CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 114783 4187257 2.67 4302040 2 49715 1537 97.00 51252 3 2260 392659 0.57 394919 4 2817 612899 0.46 615716 5 4227 550262 0.76 554489 6 5252 618166 0.84 623418 7 3666 614631 0.59 618297 8 7733 631707 1.21 639440 9 11744 685446 1.68 697190 10 4846 699284 0.69 704130 11 5991 662134 0.90 668125 12 4960 722625 0.68 727585 13 3955 725123 0.54 729078 14 7674 640356 1.18 648030 15 4395 737023 0.59 741418 16 8753 734695 1.18 743448 17 5176 638503 0.80 643679 18 3706 707113 0.52 710819 19 5405 713296 0.75 718701 20 5173 670715 0.77 675888 21 5651 740386 0.76 746037 22 4746 736967 0.64 741713 23 3575 643611 0.55 647186 24 4360 698959 0.62 703319 25 3977 695045 0.57 699022 26 3675 654987 0.56 658662 27 4544 723658 0.62 728202 28 3621 686723 0.52 690344 29 3497 640266 0.54 643763 30 4260 729475 0.58 733735 31 4045 697220 0.58 701265 32 3555 625501 0.57 629056 33 4115 694586 0.59 698701 34 3683 668726 0.55 672409 35 3629 628516 0.57 632145 36 4091 703248 0.58 707339 37 3759 682349 0.55 686108 38 3459 617564 0.56 621023 39 4042 669816 0.60 673858 40 3543 652876 0.54 656419 41 3546 605235 0.58 608781 42 4158 665636 0.62 669794 43 3441 636899 0.54 640340 44 3460 589002 0.58 592462 45 3842 647348 0.59 651190 46 3490 626941 0.55 630431 47 3205 570565 0.56 573770 48 4131 638557 0.64 642688 49 3380 603939 0.56 607319 50 2946 551792 0.53 554738 51 3759 594444 0.63 598203 52 3407 572222 0.59 575629 53 3055 529739 0.57 532794 54 3681 595100 0.61 598781 55 3395 572246 0.59 575641 56 3265 530851 0.61 534116 57 3676 597735 0.61 601411 58 3274 557424 0.58 560698 59 2952 505260 0.58 508212 60 3308 564032 0.58 567340 61 3440 555627 0.62 559067 62 2890 506696 0.57 509586 63 3839 568725 0.67 572564 64 3141 521788 0.60 524929 65 2758 468386 0.59 471144 66 3398 533348 0.63 536746 67 2932 513100 0.57 516032 68 2722 480883 0.56 483605 69 3342 530097 0.63 533439 70 2810 501772 0.56 504582 71 2739 466459 0.58 469198 72 3163 508904 0.62 512067 73 2862 480193 0.59 483055 74 2764 436767 0.63 439531 75 3042 472911 0.64 475953 76 2827 465428 0.60 468255 77 2500 425055 0.58 427555 78 2814 477217 0.59 480031 79 2885 465075 0.62 467960 80 2678 426574 0.62 429252 81 3226 469413 0.68 472639 82 2638 436347 0.60 438985 83 2366 405634 0.58 408000 84 2952 440894 0.67 443846 85 2403 412124 0.58 414527 86 2243 388803 0.57 391046 87 2744 427191 0.64 429935 88 2581 419153 0.61 421734 89 2390 386150 0.62 388540 90 2777 427204 0.65 429981 91 2443 405695 0.60 408138 92 2533 386766 0.65 389299 93 2677 428908 0.62 431585 94 2532 400951 0.63 403483 95 2337 357261 0.65 359598 96 2713 398037 0.68 400750 97 2429 380774 0.63 383203 98 2237 354677 0.63 356914 99 2679 383502 0.69 386181 100 2115 349075 0.60 351190 101 2088 335612 0.62 337700 102 2511 371217 0.67 373728 103 2164 352144 0.61 354308 104 2090 324650 0.64 326740 105 2513 363990 0.69 366503 106 2119 342458 0.61 344577 107 2115 319338 0.66 321453 108 2370 346104 0.68 348474 109 2092 317733 