CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7 184 3.66 191 2 4 195 2.01 199 3 1 162 0.61 163 4 1 128 0.78 129 5 3 93 3.12 96 6 2 67 2.90 69 7 1 86 1.15 87 8 1 70 1.41 71 9 1 102 0.97 103 10 0 71 0.00 71 11 1 86 1.15 87 12 1 89 1.11 90 13 2 67 2.90 69 14 0 96 0.00 96 15 1 70 1.41 71 16 1 83 1.19 84 17 0 111 0.00 111 18 0 101 0.00 101 19 0 91 0.00 91 20 1 104 0.95 105 21 1 100 0.99 101 22 0 95 0.00 95 23 0 87 0.00 87 24 0 82 0.00 82 25 0 91 0.00 91 26 0 98 0.00 98 27 0 95 0.00 95 28 1 113 0.88 114 29 0 87 0.00 87 30 0 100 0.00 100 31 1 104 0.95 105 32 1 91 1.09 92 33 0 105 0.00 105 34 0 86 0.00 86 35 0 105 0.00 105 36 3 110 2.65 113 37 0 87 0.00 87 38 1 110 0.90 111 39 2 102 1.92 104 40 0 101 0.00 101 41 1 94 1.05 95 42 0 83 0.00 83 43 1 88 1.12 89 44 1 80 1.23 81 45 1 89 1.11 90 46 1 71 1.39 72 47 0 74 0.00 74 48 2 89 2.20 91 49 1 101 0.98 102 50 1 95 1.04 96 51 2 104 1.89 106 52 1 88 1.12 89 53 0 97 0.00 97 54 0 78 0.00 78 55 1 85 1.16 86 56 1 80 1.23 81 57 0 69 0.00 69 58 1 97 1.02 98 59 1 112 0.88 113 60 0 98 0.00 98 61 0 81 0.00 81 62 3 76 3.80 79 63 2 64 3.03 66 64 3 79 3.66 82 65 2 80 2.44 82 66 0 62 0.00 62 67 0 87 0.00 87 68 1 66 1.49 67 69 2 83 2.35 85 70 1 63 1.56 64 71 0 71 0.00 71 72 0 77 0.00 77 73 0 62 0.00 62 74 0 58 0.00 58 75 2 74 2.63 76 76 1 71 1.39 72 77 0 67 0.00 67 78 1 66 1.49 67 79 0 56 0.00 56 80 0 69 0.00 69 81 3 79 3.66 82 82 1 58 1.69 59 83 1 54 1.82 55 84 1 58 1.69 59 85 0 59 0.00 59 86 0 48 0.00 48 87 1 57 1.72 58 88 3 54 5.26 57 89 0 49 0.00 49 90 0 51 0.00 51 91 1 50 1.96 51 92 1 56 1.75 57 93 1 43 2.27 44 94 0 36 0.00 36 95 1 36 2.70 37 96 1 37 2.63 38 97 0 54 0.00 54 98 0 47 0.00 47 99 0 45 0.00 45 100 0 53 0.00 53 101 1 51 1.92 52 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 80 56 58.82 136 2 63 52 54.78 115 3 32 61 34.41 93 4 12 83 12.63 95 5 10 81 10.99 91 6 6 74 7.50 80 7 5 91 5.21 96 8 3 86 3.37 89 9 4 94 4.08 98 10 3 96 3.03 99 11 0 92 0.00 92 12 3 84 3.45 87 13 3 86 3.37 89 14 1 96 1.03 97 15 5 82 5.75 87 16 4 102 3.77 106 17 0 108 0.00 108 18 0 84 0.00 84 19 5 92 5.15 97 20 5 97 4.90 102 21 0 105 0.00 105 22 2 96 2.04 98 23 1 100 0.99 101 24 0 97 0.00 97 25 0 114 0.00 114 26 1 85 1.16 86 27 0 106 0.00 106 28 0 93 0.00 93 29 1 109 0.91 110 30 10 95 9.52 105 31 1 87 1.14 88 32 2 77 2.53 