CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 67003 526820 11.28 593823 2 134982 559876 19.43 694858 3 85261 498629 14.60 583890 4 89717 590540 13.19 680257 5 100106 526392 15.98 626498 6 105507 617573 14.59 723080 7 106783 573887 15.69 680670 8 101389 546116 15.66 647505 9 95552 545930 14.90 641482 10 97246 533626 15.41 630872 11 92241 543361 14.51 635602 12 93849 533542 14.96 627391 13 92907 536579 14.76 629486 14 94246 539875 14.86 634121 15 94713 534453 15.05 629166 16 96243 547253 14.96 643496 17 94097 543561 14.76 637658 18 97302 548262 15.07 645564 19 97729 551254 15.06 648983 20 96113 546640 14.95 642753 21 96492 541663 15.12 638155 22 96430 544708 15.04 641138 23 97543 541257 15.27 638800 24 98056 544406 15.26 642462 25 97230 545711 15.12 642941 26 96546 542947 15.10 639493 27 96243 541872 15.08 638115 28 98304 545738 15.26 644042 29 97560 545585 15.17 643145 30 97676 550279 15.07 647955 31 97968 547415 15.18 645383 32 98118 547851 15.19 645969 33 96576 546894 15.01 643470 34 98341 548457 15.20 646798 35 97489 546232 15.14 643721 36 98037 543521 15.28 641558 37 96561 543420 15.09 639981 38 96322 544242 15.04 640564 39 97612 546145 15.16 643757 40 97074 546545 15.08 643619 41 97132 544493 15.14 641625 42 96911 547823 15.03 644734 43 96621 545220 15.05 641841 44 96298 542916 15.07 639214 45 97095 540160 15.24 637255 46 97638 543009 15.24 640647 47 95341 540845 14.99 636186 48 97041 542854 15.17 639895 49 95170 540937 14.96 636107 50 95963 538252 15.13 634215 51 96005 540079 15.09 636084 52 95273 539846 15.00 635119 53 96864 542478 15.15 639342 54 98516 540086 15.43 638602 55 95210 540197 14.98 635407 56 96831 540498 15.19 637329 57 95981 541186 15.06 637167 58 95232 544578 14.88 639810 59 95070 540395 14.96 635465 60 94815 539446 14.95 634261 61 94851 537669 15.00 632520 62 95588 537667 15.09 633255 63 95557 539333 15.05 634890 64 96224 541824 15.08 638048 65 94560 537535 14.96 632095 66 95428 538309 15.06 633737 67 94984 539553 14.97 634537 68 95332 539405 15.02 634737 69 94230 539211 14.88 633441 70 93966 537246 14.89 631212 71 93869 537626 14.86 631495 72 93243 537128 14.79 630371 73 93420 538335 14.79 631755 74 94028 535659 14.93 629687 75 94628 538520 14.95 633148 76 93957 538445 14.86 632402 77 95073 537661 15.03 632734 78 94948 536828 15.03 631776 79 94190 538327 14.89 632517 80 94892 533993 15.09 628885 81 93266 534288 14.86 627554 82 94587 537177 14.97 631764 83 93363 535272 14.85 628635 84 93792 537592 14.85 631384 85 93085 534024 14.84 627109 86 93852 534554 14.93 628406 87 93188 533836 14.86 627024 88 94178 535285 14.96 629463 89 93655 534187 14.92 627842 90 92966 533345 14.84 626311 91 91751 534603 14.65 626354 92 92135 532514 14.75 624649 93 92446 535438 14.72 627884 94 92761 533543 14.81 626304 95 91958 532053 14.74 624011 96 92531 532234 14.81 624765 97 92745 533608 14.81 626353 98 94461 534445 15.02 628906 99 91844 535215 14.65 627059 100 92729 533520 14.81 626249 101 91240 533716 14.60 624956 102 91361 533744 14.62 625105 103 92021 533034 14.72 625055 104 90916 531390 14.61 622306 105 90996 533810 14.56 624806 106 91583 535731 14.60 627314 107 91925 535502 14.65 627427 108 92700 534331 14.78 627031 109 92064 534788 14.69 626852 110 91755 534553 14.65 626308 111 91678 535450 14.62 627128 112 91176 535864 14.54 627040 113 90398 533740 