0.65 319825 110 1907 303915 0.62 305822 111 2229 332978 0.66 335207 112 1998 309434 0.64 311432 113 1931 298614 0.64 300545 114 2338 331601 0.70 333939 115 2152 316954 0.67 319106 116 1845 285756 0.64 287601 117 2168 312142 0.69 314310 118 1945 295652 0.65 297597 119 1730 262081 0.66 263811 120 2165 291555 0.74 293720 121 1779 275560 0.64 277339 122 1700 272093 0.62 273793 123 2063 303373 0.68 305436 124 1917 286384 0.66 288301 125 1871 256090 0.73 257961 126 2015 277323 0.72 279338 127 1698 267457 0.63 269155 128 1604 246300 0.65 247904 129 1805 263821 0.68 265626 130 1635 248094 0.65 249729 131 1575 235251 0.67 236826 132 1796 259633 0.69 261429 133 1660 239495 0.69 241155 134 1645 228757 0.71 230402 135 1732 250421 0.69 252153 136 1587 229485 0.69 231072 137 1350 216155 0.62 217505 138 1778 238492 0.74 240270 139 1573 230595 0.68 232168 140 1834 209200 0.87 211034 141 2003 230983 0.86 232986 142 2072 224262 0.92 226334 143 1715 203721 0.83 205436 144 2006 227381 0.87 229387 145 1788 209609 0.85 211397 146 1753 195405 0.89 197158 147 2018 206717 0.97 208735 148 1433 71951 1.95 73384 149 11741 85969 12.02 97710 150 13389 78918 14.50 92307 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 281 4525607 0.01 4525888 2 7363 3339 68.80 10702 3 42656 11271 79.10 53927 4 1957 484748 0.40 486705 5 2077 435038 0.48 437115 6 2594 471282 0.55 473876 7 2689 446710 0.60 449399 8 3563 577187 0.61 580750 9 3481 517409 0.67 520890 10 3248 517632 0.62 520880 11 3193 591400 0.54 594593 12 3490 575496 0.60 578986 13 3690 605050 0.61 608740 14 2719 568881 0.48 571600 15 3025 566891 0.53 569916 16 2942 590985 0.50 593927 17 2882 575587 0.50 578469 18 3733 559718 0.66 563451 19 6307 568411 1.10 574718 20 4931 575597 0.85 580528 21 4107 586114 0.70 590221 22 3521 561391 0.62 564912 23 3075 555368 0.55 558443 24 3025 558592 0.54 561617 25 3034 581369 0.52 584403 26 2693 554818 0.48 557511 27 2818 536410 0.52 539228 28 2704 568429 0.47 571133 29 2672 557327 0.48 559999 30 3005 569610 0.52 572615 31 2735 559460 0.49 562195 32 2639 535338 0.49 537977 33 3012 562827 0.53 565839 34 2722 553215 0.49 555937 35 2690 530216 0.50 532906 36 2718 541981 0.50 544699 37 2575 544021 0.47 546596 38 2648 566486 0.47 569134 39 2715 545956 0.49 548671 40 2539 499283 0.51 501822 41 2377 510060 0.46 512437 42 2646 519063 0.51 521709 43 2372 500787 0.47 503159 44 2314 497179 0.46 499493 45 2659 518729 0.51 521388 46 2402 500158 0.48 502560 47 2547 482286 0.53 484833 48 2792 525272 0.53 528064 49 2262 471153 0.48 473415 50 2486 492331 0.50 494817 51 2512 498001 0.50 500513 52 2299 456900 0.50 459199 53 2414 473950 0.51 476364 54 2478 471237 0.52 473715 55 2217 456743 0.48 458960 56 2298 464921 0.49 467219 57 2523 482050 0.52 484573 58 2282 442759 0.51 445041 59 2326 441461 0.52 443787 60 2288 441448 0.52 443736 61 2185 439702 0.49 441887 62 2023 427572 0.47 429595 63 2496 451933 0.55 454429 64 2153 420837 0.51 422990 65 2112 424045 0.50 426157 66 2335 411171 0.56 413506 67 2218 