CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4437683 71112909 5.87 75550592 2 883709 116597 88.34 1000306 3 114291 4092265 2.72 4206556 4 156791 7606214 2.02 7763005 5 196147 7606198 2.51 7802345 6 211197 6819976 3.00 7031173 7 216445 6815432 3.08 7031877 8 220034 6970987 3.06 7191021 9 252645 7233013 3.38 7485658 10 276437 7410053 3.60 7686490 11 208325 7108463 2.85 7316788 12 224847 7593630 2.88 7818477 13 199494 6775145 2.86 6974639 14 202715 7252904 2.72 7455619 15 230057 7367420 3.03 7597477 16 484656 8709924 5.27 9194580 17 210861 7528916 2.72 7739777 18 181061 6412890 2.75 6593951 19 177745 6170406 2.80 6348151 20 176895 6176866 2.78 6353761 21 196836 7108469 2.69 7305305 22 201393 7957741 2.47 8159134 23 217200 8291793 2.55 8508993 24 207977 6316717 3.19 6524694 25 205977 6708051 2.98 6914028 26 182933 6138003 2.89 6320936 27 186350 6799566 2.67 6985916 28 182848 7059790 2.52 7242638 29 216236 7677167 2.74 7893403 30 225455 7764461 2.82 7989916 31 238029 7973481 2.90 8211510 32 224594 8203125 2.66 8427719 33 242297 8718840 2.70 8961137 34 261648 9616336 2.65 9877984 35 186831 7219540 2.52 7406371 36 222756 7404308 2.92 7627064 37 181485 6832064 2.59 7013549 38 174015 7023790 2.42 7197805 39 191500 7155404 2.61 7346904 40 246010 8184322 2.92 8430332 41 197359 7856451 2.45 8053810 42 188894 6615453 2.78 6804347 43 182792 6473020 2.75 6655812 44 186746 6425514 2.82 6612260 45 178886 6470027 2.69 6648913 46 161373 5836752 2.69 5998125 47 177214 6468720 2.67 6645934 48 163676 6073830 2.62 6237506 49 165895 5864629 2.75 6030524 50 157186 5903600 2.59 6060786 51 200064 7471583 2.61 7671647 52 184424 8098826 2.23 8283250 53 165862 7348050 2.21 7513912 54 179853 6262689 2.79 6442542 55 143153 5378019 2.59 5521172 56 170621 5651691 2.93 5822312 57 141636 5502334 2.51 5643970 58 165033 7771123 2.08 7936156 59 157355 8077090 1.91 8234445 60 137741 5287839 2.54 5425580 61 137779 5658060 2.38 5795839 62 133245 6395504 2.04 6528749 63 143104 7025028 2.00 7168132 64 137920 5267920 2.55 5405840 65 134318 5472084 2.40 5606402 66 140246 5966677 2.30 6106923 67 125064 5669301 2.16 5794365 68 115296 5257476 2.15 5372772 69 118570 5904937 1.97 6023507 70 109204 4911004 2.18 5020208 71 110294 4687727 2.30 4798021 72 135860 4843089 2.73 4978949 73 115002 4864365 2.31 4979367 74 113365 5188741 2.14 5302106 75 108539 4972892 2.14 5081431 76 112024 4917196 2.23 5029220 77 109873 4538904 2.36 4648777 78 95542 4340925 2.15 4436467 79 92986 4484176 2.03 4577162 80 98459 4377094 2.20 4475553 81 103293 4541237 2.22 4644530 82 127376 6415483 1.95 6542859 83 118802 6791656 1.72 6910458 84 116472 4931536 2.31 5048008 85 103230 4308854 2.34 4412084 86 107291 6569822 1.61 6677113 87 148483 7598534 1.92 7747017 88 109142 4818529 2.21 4927671 89 93804 4252040 2.16 4345844 90 105027 4360153 2.35 4465180 91 88002 4101923 2.10 4189925 92 86977 4603325 1.85 4690302 93 109790 6875770 1.57 6985560 94 128068 6875905 1.83 7003973 95 109483 4358794 2.45 4468277 96 107474 4479179 2.34 4586653 97 101502 3933773 2.52 4035275 98 89248 4161296 2.10 4250544 99 107204 4374346 2.39 4481550 100 78553 4007656 1.92 4086209 101 77539 3778738 2.01 3856277 102 82429 3904166 2.07 3986595 103 86275 3828963 2.20 3915238 104 135215 5219291 2.53 5354506 105 102924 5131456 1.97 5234380 106 86426 4065668 2.08 4152094 107 81620 3982963 2.01 4064583 108 75728 3672101 2.02 3747829 109 77520 3838169 1.98 3915689 110 88718 4178628 