79 33 4 93 4.12 97 34 0 114 0.00 114 35 3 105 2.78 108 36 0 106 0.00 106 37 2 104 1.89 106 38 1 87 1.14 88 39 1 97 1.02 98 40 0 110 0.00 110 41 2 101 1.94 103 42 1 95 1.04 96 43 2 89 2.20 91 44 0 84 0.00 84 45 2 66 2.94 68 46 3 85 3.41 88 47 0 97 0.00 97 48 2 86 2.27 88 49 0 81 0.00 81 50 0 73 0.00 73 51 0 74 0.00 74 52 0 77 0.00 77 53 2 91 2.15 93 54 1 100 0.99 101 55 0 100 0.00 100 56 4 59 6.35 63 57 3 83 3.49 86 58 1 80 1.23 81 59 2 71 2.74 73 60 1 71 1.39 72 61 2 84 2.33 86 62 0 70 0.00 70 63 6 98 5.77 104 64 1 87 1.14 88 65 2 69 2.82 71 66 1 74 1.33 75 67 1 71 1.39 72 68 1 68 1.45 69 69 2 81 2.41 83 70 3 78 3.70 81 71 1 85 1.16 86 72 0 71 0.00 71 73 3 67 4.29 70 74 1 72 1.37 73 75 2 69 2.82 71 76 1 70 1.41 71 77 0 49 0.00 49 78 1 52 1.89 53 79 0 70 0.00 70 80 3 62 4.62 65 81 0 61 0.00 61 82 2 57 3.39 59 83 0 73 0.00 73 84 0 59 0.00 59 85 1 54 1.82 55 86 1 51 1.92 52 87 1 56 1.75 57 88 2 49 3.92 51 89 1 65 1.52 66 90 3 46 6.12 49 91 1 41 2.38 42 92 2 39 4.88 41 93 3 36 7.69 39 94 0 51 0.00 51 95 1 52 1.89 53 96 1 51 1.92 52 97 3 37 7.50 40 98 2 41 4.65 43 99 3 23 11.54 26 100 1 28 3.45 29 101 3 38 7.32 41 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 28 45 38.36 73 2 11 56 16.42 67 3 7 109 6.03 116 4 2 94 2.08 96 5 5 135 3.57 140 6 4 118 3.28 122 7 2 160 1.23 162 8 1 147 0.68 148 9 2 143 1.38 145 10 0 134 0.00 134 11 1 135 0.74 136 12 3 143 2.05 146 13 1 147 0.68 148 14 0 155 0.00 155 15 0 160 0.00 160 16 2 162 1.22 164 17 2 138 1.43 140 18 0 163 0.00 163 19 2 140 1.41 142 20 1 167 0.60 168 21 0 156 0.00 156 22 0 149 0.00 149 23 0 137 0.00 137 24 2 164 1.20 166 25 1 155 0.64 156 26 4 178 2.20 182 27 2 162 1.22 164 28 3 167 1.76 170 29 2 182 1.09 184 30 1 165 0.60 166 31 1 153 0.65 154 32 3 181 1.63 184 33 0 167 0.00 167 34 1 152 0.65 153 35 2 144 1.37 146 36 2 135 1.46 137 37 0 111 0.00 111 38 1 148 0.67 149 39 1 129 0.77 130 40 3 135 2.17 138 41 0 141 0.00 141 42 0 130 0.00 130 43 0 135 0.00 135 44 0 148 0.00 148 45 2 197 1.01 199 46 5 185 2.63 190 47 2 167 1.18 169 48 1 164 0.61 165 49 2 129 1.53 131 50 0 155 0.00 155 51 1 175 0.57 176 52 2 143 1.38 145 53 1 152 0.65 153 54 1 140 0.71 141 55 0 127 0.00 127 56 1 133 0.75 134 57 2 135 1.46 137 58 1 121 0.82 122 59 2 123 1.60 125 60 1 144 0.69 145 61 1 105 0.94 106 62 0 148 0.00 