432344 0.51 434562 68 2010 416205 0.48 418215 69 2116 414298 0.51 416414 70 1980 409345 0.48 411325 71 2156 427505 0.50 429661 72 2015 410098 0.49 412113 73 2026 375752 0.54 377778 74 2068 394382 0.52 396450 75 1941 380344 0.51 382285 76 1982 388890 0.51 390872 77 2034 384427 0.53 386461 78 1979 374441 0.53 376420 79 1835 369167 0.49 371002 80 2027 366566 0.55 368593 81 2019 367686 0.55 369705 82 1805 349512 0.51 351317 83 1911 356604 0.53 358515 84 1849 355249 0.52 357098 85 1802 348040 0.52 349842 86 1764 341078 0.51 342842 87 1804 339819 0.53 341623 88 1794 333395 0.54 335189 89 1716 342590 0.50 344306 90 1856 350292 0.53 352148 91 1648 324643 0.51 326291 92 1953 338912 0.57 340865 93 1736 324713 0.53 326449 94 1605 312055 0.51 313660 95 1654 308222 0.53 309876 96 1685 324498 0.52 326183 97 1488 299062 0.50 300550 98 1558 302130 0.51 303688 99 1685 312513 0.54 314198 100 1502 285361 0.52 286863 101 1683 290177 0.58 291860 102 1650 288711 0.57 290361 103 1385 273570 0.50 274955 104 1590 284555 0.56 286145 105 1598 285032 0.56 286630 106 1509 274609 0.55 276118 107 1577 281279 0.56 282856 108 1666 284814 0.58 286480 109 1385 262080 0.53 263465 110 1560 280510 0.55 282070 111 1491 275793 0.54 277284 112 1421 252160 0.56 253581 113 1395 256180 0.54 257575 114 1460 261115 0.56 262575 115 1357 254121 0.53 255478 116 1306 237199 0.55 238505 117 1437 237707 0.60 239144 118 1298 225288 0.57 226586 119 1338 234231 0.57 235569 120 1343 238085 0.56 239428 121 1095 216887 0.50 217982 122 1223 238533 0.51 239756 123 1252 235485 0.53 236737 124 1275 221764 0.57 223039 125 1200 218637 0.55 219837 126 1338 222278 0.60 223616 127 1177 220170 0.53 221347 128 1177 208386 0.56 209563 129 1283 202467 0.63 203750 130 1168 203165 0.57 204333 131 1183 201524 0.58 202707 132 1289 206173 0.62 207462 133 1115 193986 0.57 195101 134 1206 210674 0.57 211880 135 1121 197699 0.56 198820 136 1023 190934 0.53 191957 137 1114 188532 0.59 189646 138 1241 194143 0.64 195384 139 942 177128 0.53 178070 140 1131 185557 0.61 186688 141 1208 187671 0.64 188879 142 1060 185491 0.57 186551 143 976 164398 0.59 165374 144 1171 191650 0.61 192821 145 1107 173816 0.63 174923 146 1031 161448 0.63 162479 147 1116 170082 0.65 171198 148 724 51541 1.39 52265 149 557 62201 0.89 62758 150 760 90970 0.83 91730 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 485 13681 3.42 14166 2 32819 827009 3.82 859828 3 27591 666490 3.98 694081 4 21505 1166738 1.81 1188243 5 17136 934437 1.80 951573 6 22977 1014291 2.22 1037268 7 14301 1014695 1.39 1028996 8 26467 952375 2.70 978842 9 21528 1039827 2.03 1061355 10 19542 1061515 1.81 1081057 11 18561 978835 1.86 997396 12 16483 1057102 1.54 1073585 13 21880 1085293 1.98 1107173 14 25605 933948 2.67 959553 15 26295 1061651 2.42 1087946 16 16127 1079411 1.47 1095538 17 23651 948104 2.43 971755 18 27402 1083439 2.47 1110841 19 22352 1081780 2.02 1104132 20 21144 923953 2.24 945097 21 13537 1045903 1.28 1059440 22 8926 1034203 0.86 1043129 23 7434 