CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 286787 1782747 13.86 2069534 2 271142 1652460 14.10 1923602 3 270315 1683365 13.84 1953680 4 274244 1700195 13.89 1974439 5 277528 1680840 14.17 1958368 6 280671 1742368 13.87 2023039 7 287028 1741256 14.15 2028284 8 287447 1726905 14.27 2014352 9 288090 1732582 14.26 2020672 10 288469 1731435 14.28 2019904 11 290455 1731773 14.36 2022228 12 289518 1724907 14.37 2014425 13 288246 1705344 14.46 1993590 14 291301 1750028 14.27 2041329 15 292433 1759658 14.25 2052091 16 294227 1754073 14.36 2048300 17 292743 1772258 14.18 2065001 18 290494 1762803 14.15 2053297 19 292973 1750806 14.33 2043779 20 290905 1752211 14.24 2043116 21 290812 1746969 14.27 2037781 22 289193 1738118 14.26 2027311 23 290592 1760067 14.17 2050659 24 288618 1738242 14.24 2026860 25 290538 1767563 14.12 2058101 26 290353 1779609 14.03 2069962 27 291821 1765545 14.18 2057366 28 287613 1758932 14.05 2046545 29 288776 1755836 14.12 2044612 30 286605 1743771 14.12 2030376 31 286908 1737168 14.17 2024076 32 291366 1763209 14.18 2054575 33 289626 1764747 14.10 2054373 34 288273 1752402 14.13 2040675 35 287623 1762847 14.03 2050470 36 284155 1749656 13.97 2033811 37 285519 1751477 14.02 2036996 38 283319 1741460 13.99 2024779 39 286787 1761231 14.00 2048018 40 286614 1737034 14.16 2023648 41 287741 1762231 14.04 2049972 42 280955 1740242 13.90 2021197 43 286814 1743561 14.13 2030375 44 283310 1738910 14.01 2022220 45 279578 1737099 13.86 2016677 46 278969 1721412 13.95 2000381 47 277562 1739788 13.76 2017350 48 277796 1713460 13.95 1991256 49 280409 1720390 14.01 2000799 50 275204 1695554 13.96 1970758 51 277006 1707198 13.96 1984204 52 271216 1706524 13.71 1977740 53 270435 1706000 13.68 1976435 54 271973 1702076 13.78 1974049 55 269307 1693502 13.72 1962809 56 272565 1702509 13.80 1975074 57 270133 1695046 13.75 1965179 58 266829 1676800 13.73 1943629 59 265621 1664871 13.76 1930492 60 262324 1656288 13.67 1918612 61 265283 1663990 13.75 1929273 62 265332 1676859 13.66 1942191 63 263834 1670652 13.64 1934486 64 260794 1646294 13.67 1907088 65 259864 1649884 13.61 1909748 66 259651 1636178 13.70 1895829 67 255927 1627846 13.59 1883773 68 254011 1626060 13.51 1880071 69 255603 1613549 13.67 1869152 70 251023 1587157 13.66 1838180 71 252349 1589710 13.70 1842059 72 247004 1572132 13.58 1819136 73 249153 1568012 13.71 1817165 74 246517 1577969 13.51 1824486 75 242408 1566481 13.40 1808889 76 239927 1548427 13.42 1788354 77 237685 1550109 13.29 1787794 78 237146 1530431 13.42 1767577 79 236608 1525492 13.43 1762100 80 235137 1514266 13.44 1749403 81 230526 1500594 13.32 1731120 82 228126 1489078 13.28 1717204 83 225942 1478800 13.25 1704742 84 225317 1480739 13.21 1706056 85 224264 1471364 13.23 1695628 86 223128 1465598 13.21 1688726 87 221495 1457805 13.19 1679300 88 219408 1437708 13.24 1657116 89 216254 1432502 13.12 1648756 90 215101 1417506 13.18 1632607 91 213458 1415839 13.10 1629297 92 211298 1398951 13.12 1610249 93 209846 1386024 13.15 1595870 94 204250 1369642 12.98 