14.48 624138 114 90814 531355 14.60 622169 115 91995 533543 14.71 625538 116 91316 535016 14.58 626332 117 91764 534022 14.66 625786 118 91432 535029 14.60 626461 119 91348 533318 14.62 624666 120 90387 533756 14.48 624143 121 90415 534172 14.48 624587 122 91280 534677 14.58 625957 123 90485 534348 14.48 624833 124 89936 533339 14.43 623275 125 90713 532210 14.56 622923 126 90761 533543 14.54 624304 127 90506 534633 14.48 625139 128 90749 531784 14.58 622533 129 90355 531192 14.54 621547 130 89694 532664 14.41 622358 131 91183 533003 14.61 624186 132 89840 532275 14.44 622115 133 89646 534581 14.36 624227 134 90472 531598 14.54 622070 135 90311 530452 14.55 620763 136 89471 531885 14.40 621356 137 90002 529984 14.52 619986 138 89764 532613 14.42 622377 139 89857 531502 14.46 621359 140 90856 529570 14.64 620426 141 90810 530193 14.62 621003 142 89436 530490 14.43 619926 143 90259 529332 14.57 619591 144 90724 528013 14.66 618737 145 90107 532535 14.47 622642 146 91027 530118 14.65 621145 147 90876 530825 14.62 621701 148 90555 530888 14.57 621443 149 90619 528612 14.63 619231 150 89409 528674 14.47 618083 151 92041 530185 14.79 622226 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 13359 1201552 1.10 1214911 2 9518 837002 1.12 846520 3 6327 851174 0.74 857501 4 5556 842024 0.66 847580 5 6273 972544 0.64 978817 6 6530 977733 0.66 984263 7 5693 865984 0.65 871677 8 5475 901656 0.60 907131 9 5281 883609 0.59 888890 10 4957 878788 0.56 883745 11 4860 890139 0.54 894999 12 4882 900496 0.54 905378 13 4594 900158 0.51 904752 14 4533 892695 0.51 897228 15 4470 896855 0.50 901325 16 4444 901935 0.49 906379 17 4366 897370 0.48 901736 18 4356 912106 0.48 916462 19 4333 909601 0.47 913934 20 4251 897389 0.47 901640 21 4247 903610 0.47 907857 22 4174 900432 0.46 904606 23 4085 898745 0.45 902830 24 4190 896721 0.47 900911 25 4240 901355 0.47 905595 26 4248 897376 0.47 901624 27 4145 903528 0.46 907673 28 4143 904913 0.46 909056 29 4122 899740 0.46 903862 30 4144 906824 0.45 910968 31 4017 906981 0.44 910998 32 4072 906370 0.45 910442 33 4165 911909 0.45 916074 34 4109 907999 0.45 912108 35 4113 901115 0.45 905228 36 3957 903320 0.44 907277 37 4122 898048 0.46 902170 38 4111 895844 0.46 899955 39 4120 901425 0.45 905545 40 3965 901167 0.44 905132 41 4108 896891 0.46 900999 42 4043 903877 0.45 907920 43 4050 904579 0.45 908629 44 4100 901588 0.45 905688 45 4098 903328 0.45 907426 46 4015 899625 0.44 903640 47 3985 900274 0.44 904259 48 4116 898752 0.46 902868 49 3996 897044 0.44 901040 50 3980 895398 0.44 899378 51 4018 895304 0.45 899322 52 3944 904228 0.43 908172 53 3977 900984 0.44 904961 54 4137 900947 0.46 905084 55 3994 898571 0.44 902565 56 3778 898488 0.42 902266 57 3971 899188 0.44 903159 58 3999 898285 0.44 902284 59 4053 900331 0.45 904384 60 4017 899838 0.44 903855 61 4074 897923 0.45 901997 62 3965 893898 0.44 897863 63 3933 903791 0.43 907724 64 4029 900740 0.45 904769 65 3961 896614 0.44 900575 66 4026 899314 0.45 903340 67 4013 900501 0.44 904514 68 4023 891555 0.45 895578 69 3910 897838 0.43 901748 70 3935 899915 0.44 903850 71 3925 892181 0.44 896106 72 3909 898381 0.43 902290 73 3914 897035 0.43 900949 74 3996 894081 0.44 898077 75 3920 899480 0.43 903400 76 4040 901045 0.45 905085 77 4001 895134 0.44 899135 78 3921 896412 0.44 900333 79 3832 893975 