CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 114 37 75.50 151 2 121 37 76.58 158 3 129 33 79.63 162 4 110 39 73.83 149 5 114 33 77.55 147 6 112 31 78.32 143 7 101 46 68.71 147 8 103 30 77.44 133 9 109 30 78.42 139 10 111 41 73.03 152 11 118 39 75.16 157 12 110 37 74.83 147 13 107 31 77.54 138 14 105 34 75.54 139 15 120 31 79.47 151 16 122 50 70.93 172 17 110 33 76.92 143 18 116 32 78.38 148 19 126 36 77.78 162 20 110 37 74.83 147 21 131 38 77.51 169 22 130 33 79.75 163 23 117 35 76.97 152 24 116 31 78.91 147 25 104 49 67.97 153 26 118 32 78.67 150 27 117 25 82.39 142 28 106 38 73.61 144 29 111 26 81.02 137 30 139 34 80.35 173 31 119 31 79.33 150 32 101 41 71.13 142 33 134 19 87.58 153 34 130 24 84.42 154 35 102 34 75.00 136 36 125 29 81.17 154 37 112 38 74.67 150 38 109 35 75.69 144 39 143 31 82.18 174 40 145 32 81.92 177 41 110 15 88.00 125 42 104 35 74.82 139 43 123 31 79.87 154 44 104 29 78.20 133 45 98 29 77.17 127 46 126 29 81.29 155 47 118 30 79.73 148 48 111 28 79.86 139 49 115 23 83.33 138 50 117 26 81.82 143 51 94 21 81.74 115 52 97 21 82.20 118 53 103 26 79.84 129 54 105 28 78.95 133 55 102 26 79.69 128 56 102 38 72.86 140 57 89 25 78.07 114 58 95 24 79.83 119 59 85 29 74.56 114 60 89 33 72.95 122 61 88 24 78.57 112 62 95 37 71.97 132 63 91 16 85.05 107 64 101 23 81.45 124 65 78 32 70.91 110 66 85 24 77.98 109 67 75 26 74.26 101 68 65 30 68.42 95 69 82 14 85.42 96 70 63 31 67.02 94 71 94 30 75.81 124 72 68 17 80.00 85 73 77 20 79.38 97 74 75 19 79.79 94 75 71 28 71.72 99 76 78 17 82.11 95 77 67 24 73.63 91 78 52 23 69.33 75 79 46 11 80.70 57 80 20 6 76.92 26 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 17 211 7.46 228 2 9 221 3.91 230 3 6 198 2.94 204 4 12 217 5.24 229 5 7 197 3.43 204 6 12 214 5.31 226 7 10 233 4.12 243 8 11 183 5.67 194 9 5 225 2.17 230 10 7 200 3.38 207 11 8 216 3.57 224 12 5 220 2.22 225 13 8 227 3.40 235 14 6 219 2.67 225 15 6 227 2.58 233 16 4 216 1.82 220 17 11 229 4.58 240 18 7 216 3.14 223 19 2 217 0.91 219 20 4 219 1.79 223 21 7 238 2.86 245 22 5 227 2.16 232 23 3 213 1.39 216 24 3 234 1.27 237 25 8 213 3.62 221 26 10 228 4.20 238 27 4 239 1.65 243 28 6 218 2.68 224 29 12 231 4.94 243 30 6 200 2.91 206 31 5 217 2.25 222 32 4 226 1.74 230 33 7 220 3.08 227 34 3 224 1.32 227 35 3 224 1.32 227 36 12 219 5.19 231 37 4 224 1.75 228 38 4 205 1.91 209 39 7 242 2.81 249 40 5 207 2.36 212 41 5 225 2.17 230 42 4 216 1.82 220 43 3 201 1.47 204 44 2 214 0.93 216 45 3 194 1.52 197 46 3 211 1.40 214 47 5 190 2.56 195 48 7 239 2.85 246 49 4 204 1.92 208 50 2 204 0.97 206 51 3 205 1.44 208 52 4 176 2.22 180 53 6 177 3.28 183 54 5 196 2.49 201 55 0 198 0.00 198 56 3 199 1.49 202 57 6 178 3.26 184 58 6 206 2.83 212 59 2 159 1.24 161 60 3 203 1.46 206 61 3 157 1.88 160 62 5 167 2.91 172 63 4 166 2.35 170 64 3 191 1.55 194 65 3 151 1.95 154 66 3 169 1.74 172 67 3 163 1.81 166 68 4 168 2.33 172 69 5 170 2.86 175 70 3 150 1.96 153 71 4 135 2.88 139 72 3 170 1.73 173 73 4 130 2.99 134 74 4 140 2.78 144 75 1 139 0.71 140 76 3 129 2.27 132 77 3 110 2.65 113 78 4 130 2.99 134 79 2 103 1.90 105 80 1 50 1.96 51 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 47 660 6.65 707 2 55 643 7.88 698 3 39 640 5.74 679 4 29 651 4.26 680 5 35 620 5.34 655 6 31 568 5.18 599 7 37 568 6.12 605 8 37 560 6.20 597 9 38 605 5.91 643 10 40 629 5.98 669 11 39 616 5.95 655 12 39 636 5.78 675 13 28 624 4.29 652 14 29 609 4.55 638 15 32 654 4.66 686 16 37 627 5.57 664 17 26 598 4.17 624 18 38 625 5.73 663 19 30 627 4.57 657 20 32 634 4.80 666 21 29 630 4.40 659 22 21 611 3.32 632 23 28 601 4.45 629 24 23 645 3.44 668 25 26 641 3.90 667 26 28 675 3.98 703 27 40 613 6.13 653 28 25 636 3.78 661 29 21 627 3.24 648 30 29 623 4.45 652 31 25 638 3.77 663 32 28 648 4.14 676 33 22 645 3.30 667 34 18 627 2.79 645 35 19 592 3.11 611 36 20 621 3.12 641 37 23 680 3.27 703 38 20 630 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