902665 0.82 910099 24 6382 1022794 0.62 1029176 25 13559 1038476 1.29 1052035 26 4525 879488 0.51 884013 27 5107 1012035 0.50 1017142 28 4873 1027679 0.47 1032552 29 4520 873241 0.51 877761 30 4524 975528 0.46 980052 31 4461 987810 0.45 992271 32 3922 858867 0.45 862789 33 4450 963218 0.46 967668 34 4465 976881 0.45 981346 35 3947 853649 0.46 857596 36 4096 924979 0.44 929075 37 4337 931149 0.46 935486 38 3916 837492 0.47 841408 39 4174 919874 0.45 924048 40 4251 915834 0.46 920085 41 3890 824805 0.47 828695 42 4087 913319 0.45 917406 43 4016 896809 0.45 900825 44 4013 805810 0.50 809823 45 3954 884438 0.45 888392 46 3681 867697 0.42 871378 47 3599 791677 0.45 795276 48 4104 856713 0.48 860817 49 3774 855644 0.44 859418 50 3663 768501 0.47 772164 51 3884 836879 0.46 840763 52 3636 836257 0.43 839893 53 3608 750442 0.48 754050 54 3603 821365 0.44 824968 55 3491 800454 0.43 803945 56 3474 727512 0.48 730986 57 3718 799151 0.46 802869 58 3639 789264 0.46 792903 59 3348 713782 0.47 717130 60 3627 777206 0.46 780833 61 3374 756934 0.44 760308 62 3231 676959 0.48 680190 63 3493 743396 0.47 746889 64 3367 752241 0.45 755608 65 3235 669703 0.48 672938 66 3260 739320 0.44 742580 67 3345 726677 0.46 730022 68 3152 647429 0.48 650581 69 3400 725498 0.47 728898 70 3324 723761 0.46 727085 71 3032 628743 0.48 631775 72 3136 704701 0.44 707837 73 3130 678457 0.46 681587 74 2915 617097 0.47 620012 75 3167 691805 0.46 694972 76 2964 663964 0.44 666928 77 2742 584632 0.47 587374 78 3064 650944 0.47 654008 79 3068 649619 0.47 652687 80 2758 579493 0.47 582251 81 2728 623105 0.44 625833 82 3016 636855 0.47 639871 83 2713 571910 0.47 574623 84 2837 623925 0.45 626762 85 2775 618045 0.45 620820 86 2774 553596 0.50 556370 87 2802 591881 0.47 594683 88 2676 591792 0.45 594468 89 2551 530129 0.48 532680 90 2741 572752 0.48 575493 91 2754 576247 0.48 579001 92 2429 501275 0.48 503704 93 2609 558608 0.46 561217 94 2660 554558 0.48 557218 95 2373 497221 0.47 499594 96 2702 567202 0.47 569904 97 2607 543844 0.48 546451 98 2357 481367 0.49 483724 99 2597 535043 0.48 537640 100 2441 530376 0.46 532817 101 2243 471873 0.47 474116 102 2447 519014 0.47 521461 103 2428 499459 0.48 501887 104 2097 443179 0.47 445276 105 2347 491346 0.48 493693 106 2230 476479 0.47 478709 107 2070 433709 0.48 435779 108 2158 472493 0.45 474651 109 2175 464435 0.47 466610 110 2106 421847 0.50 423953 111 2102 461337 0.45 463439 112 2180 445533 0.49 447713 113 1957 404936 0.48 406893 114 2146 433883 0.49 436029 115 2076 429409 0.48 431485 116 1873 378323 0.49 380196 117 2069 418295 0.49 420364 118 2067 431467 0.48 433534 119 1889 381264 0.49 383153 120 1949 413226 0.47 415175 121 1966 395204 0.50 397170 122 1881 359953 0.52 361834 123 1949 389136 0.50 391085 124 1923 380138 0.50 382061 125 1812 359194 0.50 361006 126 1974 387553 0.51 389527 127 1980 373906 0.53 375886 128 1851 341761 0.54 343612 129 1852 377222 0.49 379074 130 1794 356646 0.50 358440 131 1635 329834 0.49 331469 132 1774 360086 