0.43 897807 80 3914 895770 0.44 899684 81 4118 898112 0.46 902230 82 4076 896694 0.45 900770 83 4003 894059 0.45 898062 84 3898 901311 0.43 905209 85 3869 895405 0.43 899274 86 3950 896179 0.44 900129 87 3941 898763 0.44 902704 88 3840 897203 0.43 901043 89 3975 893041 0.44 897016 90 3946 897547 0.44 901493 91 3817 899699 0.42 903516 92 3871 890304 0.43 894175 93 3761 896625 0.42 900386 94 4052 898103 0.45 902155 95 3871 893574 0.43 897445 96 3915 896052 0.44 899967 97 3974 898857 0.44 902831 98 3913 896146 0.43 900059 99 3912 896925 0.43 900837 100 3823 897849 0.42 901672 101 3749 891429 0.42 895178 102 3856 899015 0.43 902871 103 3843 894941 0.43 898784 104 3907 893641 0.44 897548 105 3941 899087 0.44 903028 106 3904 901029 0.43 904933 107 3845 895996 0.43 899841 108 3860 897986 0.43 901846 109 3830 895845 0.43 899675 110 3884 893225 0.43 897109 111 3945 897200 0.44 901145 112 3751 895636 0.42 899387 113 3908 892487 0.44 896395 114 3768 897583 0.42 901351 115 3823 897564 0.42 901387 116 3913 894415 0.44 898328 117 3885 897715 0.43 901600 118 3935 896675 0.44 900610 119 3821 895113 0.43 898934 120 3979 897425 0.44 901404 121 3950 895963 0.44 899913 122 3829 892838 0.43 896667 123 4040 895987 0.45 900027 124 3951 895820 0.44 899771 125 3957 894312 0.44 898269 126 3911 901622 0.43 905533 127 4037 899834 0.45 903871 128 4150 897813 0.46 901963 129 4060 897520 0.45 901580 130 4003 898151 0.44 902154 131 4070 890788 0.45 894858 132 4159 897312 0.46 901471 133 4246 897710 0.47 901956 134 4368 894814 0.49 899182 135 4551 896501 0.51 901052 136 4644 893531 0.52 898175 137 4544 892741 0.51 897285 138 4589 898883 0.51 903472 139 4746 893120 0.53 897866 140 4861 895027 0.54 899888 141 5032 896054 0.56 901086 142 5267 893881 0.59 899148 143 5381 891756 0.60 897137 144 5817 895784 0.65 901601 145 6157 896683 0.68 902840 146 6748 893141 0.75 899889 147 7926 896656 0.88 904582 148 8970 895108 0.99 904078 149 10062 888331 1.12 898393 150 11661 898418 1.28 910079 151 12148 891708 1.34 903856 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 41742 4534082 0.91 4575824 2 43034 3496979 1.22 3540013 3 25149 3407788 0.73 3432937 4 24841 3803905 0.65 3828746 5 26343 4109495 0.64 4135838 6 25814 4129827 0.62 4155641 7 25913 3936236 0.65 3962149 8 25591 4165579 0.61 4191170 9 23808 4145149 0.57 4168957 10 23475 4137611 0.56 4161086 11 22657 4203391 0.54 4226048 12 22697 4236572 0.53 4259269 13 22806 4214495 0.54 4237301 14 22705 4190738 0.54 4213443 15 21484 4173275 0.51 4194759 16 21125 4162380 0.50 4183505 17 21715 4194476 0.52 4216191 18 21754 4207569 0.51 4229323 19 21451 4200128 0.51 4221579 20 21295 4186864 0.51 4208159 21 20363 4182543 0.48 4202906 22 20893 4191642 0.50 4212535 23 21107 4178332 0.50 4199439 24 20651 4185575 0.49 4206226 25 21465 4189201 0.51 4210666 26 21597 4185753 0.51 4207350 27 20020 4210968 0.47 4230988 28 20089 4205005 0.48 4225094 29 21062 4208073 0.50 4229135 30 21195 4220868 0.50 4242063 31 21053 4219643 0.50 4240696 32 21026 4206530 0.50 4227556 33 20401 4206954 0.48 4227355 34 20568 4201869 0.49 4222437 35 20924 4196272 0.50 4217196 36 20359 4189428 0.48 4209787 37 20916 4201288 0.50 4222204 38 20995 4186126 0.50 4207121 39 20383 4201713 0.48 4222096 40 20587 4203162 0.49 4223749 41 20748 4200909 0.49 4221657 42 20825 4214750 0.49 4235575 43 21492 