1573892 95 203767 1367401 12.97 1571168 96 201061 1355111 12.92 1556172 97 201116 1343405 13.02 1544521 98 197737 1334140 12.91 1531877 99 196314 1316920 12.97 1513234 100 193892 1300176 12.98 1494068 101 193499 1298164 12.97 1491663 102 188046 1270089 12.90 1458135 103 184760 1252939 12.85 1437699 104 184198 1251402 12.83 1435600 105 182170 1238395 12.82 1420565 106 179548 1224157 12.79 1403705 107 177566 1217046 12.73 1394612 108 175351 1200000 12.75 1375351 109 174073 1192440 12.74 1366513 110 172655 1176309 12.80 1348964 111 169149 1169297 12.64 1338446 112 166779 1149009 12.68 1315788 113 164810 1139354 12.64 1304164 114 162091 1121454 12.63 1283545 115 159866 1109415 12.60 1269281 116 157364 1099626 12.52 1256990 117 156724 1087580 12.60 1244304 118 155089 1074608 12.61 1229697 119 153867 1068726 12.59 1222593 120 151262 1049028 12.60 1200290 121 148539 1034096 12.56 1182635 122 147163 1016651 12.64 1163814 123 144336 1007316 12.53 1151652 124 141960 991287 12.53 1133247 125 139827 984791 12.43 1124618 126 136417 964752 12.39 1101169 127 134165 955361 12.31 1089526 128 133185 950925 12.29 1084110 129 132108 934876 12.38 1066984 130 130055 921762 12.36 1051817 131 129378 911741 12.43 1041119 132 127487 895793 12.46 1023280 133 125348 886122 12.39 1011470 134 121771 871321 12.26 993092 135 113061 851073 11.73 964134 136 53609 730848 6.83 784457 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 15324 3266860 0.47 3282184 2 13793 2814208 0.49 2828001 3 11636 2700292 0.43 2711928 4 11691 2709494 0.43 2721185 5 11387 2686923 0.42 2698310 6 11696 2640266 0.44 2651962 7 11314 2668228 0.42 2679542 8 11734 2732488 0.43 2744222 9 11232 2675928 0.42 2687160 10 11270 2750362 0.41 2761632 11 11556 2775699 0.41 2787255 12 11061 2767550 0.40 2778611 13 11051 2742097 0.40 2753148 14 11203 2747791 0.41 2758994 15 10911 2729891 0.40 2740802 16 11307 2754226 0.41 2765533 17 10931 2776035 0.39 2786966 18 10961 2746774 0.40 2757735 19 10842 2784869 0.39 2795711 20 10954 2764727 0.39 2775681 21 11076 2756058 0.40 2767134 22 10747 2776870 0.39 2787617 23 11012 2755249 0.40 2766261 24 11155 2764875 0.40 2776030 25 10948 2759910 0.40 2770858 26 11075 2799549 0.39 2810624 27 10911 2749664 0.40 2760575 28 11026 2756840 0.40 2767866 29 10796 2761768 0.39 2772564 30 10831 2743071 0.39 2753902 31 10830 2758738 0.39 2769568 32 10807 2763056 0.39 2773863 33 10884 2769373 0.39 2780257 34 11062 2764744 0.40 2775806 35 10802 2751293 0.39 2762095 36 10741 2766502 0.39 2777243 37 10790 2712961 0.40 2723751 38 10766 2761173 0.39 2771939 39 10828 2723115 0.40 2733943 40 11172 2750217 0.40 2761389 41 10760 2767338 0.39 2778098 42 10832 2762566 0.39 2773398 43 10930 2720344 0.40 2731274 44 10677 2743344 0.39 2754021 45 10784 2707353 0.40 2718137 46 11014 2703260 0.41 2714274 47 10925 2711440 0.40 2722365 48 10937 2709537 0.40 2720474 49 10683 2681474 0.40 2692157 50 10836 2724115 0.40 2734951 51 10673 2669072 0.40 2679745 52 10939 2700167 0.40 2711106 53 10768 2665159 0.40 2675927 54 10945 2663292 0.41 2674237 55 10805 