0.49 361860 133 1945 353415 0.55 355360 134 1562 320513 0.48 322075 135 1766 344336 0.51 346102 136 1689 343666 0.49 345355 137 1766 303408 0.58 305174 138 1789 341055 0.52 342844 139 1747 338632 0.51 340379 140 1636 299391 0.54 301027 141 1787 329270 0.54 331057 142 1734 314959 0.55 316693 143 1673 282621 0.59 284294 144 1761 318799 0.55 320560 145 1640 300900 0.54 302540 146 1610 278073 0.58 279683 147 1651 285623 0.57 287274 148 1028 94985 1.07 96013 149 593 77073 0.76 77666 150 906 130657 0.69 131563 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 36587 1364621 2.61 1401208 2 53829 957 98.25 54786 3 604 93305 0.64 93909 4 603 161658 0.37 162261 5 998 138565 0.72 139563 6 829 161671 0.51 162500 7 998 157775 0.63 158773 8 908 162443 0.56 163351 9 1446 170513 0.84 171959 10 1468 169686 0.86 171154 11 957 161724 0.59 162681 12 873 167864 0.52 168737 13 888 171022 0.52 171910 14 858 153675 0.56 154533 15 1104 163956 0.67 165060 16 3825 166260 2.25 170085 17 878 149288 0.58 150166 18 803 159469 0.50 160272 19 775 159818 0.48 160593 20 797 141959 0.56 142756 21 774 149636 0.51 150410 22 833 154237 0.54 155070 23 782 137862 0.56 138644 24 800 145067 0.55 145867 25 790 141878 0.55 142668 26 712 131183 0.54 131895 27 734 145117 0.50 145851 28 702 141311 0.49 142013 29 744 127702 0.58 128446 30 652 134272 0.48 134924 31 721 132375 0.54 133096 32 696 122462 0.57 123158 33 661 134981 0.49 135642 34 682 134105 0.51 134787 35 635 123072 0.51 123707 36 639 128471 0.49 129110 37 724 127486 0.56 128210 38 724 116793 0.62 117517 39 629 119425 0.52 120054 40 618 119253 0.52 119871 41 569 111453 0.51 112022 42 588 118806 0.49 119394 43 653 119197 0.54 119850 44 533 109548 0.48 110081 45 610 112337 0.54 112947 46 547 116929 0.47 117476 47 582 107352 0.54 107934 48 506 109142 0.46 109648 49 532 105647 0.50 106179 50 559 96294 0.58 96853 51 557 104467 0.53 105024 52 616 102845 0.60 103461 53 560 93528 0.60 94088 54 486 99090 0.49 99576 55 533 99584 0.53 100117 56 506 92519 0.54 93025 57 599 101193 0.59 101792 58 465 100252 0.46 100717 59 479 88592 0.54 89071 60 527 93868 0.56 94395 61 535 97596 0.55 98131 62 518 85305 0.60 85823 63 456 90926 0.50 91382 64 437 88784 0.49 89221 65 459 80670 0.57 81129 66 445 83815 0.53 84260 67 500 82803 0.60 83303 68 397 77469 0.51 77866 69 422 83284 0.50 83706 70 412 81568 0.50 81980 71 373 77674 0.48 78047 72 440 82204 0.53 82644 73 412 80311 0.51 80723 74 399 73073 0.54 73472 75 387 74444 0.52 74831 76 335 72466 0.46 72801 77 319 65627 0.48 65946 78 315 71545 0.44 71860 79 390 71373 0.54 71763 80 370 65536 0.56 65906 81 294 67659 0.43 67953 82 347 67792 0.51 68139 83 281 63489 0.44 63770 84 335 63197 0.53 63532 85 231 59561 0.39 59792 86 273 56876 0.48 57149 87 302 60534 0.50 60836 88 305 61063 0.50 61368 89 321 59993 0.53 60314 90 274 61789 0.44 62063 91 265 60876 0.43 61141 92 248 55604 0.44 55852 93 285 58073 0.49 58358 94 280 58314 0.48 58594 95 258 52759 0.49 53017 96 267 57061 0.47 57328 97 319 58091 0.55 