4199751 0.51 4221243 44 21046 4188403 0.50 4209449 45 20161 4205546 0.48 4225707 46 20281 4201978 0.48 4222259 47 20820 4192017 0.49 4212837 48 20808 4198801 0.49 4219609 49 20805 4197756 0.49 4218561 50 20920 4193728 0.50 4214648 51 20241 4202798 0.48 4223039 52 20377 4209936 0.48 4230313 53 20410 4190286 0.48 4210696 54 20832 4199410 0.49 4220242 55 21674 4200241 0.51 4221915 56 20468 4206559 0.48 4227027 57 20093 4207040 0.48 4227133 58 20673 4207324 0.49 4227997 59 21129 4198476 0.50 4219605 60 20858 4213038 0.49 4233896 61 20873 4212537 0.49 4233410 62 20934 4209163 0.49 4230097 63 20393 4210271 0.48 4230664 64 20359 4205769 0.48 4226128 65 20550 4200447 0.49 4220997 66 20499 4201549 0.49 4222048 67 20789 4200514 0.49 4221303 68 21486 4202321 0.51 4223807 69 20243 4211599 0.48 4231842 70 20491 4200891 0.49 4221382 71 20421 4194524 0.48 4214945 72 20908 4204568 0.49 4225476 73 20994 4201067 0.50 4222061 74 20809 4194986 0.49 4215795 75 19932 4191477 0.47 4211409 76 20330 4197149 0.48 4217479 77 20257 4193202 0.48 4213459 78 20513 4202849 0.49 4223362 79 20487 4207266 0.48 4227753 80 21041 4200844 0.50 4221885 81 20284 4209733 0.48 4230017 82 20030 4207380 0.47 4227410 83 20837 4198826 0.49 4219663 84 20883 4205352 0.49 4226235 85 20339 4200152 0.48 4220491 86 20549 4200022 0.49 4220571 87 19918 4206145 0.47 4226063 88 20481 4202867 0.48 4223348 89 20503 4193964 0.49 4214467 90 20200 4202799 0.48 4222999 91 20402 4193876 0.48 4214278 92 20783 4195100 0.49 4215883 93 19935 4195323 0.47 4215258 94 19659 4200639 0.47 4220298 95 20284 4195909 0.48 4216193 96 20529 4215617 0.48 4236146 97 20837 4215931 0.49 4236768 98 20854 4203872 0.49 4224726 99 19981 4206866 0.47 4226847 100 19986 4197206 0.47 4217192 101 20435 4193367 0.48 4213802 102 20186 4207461 0.48 4227647 103 20180 4206143 0.48 4226323 104 20516 4205919 0.49 4226435 105 19832 4212748 0.47 4232580 106 19777 4198545 0.47 4218322 107 20086 4193526 0.48 4213612 108 19985 4195069 0.47 4215054 109 20412 4188633 0.48 4209045 110 20365 4192610 0.48 4212975 111 19787 4190051 0.47 4209838 112 20180 4198135 0.48 4218315 113 20476 4195518 0.49 4215994 114 20234 4208312 0.48 4228546 115 20334 4209269 0.48 4229603 116 20903 4205443 0.49 4226346 117 20038 4203898 0.47 4223936 118 20239 4200706 0.48 4220945 119 20438 4196589 0.48 4217027 120 20422 4207923 0.48 4228345 121 21061 4201035 0.50 4222096 122 21085 4195924 0.50 4217009 123 20761 4214385 0.49 4235146 124 20805 4209637 0.49 4230442 125 21359 4207871 0.51 4229230 126 21295 4210429 0.50 4231724 127 21911 4195992 0.52 4217903 128 22244 4195611 0.53 4217855 129 21975 4196267 0.52 4218242 130 22433 4202188 0.53 4224621 131 22459 4193717 0.53 4216176 132 22994 4205794 0.54 4228788 133 23740 4201872 0.56 4225612 134 24518 4191559 0.58 4216077 135 23990 4193255 0.57 4217245 136 24817 4187402 0.59 4212219 137 25353 4180316 0.60 4205669 138 26285 4185779 0.62 4212064 139 27549 4185895 0.65 4213444 140 28156 4188829 0.67 4216985 141 28346 4189557 0.67 4217903 142 29377 4184507 0.70 4213884 143 30280 4184360 0.72 4214640 144 31607 4187576 0.75 4219183 145 33179 4181521 0.79 4214700 146 37086 4176635 0.88 4213721 147 39408 4189641 0.93 4229049 148 43931 4194397 1.04 4238328 149 46378 4189071 1.09 4235449 150 50250 4186465 1.19 4236715 151 53488 4167747 1.27 4221235 