2631578 0.41 2642383 56 10913 2662084 0.41 2672997 57 10851 2619377 0.41 2630228 58 10605 2633940 0.40 2644545 59 10638 2638312 0.40 2648950 60 10893 2639160 0.41 2650053 61 10756 2588884 0.41 2599640 62 10864 2624107 0.41 2634971 63 10599 2584038 0.41 2594637 64 10613 2597726 0.41 2608339 65 10749 2595408 0.41 2606157 66 10842 2580021 0.42 2590863 67 10794 2546850 0.42 2557644 68 10636 2585633 0.41 2596269 69 10738 2528875 0.42 2539613 70 10616 2535936 0.42 2546552 71 10655 2521621 0.42 2532276 72 10644 2499992 0.42 2510636 73 10436 2480837 0.42 2491273 74 10673 2477605 0.43 2488278 75 10392 2435282 0.42 2445674 76 10385 2444444 0.42 2454829 77 10261 2425440 0.42 2435701 78 10777 2423049 0.44 2433826 79 10175 2393007 0.42 2403182 80 10510 2408935 0.43 2419445 81 10228 2353209 0.43 2363437 82 10191 2355807 0.43 2365998 83 10037 2332927 0.43 2342964 84 9932 2322484 0.43 2332416 85 9855 2297973 0.43 2307828 86 10183 2310796 0.44 2320979 87 9900 2264198 0.44 2274098 88 9828 2264512 0.43 2274340 89 9897 2256017 0.44 2265914 90 10114 2238161 0.45 2248275 91 9915 2209389 0.45 2219304 92 9603 2196810 0.44 2206413 93 9631 2167400 0.44 2177031 94 9565 2157881 0.44 2167446 95 9424 2127157 0.44 2136581 96 9428 2120482 0.44 2129910 97 9351 2096644 0.44 2105995 98 9170 2099823 0.43 2108993 99 9275 2073422 0.45 2082697 100 9163 2050756 0.44 2059919 101 9153 2026257 0.45 2035410 102 9258 2004393 0.46 2013651 103 9045 1973360 0.46 1982405 104 9013 1975090 0.45 1984103 105 8885 1936927 0.46 1945812 106 8811 1924159 0.46 1932970 107 8720 1910122 0.45 1918842 108 8799 1896813 0.46 1905612 109 8782 1875766 0.47 1884548 110 8953 1875638 0.48 1884591 111 8498 1827187 0.46 1835685 112 8954 1816850 0.49 1825804 113 8713 1781513 0.49 1790226 114 8540 1767662 0.48 1776202 115 8538 1731959 0.49 1740497 116 8417 1732803 0.48 1741220 117 8568 1705593 0.50 1714161 118 8580 1696245 0.50 1704825 119 8371 1676084 0.50 1684455 120 8384 1662697 0.50 1671081 121 8466 1613275 0.52 1621741 122 8557 1612648 0.53 1621205 123 8401 1573231 0.53 1581632 124 8337 1572629 0.53 1580966 125 8326 1539304 0.54 1547630 126 8443 1513160 0.55 1521603 127 8329 1487980 0.56 1496309 128 8301 1483976 0.56 1492277 129 8615 1456053 0.59 1464668 130 9205 1445984 0.63 1455189 131 9655 1433730 0.67 1443385 132 9632 1402318 0.68 1411950 133 9881 1379852 0.71 1389733 134 9555 1360049 0.70 1369604 135 7825 1292692 0.60 1300517 136 2737 1118578 0.24 1121315 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 62334 8856963 0.70 8919297 2 68393 9442920 0.72 9511313 3 58086 9518077 0.61 9576163 4 68265 9514040 0.71 9582305 5 59887 9442172 0.63 9502059 6 70887 9413838 0.75 9484725 7 60134 9345846 0.64 9405980 8 67780 9427898 0.71 9495678 9 54855 9378067 0.58 9432922 10 65023 9383722 0.69 9448745 11 54825 9366131 0.58 9420956 12 67170 9320278 0.72 9387448 13 58738 9345022 0.62 9403760 14 66576 9385759 0.70 9452335 15 55945 9356284 0.59 9412229 16 62864 9300627 0.67 9363491 17 54818 9392043 0.58 9446861 18 62879 9371012 0.67 9433891 19 59918 9387079 0.63 