148 63 2 116 1.69 118 64 1 123 0.81 124 65 0 106 0.00 106 66 0 130 0.00 130 67 1 117 0.85 118 68 1 101 0.98 102 69 2 110 1.79 112 70 1 101 0.98 102 71 0 99 0.00 99 72 1 125 0.79 126 73 1 84 1.18 85 74 3 112 2.61 115 75 0 90 0.00 90 76 0 109 0.00 109 77 1 108 0.92 109 78 0 126 0.00 126 79 1 107 0.93 108 80 0 93 0.00 93 81 2 97 2.02 99 82 1 87 1.14 88 83 0 87 0.00 87 84 1 78 1.27 79 85 0 84 0.00 84 86 1 68 1.45 69 87 1 83 1.19 84 88 1 77 1.28 78 89 1 72 1.37 73 90 0 85 0.00 85 91 2 68 2.86 70 92 0 84 0.00 84 93 1 82 1.20 83 94 1 78 1.27 79 95 1 71 1.39 72 96 1 64 1.54 65 97 1 79 1.25 80 98 1 63 1.56 64 99 0 45 0.00 45 100 0 49 0.00 49 101 0 67 0.00 67 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 10 42 19.23 52 2 5 56 8.20 61 3 3 52 5.45 55 4 2 53 3.64 55 5 1 61 1.61 62 6 0 29 0.00 29 7 0 29 0.00 29 8 0 32 0.00 32 9 0 49 0.00 49 10 0 37 0.00 37 11 0 41 0.00 41 12 0 28 0.00 28 13 0 39 0.00 39 14 0 21 0.00 21 15 0 41 0.00 41 16 0 39 0.00 39 17 0 32 0.00 32 18 0 37 0.00 37 19 1 38 2.56 39 20 0 31 0.00 31 21 0 34 0.00 34 22 0 17 0.00 17 23 1 33 2.94 34 24 0 29 0.00 29 25 0 41 0.00 41 26 0 33 0.00 33 27 0 23 0.00 23 28 0 33 0.00 33 29 0 21 0.00 21 30 0 26 0.00 26 31 0 27 0.00 27 32 1 38 2.56 39 33 0 30 0.00 30 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98 0 8 0.00 8 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4 21 16.00 25 2 4 39 9.30 43 3 6 51 10.53 57 4 6 33 15.38 39 5 1 58 1.69 59 6 0 47 0.00 47 7 1 39 2.50 40 8 0 53 0.00 53 9 0 37 0.00 37 10 0 41 0.00 41 11 0 41 0.00 41 12 0 34 0.00 34 13 0 37 0.00 37 14 0 35 0.00 35 15 0 35 0.00 35 16 0 30 0.00 30 17 1 40 2.44 41 18 0 30 0.00 30 19 1 38 2.56 39 20 0 36 0.00 36 21 0 25 0.00 25 22 1 36 2.70 37 23 2 39 4.88 41 24 0 36 0.00 36 25 1 22 4.35 23 26 1 35 2.78 36 27 1 31 3.12 32 28 0 32 0.00 32 29 0 36 0.00 36 30 0 18 0.00 18 31 0 17 0.00 17 32 1 28 3.45 29 33 1 24 4.00 25 34 0 27 0.00 27 35 1 20 4.76 21 36 0 30 0.00 30 37 0 25 0.00 25 38 0 26 0.00 26 39 0 27 0.00 27 40 0 17 0.00 17 41 0 27 0.00 27 42 0 19 0.00 19 43 0 14 0.00 14 44 0 31 0.00 31 45 1 18 5.26 19 46 0 20 0.00 20 47 0 16 0.00 16 48 0 29 0.00 29 49 0 20 0.00 20 50 0 15 0.00 15 51 0 19 0.00 19 52 0 16 0.00 16 53 0 17 0.00 17 54 0 18 0.00 18 55 0 14 0.00 14 56 0 23 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