2.08 4267346 111 106716 4729963 2.21 4836679 112 117054 4799411 2.38 4916465 113 106823 5044319 2.07 5151142 114 125734 4966304 2.47 5092038 115 101133 5042517 1.97 5143650 116 103988 4772472 2.13 4876460 117 71544 3236134 2.16 3307678 118 67380 3347394 1.97 3414774 119 65238 3241536 1.97 3306774 120 105436 4441629 2.32 4547065 121 81381 3925042 2.03 4006423 122 86141 4646365 1.82 4732506 123 104413 4453280 2.29 4557693 124 65600 3304055 1.95 3369655 125 62703 3142511 1.96 3205214 126 71227 3212467 2.17 3283694 127 72209 3340199 2.12 3412408 128 85164 3907474 2.13 3992638 129 94285 4367880 2.11 4462165 130 66380 2992370 2.17 3058750 131 57742 2819999 2.01 2877741 132 74010 3096315 2.33 3170325 133 61619 2770080 2.18 2831699 134 55846 2736121 2.00 2791967 135 60053 2952294 1.99 3012347 136 55441 2699063 2.01 2754504 137 59958 2667615 2.20 2727573 138 56739 2642665 2.10 2699404 139 59393 2833994 2.05 2893387 140 90648 3513202 2.52 3603850 141 60754 2603402 2.28 2664156 142 61469 2601029 2.31 2662498 143 60774 2767720 2.15 2828494 144 164594 4626029 3.44 4790623 145 77619 2638814 2.86 2716433 146 57426 2735225 2.06 2792651 147 50372 2336372 2.11 2386744 148 44948 863142 4.95 908090 149 251053 1004140 20.00 1255193 150 449830 981495 31.43 1431325 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 227348 85246899 0.27 85474247 2 122587 420250 22.58 542837 3 749490 298331 71.53 1047821 4 36011 7602037 0.47 7638048 5 34262 5768027 0.59 5802289 6 34361 5340318 0.64 5374679 7 38358 6001503 0.64 6039861 8 61197 6068896 1.00 6130093 9 50562 9492617 0.53 9543179 10 43033 6335780 0.67 6378813 11 34405 5527901 0.62 5562306 12 34997 6533800 0.53 6568797 13 34767 6530315 0.53 6565082 14 31924 6101740 0.52 6133664 15 34386 6552610 0.52 6586996 16 41755 8949765 0.46 8991520 17 47976 7862969 0.61 7910945 18 36669 6409933 0.57 6446602 19 39228 7169079 0.54 7208307 20 35509 5864813 0.60 5900322 21 45911 7348157 0.62 7394068 22 46231 8299131 0.55 8345362 23 41252 6049653 0.68 6090905 24 40595 6130929 0.66 6171524 25 44023 6598806 0.66 6642829 26 38660 5987829 0.64 6026489 27 41112 6870387 0.59 6911499 28 44713 7661924 0.58 7706637 29 48038 7087604 0.67 7135642 30 40484 5969352 0.67 6009836 31 54855 9802664 0.56 9857519 32 32918 5573183 0.59 5606101 33 40302 5748086 0.70 5788388 34 61265 10877750 0.56 10939015 35 31870 5757450 0.55 5789320 36 40086 6448228 0.62 6488314 37 34768 6502625 0.53 6537393 38 41038 7938157 0.51 7979195 39 34757 6458151 0.54 6492908 40 34816 6119064 0.57 6153880 41 33836 6256411 0.54 6290247 42 33827 6260882 0.54 6294709 43 33888 6328408 0.53 6362296 44 32329 5828720 0.55 5861049 45 36475 6721185 0.54 6757660 46 32314 6094705 0.53 6127019 47 33301 6039217 0.55 6072518 48 32540 5805385 0.56 5837925 49 31862 5548717 0.57 5580579 50 33448 6062142 0.55 6095590 51 39909 7281284 0.55 7321193 52 29968 5275579 0.56 5305547 53 30958 5455331 0.56 5486289 54 33864 6119668 0.55 6153532 55 31356 5594802 0.56 5626158 56 29384 4981853 0.59 5011237 57 30297 5368333 0.56 5398630 58 32195 6084830 0.53 6117025 59 29515 5672388 0.52 5701903 60 28255 5008337 0.56 5036592 61 30771 5525020 0.55 5555791 62 28106 5319261 0.53 5347367 63 30133 5703822 0.53 5733955 64 29137 5133097 0.56 5162234 65 28459 4920424 0.58 4948883 66 28655 4885078 0.58 4913733 67 26399 4614884 0.57 4641283 68 28232 5182901 0.54 5211133 69 27191 4816245 0.56 4843436 70 26858 4890360 0.55 4917218 71 25456 4647883 0.54 