58410 98 294 54975 0.53 55269 99 275 55069 0.50 55344 100 250 54758 0.45 55008 101 203 48313 0.42 48516 102 211 50041 0.42 50252 103 256 51126 0.50 51382 104 245 47725 0.51 47970 105 261 49235 0.53 49496 106 235 47318 0.49 47553 107 267 43958 0.60 44225 108 192 47475 0.40 47667 109 238 47875 0.49 48113 110 248 43477 0.57 43725 111 199 43912 0.45 44111 112 240 44671 0.53 44911 113 195 40420 0.48 40615 114 189 42459 0.44 42648 115 217 42365 0.51 42582 116 193 38299 0.50 38492 117 195 38579 0.50 38774 118 200 38063 0.52 38263 119 167 36168 0.46 36335 120 184 38646 0.47 38830 121 180 39198 0.46 39378 122 163 36034 0.45 36197 123 178 37925 0.47 38103 124 158 39955 0.39 40113 125 168 35422 0.47 35590 126 197 35300 0.55 35497 127 211 35388 0.59 35599 128 152 33275 0.45 33427 129 149 33325 0.45 33474 130 159 34435 0.46 34594 131 165 33465 0.49 33630 132 172 33674 0.51 33846 133 132 33856 0.39 33988 134 126 30648 0.41 30774 135 156 31536 0.49 31692 136 168 31188 0.54 31356 137 116 29049 0.40 29165 138 127 30649 0.41 30776 139 141 30730 0.46 30871 140 123 28210 0.43 28333 141 91 28534 0.32 28625 142 132 27396 0.48 27528 143 105 24933 0.42 25038 144 129 28149 0.46 28278 145 100 27016 0.37 27116 146 112 23659 0.47 23771 147 106 26213 0.40 26319 148 106 15057 0.70 15163 149 73 12733 0.57 12806 150 59 12328 0.48 12387 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 424 1136658 0.04 1137082 2 413 604 40.61 1017 3 13978 3036 82.16 17014 4 437 124567 0.35 125004 5 549 121925 0.45 122474 6 750 123210 0.61 123960 7 728 112312 0.64 113040 8 1170 145377 0.80 146547 9 733 129986 0.56 130719 10 791 120713 0.65 121504 11 879 145919 0.60 146798 12 727 136961 0.53 137688 13 811 138736 0.58 139547 14 691 136999 0.50 137690 15 795 133073 0.59 133868 16 729 132301 0.55 133030 17 672 128808 0.52 129480 18 733 128342 0.57 129075 19 680 124864 0.54 125544 20 662 126576 0.52 127238 21 680 126476 0.53 127156 22 684 120595 0.56 121279 23 678 120803 0.56 121481 24 598 110252 0.54 110850 25 646 122228 0.53 122874 26 589 116917 0.50 117506 27 598 109228 0.54 109826 28 648 112136 0.57 112784 29 602 113071 0.53 113673 30 632 105505 0.60 106137 31 584 105603 0.55 106187 32 559 104292 0.53 104851 33 605 109235 0.55 109840 34 569 107528 0.53 108097 35 523 101548 0.51 102071 36 556 98809 0.56 99365 37 641 101534 0.63 102175 38 600 108389 0.55 108989 39 592 103506 0.57 104098 40 491 95043 0.51 95534 41 569 103902 0.54 104471 42 449 90149 0.50 90598 43 516 97389 0.53 97905 44 451 90171 0.50 90622 45 468 97931 0.48 98399 46 456 93251 0.49 93707 47 497 90127 0.55 90624 48 446 84136 0.53 84582 49 507 81564 0.62 82071 50 450 91163 0.49 91613 51 409 89959 0.45 90368 52 490 80768 0.60 81258 53 452 84031 0.54 84483 54 429 78989 0.54 79418 55 384 80903 0.47 81287 56 392 81304 0.48 81696 57 412 82964 0.49 83376 58 400 73318 0.54 73718 59 411 74894 0.55 75305 60 429 75266 0.57 75695 61 384 69269 0.55 69653 62 378 75036 0.50 75414 63 372 75485 0.49 75857 64 385 70431 0.54 70816 65 330 