9446997 20 64449 9357479 0.68 9421928 21 57402 9273548 0.62 9330950 22 63053 9236726 0.68 9299779 23 53228 9264436 0.57 9317664 24 60674 9281954 0.65 9342628 25 55331 9307250 0.59 9362581 26 63610 9336525 0.68 9400135 27 57394 9377993 0.61 9435387 28 63369 9302975 0.68 9366344 29 51756 9318568 0.55 9370324 30 60950 9266980 0.65 9327930 31 51705 9235923 0.56 9287628 32 60081 9251766 0.65 9311847 33 55319 9190818 0.60 9246137 34 62558 9252136 0.67 9314694 35 52901 9276332 0.57 9329233 36 57549 9283053 0.62 9340602 37 51261 9226026 0.55 9277287 38 57373 9256162 0.62 9313535 39 53626 9225530 0.58 9279156 40 58802 9203286 0.63 9262088 41 54242 9209869 0.59 9264111 42 56139 9144739 0.61 9200878 43 51162 9142523 0.56 9193685 44 53081 9181142 0.57 9234223 45 50295 9182797 0.54 9233092 46 59271 9138106 0.64 9197377 47 52887 9156504 0.57 9209391 48 56810 9067376 0.62 9124186 49 50814 9132120 0.55 9182934 50 52399 9119056 0.57 9171455 51 47606 9122116 0.52 9169722 52 56359 9079019 0.62 9135378 53 51326 9063656 0.56 9114982 54 57103 9051830 0.63 9108933 55 49899 8990400 0.55 9040299 56 51779 9044574 0.57 9096353 57 47457 9061541 0.52 9108998 58 52729 8978492 0.58 9031221 59 49799 9035094 0.55 9084893 60 54441 8961445 0.60 9015886 61 49939 8899494 0.56 8949433 62 49151 8920991 0.55 8970142 63 47666 8845783 0.54 8893449 64 49424 8831620 0.56 8881044 65 46768 8834770 0.53 8881538 66 51498 8834711 0.58 8886209 67 48689 8811541 0.55 8860230 68 49593 8812902 0.56 8862495 69 45474 8736759 0.52 8782233 70 48555 8665334 0.56 8713889 71 44948 8686135 0.51 8731083 72 48771 8618446 0.56 8667217 73 45617 8584249 0.53 8629866 74 50223 8576154 0.58 8626377 75 43539 8487452 0.51 8530991 76 46731 8490272 0.55 8537003 77 41803 8461842 0.49 8503645 78 46366 8384036 0.55 8430402 79 44153 8381940 0.52 8426093 80 46140 8324946 0.55 8371086 81 43500 8245473 0.52 8288973 82 45344 8192852 0.55 8238196 83 41018 8126625 0.50 8167643 84 42409 8070005 0.52 8112414 85 42142 8034382 0.52 8076524 86 43419 8031882 0.54 8075301 87 42120 7962911 0.53 8005031 88 43749 7904057 0.55 7947806 89 40079 7873045 0.51 7913124 90 41988 7802251 0.54 7844239 91 38712 7766462 0.50 7805174 92 40729 7697751 0.53 7738480 93 39870 7613213 0.52 7653083 94 42042 7536742 0.55 7578784 95 37877 7483085 0.50 7520962 96 40482 7441302 0.54 7481784 97 36443 7426670 0.49 7463113 98 39085 7402186 0.53 7441271 99 37950 7329008 0.52 7366958 100 40674 7285381 0.56 7326055 101 37539 7193896 0.52 7231435 102 37988 7095077 0.53 7133065 103 35415 7002870 0.50 7038285 104 35743 6941895 0.51 6977638 105 34674 6878295 0.50 6912969 106 36691 6837235 0.53 6873926 107 36673 6809991 0.54 6846664 108 35863 6743139 0.53 6779002 109 34738 6698252 0.52 6732990 110 34158 6629158 0.51 6663316 111 33025 6538073 0.50 6571098 112 34635 6462822 0.53 6497457 113 33578 6396402 0.52 6429980 114 34775 6308757 0.55 6343532 115 32757 6220768 0.52 6253525 116 33274 6189985 0.53 6223259 117 30625 6145927 0.50 6176552 118 33397 6084572 0.55 6117969 119 31460 6036767 0.52 6068227 120 32978 5941098 