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1295060 204525 86.36 1499585 2 425642 66499 86.49 492141 3 336174 108183 75.65 444357 4 389652 197936 66.31 587588 5 280929 230685 54.91 511614 6 219600 247438 47.02 467038 7 171951 265994 39.26 437945 8 155465 341768 31.27 497233 9 141588 415660 25.41 557248 10 128354 459623 21.83 587977 11 116965 501256 18.92 618221 12 111067 515120 17.74 626187 13 106068 515371 17.07 621439 14 101834 516605 16.47 618439 15 97306 516908 15.84 614214 16 97092 517340 15.80 614432 17 97107 515297 15.86 612404 18 97222 514286 15.90 611508 19 96698 512813 15.86 609511 20 97214 511969 15.96 609183 21 97257 512843 15.94 610100 22 97061 511882 15.94 608943 23 96682 512423 15.87 609105 24 96534 509793 15.92 606327 25 96748 513779 15.85 610527 26 96536 513292 15.83 609828 27 96800 514173 15.84 610973 28 96687 512917 15.86 609604 29 96508 512446 15.85 608954 30 96056 511278 15.82 607334 31 96502 508424 15.95 604926 32 95288 507065 15.82 602353 33 95182 505055 15.86 600237 34 94044 503326 15.74 597370 35 93738 502251 15.73 595989 36 93722 500586 15.77 594308 37 92542 496879 15.70 589421 38 92813 495788 15.77 588601 39 91774 493168 15.69 584942 40 91527 491514 15.70 583041 41 91417 489552 15.74 580969 42 90726 486850 15.71 577576 43 89708 486077 15.58 575785 44 90075 483335 15.71 573410 45 88741 482040 15.55 570781 46 88720 480408 15.59 569128 47 87726 477173 15.53 564899 48 87035 475805 15.46 562840 49 86820 472765 15.52 559585 50 86505 470540 15.53 557045 51 85044 466950 15.41 551994 52 84454 466751 15.32 551205 53 84261 462375 15.41 546636 54 84110 462794 15.38 546904 55 83334 459383 15.35 542717 56 83121 457953 15.36 541074 57 82614 453762 15.40 536376 58 82735 450403 15.52 533138 59 81606 449289 15.37 530895 60 80530 445683 15.30 526213 61 80241 442258 15.36 522499 62 79387 441295 15.25 520682 63 79001 439217 15.24 518218 64 77931 435466 15.18 513397 65 77889 433256 15.24 511145 66 77089 429341 15.22 506430 67 75886 426881 15.09 502767 68 76289 423766 15.26 500055 69 75314 422823 15.12 498137 70 74518 418664 15.11 493182 71 74301 414818 15.19 489119 72 73347 411368 15.13 484715 73 72883 410338 15.08 483221 74 71858 408749 14.95 480607 75 71995 405376 15.08 477371 76 70835 402324 14.97 473159 77 70638 401687 14.96 472325 78 70743 398301 15.08 469044 79 70317 396342 15.07 466659 80 68932 392400 14.94 461332 81 68608 388775 15.00 457383 82 68002 384536 15.03 452538 83 67025 381699 14.94 448724 84 66644 378285 14.98 444929 85 65813 375261 14.92 441074 86 65683 373965 14.94 439648 87 64225 370798 14.76 435023 88 64170 366882 14.89 431052 89 63535 363609 14.87 427144 90 62840 360236 14.85 423076 91 62071 357155 14.81 419226 92 62014 355240 14.86 417254 93 61627 351861 14.90 413488 94 60681 349841 14.78 410522 95 59925 345955 14.76 405880 96 59567 341623 14.85 401190 97 58942 338831 14.82 397773 98 57803 336204 14.67 394007 99 57291 333081 14.68 390372 100 56713 328187 14.73 384900 101 56773 326378 14.82 383151 102 55340 323417 14.61 378757 103 54982 320679 14.64 375661 104 54355 316830 14.64 371185 105 53172 313719 14.49 366891 106 52707 310724 14.50 363431 107 52041 308298 14.44 360339 108 51283 304906 14.40 356189 109 50647 302518 14.34 353165 110 50274 298826 14.40 349100 111 49640 296716 14.33 346356 112 48909 292565 14.32 341474 113 48232 290124 14.25 