4673339 72 27940 4953591 0.56 4981531 73 24635 4510701 0.54 4535336 74 26147 4894824 0.53 4920971 75 27743 5272565 0.52 5300308 76 24725 4352249 0.56 4376974 77 23944 4301116 0.55 4325060 78 26680 4893294 0.54 4919974 79 26118 5005371 0.52 5031489 80 22300 4000710 0.55 4023010 81 25724 4528750 0.56 4554474 82 24350 4412299 0.55 4436649 83 23780 4427940 0.53 4451720 84 25624 4523137 0.56 4548761 85 24438 4444732 0.55 4469170 86 27068 4936072 0.55 4963140 87 28029 4539351 0.61 4567380 88 26148 4770270 0.55 4796418 89 23397 4205545 0.55 4228942 90 24726 4322673 0.57 4347399 91 21704 3998870 0.54 4020574 92 21404 3819706 0.56 3841110 93 26154 4381094 0.59 4407248 94 27890 5889841 0.47 5917731 95 23334 4298398 0.54 4321732 96 25822 4322911 0.59 4348733 97 23951 4589825 0.52 4613776 98 20890 3944836 0.53 3965726 99 23370 4257012 0.55 4280382 100 23080 4161919 0.55 4184999 101 19454 3553599 0.54 3573053 102 21315 3852962 0.55 3874277 103 23813 4270379 0.55 4294192 104 22819 3851175 0.59 3873994 105 24547 4442959 0.55 4467506 106 21979 4095211 0.53 4117190 107 32446 6334518 0.51 6366964 108 21010 3816890 0.55 3837900 109 23338 3898789 0.60 3922127 110 22299 3856619 0.57 3878918 111 34827 7366115 0.47 7400942 112 17996 3442438 0.52 3460434 113 18527 3347055 0.55 3365582 114 27932 5209261 0.53 5237193 115 18203 3166645 0.57 3184848 116 20674 4766910 0.43 4787584 117 18886 3183879 0.59 3202765 118 18773 3368224 0.55 3386997 119 18591 3287441 0.56 3306032 120 30185 4017783 0.75 4047968 121 18359 3228296 0.57 3246655 122 18163 3416236 0.53 3434399 123 27117 4945537 0.55 4972654 124 18176 3221237 0.56 3239413 125 16943 3069504 0.55 3086447 126 19015 3058520 0.62 3077535 127 32357 3283422 0.98 3315779 128 30335 4399822 0.68 4430157 129 24024 4375870 0.55 4399894 130 16221 2662610 0.61 2678831 131 15711 2671964 0.58 2687675 132 17685 2932986 0.60 2950671 133 15899 2677052 0.59 2692951 134 14321 2474328 0.58 2488649 135 15772 2758805 0.57 2774577 136 26163 5210842 0.50 5237005 137 16584 2903103 0.57 2919687 138 17010 2681339 0.63 2698349 139 15189 2590702 0.58 2605891 140 13585 2329760 0.58 2343345 141 14749 2528260 0.58 2543009 142 14177 2380967 0.59 2395144 143 15350 2501534 0.61 2516884 144 53971 5414804 0.99 5468775 145 15148 2435247 0.62 2450395 146 15814 2573455 0.61 2589269 147 14105 2219764 0.63 2233869 148 10026 815518 1.21 825544 149 14824 993335 1.47 1008159 150 16507 1265460 1.29 1281967 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 66545 4877269 1.35 4943814 2 839777 16793875 4.76 17633652 3 759010 15185566 4.76 15944576 4 490748 23045476 2.09 23536224 5 391724 21597342 1.78 21989066 6 362073 24279666 1.47 24641739 7 362303 21903903 1.63 22266206 8 398747 22326320 1.75 22725067 9 375083 21081517 1.75 21456600 10 344422 21853536 1.55 22197958 11 373800 22064095 1.67 22437895 12 389752 24515539 1.56 24905291 13 425605 23727659 1.76 24153264 14 524265 21196251 2.41 21720516 15 333405 25016411 1.32 25349816 16 342638 21792802 1.55 22135440 17 350492 23612184 1.46 23962676 18 340550 24299050 1.38 24639600 19 372377 22571572 1.62 22943949 20 356989 22280337 1.58 22637326 21 381656 23716386 1.58 24098042 22 421724 23764072 1.74 24185796 23 394534 22354512 1.73 22749046 24 348209 23632402 1.45 23980611 25 493801 21834782 2.21 22328583 26 355172 21903201 1.60 22258373 27 337766 24206074 1.38 24543840 28 292690 22208139 1.30 22500829 29 276720 21050430 1.30 21327150 30 244709 