0.55 5974076 121 31853 5867779 0.54 5899632 122 31800 5786287 0.55 5818087 123 30753 5705135 0.54 5735888 124 31627 5633001 0.56 5664628 125 30790 5548618 0.55 5579408 126 32259 5479701 0.59 5511960 127 31275 5429249 0.57 5460524 128 30972 5396764 0.57 5427736 129 31738 5327581 0.59 5359319 130 32016 5256804 0.61 5288820 131 32740 5189349 0.63 5222089 132 34351 5100181 0.67 5134532 133 35790 5022013 0.71 5057803 134 36575 4946396 0.73 4982971 135 27429 4807110 0.57 4834539 136 13216 4331203 0.30 4344419 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 100183 730058 12.07 830241 2 91723 661943 12.17 753666 3 89472 660800 11.93 750272 4 89420 655886 12.00 745306 5 89379 644980 12.17 734359 6 88112 652131 11.90 740243 7 89209 643698 12.17 732907 8 87209 626684 12.22 713893 9 86536 619600 12.25 706136 10 85659 607219 12.36 692878 11 84797 598877 12.40 683674 12 82347 585613 12.33 667960 13 80921 571988 12.39 652909 14 79928 576297 12.18 656225 15 79949 574540 12.22 654489 16 78190 560614 12.24 638804 17 77140 557457 12.16 634597 18 74896 545366 12.07 620262 19 75045 535591 12.29 610636 20 73095 527153 12.18 600248 21 71830 517281 12.19 589111 22 70609 505013 12.27 575622 23 69180 500700 12.14 569880 24 67665 486265 12.22 553930 25 67084 486856 12.11 553940 26 65748 484376 11.95 550124 27 65306 475942 12.07 541248 28 63037 465181 11.93 528218 29 62570 455977 12.07 518547 30 61148 446837 12.04 507985 31 60044 436627 12.09 496671 32 60594 436030 12.20 496624 33 58749 427518 12.08 486267 34 56803 418712 11.95 475515 35 56708 414692 12.03 471400 36 54746 405139 11.90 459885 37 54257 401406 11.91 455663 38 53118 394368 11.87 447486 39 53361 391959 11.98 445320 40 52540 380281 12.14 432821 41 52119 379000 12.09 431119 42 49724 368180 11.90 417904 43 49341 364159 11.93 413500 44 48681 355726 12.04 404407 45 47410 349837 11.93 397247 46 46255 342531 11.90 388786 47 45298 340887 11.73 386185 48 44423 330149 11.86 374572 49 43932 327794 11.82 371726 50 42790 318627 11.84 361417 51 42594 317050 11.84 359644 52 40973 310013 11.67 350986 53 40450 304006 11.74 344456 54 39394 298971 11.64 338365 55 38927 293587 11.71 332514 56 38807 291205 11.76 330012 57 38163 286390 11.76 324553 58 36898 278688 11.69 315586 59 36581 273153 11.81 309734 60 35359 268859 11.62 304218 61 35639 265793 11.82 301432 62 34829 264122 11.65 298951 63 34559 258245 11.80 292804 64 33548 250339 11.82 283887 65 33196 247173 11.84 280369 66 32319 242982 11.74 275301 67 31249 237116 11.64 268365 68 30662 234177 11.58 264839 69 30498 231159 11.66 261657 70 29296 225615 11.49 254911 71 29732 222248 11.80 251980 72 28564 217371 11.61 245935 73 28512 214765 11.72 243277 74 28136 212351 11.70 240487 75 27056 207456 11.54 234512 76 26342 203078 11.48 229420 77 25986 200377 11.48 226363 78 25374 194719 11.53 220093 79 25216 193883 11.51 219099 80 24884 188516 11.66 213400 81 24157 185614 11.52 209771 82 23546 182061 11.45 205607 83 23293 177825 11.58 201118 84 22699 176575 11.39 199274 85 22619 173994 11.50 196613 86 21819 170186 11.36 