338356 114 47757 288038 14.22 335795 115 47093 284354 14.21 331447 116 46524 281894 14.17 328418 117 46508 278814 14.30 325322 118 46263 277559 14.29 323822 119 45071 273235 14.16 318306 120 44642 271178 14.14 315820 121 43932 267949 14.09 311881 122 43794 265605 14.15 309399 123 43354 262371 14.18 305725 124 42823 259849 14.15 302672 125 41636 256406 13.97 298042 126 40936 253095 13.92 294031 127 40592 249706 13.98 290298 128 39979 247667 13.90 287646 129 39839 244671 14.00 284510 130 38975 242602 13.84 281577 131 38357 240468 13.76 278825 132 38229 238596 13.81 276825 133 37687 234804 13.83 272491 134 37261 232072 13.83 269333 135 36437 229975 13.68 266412 136 35608 226352 13.59 261960 137 35140 225001 13.51 260141 138 34708 221877 13.53 256585 139 34519 218411 13.65 252930 140 34513 214805 13.84 249318 141 34106 213029 13.80 247135 142 33286 211242 13.61 244528 143 32713 207599 13.61 240312 144 31929 205226 13.46 237155 145 31566 203656 13.42 235222 146 31246 200652 13.47 231898 147 31163 198029 13.60 229192 148 30273 196319 13.36 226592 149 29796 194089 13.31 223885 150 29790 191891 13.44 221681 151 28869 188037 13.31 216906 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1651164 260104 86.39 1911268 2 1554572 269743 85.21 1824315 3 406438 121404 77.00 527842 4 410215 207185 66.44 617400 5 389740 332936 53.93 722676 6 268892 329808 44.91 598700 7 213463 358635 37.31 572098 8 150844 547483 21.60 698327 9 113500 675926 14.38 789426 10 79693 791082 9.15 870775 11 56127 867667 6.08 923794 12 37323 893928 4.01 931251 13 25454 890262 2.78 915716 14 16718 884011 1.86 900729 15 11462 879010 1.29 890472 16 8395 870767 0.95 879162 17 6946 868915 0.79 875861 18 5882 863240 0.68 869122 19 5402 861946 0.62 867348 20 4996 858835 0.58 863831 21 4978 857761 0.58 862739 22 4881 854009 0.57 858890 23 4573 853354 0.53 857927 24 4478 851989 0.52 856467 25 4350 853009 0.51 857359 26 4333 854082 0.50 858415 27 4260 852592 0.50 856852 28 4183 851507 0.49 855690 29 4139 853455 0.48 857594 30 4075 853162 0.48 857237 31 4119 849455 0.48 853574 32 3947 848947 0.46 852894 33 3975 844198 0.47 848173 34 3904 839364 0.46 843268 35 3878 839078 0.46 842956 36 3801 836025 0.45 839826 37 3876 834486 0.46 838362 38 3802 829891 0.46 833693 39 3707 828270 0.45 831977 40 3597 825121 0.43 828718 41 3714 821052 0.45 824766 42 3792 815770 0.46 819562 43 3676 811853 0.45 815529 44 3767 811448 0.46 815215 45 3638 808872 0.45 812510 46 3629 804132 0.45 807761 47 3548 801543 0.44 805091 48 3638 797240 0.45 800878 49 3413 794971 0.43 798384 50 3583 790681 0.45 794264 51 3611 787155 0.46 790766 52 3463 783564 0.44 787027 53 3532 781110 0.45 784642 54 3486 775673 0.45 779159 55 3454 773082 0.44 776536 56 3437 769470 0.44 772907 57 3341 767126 0.43 770467 58 3411 762215 0.45 765626 59 3388 754685 0.45 758073 60 3361 754164 0.44 757525 61 3343 748909 0.44 752252 62 3289 744202 0.44 747491 63 3335 737946 0.45 741281 64 3320 733425 0.45 736745 65 3206 729691 0.44 732897 66 3333 723557 0.46 726890 67 3239 718187 0.45 721426 68 3173 713089 0.44 716262 69 3093 709542 0.43 712635 70 3115 704471 0.44 707586 71 3166 699891 0.45 703057 72 2978 695102 0.43 698080 73 3103 691332 0.45 694435 74 3096 686982 0.45 690078 75 3077 681867 0.45 684944 76 3017 678358 0.44 681375 77 3036 673552 0.45 676588 78 2924 670606 0.43 