67288 0.49 67618 66 349 67585 0.51 67934 67 370 71121 0.52 71491 68 371 67635 0.55 68006 69 302 63573 0.47 63875 70 320 65223 0.49 65543 71 368 68529 0.53 68897 72 325 60999 0.53 61324 73 325 65865 0.49 66190 74 335 63878 0.52 64213 75 288 59018 0.49 59306 76 325 58106 0.56 58431 77 294 60656 0.48 60950 78 281 57260 0.49 57541 79 267 55332 0.48 55599 80 331 57345 0.57 57676 81 257 56449 0.45 56706 82 308 49770 0.62 50078 83 283 53967 0.52 54250 84 299 55450 0.54 55749 85 259 54057 0.48 54316 86 240 51542 0.46 51782 87 300 52537 0.57 52837 88 234 48071 0.48 48305 89 247 51300 0.48 51547 90 220 49661 0.44 49881 91 256 51570 0.49 51826 92 229 46442 0.49 46671 93 196 46556 0.42 46752 94 261 46707 0.56 46968 95 253 46703 0.54 46956 96 214 45963 0.46 46177 97 200 45181 0.44 45381 98 231 45496 0.51 45727 99 186 43625 0.42 43811 100 242 39976 0.60 40218 101 205 42299 0.48 42504 102 183 41107 0.44 41290 103 191 40131 0.47 40322 104 180 42217 0.42 42397 105 164 36199 0.45 36363 106 199 38669 0.51 38868 107 226 41210 0.55 41436 108 160 37323 0.43 37483 109 173 36025 0.48 36198 110 235 40593 0.58 40828 111 180 34249 0.52 34429 112 186 33972 0.54 34158 113 172 34286 0.50 34458 114 176 35304 0.50 35480 115 146 35322 0.41 35468 116 171 34482 0.49 34653 117 132 32268 0.41 32400 118 148 33514 0.44 33662 119 147 32711 0.45 32858 120 118 31739 0.37 31857 121 132 29789 0.44 29921 122 155 31544 0.49 31699 123 139 30343 0.46 30482 124 156 29258 0.53 29414 125 169 30634 0.55 30803 126 116 29869 0.39 29985 127 148 30561 0.48 30709 128 109 29244 0.37 29353 129 118 25547 0.46 25665 130 140 27768 0.50 27908 131 159 29680 0.53 29839 132 110 28488 0.38 28598 133 124 25263 0.49 25387 134 140 28306 0.49 28446 135 111 27142 0.41 27253 136 112 26242 0.42 26354 137 111 25051 0.44 25162 138 168 25905 0.64 26073 139 104 23748 0.44 23852 140 94 23534 0.40 23628 141 125 25027 0.50 25152 142 92 25746 0.36 25838 143 98 23171 0.42 23269 144 86 21088 0.41 21174 145 92 20023 0.46 20115 146 90 22002 0.41 22092 147 118 21209 0.55 21327 148 103 11202 0.91 11305 149 61 12053 0.50 12114 150 63 10724 0.58 10787 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 345 992 25.80 1337 2 1800 204349 0.87 206149 3 1429 166752 0.85 168181 4 1938 301179 0.64 303117 5 1832 239446 0.76 241278 6 1402 257545 0.54 258947 7 1499 248901 0.60 250400 8 1462 233372 0.62 234834 9 1513 261069 0.58 262582 10 1392 259144 0.53 260536 11 1400 243425 0.57 244825 12 1346 256435 0.52 257781 13 1727 262101 0.65 263828 14 1377 223844 0.61 225221 15 1306 246833 0.53 248139 16 1238 244055 0.50 245293 17 1238 215418 0.57 216656 18 1201 239838 0.50 241039 19 1238 242676 0.51 243914 20 1144 209360 0.54 210504 21 1194 227127 0.52 228321 22 1089 226223 0.48 227312 23 1048 196220 0.53 197268 24 1103 227782 0.48 228885 25 962 220181 0.44 221143 26 1038 192992 0.53 194030 27 960 212737 0.45 213697 28 967 211858 0.45 212825 29 933 185187 0.50 186120 30 1024 205607 0.50 206631 31 956 210819 0.45 211775 32 1003 181204 0.55 