192005 87 21716 168267 11.43 189983 88 21220 163698 11.48 184918 89 20513 161219 11.29 181732 90 20107 157638 11.31 177745 91 20188 158010 11.33 178198 92 19602 153128 11.35 172730 93 19515 151507 11.41 171022 94 18888 148515 11.28 167403 95 18888 146178 11.44 165066 96 18209 143159 11.28 161368 97 18127 140730 11.41 158857 98 17489 138312 11.23 155801 99 17159 134651 11.30 151810 100 16634 132895 11.12 149529 101 16607 131771 11.19 148378 102 15907 128072 11.05 143979 103 15798 125422 11.19 141220 104 15454 124395 11.05 139849 105 15458 122504 11.20 137962 106 15135 119515 11.24 134650 107 14701 117574 11.11 132275 108 14310 115342 11.04 129652 109 14216 113648 11.12 127864 110 13745 111015 11.02 124760 111 13511 108869 11.04 122380 112 13470 106946 11.19 120416 113 12880 105131 10.91 118011 114 12680 103148 10.95 115828 115 12630 101855 11.03 114485 116 12266 100187 10.91 112453 117 12172 97889 11.06 110061 118 11933 95858 11.07 107791 119 11747 94300 11.08 106047 120 11331 92100 10.96 103431 121 11311 90008 11.16 101319 122 10955 88807 10.98 99762 123 10694 87563 10.88 98257 124 10515 85187 10.99 95702 125 9965 84272 10.57 94237 126 10178 82592 10.97 92770 127 9673 80907 10.68 90580 128 9644 80077 10.75 89721 129 9494 78117 10.84 87611 130 9116 76203 10.68 85319 131 9008 74839 10.74 83847 132 8799 73963 10.63 82762 133 8651 72506 10.66 81157 134 8304 70469 10.54 78773 135 7479 68385 9.86 75864 136 3702 57048 6.09 60750 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6832 1334083 0.51 1340915 2 5977 1126345 0.53 1132322 3 4860 1055214 0.46 1060074 4 4803 1042922 0.46 1047725 5 4600 1018446 0.45 1023046 6 4445 986219 0.45 990664 7 4280 979601 0.44 983881 8 4340 987044 0.44 991384 9 4066 952732 0.42 956798 10 4283 967909 0.44 972192 11 3979 962146 0.41 966125 12 3908 944091 0.41 947999 13 3657 917340 0.40 920997 14 3741 903275 0.41 907016 15 3472 881843 0.39 885315 16 3607 875160 0.41 878767 17 3330 871461 0.38 874791 18 3384 847081 0.40 850465 19 3336 844554 0.39 847890 20 3316 827688 0.40 831004 21 3117 811401 0.38 814518 22 3129 805085 0.39 808214 23 3045 785388 0.39 788433 24 2964 775045 0.38 778009 25 3014 760329 0.39 763343 26 2822 755145 0.37 757967 27 2833 731878 0.39 734711 28 2810 721394 0.39 724204 29 2631 715106 0.37 717737 30 2685 696514 0.38 699199 31 2624 692840 0.38 695464 32 2501 682287 0.37 684788 33 2525 670477 0.38 673002 34 2403 661231 0.36 663634 35 2317 642907 0.36 645224 36 2339 638443 0.37 640782 37 2270 616195 0.37 618465 38 2287 615988 0.37 618275 39 2231 600769 0.37 603000 40 2217 596096 0.37 598313 41 2229 590165 0.38 592394 42 2077 585251 0.35 587328 43 2059 562461 0.36 564520 44 2110 559409 0.38 561519 45 1998 543803 0.37 545801 46 1982 534466 0.37 536448 47 1888 526380 0.36 528268 48 1919 516585 0.37 518504 49 1854 505190 0.37 507044 50 1789 508498 0.35 510287 51 1774 489358 0.36 491132 52 1806 488326 0.37 490132 53 1732 473547 0.36 475279 54 1741 469205 0.37 470946 55 1691 454243 0.37 455934 56 1662 450860 0.37 452522 57 1555 438208 0.35 439763 58 