22511842 1.08 22756551 31 237555 21346110 1.10 21583665 32 212042 20483898 1.02 20695940 33 156688 20887726 0.74 21044414 34 149835 20608238 0.72 20758073 35 145657 21167249 0.68 21312906 36 125695 20706499 0.60 20832194 37 133958 22854041 0.58 22987999 38 127220 21507511 0.59 21634731 39 120479 19910826 0.60 20031305 40 113837 20473206 0.55 20587043 41 110345 19462730 0.56 19573075 42 107375 19684198 0.54 19791573 43 110914 20879221 0.53 20990135 44 109245 20849213 0.52 20958458 45 106324 20521940 0.52 20628264 46 105813 19556927 0.54 19662740 47 103146 19027530 0.54 19130676 48 101884 20728866 0.49 20830750 49 98162 20541123 0.48 20639285 50 103054 19467873 0.53 19570927 51 105341 20079040 0.52 20184381 52 88634 17402743 0.51 17491377 53 92969 18376705 0.50 18469674 54 101334 19679204 0.51 19780538 55 93402 18639162 0.50 18732564 56 90433 17906717 0.50 17997150 57 91641 18038852 0.51 18130493 58 93024 18513389 0.50 18606413 59 87165 16720912 0.52 16808077 60 88722 17805737 0.50 17894459 61 82015 16544461 0.49 16626476 62 88950 17616847 0.50 17705797 63 90401 18872145 0.48 18962546 64 84377 16509287 0.51 16593664 65 83298 17251736 0.48 17335034 66 84056 16557314 0.51 16641370 67 84595 17608338 0.48 17692933 68 83933 17351553 0.48 17435486 69 81196 16669776 0.48 16750972 70 90543 18971706 0.47 19062249 71 79262 15283497 0.52 15362759 72 87239 17639228 0.49 17726467 73 84060 17304935 0.48 17388995 74 77007 15384397 0.50 15461404 75 86884 17929988 0.48 18016872 76 80283 16533285 0.48 16613568 77 81782 17095750 0.48 17177532 78 81777 16962128 0.48 17043905 79 78240 15313186 0.51 15391426 80 76998 16829714 0.46 16906712 81 71272 14729442 0.48 14800714 82 77837 16335532 0.47 16413369 83 75910 15449174 0.49 15525084 84 71013 14435131 0.49 14506144 85 69512 14593414 0.47 14662926 86 71985 14148297 0.51 14220282 87 67157 13563686 0.49 13630843 88 66675 13858755 0.48 13925430 89 68509 13885935 0.49 13954444 90 69720 14385556 0.48 14455276 91 70629 14864618 0.47 14935247 92 65784 13359598 0.49 13425382 93 66418 13479217 0.49 13545635 94 64346 13413055 0.48 13477401 95 63945 13212363 0.48 13276308 96 69175 14583400 0.47 14652575 97 66710 14129330 0.47 14196040 98 62839 12551179 0.50 12614018 99 66836 13959568 0.48 14026404 100 60945 12583350 0.48 12644295 101 64477 13823852 0.46 13888329 102 65416 13148572 0.50 13213988 103 59433 11891572 0.50 11951005 104 61969 11986710 0.51 12048679 105 73933 14366635 0.51 14440568 106 58036 12025150 0.48 12083186 107 65871 13637980 0.48 13703851 108 71802 15022107 0.48 15093909 109 59118 12053511 0.49 12112629 110 63057 12535572 0.50 12598629 111 57864 11838307 0.49 11896171 112 55599 11744256 0.47 11799855 113 55717 11333263 0.49 11388980 114 54436 11180269 0.48 11234705 115 62634 13184478 0.47 13247112 116 76339 12440946 0.61 12517285 117 59288 12472390 0.47 12531678 118 62023 13329534 0.46 13391557 119 54560 10738224 0.51 10792784 120 53884 10389054 0.52 10442938 121 57299 11295053 0.50 11352352 122 54518 10982023 0.49 11036541 123 53192 11316162 0.47 11369354 124 51096 11130175 0.46 11181271 125 47445 9323228 0.51 9370673 126 47441 9503198 0.50 9550639 127 55821 11238962 0.49 11294783 128 52411 10588854 0.49 10641265 129 47706 9622514 0.49 9670220 130 54447 11838887 0.46 11893334 131 47683 9576369 0.50 9624052 132 51388 10204675 0.50 10256063 133 50963 10420915 0.49 10471878 134 45220 8823557 0.51 8868777 135 45701 8616643 0.53 8662344 136 42025 