[2021-02-21 15:12:37,343] multiqc [DEBUG ] No MultiQC config found: /Users/Shared/Apps/anaconda/lib/python3.5/site-packages/multiqc-1.0.dev0-py3.5.egg/multiqc_config.yaml [2021-02-21 15:12:37,343] multiqc [DEBUG ] No MultiQC config found: /Users/yaamini/.multiqc_config.yaml [2021-02-21 15:12:37,344] multiqc [DEBUG ] No MultiQC config found: multiqc_config.yaml [2021-02-21 15:12:37,345] multiqc [DEBUG ] Command used: /Users/Shared/Apps/anaconda/bin/multiqc CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt bismark_summary_report.html bismark_summary_report.txt slurm-1127197.out slurm-1127204.out zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt [2021-02-21 15:12:38,735] multiqc [WARNING] MultiQC Version v1.9 now available! [2021-02-21 15:12:38,736] multiqc [INFO ] This is MultiQC v1.0.dev0 [2021-02-21 15:12:38,736] multiqc [DEBUG ] Command : /Users/Shared/Apps/anaconda/bin/multiqc CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt bismark_summary_report.html bismark_summary_report.txt slurm-1127197.out slurm-1127204.out zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt [2021-02-21 15:12:38,736] multiqc [DEBUG ] Working dir : /Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark [2021-02-21 15:12:38,736] multiqc [INFO ] Template : default [2021-02-21 15:12:38,738] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,739] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,739] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,739] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,739] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,739] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,739] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,739] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,739] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,739] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,740] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,740] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,740] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,740] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,740] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,740] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,740] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,740] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,740] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,741] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,741] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,741] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,741] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,741] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,741] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,741] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,741] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,742] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,742] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,742] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,742] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,742] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,742] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,742] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,742] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,742] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,743] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,744] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,744] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,744] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,744] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,744] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,744] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,744] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,744] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,744] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,745] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,746] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,747] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'bismark_summary_report.html' [2021-02-21 15:12:38,748] multiqc [INFO ] Searching 'bismark_summary_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'slurm-1127197.out' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'slurm-1127204.out' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-02-21 15:12:38,749] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-02-21 15:12:38,750] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-02-21 15:12:38,751] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-02-21 15:12:38,752] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,753] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-02-21 15:12:38,754] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-02-21 15:12:38,755] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-02-21 15:12:38,756] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-02-21 15:12:38,757] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [DEBUG ] Analysing modules: custom_content, peddy, methylQA, qualimap, preseq, quast, rseqc, busco, goleft_indexcov, snpeff, gatk, htseq, bcftools, featureCounts, picard, prokka, samblaster, samtools, bamtools, bismark, hicup, salmon, kallisto, slamdunk, star, tophat, bowtie2, bowtie1, cutadapt, trimmomatic, skewer, fastq_screen, fastqc, clusterflow [2021-02-21 15:12:38,758] multiqc [DEBUG ] Using temporary directory for creating report: /var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmph2jv_96q [2021-02-21 15:12:38,821] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,822] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,822] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,822] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,822] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,822] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,823] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,823] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,823] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,823] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,823] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,823] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,824] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,824] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,824] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,824] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,824] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,824] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,825] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,825] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,825] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,825] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,825] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,825] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,826] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,826] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,826] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,826] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,826] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,826] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,826] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,826] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,827] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,827] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,827] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,827] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,827] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,828] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,828] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,828] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,828] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,828] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,828] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,828] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,829] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,829] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,829] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,829] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,829] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,829] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,829] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,830] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,830] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,830] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,830] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,830] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,830] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,830] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,831] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,831] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,831] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,831] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,831] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,832] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,832] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,832] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,832] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,832] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,832] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,833] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,833] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,833] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,833] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,833] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,833] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,833] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,834] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,834] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,834] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,834] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,834] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,834] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,835] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,835] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,835] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,835] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,835] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,835] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,835] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,836] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,836] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,836] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,836] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,836] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,836] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,836] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-02-21 