1557 433687 0.36 435244 59 1597 428482 0.37 430079 60 1521 423020 0.36 424541 61 1418 410548 0.34 411966 62 1517 410307 0.37 411824 63 1408 397959 0.35 399367 64 1450 393922 0.37 395372 65 1318 389071 0.34 390389 66 1417 380120 0.37 381537 67 1323 369868 0.36 371191 68 1335 370894 0.36 372229 69 1372 358809 0.38 360181 70 1300 355463 0.36 356763 71 1249 350135 0.36 351384 72 1254 341520 0.37 342774 73 1235 336469 0.37 337704 74 1179 331698 0.35 332877 75 1174 320593 0.36 321767 76 1235 318243 0.39 319478 77 1106 311116 0.35 312222 78 1204 306607 0.39 307811 79 1044 299563 0.35 300607 80 1100 298388 0.37 299488 81 1031 288405 0.36 289436 82 1028 284168 0.36 285196 83 1049 279969 0.37 281018 84 973 275739 0.35 276712 85 980 269911 0.36 270891 86 998 267953 0.37 268951 87 963 258002 0.37 258965 88 894 257118 0.35 258012 89 941 251481 0.37 252422 90 895 247279 0.36 248174 91 902 242102 0.37 243004 92 846 239678 0.35 240524 93 840 233693 0.36 234533 94 849 231199 0.37 232048 95 811 226717 0.36 227528 96 862 222631 0.39 223493 97 777 217143 0.36 217920 98 845 216133 0.39 216978 99 780 209740 0.37 210520 100 804 207132 0.39 207936 101 812 202504 0.40 203316 102 758 199998 0.38 200756 103 730 196040 0.37 196770 104 736 195243 0.38 195979 105 702 188165 0.37 188867 106 768 186214 0.41 186982 107 682 182998 0.37 183680 108 680 179920 0.38 180600 109 695 176979 0.39 177674 110 667 173942 0.38 174609 111 642 168842 0.38 169484 112 634 167246 0.38 167880 113 633 163539 0.39 164172 114 629 161416 0.39 162045 115 604 156795 0.38 157399 116 602 156227 0.38 156829 117 588 152034 0.39 152622 118 600 149389 0.40 149989 119 575 146318 0.39 146893 120 596 144640 0.41 145236 121 588 139436 0.42 140024 122 571 138883 0.41 139454 123 570 135035 0.42 135605 124 551 134128 0.41 134679 125 573 130889 0.44 131462 126 541 127987 0.42 128528 127 523 124790 0.42 125313 128 532 124406 0.43 124938 129 501 120871 0.41 121372 130 516 118306 0.43 118822 131 502 117144 0.43 117646 132 503 114300 0.44 114803 133 488 110779 0.44 111267 134 458 110107 0.41 110565 135 370 101882 0.36 102252 136 151 85425 0.18 85576 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 26078 3863736 0.67 3889814 2 26458 4041544 0.65 4068002 3 23840 4007445 0.59 4031285 4 25238 3943904 0.64 3969142 5 23357 3854306 0.60 3877663 6 24758 3783192 0.65 3807950 7 21743 3710691 0.58 3732434 8 22991 3691898 0.62 3714889 9 19364 3629674 0.53 3649038 10 21090 3597111 0.58 3618201 11 18699 3538407 0.53 3557106 12 21069 3474514 0.60 3495583 13 19098 3427062 0.55 3446160 14 19994 3392205 0.59 3412199 15 17554 3327611 0.52 3345165 16 18607 3254247 0.57 3272854 17 16912 3241065 0.52 3257977 18 17456 3186001 0.54 3203457 19 17887 3148708 0.56 3166595 20 17337 3095107 0.56 3112444 21 16342 3031110 0.54 3047452 22 16798 2975274 0.56 2992072 23 14534 2938353 0.49 2952887 24 15716 2896494 0.54 2912210 25 14713 2854456 0.51 2869169 26 15827 2814244 0.56 2830071 27 14736 2787779 0.53 2802515 28 15535 2727941 0.57 2743476 29 12765 2683189 0.47 2695954 30 14523 2634166 0.55 