8468830 0.49 8510855 137 50472 9945252 0.50 9995724 138 44753 8808023 0.51 8852776 139 50135 10183946 0.49 10234081 140 43624 8364862 0.52 8408486 141 45998 8455522 0.54 8501520 142 46230 8364168 0.55 8410398 143 46592 9209770 0.50 9256362 144 44341 8239946 0.54 8284287 145 43980 8040622 0.54 8084602 146 49475 7727080 0.64 7776555 147 41766 7771126 0.53 7812892 148 25305 2534894 0.99 2560199 149 19003 2486754 0.76 2505757 150 29336 3693308 0.79 3722644 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1673207 29539226 5.36 31212433 2 905353 63757 93.42 969110 3 25620 1305487 1.92 1331107 4 34774 2413156 1.42 2447930 5 36924 1878361 1.93 1915285 6 37666 1847216 2.00 1884882 7 39260 1984807 1.94 2024067 8 43447 2014202 2.11 2057649 9 67674 2031888 3.22 2099562 10 68905 2058344 3.24 2127249 11 37389 2135700 1.72 2173089 12 39624 2180110 1.79 2219734 13 36177 2101030 1.69 2137207 14 37642 2072930 1.78 2110572 15 69791 2191026 3.09 2260817 16 222307 2276983 8.89 2499290 17 43767 1981322 2.16 2025089 18 32389 1901545 1.67 1933934 19 34901 1942635 1.76 1977536 20 36205 1979486 1.80 2015691 21 34552 1982468 1.71 2017020 22 33671 1861599 1.78 1895270 23 35395 1881106 1.85 1916501 24 29316 1678033 1.72 1707349 25 30645 1828792 1.65 1859437 26 30135 1772591 1.67 1802726 27 28865 1715197 1.66 1744062 28 27045 1676074 1.59 1703119 29 29935 1784548 1.65 1814483 30 29218 1777825 1.62 1807043 31 33997 1951579 1.71 1985576 32 27520 1588328 1.70 1615848 33 31764 1821740 1.71 1853504 34 27287 1753509 1.53 1780796 35 25026 1511505 1.63 1536531 36 25353 1479968 1.68 1505321 37 26212 1649624 1.56 1675836 38 24940 1638622 1.50 1663562 39 24800 1538292 1.59 1563092 40 28758 1692850 1.67 1721608 41 25677 1506962 1.68 1532639 42 24923 1514172 1.62 1539095 43 26560 1547156 1.69 1573716 44 24918 1441664 1.70 1466582 45 22827 1298036 1.73 1320863 46 21781 1334091 1.61 1355872 47 22204 1425014 1.53 1447218 48 22608 1456495 1.53 1479103 49 21678 1377081 1.55 1398759 50 21225 1344676 1.55 1365901 51 23631 1535148 1.52 1558779 52 20600 1364384 1.49 1384984 53 21022 1280693 1.61 1301715 54 19624 1277148 1.51 1296772 55 19910 1278573 1.53 1298483 56 19968 1256784 1.56 1276752 57 20353 1240434 1.61 1260787 58 23246 1346671 1.70 1369917 59 18791 1234644 1.50 1253435 60 17991 1165210 1.52 1183201 61 18255 1196576 1.50 1214831 62 17435 1146930 1.50 1164365 63 17715 1194923 1.46 1212638 64 16962 1168409 1.43 1185371 65 16703 1125045 1.46 1141748 66 16802 1090656 1.52 1107458 67 17235 1179235 1.44 1196470 68 16400 1097084 1.47 1113484 69 16493 1049624 1.55 1066117 70 16873 1091412 1.52 1108285 71 17008 1090510 1.54 1107518 72 17436 1079485 1.59 1096921 73 16952 1098886 1.52 1115838 74 17466 1070871 1.60 1088337 75 15729 1067675 1.45 1083404 76 15141 988040 1.51 1003181 77 14355 941372 1.50 955727 78 13555 911766 1.46 925321 79 13614 866255 1.55 879869 80 13007 879622 1.46 892629 81 13390 930800 1.42 944190 82 15161 1163536 1.29 1178697 83 13240 973246 1.34 986486 84 12792 948090 1.33 960882 85 14850 937610 1.56 952460 86 14246 1022750 1.37 1036996 87 13698 978844 1.38 992542 88 18963 909022 2.04 927985 89 11999 855214 1.38 867213 90 12252 849745 1.42 861997 91 12113 778262 1.53 790375 92 11942 888175 1.33 900117 93 11738 878009 1.32 889747 94 13888 1003967 1.36 1017855 95 11512 809776 1.40 821288 96 10798 757086 1.41 767884 97 10248 719813 1.40 730061 98 10441 708199 1.45 718640 99 11005 837642 1.30 848647 