	T	A	True	1	0.0	0.0	0.038	False	False	0.00/8	0.00/7	0.00/11	0.00/9	0.00/3	0.00/9	0.25/4	0.00/6	0.00/7
6561207	C	G	True	0			0.25	False	False	0.00/3	0.00/1	0.00/1	0.00/1		0.00/1	1.00/1	0.00/1	0.00/1
6561227	G	C	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/6	0.00/7	0.00/6	0.00/3	0.00/8	0.00/4	0.00/5	0.00/4
6561240	C	A	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2		0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1
6561241	C	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2		0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1
6561245	C	G	True	1	0.25	0.0	0.0	False	False	0.25/4	0.00/2	0.00/1	0.00/2	0.00/2	0.00/1	0.00/1	0.00/1	0.00/1
6561327	A	G	True	2	0.167	0.31	0.0	False	False	0.17/6	0.33/3	0.43/7	0.11/9	0.40/10	0.00/6	0.00/7	0.00/7	0.00/9
6561337	A	G	True	1	0.0	0.062	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.11/9	0.00/8	0.00/11	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561338	T	G	True	1	0.0	0.067	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.11/9	0.00/8	0.00/9	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561339	A	G	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/9	0.00/8	0.00/11	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561340	A	G	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/9	0.00/8	0.00/11	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561341	A	G	True	1	0.0	0.032	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/8	0.00/8	0.00/11	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561343	A	G	True	1	0.0	0.032	0.0	False	False	0.00/5	0.25/4	0.00/8	0.00/8	0.00/11	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561344	A	G	True	1	0.0	0.031	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/9	0.00/8	0.00/11	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561346	A	G	True	1	0.0	0.032	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/9	0.00/8	0.00/10	0.00/5	0.00/5	0.00/8	0.00/9
6561348	A	G	True	1	0.0	0.03	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/9	0.00/8	0.00/12	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561349	T	A	True	1	0.0	0.03	0.0	False	False	0.00/4	0.25/4	0.00/9	0.00/8	0.00/12	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561352	A	G	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/4	0.40/5	0.00/9	0.00/8	0.00/12	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561353	A	G	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/5	0.40/5	0.00/9	0.00/8	0.00/12	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561355	A	G	True	1	0.0	0.061	0.0	False	False	0.00/4	0.40/5	0.00/8	0.00/8	0.00/12	0.00/5	0.00/4	0.00/8	0.00/9
6561422	A	G	True	1		0.0	0.056	False	False	0.00/3	0.00/7	0.00/12	0.00/10	0.00/8	0.00/6	0.25/8	0.00/10	0.00/12
6561432	T	C	True	3	0.0	0.27	0.0	False	False	0.00/4	0.43/7	0.25/12	0.10/10	0.38/8	0.00/4	0.00/10	0.00/11	0.00/12
6561493	C	A	True	3	0.0	0.464	0.0	False	False	0.00/5	0.50/8	0.57/7	0.17/6	0.57/7	0.00/6	0.00/11	0.00/9	0.00/9
6561557	C	T	True	3	0.0	0.407	0.0	False	True	0.00/10	0.43/7	0.50/8	0.17/6	0.50/6	0.00/9	0.00/10	0.00/8	0.00/9
6561588	G	A	True	0		0.5		False	True	0.00/1		0.00/1	0.00/1	1.00/2				0.00/2