673530 79 3035 664062 0.45 667097 80 2911 659453 0.44 662364 81 2886 653757 0.44 656643 82 2817 648845 0.43 651662 83 2732 643395 0.42 646127 84 2838 636232 0.44 639070 85 2835 631510 0.45 634345 86 2816 625439 0.45 628255 87 2804 620904 0.45 623708 88 2814 617169 0.45 619983 89 2549 610735 0.42 613284 90 2662 606841 0.44 609503 91 2652 601461 0.44 604113 92 2680 597153 0.45 599833 93 2539 591568 0.43 594107 94 2599 585697 0.44 588296 95 2482 582096 0.42 584578 96 2428 575502 0.42 577930 97 2540 570535 0.44 573075 98 2463 566278 0.43 568741 99 2517 559664 0.45 562181 100 2372 554677 0.43 557049 101 2395 550432 0.43 552827 102 2376 545175 0.43 547551 103 2244 539504 0.41 541748 104 2304 535087 0.43 537391 105 2331 529609 0.44 531940 106 2279 522435 0.43 524714 107 2267 517746 0.44 520013 108 2185 515700 0.42 517885 109 2152 508110 0.42 510262 110 2164 504016 0.43 506180 111 2178 499163 0.43 501341 112 2191 493027 0.44 495218 113 2028 487993 0.41 490021 114 2077 481174 0.43 483251 115 2126 476948 0.44 479074 116 1971 471430 0.42 473401 117 2061 467835 0.44 469896 118 2053 462284 0.44 464337 119 2030 457741 0.44 459771 120 2005 453070 0.44 455075 121 1950 448421 0.43 450371 122 1945 443865 0.44 445810 123 1907 439126 0.43 441033 124 1884 432383 0.43 434267 125 1944 428306 0.45 430250 126 1833 421552 0.43 423385 127 1853 417162 0.44 419015 128 1820 412530 0.44 414350 129 1827 408000 0.45 409827 130 1759 403709 0.43 405468 131 1690 399025 0.42 400715 132 1728 394718 0.44 396446 133 1743 390844 0.44 392587 134 1683 384432 0.44 386115 135 1656 381752 0.43 383408 136 1741 376952 0.46 378693 137 1638 371105 0.44 372743 138 1576 366822 0.43 368398 139 1579 362219 0.43 363798 140 1561 358236 0.43 359797 141 1540 353596 0.43 355136 142 1515 348688 0.43 350203 143 1556 343352 0.45 344908 144 1509 339676 0.44 341185 145 1523 335745 0.45 337268 146 1452 331132 0.44 332584 147 1511 327773 0.46 329284 148 1433 324433 0.44 325866 149 1467 318803 0.46 320270 150 1506 315513 0.48 317019 151 1490 310328 0.48 311818 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 5481622 859050 86.45 6340672 2 4691296 785884 85.65 5477180 3 4082142 1428527 74.08 5510669 4 3464757 1860402 65.06 5325159 5 2525906 2214938 53.28 4740844 6 1937139 2359219 45.09 4296358 7 1441121 2311416 38.40 3752537 8 1067880 2443181 30.41 3511061 9 768328 2688176 22.23 3456504 10 536978 2940583 15.44 3477561 11 359437 3294558 9.84 3653995 12 238467 3519625 6.35 3758092 13 154305 3662508 4.04 3816813 14 100269 3785265 2.58 3885534 15 66831 3890569 1.69 3957400 16 47648 3962562 1.19 4010210 17 37012 4014686 0.91 4051698 18 30827 4043716 0.76 4074543 19 27055 4060358 0.66 4087413 20 25466 4066776 0.62 4092242 21 24404 4065343 0.60 4089747 22 23857 4057403 0.58 4081260 23 23539 4052982 0.58 4076521 24 23258 4032918 0.57 4056176 25 23072 4020740 0.57 4043812 26 22136 4009095 0.55 4031231 27 21778 3997060 0.54 4018838 28 21245 3985365 0.53 4006610 29 20429 3978927 0.51 3999356 30 20351 3969607 0.51 3989958 31 19636 3962116 0.49 3981752 32 19446 3954552 0.49 3973998 33 19178 3940908 0.48 3960086 34 18785 3924710 0.48 3943495 35 18373 3916245 0.47 3934618 36 18376 3904448 0.47 3922824 37 18334 3888715 0.47 3907049 38 18229 3877279 0.47 3895508 39 17839 3868018 0.46 3885857 40 17769 3852097 0.46 3869866 41 17420 3837226 