100 10662 773435 1.36 784097 101 10073 702453 1.41 712526 102 9603 735049 1.29 744652 103 10150 772959 1.30 783109 104 11065 694672 1.57 705737 105 9926 744435 1.32 754361 106 9018 703187 1.27 712205 107 9296 656182 1.40 665478 108 9833 698046 1.39 707879 109 9918 754647 1.30 764565 110 9638 670510 1.42 680148 111 9343 676286 1.36 685629 112 12128 779982 1.53 792110 113 8982 664036 1.33 673018 114 11645 792559 1.45 804204 115 8733 686955 1.26 695688 116 10693 655079 1.61 665772 117 7821 580368 1.33 588189 118 7654 573828 1.32 581482 119 7896 582567 1.34 590463 120 9334 626911 1.47 636245 121 23228 610601 3.66 633829 122 9269 615439 1.48 624708 123 7593 591398 1.27 598991 124 7664 614924 1.23 622588 125 8132 545070 1.47 553202 126 7377 533587 1.36 540964 127 8947 579756 1.52 588703 128 19561 532404 3.54 551965 129 9065 601163 1.49 610228 130 7533 518343 1.43 525876 131 6844 483221 1.40 490065 132 6460 480389 1.33 486849 133 6751 493175 1.35 499926 134 7125 503466 1.40 510591 135 6941 506870 1.35 513811 136 7123 533922 1.32 541045 137 6983 530419 1.30 537402 138 6879 510952 1.33 517831 139 9022 607367 1.46 616389 140 6085 485291 1.24 491376 141 5858 503670 1.15 509528 142 5792 492873 1.16 498665 143 6226 506558 1.21 512784 144 15763 623134 2.47 638897 145 60760 443359 12.05 504119 146 5516 424063 1.28 429579 147 5851 396333 1.45 402184 148 5097 237699 2.10 242796 149 2731 219571 1.23 222302 150 2400 218600 1.09 221000 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 94113 27324764 0.34 27418877 2 57776 171573 25.19 229349 3 272086 112995 70.66 385081 4 11995 2556046 0.47 2568041 5 12060 1854442 0.65 1866502 6 13021 2279127 0.57 2292148 7 14155 1918301 0.73 1932456 8 33500 1791187 1.84 1824687 9 13602 2284850 0.59 2298452 10 14507 2082239 0.69 2096746 11 10220 1837065 0.55 1847285 12 9695 1877083 0.51 1886778 13 11212 2171906 0.51 2183118 14 10066 2181773 0.46 2191839 15 9613 1832076 0.52 1841689 16 10669 2101298 0.51 2111967 17 10023 2006639 0.50 2016662 18 9845 1980268 0.49 1990113 19 9727 2056397 0.47 2066124 20 9251 1807102 0.51 1816353 21 9896 1916401 0.51 1926297 22 9609 1945570 0.49 1955179 23 8587 1646898 0.52 1655485 24 8334 1638879 0.51 1647213 25 8150 1641014 0.49 1649164 26 8711 1824855 0.48 1833566 27 8493 1735643 0.49 1744136 28 7983 1594472 0.50 1602455 29 8008 1628774 0.49 1636782 30 8278 1674826 0.49 1683104 31 7935 1643743 0.48 1651678 32 7365 1431176 0.51 1438541 33 7603 1516723 0.50 1524326 34 8922 1885097 0.47 1894019 35 7693 1525273 0.50 1532966 36 8105 1598331 0.50 1606436 37 7791 1609827 0.48 1617618 38 7983 1672925 0.47 1680908 39 7346 1469838 0.50 1477184 40 7561 1511066 0.50 1518627 41 7128 1449634 0.49 1456762 42 6682 1327857 0.50 1334539 43 7504 1502109 0.50 1509613 44 7127 1518169 0.47 1525296 45 7198 1476442 0.49 1483640 46 7637 1560763 0.49 1568400 47 6953 1353623 0.51 1360576 48 6385 1333232 0.48 1339617 49 6390 1268993 0.50 1275383 50 6357 1370091 0.46 1376448 51 6248 1309952 0.47 1316200 52 6201 1318832 0.47 1325033 53 6438 1321086 0.48 1327524 54 6207 1276729 0.48 1282936 55 6210 1294962 0.48 1301172 56 6031 1241830 0.48 1247861 57 5992 1274412 0.47 1280404 58 6522 1371610 0.47 1378132 59 5311 1083719 0.49 1089030 60 5387 1107224 0.48 1112611 61 5140 1073685 0.48 1078825 62 5467 1118117 0.49 1123584 63 5756 1186149 0.48 1191905 64 5654 1218725 0.46 1224379 65 5703 1155995 0.49 1161698 66 5296 1099211 0.48 1104507 67 5365 1123942 0.48 