6561592	T	A	True	3	0.0	0.343	0.0	False	False	0.00/10	0.38/8	0.57/7	0.10/10	0.40/10	0.00/9	0.00/7	0.00/8	0.00/5
6561630	T	A	True	3	0.0	0.36	0.0	False	False	0.00/9	0.46/13	0.29/14	0.09/11	0.58/12	0.00/13	0.00/8	0.00/10	0.00/6
6561632	A	G	True	2	0.111	0.222	0.026	False	False	0.11/9	0.19/16	0.20/15	0.25/12	0.27/11	0.00/13	0.00/8	0.00/11	0.14/7
6561633	C	T	True	2	0.111	0.212	0.028	False	True	0.11/9	0.31/16	0.29/14	0.08/13	0.11/9	0.00/12	0.00/7	0.10/10	0.00/7
6561649	A	T	True	2	0.125	0.19	0.0	False	False	0.12/8	0.27/15	0.25/16	0.12/16	0.09/11	0.00/11	0.00/7	0.00/12	0.00/6
6561668	A	G	True	3	0.25	0.333	0.0	False	False	0.25/8	0.33/15	0.53/19	0.21/19	0.20/10	0.00/15	0.00/6	0.00/11	0.00/6
6561688	C	A	True	4	0.125	0.37	0.0	False	False	0.12/8	0.39/18	0.43/23	0.29/21	0.36/11	0.00/15	0.00/4	0.00/11	0.00/9
6561692	A	T	True	1	0.0	0.234	0.0	False	False	0.00/6	0.24/21	0.23/22	0.10/20	0.43/14	0.00/11	0.00/6	0.00/10	0.00/8
6561744	A	G	True	1	0.182	0.159	0.0	False	False	0.18/11	0.00/18	0.17/24	0.25/24	0.19/16	0.00/15	0.00/5	0.00/13	0.00/9
6561750	A	G	True	4	0.083	0.584	0.0	True	False	0.08/12	0.50/16	0.64/25	0.52/23	0.69/13	0.00/18	0.00/5	0.00/13	0.00/8
6561763	A	G	True	1	0.0	0.162	0.0	False	False	0.00/13	0.19/16	0.17/23	0.04/23	0.33/12	0.00/17	0.00/7	0.00/11	0.00/7
6561767	A	G	True	4	0.0	0.486	0.0	False	False	0.00/13	0.47/15	0.58/19	0.39/23	0.54/13	0.00/16	0.00/8	0.00/12	0.00/8
6561768	T	C	True	4	0.0	0.343	0.044	False	False	0.00/13	0.36/14	0.25/20	0.39/23	0.38/13	0.12/17	0.00/8	0.00/12	0.00/8
6561770	T	C	True	3	0.0	0.457	0.022	False	False	0.00/13	0.57/14	0.55/20	0.22/23	0.62/13	0.06/17	0.00/8	0.00/12	0.00/9
6561772	T	A	True	3	0.0	0.29	0.0	False	False	0.00/12	0.31/13	0.42/19	0.13/23	0.36/14	0.00/19	0.00/8	0.00/12	0.00/9
6561773	T	C	True	4	0.083	0.543	0.042	True	False	0.08/12	0.57/14	0.58/19	0.48/23	0.57/14	0.11/18	0.00/8	0.00/13	0.00/9
6561786	A	G	True	2	0.0	0.254	0.0	False	False	0.00/13	0.20/15	0.33/18	0.20/25	0.31/13	0.00/19	0.00/9	0.00/11	0.00/8
6561824	A	G	True	3	0.0	0.308	0.0	False	False	0.00/15	0.21/14	0.27/15	0.27/22	0.50/14	0.00/19	0.00/10	0.00/14	0.00/10
6561828	A	G	True	4	0.0	0.403	0.0	False	False	0.00/15	0.47/15	0.40/15	0.27/22	0.53/15	0.00/19	0.00/10	0.00/13	0.00/11
6561850	T	C	True	1	0.0	0.193	0.0	False	False	0.00/17	0.12/16	0.15/13	0.27/15	0.23/13	0.00/21	0.00/10	0.00/13	0.00/12
6561867	C	T	True	1	0.0	0.188	0.0	False	True	0.00/16	0.20/10	0.17/12	0.13/15	0.27/11	0.00/20	0.00/10	0.00/13	0.00/12
6561873	C	T	True	2	0.0	0.279	0.0	False	True	0.00/16	0.33/9	0.20/10	0.08/13	0.55/11	0.00/20	0.00/10	0.00/14	0.00/12
6561892	C	A	True	1	0.0	0.143	0.0	False	False	0.00/14	0.00/7	0.11/9	0.11/9	0.30/10	0.00/19	0.00/15	0.00/14	0.00/12
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6561901	A	T	True	3	0.0	0.303	0.0	False	False	0.00/11	0.29/7	0.22/9	0.25/8	0.44/9	0.00/22	0.00/13	0.00/15	0.00/13
6561911	T	C	True	1	0.0	0.059	0.0	False	False	0.00/12	0.00/8	0.00/9	0.00/9	0.25/8	0.00/23	0.00/14	0.00/15	0.00/14
6561920	T	C	True	1	0.0	0.069	0.0	False	False	0.00/13	0.00/7	0.00/8	0.00/6	0.25/8	0.00/23	0.00/13	0.00/14	0.00/14
6561922	T	C	True	1	0.083	0.207	0.0	False	False	0.08/12	0.14/7	0.12/8	0.17/6	0.38/8	0.00/23	0.00/11	0.00/14	0.00/14