15:12:38,837] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: slurm-1127204.out [2021-02-21 15:12:38,837] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-02-21 15:12:38,837] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-02-21 15:12:38,837] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-02-21 15:12:38,837] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-02-21 15:12:38,838] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-02-21 15:12:38,838] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-02-21 15:12:38,838] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-02-21 15:12:38,838] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-02-21 15:12:38,839] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-02-21 15:12:38,839] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-02-21 15:12:38,839] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-02-21 15:12:38,839] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-02-21 15:12:38,839] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-02-21 15:12:38,839] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-02-21 15:12:38,840] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-02-21 15:12:38,840] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-02-21 15:12:38,840] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-02-21 15:12:38,840] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-02-21 15:12:38,841] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-02-21 15:12:38,841] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-02-21 15:12:38,841] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-02-21 15:12:38,841] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-02-21 15:12:38,841] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-02-21 15:12:38,841] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-02-21 15:12:38,842] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-02-21 15:12:38,842] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-02-21 15:12:38,842] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-02-21 15:12:38,842] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-02-21 15:12:38,842] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-02-21 15:12:38,842] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-02-21 15:12:38,843] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-02-21 15:12:38,843] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-02-21 15:12:38,843] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-02-21 15:12:38,843] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-02-21 15:12:38,844] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-02-21 15:12:38,844] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-02-21 15:12:38,844] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-02-21 15:12:38,844] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-02-21 15:12:38,844] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-02-21 15:12:38,844] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-02-21 15:12:38,845] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-02-21 15:12:38,845] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-02-21 15:12:38,845] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-02-21 15:12:38,845] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-02-21 15:12:38,845] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-02-21 15:12:38,846] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-02-21 15:12:38,846] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-02-21 15:12:38,846] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-02-21 15:12:38,846] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-02-21 15:12:38,846] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-02-21 15:12:38,847] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-02-21 15:12:38,847] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-02-21 15:12:38,847] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-02-21 15:12:38,847] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-02-21 15:12:38,847] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-02-21 15:12:38,847] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-02-21 15:12:38,848] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-02-21 15:12:38,848] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-02-21 15:12:38,848] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-02-21 15:12:38,848] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-02-21 15:12:38,848] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-02-21 15:12:38,849] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-02-21 15:12:38,849] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-02-21 15:12:38,849] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-02-21 15:12:40,191] multiqc.modules.custom_content.custom_content [DEBUG ] No custom content found [2021-02-21 15:12:40,215] multiqc.modules.peddy.peddy [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:40,223] multiqc.modules.methylQA.methylQA [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:40,227] multiqc.modules.qualimap.QM_BamQC [DEBUG ] Using default Qualimap thresholds: 1, 5, 10, 30, 50 [2021-02-21 15:12:40,261] multiqc.modules.qualimap.qualimap [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:41,517] multiqc.modules.preseq.preseq [DEBUG ] Could not find any preseq data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:41,526] multiqc.modules.quast.quast [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:43,797] multiqc.modules.rseqc.rseqc [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:43,806] multiqc.modules.busco.busco [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:43,834] multiqc.modules.goleft_indexcov.goleft_indexcov [DEBUG ] Did not find goleft indexcov outputs in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:44,394] multiqc.modules.snpeff.snpeff [DEBUG ] Could not find any data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:44,957] multiqc.modules.gatk.gatk [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:45,512] multiqc.modules.htseq.htseq [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:46,131] multiqc.modules.bcftools.bcftools [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:46,140] multiqc.modules.featureCounts.feature_counts [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:51,669] multiqc.modules.picard.picard [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:51,873] multiqc.modules.prokka.prokka [DEBUG ] Could not find any Prokka data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:52,489] multiqc.modules.samblaster.samblaster [DEBUG ] Could not find any data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:54,174] multiqc.modules.samtools.samtools [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:54,772] multiqc.modules.bamtools.bamtools [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:54,924] multiqc.modules.bismark.bismark [INFO ] Found 8 bismark alignment reports [2021-02-21 15:12:54,926] multiqc.modules.bismark.bismark [INFO ] Found 8 bismark dedup reports [2021-02-21 15:12:54,927] multiqc.modules.bismark.bismark [INFO ] Found 8 bismark methextract reports [2021-02-21 15:12:54,950] multiqc.modules.hicup.hicup [DEBUG ] Could not find any HiCUP data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:54,963] multiqc.modules.salmon.salmon [DEBUG ] Could not find any Salmon data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:55,525] multiqc.modules.kallisto.kallisto [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:58,923] multiqc.modules.slamdunk.slamdunk [DEBUG ] No slamdunk reports found. [2021-02-21 15:12:58,936] multiqc.modules.star.star [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:58,944] multiqc.modules.tophat.tophat [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:12:59,498] multiqc.modules.bowtie2.bowtie2 [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:13:00,051] multiqc.modules.bowtie1.bowtie1 [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:13:00,608] multiqc.modules.cutadapt.cutadapt [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:13:01,165] multiqc.modules.trimmomatic.trimmomatic [DEBUG ] Could not find any Trimmomatic data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:13:01,715] multiqc.modules.skewer.skewer [DEBUG ] Could not find any data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:13:01,723] multiqc.modules.fastq_screen.fastq_screen [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:13:01,737] multiqc.modules.fastqc.fastqc [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:13:01,751] multiqc.modules.clusterflow.clusterflow [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1127197.out', 'slurm-1127204.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-02-21 15:13:01,753] multiqc [INFO ] Report : multiqc_report.html [2021-02-21 15:13:01,768] multiqc [INFO ] Data : multiqc_data [2021-02-21 15:13:01,769] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmph2jv_96q/multiqc_data/multiqc_bismark_alignment.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark/multiqc_data' [2021-02-21 15:13:01,834] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmph2jv_96q/multiqc_data/multiqc_bismark_dedup.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark/multiqc_data' [2021-02-21 15:13:01,843] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmph2jv_96q/multiqc_data/multiqc_bismark_methextract.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark/multiqc_data' [2021-02-21 15:13:01,852] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmph2jv_96q/multiqc_data/multiqc_general_stats.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark/multiqc_data' [2021-02-21 15:13:01,860] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmph2jv_96q/multiqc_data/multiqc_sources.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark/multiqc_data' [2021-02-21 15:13:02,081] multiqc [INFO ] MultiQC complete