1129307 68 5402 1136426 0.47 1141828 69 4890 1025561 0.47 1030451 70 4851 985264 0.49 990115 71 4882 1008683 0.48 1013565 72 4889 1041583 0.47 1046472 73 4658 922306 0.50 926964 74 4781 998033 0.48 1002814 75 4836 1007067 0.48 1011903 76 4780 994018 0.48 998798 77 4246 959935 0.44 964181 78 4539 965807 0.47 970346 79 4523 959469 0.47 963992 80 4256 880192 0.48 884448 81 5011 1101616 0.45 1106627 82 4333 936141 0.46 940474 83 4358 923458 0.47 927816 84 4710 960986 0.49 965696 85 4135 886009 0.46 890144 86 3625 780462 0.46 784087 87 4113 884184 0.46 888297 88 3863 844949 0.46 848812 89 3797 810231 0.47 814028 90 3720 786784 0.47 790504 91 4100 957360 0.43 961460 92 3455 734242 0.47 737697 93 4004 826574 0.48 830578 94 3829 860367 0.44 864196 95 3445 739474 0.46 742919 96 3777 819369 0.46 823146 97 4185 926827 0.45 931012 98 3347 720052 0.46 723399 99 3658 761990 0.48 765648 100 3404 729601 0.46 733005 101 3367 698408 0.48 701775 102 3367 726831 0.46 730198 103 3693 803930 0.46 807623 104 3437 768953 0.44 772390 105 3262 698182 0.47 701444 106 3514 748801 0.47 752315 107 3371 707866 0.47 711237 108 2815 598900 0.47 601715 109 3135 710666 0.44 713801 110 2822 639567 0.44 642389 111 4326 973119 0.44 977445 112 2982 637760 0.47 640742 113 2705 568064 0.47 570769 114 3490 820401 0.42 823891 115 2840 618570 0.46 621410 116 2617 582262 0.45 584879 117 2541 575771 0.44 578312 118 2584 581790 0.44 584374 119 2597 611056 0.42 613653 120 3480 638543 0.54 642023 121 3550 619546 0.57 623096 122 2462 538899 0.45 541361 123 3017 638896 0.47 641913 124 2435 571996 0.42 574431 125 2256 466119 0.48 468375 126 2475 515452 0.48 517927 127 2695 531493 0.50 534188 128 23518 508000 4.42 531518 129 2233 497272 0.45 499505 130 2281 496824 0.46 499105 131 2575 578607 0.44 581182 132 2305 470372 0.49 472677 133 2331 487097 0.48 489428 134 2205 465958 0.47 468163 135 2562 563955 0.45 566517 136 2464 527914 0.46 530378 137 2066 439347 0.47 441413 138 2203 486210 0.45 488413 139 1952 420832 0.46 422784 140 2627 573727 0.46 576354 141 2066 437678 0.47 439744 142 1900 430451 0.44 432351 143 2443 514558 0.47 517001 144 3031 509338 0.59 512369 145 2132 411382 0.52 413514 146 1826 428524 0.42 430350 147 1608 385889 0.41 387497 148 1455 215403 0.67 216858 149 1005 213621 0.47 214626 150 906 195820 0.46 196726 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 50690 1806894 2.73 1857584 2 105798 4856526 2.13 4962324 3 83367 4709641 1.74 4793008 4 52511 8148251 0.64 8200762 5 77452 7193131 1.07 7270583 6 43105 7515758 0.57 7558863 7 40335 7484911 0.54 7525246 8 47359 7424412 0.63 7471771 9 46693 7173439 0.65 7220132 10 41660 7117084 0.58 7158744 11 37660 7327603 0.51 7365263 12 49798 7191796 0.69 7241594 13 76547 7472624 1.01 7549171 14 37274 6613805 0.56 6651079 15 36287 6981231 0.52 7017518 16 34170 6855212 0.50 6889382 17 34990 6846867 0.51 6881857 18 35029 7040639 0.50 7075668 19 34449 6712743 0.51 6747192 20 32439 6316295 0.51 6348734 21 32578 6460347 0.50 6492925 22 32955 6622017 0.50 6654972 23 30636 6030936 0.51 6061572 24 31642 6367821 0.49 6399463 25 31986 6589736 0.48 6621722 26 29653 5966710 0.49 5996363 27 29796 6077122 0.49 6106918 28 30157 6105386 0.49 6135543 29 28811 5884087 0.49 5912898 30 30129 6082409 0.49 6112538 31 28101 5684356 0.49 5712457 32 28068 5481301 0.51 5509369 33 28071 5843079 0.48 5871150 34 29537 5936024 0.50 5965561 35 27766 5624772 0.49 5652538 36 28422 5634546 0.50 5662968 