2648689 31 12156 2587688 0.47 2599844 32 13919 2560074 0.54 2573993 33 12731 2504312 0.51 2517043 34 13943 2479753 0.56 2493696 35 12245 2442668 0.50 2454913 36 12451 2404463 0.52 2416914 37 11388 2349282 0.48 2360670 38 12288 2320049 0.53 2332337 39 11650 2276316 0.51 2287966 40 12222 2238180 0.54 2250402 41 11897 2209104 0.54 2221001 42 11213 2163939 0.52 2175152 43 10529 2134803 0.49 2145332 44 10628 2113114 0.50 2123742 45 10040 2077373 0.48 2087413 46 11510 2029272 0.56 2040782 47 10446 1999246 0.52 2009692 48 10913 1952610 0.56 1963523 49 9805 1931307 0.51 1941112 50 9623 1906014 0.50 1915637 51 8746 1880433 0.46 1889179 52 10435 1846820 0.56 1857255 53 9141 1818751 0.50 1827892 54 10095 1790172 0.56 1800267 55 8856 1751809 0.50 1760665 56 8839 1732206 0.51 1741045 57 8254 1709785 0.48 1718039 58 9084 1666575 0.54 1675659 59 8444 1649422 0.51 1657866 60 9176 1615419 0.56 1624595 61 8334 1579471 0.52 1587805 62 7817 1569881 0.50 1577698 63 8180 1536475 0.53 1544655 64 7999 1509937 0.53 1517936 65 7741 1490154 0.52 1497895 66 7885 1464895 0.54 1472780 67 7722 1439290 0.53 1447012 68 7384 1421353 0.52 1428737 69 7139 1387430 0.51 1394569 70 7352 1361725 0.54 1369077 71 6879 1348552 0.51 1355431 72 7297 1322183 0.55 1329480 73 6487 1301872 0.50 1308359 74 7394 1289076 0.57 1296470 75 6124 1256757 0.48 1262881 76 6850 1240298 0.55 1247148 77 5984 1216711 0.49 1222695 78 6532 1187431 0.55 1193963 79 6292 1176494 0.53 1182786 80 6189 1155181 0.53 1161370 81 5872 1128255 0.52 1134127 82 6102 1113015 0.55 1119117 83 5593 1092959 0.51 1098552 84 5407 1074081 0.50 1079488 85 5889 1058331 0.55 1064220 86 5534 1043765 0.53 1049299 87 5520 1021179 0.54 1026699 88 5487 999765 0.55 1005252 89 4935 986630 0.50 991565 90 5287 966511 0.54 971798 91 4857 956110 0.51 960967 92 4956 940779 0.52 945735 93 4877 920230 0.53 925107 94 5068 901770 0.56 906838 95 4391 886253 0.49 890644 96 4809 871742 0.55 876551 97 4302 860968 0.50 865270 98 4560 848779 0.53 853339 99 4238 832109 0.51 836347 100 4572 823306 0.55 827878 101 4234 804449 0.52 808683 102 4208 789014 0.53 793222 103 3927 771029 0.51 774956 104 3928 759445 0.51 763373 105 3613 746706 0.48 750319 106 3939 735269 0.53 739208 107 3909 724952 0.54 728861 108 3649 711313 0.51 714962 109 3655 703225 0.52 706880 110 3436 688942 0.50 692378 111 3324 673393 0.49 676717 112 3596 661544 0.54 665140 113 3298 654236 0.50 657534 114 3469 640260 0.54 643729 115 3171 625827 0.50 628998 116 3149 617465 0.51 620614 117 2963 607894 0.49 610857 118 3399 596967 0.57 600366 119 2911 587156 0.49 590067 120 3083 573488 0.53 576571 121 2832 564075 0.50 566907 122 2898 551704 0.52 554602 123 2709 542339 0.50 545048 124 3020 533843 0.56 536863 125 2732 521247 0.52 523979 126 2781 515035 0.54 517816 127 2678 504500 0.53 507178 128 2393 498032 0.48 500425 129 2714 488684 0.55 491398 130 2513 476081 0.53 478594 131 2583 467828 0.55 470411 132 2634 454518 0.58 457152 133 2525 447573 0.56 450098 134 2433 437476 0.55 439909 135 1920 423568 0.45 425488 136 1066 373607 0.28 374673