182207 33 1005 194603 0.51 195608 34 1016 202204 0.50 203220 35 946 174788 0.54 175734 36 998 191245 0.52 192243 37 994 193862 0.51 194856 38 913 169279 0.54 170192 39 852 183330 0.46 184182 40 987 183881 0.53 184868 41 883 167133 0.53 168016 42 914 178592 0.51 179506 43 815 169526 0.48 170341 44 847 161044 0.52 161891 45 849 174843 0.48 175692 46 896 174325 0.51 175221 47 839 146894 0.57 147733 48 827 165314 0.50 166141 49 839 161434 0.52 162273 50 689 152665 0.45 153354 51 738 153778 0.48 154516 52 722 153853 0.47 154575 53 705 140718 0.50 141423 54 701 155115 0.45 155816 55 689 149163 0.46 149852 56 652 136837 0.47 137489 57 691 142752 0.48 143443 58 720 144743 0.49 145463 59 760 132303 0.57 133063 60 620 139080 0.44 139700 61 666 135717 0.49 136383 62 628 125519 0.50 126147 63 633 134464 0.47 135097 64 600 133492 0.45 134092 65 641 122506 0.52 123147 66 663 128306 0.51 128969 67 665 131829 0.50 132494 68 553 114360 0.48 114913 69 603 131392 0.46 131995 70 510 126621 0.40 127131 71 580 109750 0.53 110330 72 536 120693 0.44 121229 73 578 114561 0.50 115139 74 493 101420 0.48 101913 75 490 114218 0.43 114708 76 555 115987 0.48 116542 77 503 98688 0.51 99191 78 551 110151 0.50 110702 79 386 104776 0.37 105162 80 423 99191 0.42 99614 81 457 104125 0.44 104582 82 431 104024 0.41 104455 83 491 95269 0.51 95760 84 471 107852 0.43 108323 85 507 104508 0.48 105015 86 499 93485 0.53 93984 87 430 97348 0.44 97778 88 432 96086 0.45 96518 89 401 83753 0.48 84154 90 421 93366 0.45 93787 91 447 92299 0.48 92746 92 445 82727 0.54 83172 93 418 91928 0.45 92346 94 346 88310 0.39 88656 95 439 81344 0.54 81783 96 447 89607 0.50 90054 97 371 86343 0.43 86714 98 326 74510 0.44 74836 99 432 85338 0.50 85770 100 402 80746 0.50 81148 101 384 75023 0.51 75407 102 392 82949 0.47 83341 103 387 80447 0.48 80834 104 309 68191 0.45 68500 105 339 76863 0.44 77202 106 347 76441 0.45 76788 107 286 68237 0.42 68523 108 330 70461 0.47 70791 109 364 70854 0.51 71218 110 300 65750 0.45 66050 111 268 70436 0.38 70704 112 314 69877 0.45 70191 113 304 60486 0.50 60790 114 344 67985 0.50 68329 115 304 68559 0.44 68863 116 286 60519 0.47 60805 117 313 66486 0.47 66799 118 271 63367 0.43 63638 119 301 59300 0.51 59601 120 285 61366 0.46 61651 121 289 58398 0.49 58687 122 307 57868 0.53 58175 123 258 59752 0.43 60010 124 245 58764 0.42 59009 125 240 51821 0.46 52061 126 280 56714 0.49 56994 127 279 58268 0.48 58547 128 186 51904 0.36 52090 129 254 55085 0.46 55339 130 237 52071 0.45 52308 131 249 46806 0.53 47055 132 223 53676 0.41 53899 133 230 49821 0.46 50051 134 201 44809 0.45 45010 135 230 50359 0.45 50589 136 276 50161 0.55 50437 137 204 44553 0.46 44757 138 224 47260 0.47 47484 139 249 50238 0.49 50487 140 195 42243 0.46 42438 141 161 48489 0.33 48650 142 213 48399 0.44 48612 143 191 42401 0.45 42592 144 216 46838 0.46 47054 145 164 42253 0.39 42417 146 169 39490 0.43 39659 147 160 42452 0.38 42612 148 138 24058 0.57 24196 149 109 21152 0.51 21261 150 80 20239 0.39 20319