37 26482 5388762 0.49 5415244 38 26234 5287679 0.49 5313913 39 25870 5357761 0.48 5383631 40 25323 5168635 0.49 5193958 41 25629 5234929 0.49 5260558 42 25155 5121207 0.49 5146362 43 25542 5242453 0.48 5267995 44 24066 4892830 0.49 4916896 45 25349 5280684 0.48 5306033 46 23870 4896115 0.49 4919985 47 24048 4879830 0.49 4903878 48 23569 4943058 0.47 4966627 49 24298 5055769 0.48 5080067 50 22933 4790443 0.48 4813376 51 22553 4662273 0.48 4684826 52 22713 4612823 0.49 4635536 53 22200 4522811 0.49 4545011 54 21486 4483584 0.48 4505070 55 21734 4543560 0.48 4565294 56 20996 4344051 0.48 4365047 57 21267 4373864 0.48 4395131 58 20933 4364172 0.48 4385105 59 19866 4068007 0.49 4087873 60 20578 4318724 0.47 4339302 61 20771 4355703 0.47 4376474 62 20783 4327727 0.48 4348510 63 21385 4460654 0.48 4482039 64 19299 3950489 0.49 3969788 65 19086 3955385 0.48 3974471 66 18902 4056993 0.46 4075895 67 19753 4230668 0.46 4250421 68 17832 3824684 0.46 3842516 69 18252 3811577 0.48 3829829 70 18956 4106288 0.46 4125244 71 17778 3790823 0.47 3808601 72 18682 4048271 0.46 4066953 73 17725 3784620 0.47 3802345 74 17116 3585251 0.48 3602367 75 17533 3724082 0.47 3741615 76 17828 3776617 0.47 3794445 77 17062 3643693 0.47 3660755 78 16831 3573497 0.47 3590328 79 16122 3413430 0.47 3429552 80 15835 3545629 0.44 3561464 81 15304 3270509 0.47 3285813 82 15570 3358386 0.46 3373956 83 15601 3265110 0.48 3280711 84 14669 3192791 0.46 3207460 85 14783 3252265 0.45 3267048 86 14460 3127287 0.46 3141747 87 15042 3163406 0.47 3178448 88 15498 3241284 0.48 3256782 89 14210 3068305 0.46 3082515 90 14381 3056055 0.47 3070436 91 13813 2982894 0.46 2996707 92 14095 2970245 0.47 2984340 93 13738 2981651 0.46 2995389 94 13453 2910657 0.46 2924110 95 13484 2926463 0.46 2939947 96 13709 2932736 0.47 2946445 97 13207 2750831 0.48 2764038 98 12744 2787130 0.46 2799874 99 12829 2870440 0.44 2883269 100 12923 2820855 0.46 2833778 101 12716 2711663 0.47 2724379 102 12266 2645142 0.46 2657408 103 12048 2651364 0.45 2663412 104 12026 2658902 0.45 2670928 105 12883 2720980 0.47 2733863 106 11810 2526218 0.47 2538028 107 12530 2652612 0.47 2665142 108 11989 2550644 0.47 2562633 109 11380 2477184 0.46 2488564 110 10848 2372730 0.46 2383578 111 11129 2381318 0.47 2392447 112 10762 2428259 0.44 2439021 113 10780 2314552 0.46 2325332 114 10779 2307312 0.46 2318091 115 11454 2578656 0.44 2590110 116 10628 2243988 0.47 2254616 117 10276 2217956 0.46 2228232 118 10849 2398877 0.45 2409726 119 10070 2153968 0.47 2164038 120 10035 2087499 0.48 2097534 121 9831 2135843 0.46 2145674 122 11270 2188096 0.51 2199366 123 9611 2122743 0.45 2132354 124 9547 2221936 0.43 2231483 125 8904 1934318 0.46 1943222 126 9188 2002634 0.46 2011822 127 10904 2062983 0.53 2073887 128 8898 1917968 0.46 1926866 129 9209 1970194 0.47 1979403 130 9707 2158682 0.45 2168389 131 8750 1807635 0.48 1816385 132 9156 2050873 0.44 2060029 133 8376 1881751 0.44 1890127 134 8361 1904205 0.44 1912566 135 8138 1784319 0.45 1792457 136 7937 1685913 0.47 1693850 137 8151 1826694 0.44 1834845 138 8104 1732325 0.47 1740429 139 9738 1690593 0.57 1700331 140 7473 1630583 0.46 1638056 141 7224 1613256 0.45 1620480 142 7356 1581629 0.46 1588985 143 7637 1643060 0.46 1650697 144 7211 1593452 0.45 1600663 145 7326 1627746 0.45 1635072 146 7464 1617844 0.46 1625308 147 6561 1547308 0.42 1553869 148 5545 831836 0.66 837381 149 4375 783996 0.55 788371 150 3705 749314 0.49 753019