[2021-03-30 08:33:18,109] multiqc [DEBUG ] No MultiQC config found: /Users/Shared/Apps/anaconda/lib/python3.5/site-packages/multiqc-1.0.dev0-py3.5.egg/multiqc_config.yaml [2021-03-30 08:33:18,109] multiqc [DEBUG ] No MultiQC config found: /Users/yaamini/.multiqc_config.yaml [2021-03-30 08:33:18,111] multiqc [DEBUG ] No MultiQC config found: multiqc_config.yaml [2021-03-30 08:33:18,111] multiqc [DEBUG ] Command used: /Users/Shared/Apps/anaconda/bin/multiqc CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt bismark_summary_report.html bismark_summary_report.txt slurm-1614378.out slurm-1725011.out slurm-1725072.out zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt [2021-03-30 08:33:19,435] multiqc [WARNING] MultiQC Version v1.10 now available! [2021-03-30 08:33:19,435] multiqc [INFO ] This is MultiQC v1.0.dev0 [2021-03-30 08:33:19,436] multiqc [DEBUG ] Command : /Users/Shared/Apps/anaconda/bin/multiqc CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt bismark_summary_report.html bismark_summary_report.txt slurm-1614378.out slurm-1725011.out slurm-1725072.out zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt [2021-03-30 08:33:19,436] multiqc [DEBUG ] Working dir : /Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark-roslin [2021-03-30 08:33:19,436] multiqc [INFO ] Template : default [2021-03-30 08:33:19,438] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,438] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,438] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,438] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,439] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,439] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,439] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,439] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,439] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,439] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,439] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,439] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,439] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,440] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,440] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,440] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,440] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,440] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,440] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,440] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,441] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,442] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,443] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,444] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,445] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,446] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,447] multiqc [INFO ] Searching 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'bismark_summary_report.html' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'bismark_summary_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'slurm-1614378.out' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'slurm-1725011.out' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'slurm-1725072.out' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-03-30 08:33:19,448] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,449] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-03-30 08:33:19,450] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-03-30 08:33:19,451] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-03-30 08:33:19,452] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-03-30 08:33:19,453] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-03-30 08:33:19,454] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,455] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-03-30 08:33:19,456] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz' [2021-03-30 08:33:19,457] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam' [2021-03-30 08:33:19,458] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai' [2021-03-30 08:33:19,458] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,458] multiqc [INFO ] Searching 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt' [2021-03-30 08:33:19,458] multiqc [DEBUG ] Analysing modules: custom_content, peddy, methylQA, qualimap, preseq, quast, rseqc, busco, goleft_indexcov, snpeff, gatk, htseq, bcftools, featureCounts, picard, prokka, samblaster, samtools, bamtools, bismark, hicup, salmon, kallisto, slamdunk, star, tophat, bowtie2, bowtie1, cutadapt, trimmomatic, skewer, fastq_screen, fastqc, clusterflow [2021-03-30 08:33:19,458] multiqc [DEBUG ] Using temporary directory for creating report: /var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmp442vhw2k [2021-03-30 08:33:19,573] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,574] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,574] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,574] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,575] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,575] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,575] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,575] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,576] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,576] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,576] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,576] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,577] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,577] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,577] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,577] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,578] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,578] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,578] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,578] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,578] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,579] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,579] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,579] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,579] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,579] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,580] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,580] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,580] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,580] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,580] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,580] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,581] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,581] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,581] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,581] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,581] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,581] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,582] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,582] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,582] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,582] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,582] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,582] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,583] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,583] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,583] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,583] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,583] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,583] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,584] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,584] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,584] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,584] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,584] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,584] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,585] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,585] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,585] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,585] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,585] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,585] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,586] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,586] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,586] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,586] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,586] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,586] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,587] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,587] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,587] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,587] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,587] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,587] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,588] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,588] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,588] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,588] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,588] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,588] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,588] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,589] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,589] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,589] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,589] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,589] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,589] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,589] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,590] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,590] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,590] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,590] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,590] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,590] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,590] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,591] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt [2021-03-30 08:33:19,591] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-03-30 08:33:19,591] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-03-30 08:33:19,592] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-03-30 08:33:19,592] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-03-30 08:33:19,592] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-03-30 08:33:19,592] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-03-30 08:33:19,593] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-03-30 08:33:19,593] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-03-30 08:33:19,593] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-03-30 08:33:19,593] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-03-30 08:33:19,594] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-03-30 08:33:19,594] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-03-30 08:33:19,594] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-03-30 08:33:19,594] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-03-30 08:33:19,595] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-03-30 08:33:19,595] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-03-30 08:33:19,596] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-03-30 08:33:19,596] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-03-30 08:33:19,596] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-03-30 08:33:19,596] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-03-30 08:33:19,597] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-03-30 08:33:19,597] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-03-30 08:33:19,597] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-03-30 08:33:19,597] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-03-30 08:33:19,598] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-03-30 08:33:19,598] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-03-30 08:33:19,599] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-03-30 08:33:19,599] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-03-30 08:33:19,599] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-03-30 08:33:19,599] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-03-30 08:33:19,599] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-03-30 08:33:19,599] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-03-30 08:33:19,600] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-03-30 08:33:19,600] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-03-30 08:33:19,600] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-03-30 08:33:19,600] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-03-30 08:33:19,601] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-03-30 08:33:19,601] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-03-30 08:33:19,601] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-03-30 08:33:19,601] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-03-30 08:33:19,601] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-03-30 08:33:19,602] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-03-30 08:33:19,602] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-03-30 08:33:19,602] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-03-30 08:33:19,602] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-03-30 08:33:19,602] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-03-30 08:33:19,602] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-03-30 08:33:19,603] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-03-30 08:33:19,606] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-03-30 08:33:19,607] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-03-30 08:33:19,607] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-03-30 08:33:19,607] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-03-30 08:33:19,607] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-03-30 08:33:19,607] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-03-30 08:33:19,608] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-03-30 08:33:19,609] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-03-30 08:33:19,614] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov [2021-03-30 08:33:19,614] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt [2021-03-30 08:33:19,614] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as too large: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph [2021-03-30 08:33:19,614] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam [2021-03-30 08:33:19,615] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam [2021-03-30 08:33:19,616] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz [2021-03-30 08:33:19,616] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as is encoded: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz [2021-03-30 08:33:19,616] multiqc [DEBUG ] Ignoring file as matched an ignore pattern: zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam [2021-03-30 08:33:22,611] multiqc.modules.custom_content.custom_content [DEBUG ] No custom content found [2021-03-30 08:33:22,654] multiqc.modules.peddy.peddy [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:22,674] multiqc.modules.methylQA.methylQA [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:22,679] multiqc.modules.qualimap.QM_BamQC [DEBUG ] Using default Qualimap thresholds: 1, 5, 10, 30, 50 [2021-03-30 08:33:22,713] multiqc.modules.qualimap.qualimap [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:23,546] multiqc.modules.preseq.preseq [DEBUG ] Could not find any preseq data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:23,598] multiqc.modules.quast.quast [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:26,181] multiqc.modules.rseqc.rseqc [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:26,226] multiqc.modules.busco.busco [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:26,241] multiqc.modules.goleft_indexcov.goleft_indexcov [DEBUG ] Did not find goleft indexcov outputs in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:26,867] multiqc.modules.snpeff.snpeff [DEBUG ] Could not find any data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:27,500] multiqc.modules.gatk.gatk [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:28,129] multiqc.modules.htseq.htseq [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:28,809] multiqc.modules.bcftools.bcftools [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:28,818] multiqc.modules.featureCounts.feature_counts [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:35,009] multiqc.modules.picard.picard [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:35,154] multiqc.modules.prokka.prokka [DEBUG ] Could not find any Prokka data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:35,801] multiqc.modules.samblaster.samblaster [DEBUG ] Could not find any data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:37,667] multiqc.modules.samtools.samtools [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:38,289] multiqc.modules.bamtools.bamtools [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:38,437] multiqc.modules.bismark.bismark [INFO ] Found 8 bismark alignment reports [2021-03-30 08:33:38,488] multiqc.modules.bismark.bismark [INFO ] Found 8 bismark dedup reports [2021-03-30 08:33:38,489] multiqc.modules.bismark.bismark [INFO ] Found 8 bismark methextract reports [2021-03-30 08:33:38,513] multiqc.modules.hicup.hicup [DEBUG ] Could not find any HiCUP data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:38,527] multiqc.modules.salmon.salmon [DEBUG ] Could not find any Salmon data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:39,170] multiqc.modules.kallisto.kallisto [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:42,904] multiqc.modules.slamdunk.slamdunk [DEBUG ] No slamdunk reports found. [2021-03-30 08:33:42,918] multiqc.modules.star.star [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:42,927] multiqc.modules.tophat.tophat [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:43,006] multiqc.modules.bowtie2.bowtie2 [DEBUG ] Skipping "slurm-1614378.out" as looks like a bismark log file (contains word "bisulfite") [2021-03-30 08:33:43,051] multiqc.modules.bowtie2.bowtie2 [DEBUG ] Skipping "slurm-1725072.out" as looks like a bismark log file (contains word "bisulfite") [2021-03-30 08:33:43,554] multiqc.modules.bowtie2.bowtie2 [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:44,172] multiqc.modules.bowtie1.bowtie1 [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:44,798] multiqc.modules.cutadapt.cutadapt [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:45,425] multiqc.modules.trimmomatic.trimmomatic [DEBUG ] Could not find any Trimmomatic data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:46,044] multiqc.modules.skewer.skewer [DEBUG ] Could not find any data in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:46,053] multiqc.modules.fastq_screen.fastq_screen [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:46,067] multiqc.modules.fastqc.fastqc [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:46,082] multiqc.modules.clusterflow.clusterflow [DEBUG ] Could not find any reports in ('CHG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CHH_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_CTOT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OB_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'CpG_OT_zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.txt', 'bismark_summary_report.html', 'bismark_summary_report.txt', 'slurm-1614378.out', 'slurm-1725011.out', 'slurm-1725072.out', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_1_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_2_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_3_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_4_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_5_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_6_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_7_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.html', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_PE_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.merged_CpG_evidence.cov', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe..CpG_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe._5x.bedgraph', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.M-bias.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bedGraph.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.bismark.cov.gz', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated.sorted.bam.bai', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplicated_splitting_report.txt', 'zr3616_8_R1_val_1_val_1_val_1_bismark_bt2_pe.deduplication_report.txt') [2021-03-30 08:33:46,084] multiqc [INFO ] Report : multiqc_report.html [2021-03-30 08:33:46,087] multiqc [INFO ] Data : multiqc_data [2021-03-30 08:33:46,087] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmp442vhw2k/multiqc_data/multiqc_bismark_alignment.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark-roslin/multiqc_data' [2021-03-30 08:33:46,100] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmp442vhw2k/multiqc_data/multiqc_bismark_dedup.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark-roslin/multiqc_data' [2021-03-30 08:33:46,108] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmp442vhw2k/multiqc_data/multiqc_bismark_methextract.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark-roslin/multiqc_data' [2021-03-30 08:33:46,117] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmp442vhw2k/multiqc_data/multiqc_general_stats.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark-roslin/multiqc_data' [2021-03-30 08:33:46,126] multiqc [DEBUG ] Moving data file from '/var/folders/m7/jdh7hbrn2c90384jzrhjbv0h0000gz/T/tmp442vhw2k/multiqc_data/multiqc_sources.txt' to '/Volumes/web/spartina/project-gigas-oa-meth/output/bismark-roslin/multiqc_data' [2021-03-30 08:33:46,460] multiqc [INFO ] MultiQC complete