0.45 3854646 42 17728 3826142 0.46 3843870 43 17693 3810978 0.46 3828671 44 17655 3797454 0.46 3815109 45 17478 3787241 0.46 3804719 46 17545 3772158 0.46 3789703 47 17298 3754572 0.46 3771870 48 16910 3736856 0.45 3753766 49 16931 3719867 0.45 3736798 50 17014 3701484 0.46 3718498 51 16730 3686104 0.45 3702834 52 16507 3666789 0.45 3683296 53 16471 3646939 0.45 3663410 54 16689 3632400 0.46 3649089 55 16456 3609218 0.45 3625674 56 16175 3589643 0.45 3605818 57 16171 3567524 0.45 3583695 58 16325 3544887 0.46 3561212 59 16018 3523510 0.45 3539528 60 15740 3504756 0.45 3520496 61 16012 3487986 0.46 3503998 62 15568 3469757 0.45 3485325 63 15595 3445934 0.45 3461529 64 15401 3425249 0.45 3440650 65 15473 3407359 0.45 3422832 66 15197 3386032 0.45 3401229 67 15019 3365975 0.44 3380994 68 15062 3341697 0.45 3356759 69 15185 3318983 0.46 3334168 70 14924 3293779 0.45 3308703 71 14722 3277953 0.45 3292675 72 14673 3255290 0.45 3269963 73 14456 3230801 0.45 3245257 74 14176 3213888 0.44 3228064 75 14141 3194239 0.44 3208380 76 14140 3170488 0.44 3184628 77 14232 3143016 0.45 3157248 78 14054 3120443 0.45 3134497 79 13887 3099698 0.45 3113585 80 14005 3069599 0.45 3083604 81 13530 3047067 0.44 3060597 82 13459 3024378 0.44 3037837 83 13356 3001463 0.44 3014819 84 13279 2976719 0.44 2989998 85 13414 2951694 0.45 2965108 86 13013 2928037 0.44 2941050 87 13243 2904834 0.45 2918077 88 12797 2881604 0.44 2894401 89 12699 2857055 0.44 2869754 90 12641 2835521 0.44 2848162 91 12761 2811475 0.45 2824236 92 12566 2787089 0.45 2799655 93 12153 2762560 0.44 2774713 94 12318 2740892 0.45 2753210 95 12021 2714864 0.44 2726885 96 11926 2693460 0.44 2705386 97 12245 2665728 0.46 2677973 98 11803 2645952 0.44 2657755 99 11885 2618086 0.45 2629971 100 11694 2594710 0.45 2606404 101 11419 2571570 0.44 2582989 102 11210 2550672 0.44 2561882 103 11209 2525081 0.44 2536290 104 11019 2499716 0.44 2510735 105 11085 2476798 0.45 2487883 106 10938 2452917 0.44 2463855 107 10598 2429901 0.43 2440499 108 10801 2408210 0.45 2419011 109 10536 2383078 0.44 2393614 110 10373 2359963 0.44 2370336 111 10223 2336157 0.44 2346380 112 10326 2314012 0.44 2324338 113 10170 2289393 0.44 2299563 114 9737 2267171 0.43 2276908 115 10101 2242446 0.45 2252547 116 9734 2218819 0.44 2228553 117 9819 2197180 0.44 2206999 118 9640 2175684 0.44 2185324 119 9726 2152409 0.45 2162135 120 9447 2129624 0.44 2139071 121 9289 2109972 0.44 2119261 122 9363 2085775 0.45 2095138 123 9135 2061657 0.44 2070792 124 9148 2038007 0.45 2047155 125 8962 2013230 0.44 2022192 126 8853 1994065 0.44 2002918 127 8754 1969748 0.44 1978502 128 8568 1946471 0.44 1955039 129 8633 1922290 0.45 1930923 130 8597 1902999 0.45 1911596 131 8311 1879882 0.44 1888193 132 8287 1857459 0.44 1865746 133 7972 1835806 0.43 1843778 134 8070 1813107 0.44 1821177 135 8031 1794251 0.45 1802282 136 7834 1772595 0.44 1780429 137 7654 1751744 0.44 1759398 138 7681 1730158 0.44 1737839 139 7636 1710371 0.44 1718007 140 7517 1688690 0.44 1696207 141 7570 1666393 0.45 1673963 142 7482 1645120 0.45 1652602 143 7248 1624870 0.44 1632118 144 7242 1605802 0.45 1613044 145 7089 1584156 0.45 1591245 146 6924 1562788 0.44 1569712 147 6920 1544000 0.45 1550920 148 6878 1523437 0.45 1530315 149 6957 1506515 0.46 1513472 150 6814 1491896 0.45 1498710 151 7007 1468437 0.47 1475444